楸树优良种质资源的AFLP遗传多样性分析

为研究44份楸树种质资源的遗传多样性及亲缘关系,利用AFLP分子标记技术,对采自鲁豫地区的44份楸树优良种质进行了分析。结果表明:筛选出的8对PstI/MseI引物组合从44份楸树种质中共扩增出1087条清晰条带,其中多态性条带(NPB)1043条,多态性比率(PPB)达到95.60%。平均每对引物可扩增出135.88条带和130.38条多态性带。每个位点的平均有效等位基因数(Ne)、Nei’s平均基因多样性(H)、Shannon平均信息指数(Ⅰ)分别为1.3210、0.2003和0.3204,且8对引物组合共产生261条特异性条带,表明楸树资源间具有丰富的遗传多样性。通过计算种质间遗传相似系数和进行UPGMA聚类分析得出,各种质材料间的遗传相似性系数在0.5022~0.7919间,平均为0.6527。以遗传相似性系数0.65为界44份楸树种质可划分为5组,其中第1组包括15个山东种质和2个河南种质;第2组包括18个山东种质和3个河南种质;第3组包括3河南种质;第4组包括1个河南种质;第5组包括2个河南种质。这表明不同地理生态条件造就了各种质材料间丰富的遗传多样性,其遗传多样性以及亲缘关系与其地理分布并不完全一致。综上,AFLP标记技术能较好的揭示楸树种质资源的遗传多样性和亲缘关系,可为楸树优良种质资源的收集、鉴别及利用提供参考依据。     

基于AFLP标记的薄壳山核桃种质资源遗传多样性分析

利用荧光AFLP分子标记技术,对引种到山东地区的30份薄壳山核桃品种(系)的遗传多样性和亲缘关系进行分析,旨在加深山东地区引进的薄壳山核桃品种资源遗传背景的认识,为以后山东地区薄壳山核桃的品种选育在分子层面提供理论基础.总体上,9对引物组合共扩增出1425个条带,多态性条带1381个,平均多态性比例为96.9％,其中有...     

黑松家系遗传多样性的AFLP分析

为探究黑松家系的遗传多样性,采用限制性片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism)分子标记技术对51份黑松家系进行遗传多样性的分析。9对引物共检测出1 125条谱带,其中有1 122条多态带,平均多态带比例为99.73%,表明所试黑松材料具有较高的遗传多样性。分析统计黑松家系的特异性条带有220条,包括一条缺失带,通过特异性条带可将90%的黑松家系鉴别出来。聚类分析将黑松种质分成5组,来源相同的家系并未严格聚在一起,表明黑松家系的变异与地理来源没有严格的相关性。     

川滇石榴品种遗传多样性及亲缘关系的AFLP分析

石榴(Punica granatum)为石榴科(Punicaceae)石榴属(Punica)落叶灌木或小乔木,原产伊朗、阿富汗等中亚一带,从西汉张骞出使西域将涂林安石榴引入我国,石榴作为水果和观赏树木在我国已有2000多年的栽培历史.经长期天然杂交和基因突变,以及采用实生、分株、嫁接等多种繁殖方法,产生了复杂而多样的品种和类型,据不完全统计,我国现有石榴品种资源200多个,遍及南北各地20多个省区,形成了山东枣庄、新疆叶城、陕西临潼、安徽怀远、河南开封、云南蒙自和四川会理等著名的栽培区(汪小飞,2007).     

金丝楸优良无性系遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析

目的 为了加深对金丝楸(Catalpa bungei C. A. Mey.)优良无性系资源遗传背景的认识, 方法 本研究运用荧光扩增片段长度多态性(AFLP)技术,筛选10 对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合,以梓树属的梓树(C. ovata G. Don)、灰楸(C. fargesii Bur.)、光叶楸和‘豫楸1号’良种为对照,在基因组水平上检测定植于河南省洛宁县的75个金丝楸无性系的遗传变异。 结果 总体水平上,在获得的1 177条可统计条带中,1 130条呈多态性,多态性带百分率（PPBs）达96.01%;不同位点的有效等位基因数为1.00~1.99,平均为1.48±0.03;基因多样度为0.00~0.49,平均为0.28±0.01;Shannon信息指数为0.00~0.69,平均为0.43±0.02。当遗传相似系数为0.827 7时可将供试样品分为8组,其中,71个无性系聚为一组,显示出金丝楸无性系遗传背景较狭窄。各无性系的遗传距离和地理距离呈极显著正相关,表明地理隔离对楸树遗传多样性有明显的影响。结合聚类分析结果,金丝楸无性系当中的63号与其他遗传距离最远,值得重点保护和推广。 结论 形态学性状观察和AFLP分子标记分析显示：金丝楸与普通楸树存在较显著的差异,因此,认为金丝楸的分类地位宜做更加深入的探讨。     

运用AFLP技术分析筇竹种群遗传多样性

利用AFLP分子标记技术对筇竹2个种群的遗传多样性进行了分析,筛选出10对多态性和清晰度较高的引物组合,共获得680个AFLP位点,其中多态性位点662个,平均多态性检出率为97.20%,并用PopGen32软件对AFLP多态性数据进行分析,结果表明,供试2个筇竹种群均具有丰富的遗传多样性,多态位点百分率分别为89.86％和91.95％,等位基因数分别为1.898 6和1.919 5,有效等位基因数分别为1.585 0和1.568 3,种群内遗传多样性为0.332 1,种群水平平均Nei’s 遗传多样性为0.394 9,Shannon信息指数为0.575 4,基因流为2.900 9,遗传一致度为0.821 9,遗传距离平均值为0.196 1。并根据遗传距离进行了UPGMA聚类分析。     

柳树种质资源遗传多样性和亲缘关系的CE-AFLP分析

利用毛细管电泳-AFLP技术,采用EcoR Ⅰ+3/Mse Ⅰ+3和Pst Ⅰ+2/Mse Ⅰ+3引物组合,对从国内外搜集的37份柳树种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析.11对引物共扩增出1 580条条带,多态性条带数为1 399条,多态率在80.65％ ～ 94.67％之间,表明柳树种质间的遗传多样性较高.采用NTSYS-pc 2.10e软件对37份种质进行聚类分析和主成分分析,在相似系数0.63时,37份种质分为2大类,一类是乔木柳,一类除小乔木康定柳外,其余都为灌木柳.聚类分析和主成分分析结果与传统形态分类基本一致,但筐柳组中簸箕柳P295和沙柳基因组水平上差异较大,P295与银芽柳亲缘关系较近.研究结果为柳树分子生物学分类、种质资源保存与利用及品种改良等研究提供理论依据.     

人心果品种资源亲缘关系的AFLP分析

利用荧光AFLP分子标记技术对27个人心果品种(类型)及4个蔓妹人心果品种资源的亲缘关系进行研究.9对引物(Pst Ⅰ-Mse Ⅰ)共扩增得到1131条带(75～500 bp),其中多态性带1096条(96.90%).28个品种(类型)具特征性条带,特征带大小为350～500 bp.品种间多态性比例在22.19%～45.89%之间,遗传相似性系数为0.40～0.87.UPGMA聚类结果将31个品种聚为蔓妹人心果类群(MAM)和2个人心果类群(SAP1和SAP2).在遗传相似性系数0.52处,4个蔓妹人心果品种首先被区分开,单独聚为一类(MAM).人心果类群中,11个美国品种和10个国内地方类型在相似性系数0.66处聚为一大组(C、D组),相互之间表现出较近的亲缘关系.大部分栽培品种聚于D-2亚组,与地方类型有一定的遗传距离,说明栽培种的亲缘关系较为相近.人心果表型标记与分子标记结果间存在一定差异,二者的相关性不高.     

河南省柿种质资源的遗传多样性

【目的】对河南省柿种质资源的遗传多样性进行分析,揭示河南省柿种质资源的遗传多样性程度,分析不同资源之间的亲缘关系,并进行种质资源鉴定,判断同名异物和同物异名品种。【方法】以柿近缘种君迁子、油柿、浙江柿、美洲柿、金枣柿及柿变种野柿共计9份材料作为对照,从已发表的柿属植物 SSR 引物中,筛选出多态性较高的,对来自河南省不同地区的柿主栽品种(18份)、农家品种(55份)及野生资源(20份),共计93份资源进行遗传多样性分析。【结果】利用17对 SSR引物对102份材料进行 PCR扩增,共得到159个不同的 DNA片段(即条带),平均每对引物9.35个,范围为5～14个,扩增条带最多的引物有2对,分别来自位点 ssrDK11/DQ097479和ssrDK14/DQ097482,最少的来自位点8125/DC592401;所得到的所有条带均具有多态性;共得到508个谱带类型(即带型),平均每对引物29.88个,范围为8～53个,最多的引物对来自位点 ssrDK11/DQ097479,而最少的则来自位点5553/DC585710;特异带型总数为267个,平均每对引物15.71个,范围为2～37个,最多的依然来自位点ssrDK11/DQ097479,最少的同样是5553/DC585710;特异带型比率73.68%～25.00%;种质鉴定率1.96%～36.27%;多态性信息含量(PIC)平均为0.8397,范围是0.4667～0.9647; Shannon信息指数(I)平均为2.6586,范围为1.1121～3.5967;平均观察杂合度( Ho )为0.7774,范围是0.1471～0.9608。综合对比,ssrDK11/DQ097479、ssrDK14/DQ097482和mDp17/EF567410这3个位点遗传变异程度最高。主坐标分析与聚类分析结果基本一致：柿及其近缘种彼此之间具有明显的遗传差异;柿种下所有资源单独聚为一大类,能够与近缘种区别开;与其他近缘种相比,美洲柿与柿的亲缘关系相对较远。扩增的位点可鉴别所有供试资源,并可判断部分同名异物或同物异名品种。【结论】河南省柿种质资源遗传变异程度较大,杂合程度高,具有较高水平的遗传多样性;本研究所用方法可有效应用于柿种质资源鉴定。     

叶籽银杏种质遗传多样性的AFLP评价

文章对来自日本和中国的8株叶籽银杏亲缘关系进行了评价,从64对EcoRI／MseI引物中筛选出7对清晰、多态性高的引物,对8个叶籽银杏种质的亲缘关系进行了AFLP分析。7对引物共产生841条谱带、240个特异位点和749条多态带,多态带的比例平均为89．06％,每对引物鉴别效率达到100％,所有种质之间相似系数（SC）在0．48～0．78之间,表明叶籽银杏单株问存有较大的遗传变异,中国的叶籽银杏具有较丰富的遗传变异。     

10个南方皂荚群体遗传多样性的AFLP分析

[目的]研究南方皂荚的遗传多样性和遗传结构现状,为制定有效的保护策略和育种策略提供理论依据。[方法]采用扩增片段长度多态性技术对供试的215份皂荚的遗传多样性及遗传距离进行分析。[结果]表明:检测到1 782个位点,其中,有1 389个为多态性位点,多态位点百分率为77.94%;皂荚各群体Shannon’s信息指数平均为0.256;Nei’s多样性指数平均为0.168,表明皂荚群体的遗传多样性偏低,皂荚群体间存在着一定的遗传分化;根据遗传距离UPGMA聚类分析,将10个群体划分为4大类。由遗传分化系数和分子方差分析结果发现,群体内的变异是皂荚遗传变异的主体,74.79%的变异来自群体内。[结论]皂荚群体的遗传多样性与遗传结构的形成不仅与其分布广泛、种子特性及生活史有关,而且与人为的砍伐、引种、生境片段化等因素有重要关系。基于上述结果提出了皂荚的保护策略。     

马缨杜鹃不同完整性居群遗传多样性的AFLP分析

采用选择性扩增片段多态性(AFLP)技术对马缨杜鹃5个不同完整性居群的遗传多样性进行检测和分析。结果表明:筛选出的7对引物组合共扩增出527条带,其中多态带382条,多态带百分率为72.49%;5个居群间的多态性百分率在52.23%~69.64%之间,居群平均多态性百分率为57.80%;Nei’s基因多样性变化范围在0.113 9~0.173 8之间,Shannon信息指数为0.186 8~0.277 7;居群间遗传分化系数Gst为0.168 8,表明83.12%遗传变异发生在居群内,居群间基因流为2.462 4,足以维持居群间现有的遗传结构;AMOVA分析结果表明,18.34%的遗传变异存在于居群间,81.66%的遗传变异存在于居群内;基于UPGMA聚类结果,可将5个马缨杜鹃居群分为3组,紫溪山和板凳山居群、马雄山和小营地居群之间各为一组,老湾地居群独自一组。研究表明,该物种有些居群虽遭受严重的人为破坏,但居群的遗传多样性仍然较高。     

海南岛青梅AFLP标记的遗传多样性

采用AFLP标记检测海南岛青梅7个主要自然居群192株个体的遗传多样性及遗传结构.应用筛选出的6对引物共扩增出频率大于5.00%的位点777个,其中多态位点比例为99.61%(774).在种级水平上,Nei's基因多样性指数(H)为0.266 1,Shannon多态性信息指数(I)为0.420 4;总基因多样度(H,1)为0.268 4.居群水平的平均多态性位点数和多态性比例为617个和79.45%;H和I平均值分别为0.215 3和0.335 2.遗传分化指数(Fst)和基因流(N,m)分别为0.198 0和1.012 7.UPGMA聚类和遗传距离与空间距离相关性分析结果表明,居群间遗传亲缘关系与其地理位置关系不明显(P=0.230 0,r'2=0.232 5.综合研究结果表明,青梅具有较高的遗传多样性,居群间有一定的遗传分化.建议采取人工促进天然林下层苗木生长和人工造林等措施,促进现有青梅居群遗传多样性保育和发展.     

利用AFLP技术研究不同产地绿竹的遗传多样性

应用AFLP技术对21个不同产地的绿竹遗传多样性进行了研究。结果显示：所用20对选择性引物组合对样品的扩增PCR产物均得到了清晰的条带,对条带的分析表明21个不同产地的绿竹之问多态性位点很少,由此证明所选绿竹样品之间的遗传多样性水平较低。     

蒙古栎天然群体遗传多样性的AFLP分析

以黑龙江省小兴安岭嘉荫、内蒙古大青沟和河北省雾灵山的3个蒙古栎群体及北京东灵山辽东栎群体为供试材料,用筛选出的4对荧光引物,对4个群体共计96个个体进行Ant分析,每对AFLP引物扩增出63～113条,共得到346条多态带;群体特异带及群体间共有带的差异与分布揭示了群体间的遗传差异及相似性;蒙古栎遗传多样性主要存在于群体内,群体间的遗传分化系数Gst为0．077。蒙古栎在种级水平的遗传多样性参数略高于群体水平,多态带百分率P分别为96．8％、67．2％,有效等位基因数Ae分别为1．220、1．208,Nei基因多样性指数H分别为0．145、0．134,Shannon多样性指数,分别为0．246、0．208。东灵山辽东栎群体的P为67．6％,Shannon多样性指数,为0．220,Nei基因多样性指数H为0．134。UPGMA聚类分析结果表明,蒙古栎自然群体间的遗传距离有随地理距离跨度增加而递增的趋势。蒙古栎遗传多样性偏低可能与其在历史上长期用作经济树种、人为干预和环境破坏较为严重、现存林分基本上为次生林等因素有关。     

AFLP技术在植物遗传多样性研究中的应用

AFLP技术在植物遗传多样性研究中的应用较为广泛.AFLP技术高度灵敏,可鉴别品种,甚至将亲缘关系很近的品种鉴别开来,如自交系、杂交系、近缘种和芽变种.AFLP技术通过检测基因组DNA水平的差异进行系统分类,结果更稳定、客观.AFLP技术可检测群体之间甚至个体之间细微差异,为收集、保存、评价和利用植物资源提供了最直接的依据.AFLP技术可以为物种的起源和进化这类问题的解决提供DNA水平上的有力证据.本文还对AFLP技术的应用前景进行了讨论.     

古银杏种质亲缘关系及遗传多样性的ISSR分析

为了探明山东古银杏种质及其群体的亲缘关系和遗传多样性水平,从20对ISSR中筛选出7对扩增产物重复性好、谱带清晰的引物,对29个山东古银杏种质的亲缘关系及遗传多样性进行了研究。结果表明:7对引物共产生34条谱带,其中多态带28条,多态带的比例为82.4%;29个古银杏种质之间的相似系数为0.53～0.95;当相似系数为0.78时,供试种质可分为5类,种质的聚类与种质是否在同一地理区域并非完全相关;泰安与临沂群体之间的遗传一致度比较高,非半岛地区古银杏种质的遗传多样性高于半岛地区的。     

杨树部分种的AFLP遗传多样性分析

利用10对AFLP引物对杨属5个派20个种及杂种的44份杨树材料进行分析.结果表明:在这些材料中,不同引物组合的多态性均为100%,表明杨属种间及无性系间在DNA 水平上存在广泛变异.利用 UPGMA 法对 AFLP 数据进行聚类分析,相似系数在 0.765～0.971 之间,派间聚类与经典形态分类完全一致,派内种间及种内无性系间聚类与形态分类基本相同.构建了 44 份材料的指纹图谱,在该图谱中,每个材料都具有自身独特的条带.最后,探讨根据分子标记结果进行杂交亲本选配及杂种子代早期选择的可行性.     

油茶种质资源遗传多样性分析

利用RAPD标记技术分析90份油茶种质的遗传多样性,探讨无性系间的亲缘关系,以及抗病性、果油率和产油量3个数量性状与谱带的相关性.结果表明:RAPD扩增得到593条谱带,多态性谱带564条,多态比率达95.11%,特异性及特异性缺失谱带32条,占5.32%,无性系间存在丰富的遗传多样性;广西软枝油茶和广东阳春油茶均聚在同一亚类,从分子水平说明了阳春油茶和软枝油茶的亲缘关系比较近,可能是同一个农家品种;与抗病性、果油率和产油量3个数量性状显著相关谱带分别为13.1%、25.2%和34.5%,这些与抗病性、果油率和产油量数量性状相关谱带的确定,可为选育丰产、抗病、优质的油茶品种提供参考.     

42份乌榄种质资源SCoT分子标记遗传多样性分析

为了解和掌握广西乌榄的资源类型及其遗传变化规律,利用SCoT分子标记技术,对桂西南地区收集到的42份乌榄种质资源进行遗传多样性分析。筛选出14条引物对供试材料进行PCR扩增,共获得124条带(DNA位点),其中具有多态性条带74条,平均多态性比例(PPB)59.68%;经Ntedit软件计算,其遗传相似系数(GS)的范围值在0.726~0.903,平均为0.817,表明SCoT能够揭示乌榄种质间的遗传变异。UPGMA法聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.812时,可将乌榄种质资源分为A、B 2个大组,每大组又各分2个亚组,亚组内种质资源按照采样地聚集,说明乌榄的亲缘关系与地理起源有一定的相关性。总体上,橄榄种质资源遗传多样性水平相对较低。