云南地方猪种线粒体DNA多态性研究

本文用ＡｐａⅠ、ＡｖａⅠ,ＢａｍＨⅠ,ＢｅｌⅠ,ＢｃｌⅠ,ＣｌａⅠ,ＤｒａⅠ,ＥⅠ,ＥｃｏＲⅤ,ＫｐｎⅠ,ＰｓｔⅠ,ＰｕｖⅡ,ＳａｌⅠ,ＳｍａⅠ,ＳｔｕⅠ,ＸｈｏⅠ等１８种限制性内切酶分析云南猪种的ｍｔＤＮＡ多态性。在全部１８头个体中只检出一种限制性类型,结果表明,云南猪种的ｍｔＤＮＡ变异度很低,遗传多样性贫乏,提示云南猪种起源于一个共同的祖先,在品种形成的早期可能受到创立者效应的制约。     

10个山羊品种(群体)线粒体DNA D-loop序列多态性分析

对四川10个山羊品种(群体)线粒体DNA D-loop序列多态性及系统进化关系进行了探讨.结果表明:群体间共有多态位点83个,单一多态位点23个,简约信息位点24个,平均核苷酸歧异度为0.001 828,D-loop序列多态性相对贫乏;经聚类,10个品种(群体)分为两大类,合江黑山羊与江安黑山羊先聚在一起后,再与自贡黑山羊聚为1类,营山黑山羊与嘉陵黑山羊聚为1类,两类形成一大类;成都麻羊先与金堂黑山羊聚在一起后,再依次与乐至黑山羊、建昌黑山羊、白玉黑山羊形成另一大类,最后两个大类聚在一起.聚类结果与品种(群体)来源和生态地理分布相一致.     

猪线粒体DNA D-loop环研究进展

D-loop环作为线粒体DNA重要的一个区域,已被广泛用于物种起源分化、系统进化等方面的研究。本文简要介绍了线粒体DNA D-loop环的结构特征及其研究方法,并综述了近年来猪线粒体DNA D-loop环的研究进展。     

猪mtDNA多态性的研究与应用

本文介绍了猪mtDNA的结构,以及mtDNA多态性的研究方法;综述了猪mtDNA多态性的研究进展与应用.     

猪mtDNA多态性的研究与应用

本文介绍了猪mtDNA的结构，以及mtDNA多态性的研究方法；综述了猪mtDNA多态性的研究进展与应用。     

南阳牛mtDNA D-loop序列多态性分析

本文以3头南阳牛线粒体DNA D-loop区910bp的核苷酸序列进行了分析。结果发现，3头南阳牛D－loop区的核苷酸序列有3种单倍型。南阳牛1、2和3号D－loop区的平均核苷酸变异率分别为0.44%、4.84%和0.44%，其高变区的平均核苷酸变异率分别为0.81%、7.57%和0.00％。南阳牛1号的核苷酸变异类型只有转换一种式，南阳牛2号的核苷酸变异类型有转换、颠换、插入和缺失四种形式，南阳牛3号的核苷酸变异类型有转换和插入两种形式。在3头牛的核苷酸变异类型中，均以转换最常。说明南阳牛mtDNA D-loop区表现出丰富的核苷酸变异多态性。从线粒体D－loop区核苷酸序列的3种单倍型分析，提出南阳牛可能有两种不同的母系起源。     

4个肉用绵羊品种微卫星标记的多态性与系统发育分析

利用10个微卫星座位对4个肉用绵羊品种进行遗传检测,计算出了各品种的平均杂合度、平均多态信息含量及品种间的遗传距离,并进行了系统发育分析。结果表明:10个微卫星座位上共检测到了107个等位基因,等位基因数在5~13个之间。各基因座位多态信息含量为0.498 5~0.890 4,均表现出了高度多态性。各基因座位杂合度较高,为0.563 0~0.899 5,说明肉用绵羊品种有着较丰富的遗传多样性。4个肉用绵羊品种间的遗传距离相对较远,萨福克羊和陶赛特羊先聚在一起,他们之间的遗传距离最近,为0.345 25,然后与夏洛来羊聚在一起,最后与中国美利奴羊聚在一起,中国美利奴羊与夏洛来羊之间的遗传距离最远,为0.516 39。研究结果对我国肉用绵羊资源的评估、保存和预测杂种优势具有一定的指导意义。     

金华猪分子遗传标记及其DNA多态性的研究进展

DNA多态性遗传标记可以是单位点和多位点,多态性可根据各种来源和不同的实验室检测技术进行分类,本文对近几年金华猪的一些数量性状位点的研究进展进行了综述,如雌激素受体基因、卵泡刺激素β基因、催乳素受体基因、心脏脂肪酸结合蛋白基因、肌细胞生成素等,并提出了今后值得关注的几个研究方向。     

马身猪和8个参照种群mtDNA D-loop序列多态性研究

为了研究山西马身猪遗传变异和分化,选择马身猪及其他8个参照种群共计327头猪样本的线粒体DNA D-loop区域,采用PCR-SSCP和克隆测序技术相结合的方法,并先后使用DNAStar软件包、MEGA软件和DNASp 4.10.7软件对所得数据进行了比对和分析。结果显示:共检测到14种单倍型,50个核苷酸多态位点,其中单一变异位点24个,简约信息位点26个。在所分析的序列中,T、C、A和G 4种碱基的平均比例分别为25.7%、26.0%、35.5%和12.8%。结果表明:山西马身猪群体mt DNA D-loop序列多态性较为贫乏;通过邻接法构建其系统进化树,其系统发育和遗传距离分析显示,马身猪、辽宁野猪和长白猪归为亚洲型,皮特兰猪与PIC猪归为欧洲型;而辽宁杂种野猪、晋阳白猪、大白猪和杜洛克猪有欧亚2种血统。     

特克塞尔羊和地方绵羊品种微卫星DNA多态性分析及群体间杂种优势预测

文章宗旨是利用5个微卫星标记分析5个绵羊品种的遗传结构变异,了解特克塞尔羊和地方绵羊品种的遗传多样性及亲缘关系,以期为种质资源合理利用和保护提供理论依据.根据5个绵羊品种在5个微卫星位点的等位基因组成及频率进行群体遗传统计分析.5个微卫星座位在5个绵羊品种中共检测到78.0个等位基因,各位点的等位基因数(Na)11.0～19.0个;5个绵羊品种平均多态信息含量(PIG)为0.615 2～0.7373,平均基因杂合度(He)为0.671 1～0.7820.特克塞尔羊与晋中绵羊的标准遗传距离(DS)为最大(1.6668),其余依次为广灵大尾羊(1.3062)、小尾寒羊(1.095 9)、乌珠穆沁羊(0.8308).表明5个微卫星座位均为高度多态位点,可作为有效遗传标记用于绵羊品种的遗传多样性及品种间遗传关系分析;5个绵羊品种在5个微卫星位点遗传变异大、多态性丰富.据DS推测,特克塞尔羊(Texel)与晋中绵羊(Jinzhong sheep)杂交可望获得较大的杂种优势,与广灵大尾羊(Guangling Large-tailed sheep)、小尾寒羊(Small-tailed Han sheep)的杂种优势次之,与乌珠穆沁羊(U jumqin sheep)杂种优势稍小.     

家畜线粒体DNA限制性片段长度多态性的研究与应用

在阐述线粒体DNA的特点及其限制性片段长度多态性的基础上,介绍了线粒体DAN多态性的研究现状及在家畜育种中的应用,并指出线粒体DNA限制性片段多态分析在家畜品种资源研究中的意义。     

兔出血症病毒(RHDV)基因的系统发育分析——RHDV是否同时在亚洲和欧洲出现

兔出血症(RHD)第一次大流行于1984年出现在中国(Liuetal.,1984)。该病在9个月内迅速波及中国各地的家兔,造成了1400万只家兔死亡(Cooke,2002)。随后,兔出血症病毒(RHDV)在欧洲、中东和亚洲扩散开来。到20世纪90年代后期,     

贵州宗地花猪母系起源及分化关系的初步研究

研究从母系遗传的角度出发,对宗地花猪及与之地域相近的关岭猪和江口萝卜猪3个贵州地方猪种线粒体D-loop环高变区进行了克隆测序,结合从GenBank中获得的其他国内猪种和几个国外猪种序列,用邻接法构建了猪科物种的系统发育关系。结果表明:国内猪种和国外猪种呈现出明显的2个大类群,宗地花猪、关岭猪和江口萝卜猪毫无争议的归类于国内类群;宗地花猪和藏猪有较近的亲缘关系,与关岭猪反而较远,这表明宗地花猪作为关岭猪一个类型的传统分类方法存在不妥,宗地花猪可作为异于关岭猪的不同类型来进行分类、遗传资源的保存和开发利用。     

研究猪品种生长激素(pGH)基因的多态性

本文在对猪品种生长激素基因多态性进行研究的同时,借助于PCR和测序技术,对11个猪品种的生长激素基因全序列多态性进行检测,43个SNPS和1个位于内含子3的7bp缺少片段被检测出,结果表明,猪品种之间的某种遗传分化在某种程度上不仅仅与地理的分布有关,同时和其基因的交流也有着直接性的关系。     

西藏小型猪线粒体DNA控制区的分子遗传学研究

通过扩增102头西藏小型猪以及16头巴马小型猪、17头贵州香猪的线粒体DNA控制区,测序并与国内其他猪种进行比较,研究西藏小型猪的遗传标记以及与其他国内地方猪种的亲缘关系.结果显示,两藏小型猪线粒体DNAD-loop区分3个区域.串联重复序列区处于中间位置,包含有15～29个10 bp的重复片段,分为A、B 2种类型.3'端340 bp,与国内其他猪种的序列相同,比较保守;D-loop 5'端704 bp,共有22个变异位点.由22个变异位点中归纳出25个单倍型,其中有2种主要的单倍型,分别占34.4%和36.6%.根据3个转换位点:305、500、691,将西藏小型猪分成了2组,几乎与串联重复序列所分的A、B 2组类型相对应.与西藏小型猪相比,巴马小型猪和贵州香猪D-loop 5'端变异位点较少,分别只有4种和2种单倍型,串联重复区也只有1个类型.说明西藏小型猪可能有2个母系祖先,并且与我国西南地区的猪种有较近的亲缘关系;不同的串联重复片段类型和5'端的变异位点可以联合组建西藏小型猪的遗传标记.     

几个地方绵羊品种线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b基因多态性研究

用12种限制性内切酶分析了6个地方绵羊品种线粒体DNA（mtDNA）细胞色素b（cytb）基因的RFLP。结果表明，在71只绵羊个体中，检出的14种限制性态型可归结成4种单倍型，其间的差异主要来源于几个限制性位点的点突变；4种单倍型间和6个绵羊群体间的平均遗传距离（D）分别为0．412％和0．041％，遗传多态程度（π）为0．028％，说明遗传多样性较为贫乏；单倍型聚类结果和群体聚类结果提示，我国地方绵羊品种的起源可能是单一的。     

波尔山羊和山西省地方山羊品种微卫星DNA多态性分析及群体间杂种优势预测

（方法）利用5个微卫星标记对山西省5个山羊品种遗传多态性进行分析,（目的）以预测波尔山羊与地方山羊品种的杂种优势,为山西省肉用山羊新品种培育及波尔山羊在山西省合理杂交利用提供理论依据。（结果）5个山羊品种共检测到70．0个等位基因,各位点的等位基因数在9．0～21．0之间;经群体遗传统计分析,5个山羊品种平均有效等位基因数4．94～6．05个,平均多态信息含量0．7053～0．7982,平均基因杂合度0．7592～0．8316。5个山羊品种间遗传分化系数0．0607;波尔山羊与吕梁黑山羊的标准遗传距离最大（0．5083）,其余依次为阳城白山羊（0．4474）、洪洞奶山羊（0．4332）、黎城大青羊（0．3301）。（结论）5个微卫星位点均为高度多态位点,可用于5个山羊品种遗传多样性评估;5个山羊品种在5个微卫星位点多态性丰富,遗传变异大,品种间遗传分化小。据品种间遗传距离推测,波尔山羊与吕梁黑山羊的杂种优势最大,与阳城白山羊和洪洞奶山羊的杂种优势次之,与黎城大青羊的杂种优势最小。     

5个猪品种3个拷贝数变异区的多态性分析

为了探究拷贝数变异(copy number variation,CNV)在不同猪品种间的多态性,本试验根据猪SNP60芯片检测结果,以大白猪、香猪、柯乐猪、糯谷猪、荣昌猪为主要研究对象,采用实时荧光定量PCR方法,对5个猪品种基因组中3个CNV区域(CNVR91、CNVR92和CNVR143)的拷贝数进行测定。结果显示,香猪的CNVR91以拷贝数缺失为主,其他4个猪品种的拷贝数以正常为主;香猪、大白猪、柯乐猪、荣昌猪的CNVR92以拷贝数缺失为主,糯谷猪以拷贝数正常为主;香猪和糯谷猪的CNVR143以拷贝数增加为主,其他3个猪品种以拷贝数正常为主。表明3个拷贝数变异区在5个猪品种之间具有多态性,可能通过剂量效应影响香猪、糯谷猪和柯乐猪等相关基因的表达和生理功能。     

基于RAPD和SSR分子标记的家蚕部分实用品种多态性及其亲缘关系分析

分子标记是生物系统进化和亲缘关系分析的重要手段。利用RAPD和SSR标记对12个家蚕实用品种的基因组DNA进行多态性分析和聚类分析。采用21条RAPD引物对12个品种的基因组DNA扩增产生的清晰稳定条带数为196条,其中多态性片段143条,多态位点比例72.96%,品种间的遗传距离在0.157～0.352之间。采用32条SSR引物对12个品种的基因组DNA扩增产生的片段数为86条,其中多态性带80条,多态性位点比例93.02%,遗传距离在0.214～0.600之间。对12个家蚕品种的2种分子标记的单独聚类结果表现出一定差异,但均把12个品种分为中系、日系两大类,其中7532和湘晖、871和57B的亲缘关系较近,而传统分类于中系品种东34却聚类于日系,但又独立于其余6个日系品种。结合RAPD标记和SSR标记的12个品种间的遗传距离与聚类结果,更能准确地从分子水平上反映品种间的亲缘关系及其来源,是家蚕杂交育种亲本选择的依据。     

中国地方品种淮猪FSHβ亚基、ESR和Hal基因的多态性及其产仔效分析

人们对猪产仔数主效基因的研究证明，雌激素受体（ESR）基因和促卵泡素β亚基（FSHβ）基因是控制猪产仔数的主效基因：Hal基因是控制猪的应激敏感基因。为了更好地开展对淮猪的保种、开发和利用，刘卫东等采用PCR—RFLP分析技术对51头淮猪的DNA样品进行检测分析。