遗传算法在RNA二级结构预测中的应用

介绍了几类遗传算法在RNA二级结构预测中的应用,并探讨该领域进一步的研究方向。     

小RNA在慢性疾病治疗中的应用

通过对小RNA分类及其在慢性疾病治疗中的应用的介绍,阐明了小RNA在生命科学基础理论研究及在疾病治疗中的重要应用价值;通过对现阶段研究成果的分析,指出了小RNA研究的优势和存在的问题,并预测了其未来发展趋势。     

RNA二级结构预测算法的研究进展

在简要介绍了RNA的基础知识之后,对RNA二级结构的定义、表示方法、数据库等内容进行了详细阐述,并重点探讨了RNA二级结构预测方法的原理、适用范围及优缺点。目前,传统的RNA二级结构预测方法有比较序列分析法和最小自由能算法;新进发展的算法有支持向量机算法、基于堆积协变信息与最小自由能算法、基于局部茎搜索的算法、基于快速动态权重匹配算法、免疫粒子群算法、基于茎区的自由能算法、质心法。经过预测精度、复杂度、预测假节能力的对比,发现基于堆积协变信息与最小自由能算法和基于快速动态权重匹配算法,预测结果比较理想。     

基于随机文法云模型的RNA二级结构预测

[目的]研究基于随机文法云模型预测RNA二级结构的方法。[方法]将云模型引入到随机文法模型中,提出适合于词汇化随机文法模型的机器学习算法,通过词网格模型对RNA序列进行词条获取和划分,再经过云分类器搜索每个词条被标注为某种二级结构类型的最大概率,然后将这些词条信息作为先验信息在随机文法云模型训练过程中引入,实现对RNA二级结构的预测,并对该方法进行试验检测。[结果]试验测试表明,在随机文法模型中引入云模型后,其在预测的准确度和搜索速度上较单纯的随机文法效果有明显改善。[结论]该研究为随机文法模型在RNA二级结构预测中的广泛应用奠定了基础。     

基于词条提取云模型的RNA二级结构预测(英文)

[目的]研究基于词条提取云模型预测RNA二级结构的方法。[方法]将云模型引入到随机文法模型中,提出适合于词汇化随机文法模型的机器学习算法,通过词网格模型对RNA序列进行词条获取和划分,再经过云分类器搜索每个词条被标注为某种二级结构类型的最大概率,然后将这些词条信息作为先验信息在随机文法云模型训练过程中引入,实现对RNA二级结构的预测,并对该方法进行试验检测。[结果]试验测试表明,在随机文法模型中引入云模型后,其在预测的准确度和搜索速度上较单纯的随机文法效果有明显改善。[结论]该研究为随机文法模型在RNA二级结构预测中的广泛应用奠定了基础。     

RNA二级结构预测算法的研究进展

在简要介绍了RNA的基础知识之后,对RNA二级结构的定义、表示方法、数据库等内容进行了详细阐述,并重点探讨了RNA二级结构预测方法的原理、适用范围及优缺点.目前,传统的RNA二级结构预测方法有比较序列分析法和最小自由能算法;新进发展的算法有支持向量机算法、基于堆积协变信息与最小自由能算法、基于局部茎搜索的算法、基于快速动态权重匹配算法、免疫粒子群算法、基于茎区的自由能算法、质心法.经过预测精度、复杂度、预测假节能力的对比,发现基于堆积协变信息与最小自由能算法和基于快速动态权重匹配算法,预测结果比较理想.     

核糖体RNA基因在酵母分类鉴定中的应用

核糖体DNA在酵母分类鉴定中发挥着重要作用。本文介绍了核糖体的构成,核糖体RNA基因26S rDNA D1/D2区域、18S rDNA、ITS-5.8S rDNA和IGS rDNA片段作为分子标记的原理方法、在酵母菌种鉴定和分子系统发育中的应用,同时对rDNA各个序列片段在国内外酵母分类鉴定应用中的问题和前景进行探讨。     

RNA二级结构预测方法

RNA是一类具有重要生物学功能的生物大分子,它是遗传信息由DNA到蛋白质的中间传递体.RNA二级结构预测方法可以分为基于热力学的预测方法和基于系统发生学的预测方法两大类.本文就RNA二级结构预测的方法进行了综述,介绍了最低自由能预测法、配分函数预测法、协同变异预测法、随机上下文无关语法预测法等4种预测方法以及它们的优缺点.     

适配体的研究进程与思考*

 适配体（aptamer）是指利用指数富集的配体系统进化（SELEX）技术，从人工合成的寡核苷酸文库中筛选获得的能够与靶分子特异结合的短单链DNA和RNA分子。筛选得到的适配体可以与DNA，RNA，蛋白质或其它靶分子结合，影响这些靶分子的性质，从而起到改变与靶分子相关的生物学功能的效果。而且研究发现，适配体在与靶分子相互作用时，不仅序列，它们所形成的三维结构也尤其重要。同时，适配体在生物医药研究方面显示出广阔的应用前景。介绍了适配体的发展历程，以及一些典型适配体的生物学功效。提出了RNA适配体三维结构在与靶分子进行相互作用时可能发挥重要作用，以期为RNA适配体的筛选提供理论思考。     

RNA沉默技术在食用菌分子遗传学中的应用

RNA沉默技术有效地避免了食用菌遗传操作中同源重组率低的缺点,应用于食用菌分子遗传学研究中有诸多优势,正在发展成为食用菌基础研究中必不可缺的遗传操作技术。本文综述了食用菌中的RNA沉默相关途径与相关基因的研究进展以及RNA沉默技术在食用菌基因功能研究中的应用,并探讨了RNA沉默技术在食用菌应用中的优缺点与应用前景。     

内蒙古车前属6种,2变种植物种皮的扫描结构

利用种子外部形态和种皮扫描特征进行植物分类学研究,这在车前属 Plantago L.植物的研究中尚属空白。本文对内蒙古车前属6种,2变种植物的种子外部形态和种皮表面结构进行了扫描电镜观察。从种子外部形态和种皮表面雕纹结构分析,各种之间均存在程度不同的差异,它可以反映种群的分类学特征,因而作者提出应把种子外部形态和种皮扫描特征作为车前属植物分类的依据之一,依此进一步印证了前人对车前属分类的合理性,同时报道了车前属植物在内蒙古的4个新记录种。     

稳定小分子量RNA指纹图谱技术在根瘤菌分类研究中的发展和应用

综述了稳定小分子量RNA指纹图谱技术的原理和发展历程,并对该技术在根瘤菌分类研究中的应用现状和前景进行了阐述。稳定小分子量RNA指纹图谱包括5S rRNA和tRNA,该技术在微生物分类鉴定方面具有很大的潜力。     

分子生物学新方法在根瘤菌分类中的应用

随着分子生物学技术的发展,一些全新的方法应用于根瘤菌分类,使根瘤菌分类的研究得到了迅速发展,从过去的传统分类过渡到了以遗传特征和系统发育为主要依据的现代系统分类。研究在参考大量文献的基础上,概述了全细胞可溶性蛋白电泳、多位点酶电泳、ＤＮＡＧ＋Ｃ摩尔百分含量测定及ＤＮＡ－ＤＮＡ杂交、限制性片段长度多态性分析、随机扩增ＤＮＡ片段的多态性、基因外回文重复序列ＰＣＲ扩增技术及１６ＳｒＤＮＡ序列分析确定根瘤菌系统发育等７种分子生物学方法的原理、特点,以及在根瘤菌分类研究中的应用现状和前景。     

香蕉野生种质资源系统分类研究进展

从形态学标记、细胞学标记、生物化学标记和DNA分子标记等方面介绍了香蕉野生种质资源系统分类的方法,并对世界香蕉野生种质资源系统分类的研究进展进行了综述,旨在为香蕉种质资源研究提供参考,为定性选育香蕉新品种提供理论依据。     

中药资源繁缕属植物分类研究进展

综述了中药资源繁缕属植物的分类学研究进展,以期为繁缕属的进一步研究及应用提供参考。综合相关文献,着重探讨了在形态学、实验分类学、化学分类等方面的研究进展。该属资源丰富,特有性高,但研究范围较窄,多种分类方法的有效结合是该属分类的最好手段。该属分类学的工作重点在于进一步调查种子资源,扩大研究对象,增加分子标记等手段,结合药理学研究以发掘新药源。     

细菌分类学方法研究概况

对细菌分类鉴定中采用的传统分类法、数值分类法、化学分类法、遗传学分类法等多项分类技术作了详细的介绍和全面的总结,从而为临床和科研中选择和应用恰当的细菌分类鉴定方法提供参考依据。     

分子生物学在媒介生物研究中的应用

随着分子生物学及其技术迅猛发展,分子生物学已成为现代生物学研究领域的热点之一,在媒介生物研究中也得到了越来越多的应用,为媒介生物的分类鉴定提供了可测量的指标,对媒介生物的分类地位和进化关系有了更准确的定位.就分子生物学在媒介生物研究中应用的一些新进展做了综述,以期为媒介生物资源的检测开发利用、虫媒病毒的检测分析及所传疾病的诊断和防制策略提供理论依据.     

中国蟋蟀总科昆虫分类学研究概况

简述了中国蟋蟀总科昆虫的分类系统及其分类学的现状;在形态学方面,中国蟋蟀总科昆虫已知230种（亚种）,隶属于10科69属;概述了蟋蟀鸣声和发声器、细胞分类学、分子系统学等3个方面的研究概况.     

DNA条形码技术在昆虫分类学中的研究进展

DNA 条形编码( DNA Barcoding )是一种快速、准确的生物分类技术,它是分子生物学和生物信息学相结合的产物。昆虫种类繁多,近似物种鉴定困难使该技术在昆虫分类工作中得到了广泛应用。文章简要综述了DNA条形码技术的概念、原理与操作步骤,详细阐述了DNA条形码技术在昆虫分类研究中的具体应用情况,对其在应用过程中相比传统形态分类方法的优势和存在问题予以论述,并探讨了DNA 条形码技术今后在昆虫分类中应用的可行性与发展前景。