环介导等温扩增(LAMP)检测禽脑脊髓炎病毒方法的建立

根据已发表的禽脑脊髓炎病毒的VP2基因序列,设计并合成了6对特异扩增禽脑脊髓炎病毒VP2基因片段的引物,通过条件优化,成功建立了针对禽脑脊髓炎病毒的环介导等温扩增(LAMP)检测法,并测定其特异性和敏感性,对采集的禽临床样品的核酸分别进行了检测.结果表明,该法只检出禽脑脊髓炎病毒.敏感性扩增结果表明,Lamp检测禽脑脊髓炎病毒为100fg的RNA模板.该LAMP方法有简便、快速和特异性高的优点,可用于临床上对禽脑脊髓炎病毒的快速检测.     

环介导等温扩增技术快速检测猪细小病毒的试验

利用环介导等温核酸扩增技术(LAMP),建立了一种灵敏、特异、快速的猪细小病毒(PPV)检测方法.该方法针对猪细小病毒非结构蛋白(NS-1)基因保守区域设计6条特异引物,在63℃的等温条件下45 min即可完成反应.最低检测限量为10拷贝的PPV目的基因,比常规聚合酶链式反应(PCR)方法敏感100倍,并具有良好的特异性.以钙黄绿素和Mn2+作为荧光指示剂,可快速、直观判定反应结果.通过对149份临床样品进行检测比较,LAMP与PCR检出阳性样本数分别为33份和27份,表明LAMP方法阳性检出率高于PCR.     

禽呼肠孤病毒RT—LAMP快速检测方法的建立

根据GenBank中登录的禽呼肠孤病毒（Aviem reovirus,ARV）S1基因序列设计了特异对应靶序列中的6个基因区段的4条引物,以此建立了一种快速、准确的ARV逆转录环介导等温扩增（RT—LAMP）检测方法,并对此方法的反应条件进行了优化。结果表明,该方法能够特异地扩增ARV,而对其他常见的禽类病毒均无扩增作用,特异性强、重复性好;检测ARV的灵敏度为4ELD50,是RT-PCR方法的10倍;在反应产物中添加SYBR GREEN Ⅰ染料后,可通过肉眼观察有无荧光直接判定结果。     

环介导等温扩增法(LAMP)在水生动物病害检测中的应用

近年来我国的水产养殖发展迅速,养殖面积和产量都位居世界第一。但是疾病频发一直是困扰水产养殖的一个问题,而病原的快速检测是水产动物疾病防控的前提和关键。随着水产病害基础研究的不断深入,病原的检测技术也得到快速发展。本文介绍了一种新型的核酸扩增技术——环介导等温扩增(l oop-medi at ed i sot hermalampl i f i cat i on,LAMP),综述了近年来LAMP方法在水生动物病害检测领域的具体应用实例和研究进展,并对该方法的应用前景做了展望。     

布鲁氏菌环介导等温扩增（LAMP）可视化检测方法的建立

应用环介导等温扩增(LAMP)技术建立了布鲁氏菌可视化快速检测方法。针对布鲁氏菌外膜蛋白OMP25基因保守区设计6条特异引物,反应前加入染料羟基萘芬蓝(HNB)作为LAMP扩增的指示剂,63℃恒温反应60min,根据HNB的颜色变化进行结果判定。分别评价所建立LAMP方法的特异性和灵敏性,并对60份牛布鲁氏菌病虎红平板凝集试验(RBT)阳性血清样本,经LAMP和B4/B5-PCR方法进行平行检测。结果显示,本方法最低检出限约为17fg布鲁氏菌基因组DNA。本方法特异性良好,布鲁氏菌反应管均出现特异性LAMP扩增反应,而猪大肠杆菌K99、巴氏杆菌C48-1、猪链球菌ST171、绿脓杆菌等对照组均未出现扩增。针对60份RBT阳性血清的平行检测结果显示,LAMP和B4/B5-PCR这两种方法间的结果符合率为85.0%。B4/B5-PCR检测为阳性的43份样品,经本方法检测全部为阳性;B4/B5-PCR检测为阴性的17份样品,经本方法检测,9份为阳性,8份为阴性。LAMP的敏感性高于B4/B5-PCR方法。实验表明,本文所建立的基于颜色判定的布鲁氏菌LAMP检测方法具有特异、灵敏、设备要求简单等特点,适用于基层兽医部门进行布鲁氏菌的快速检测。     

猪圆环病毒2型环介导等温扩增(LAMP)检测方法的研究

本研究介绍了一种便捷、灵敏而又特异的环介导逆转录等温扩增(LAMP)基因检测技术,该技术分别使用特异对应于靶序列中2对特殊引物,并在Bst DNA聚合酶的作用下对靶序列进行等温核酸扩增反应.本研究对LAMP反应体系和反应条件的优化,结果表明PCV-2 LAMP在63℃1 h内能够成功的检测猪圆环病毒2型基因;敏感性和特异性试验表明,本研究能够特异的检测PCV-2并且其敏感度可以达到10个拷贝的DNA分子,初步研究LAMP的阳性检出率与PCR的阳性检出率比较结果为94%符合.以上结果证明,LAMP扩增技术是一种检测程序简便、灵敏度和特异性较高的基因检测手段,在猪圆环病毒2型的快速检测方面具有一定的开发潜力.     

鸭瘟病毒环介导等温扩增(LAMP)快速检测方法的建立与应用

为建立一种简便、快速、灵敏、特异的鸭瘟病毒(DPV)检测方法,本研究根据GenBank中登录的DPV基因组序列,设计3对特异性的环介导等温扩增(LAMP)引物,经优化反应体系,建立了LAMP快速检测方法.结果表明,LAMP方法能够在63℃恒温下,1h内实现目的核酸的大量扩增.结果判定时只需要在扩增产物中加入SYBRGreen Ⅰ染料,就可以直接在可见光或紫外光下观察颜色变化.该方法敏感性可达0.245 μg/L,比普通PCR灵敏性高10倍;对鸭病毒性肝炎病毒、H9N2亚型禽流感病毒、鸭副黏病毒、鸭源偏肺病毒等的核酸无交叉反应;利用建立的LAMP检测方法对40份临床样品的阳性检出率为30％.该方法简便快捷,省时省力,是一种适用于基层实验室快速、准确检测DPV的方法.     

基于钙黄绿素显色的可视化LAMP检测猪流行性腹泻病毒的研究

针对猪流行性腹泻病毒(PEDV)的NP基因设计1套环介导等温扩增(LAMP)引物,在反应体系中添加钙黄绿素/氯化锰指示剂代替传统的反应后添加SYBR Green Ⅰ染料,建立了基于钙黄绿素的可视化LAMP检测PEDV的方法。该方法能在65 ℃ 1 h内特异性扩增PEDV,与猪瘟病毒(CSFV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PoRV)及大肠杆菌等均无交叉反应,检测下限为3.73 pg/μL,其结果可用肉眼判断,快捷方便。用该方法对龙岩学院动物医学研究所接诊的93份腹泻病例进行检测,结果表明,LAMP方法检测PEDV的阳性率为43.01%(40/93),高于普通PCR的检出率(38.7%,36/93)。本试验建立的可视化LAMP检测方法能用于PED诊断。     

肺炎克雷伯菌环介导等温扩增技术检测方法的建立

本研究旨在建立一种环介导等温扩增技术（loop-mediated isothermal amplification,LAMP）检测食品中的肺炎克雷伯菌。选取肺炎克雷伯菌特有的毒力基因区域,设计2对引物（1对内引物、1对外引物）,进行体外恒温扩增反应。对反应体系内的甜菜碱、核酸原料（dNTPs）、内外引物比例、Mg²⁺浓度、反应时间和温度进行优化和选择,并进行特异性和灵敏性试验检测。应用建立的LAMP方法对灭菌鸡肉人工污染加标样品进行检测。结果表明,通过优化试验,筛选到最优反应体系和反应条件;应用优化后的LAMP反应体系对包括肺炎克雷伯菌在内的18种常见微生物进行特异性检测试验,特异性良好。肺炎克雷伯菌LAMP反应体系对基因组的最低检测限是0.875 pg/μL,比传统PCR方法灵敏性高100倍。对人工鸡肉阳性样品进行检测,检测限为30 CFU/mL。本试验成功建立了一种能检测食物中致病肺炎克雷伯菌的LAMP检测方法,该方法利用2对引物针对肺炎克雷伯菌目的基因6个区域进行体外恒温核酸阶梯性扩增,灵敏性更高,反应时间更短,检测成本更低。     

环介导等温扩增技术（LAMP）在肉源性检测中的应用及前景展望

近年来,肉类掺假事件时有发生,给消费者和相关食品安全监督部门造成一定的困扰,同时威胁着消费者的身体健康。传统意义上的检测方法如酶联检测法及PCR法均存在一定的局限性,限制其在市场上进行快速的肉类鉴别。环介导等温扩增(LAMP)是一种新型核酸扩增技术,其灵敏度高、特异性强,不依赖专业仪器设备,操作简单,已开始被广泛应用于食源性微生物的检验。本文从LAMP原理出发,阐述了LAMP技术在肉源性检测中的应用,对LAMP技术的发展前景进行了展望。     

沙门菌LAMP检测方法的建立

建立了一种沙门菌环介导等温扩增(LAMP)检测方法。依据GenBank公布的沙门菌属fimY基因序列,利用Primer Explorer V5软件设计LAMP扩增所需引物,通过LAMP反应条件的优化,建立沙门菌LAMP快速检测方法,并对其特异性和敏感性进行了评价。结果表明,针对fimY基因建立的LAMP方法具有较强的特异性,最低可检出浓度为56×102CFU/mL,灵敏度高于PCR方法 10倍。     

环介导等温扩增技术在转基因饲料成分检测中的应用

本文介绍了一种适合转基因饲料成分检测的新方法—环介导等温扩增技术(LAMP),概述了该方法的原理与特点、应用实例及其在饲料转基因成分检测中的应用展望。     

结核杆菌多位点环介导等温扩增检测方法的建立

为建立一种快速、高敏感、高特异、鉴别结核分枝杆菌和牛分枝杆菌的方法,本研究根据大多数致病性结核分枝杆菌共有序列esat-6,结核分枝杆菌和牛分枝杆菌gyrB共有特异性序列,以及结核分枝杆菌种特异序列mtp40设计6对特异性引物对痰液中的结核分枝杆菌进行检测,并与鉴别培养基分离培养结果以及常规PCR鉴定结果进行比较。实验结果表明,建立的LAMP检测方法具有很高的特异性。可区分致病性结核分枝杆菌和非致病结核分枝杆菌,也可鉴别结核分枝杆菌和牛分枝杆菌。LAMP检测技术的灵敏度比经典PCR技术高100倍左右,可检测到7拷贝/反应。另外,用3种方法同时检测样品发现,LAMP与细菌培养的符合率为90.91%,LAMP与常规PCR检测结果的符合率为100%。LAMP检测方法可以在流行病学调查及现场快速诊断方面广泛应用,并为临床治疗提供依据。     

Direct detection of equine herpesvirus type 1 DNA in nasal swabs by loop-mediated isothermal amplification (LAMP)

We evaluated loop-mediated isothermal amplification (LAMP) as a means of detecting equine herpesvirus type 1 (EHV-1) DNA directly from nasal swabs. To increase the sensitivity, we added a step in which the samples were heat-treated to the original LAMP procedure. The detection limit of the LAMP assay with heat treatment was 10 times more sensitive than the original LAMP assay even when the DNA extraction step was omitted. In addition, the LAMP assay with heat treatment was more sensitive than the original LAMP assay and the polymerase chain reaction using clinical samples. The LAMP assay with heat treatment is easy to perform and so should be applicable to the diagnosis of EHV-1 infections in clinical laboratories.     

Rapid identification of Ochroconis gallopava by a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method

Ochroconis gallopava is a species of dematiaceous fungi recognized as a causative agent of zoonotic and emerging fungal infections. It affects the central nervous system and respiratory tracts of humans, birds and cats. We designed O. gallopava species-specific primer sets to aid in its identification by a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method based on the D1/D2 domain of the LSU rDNA sequence. The LAMP method successfully detected the gene from both fungal DNA and experimentally infected brains and spleens of mice and will be helpful in the diagnosis of O. gallopava infection.     

Rapid detection of group I avian adenoviruses by a loop-mediated isothermal amplification

A loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay was optimized for the rapid detection of Group I avian adenoviruses. A set of six primers was designed from the DNA sequences of hexon genes from Group I avian adenovirus. The assay was performed in a water bath for 60 min at 63 C, and the amplification result was visualized by adding a fluorescence dye reagent or by inspecting the white sediment. The results showed that the LAMP assay could detect all 12 serotypes of Group I avian adenovirus and nine Guangxi Group I avian adenovirus isolates. This avian adenovirus Group I-specific LAMP assay could detect 238 copies of avian adenovirus. No cross-reactions were detected using the LAMP assay with avian adenoviruses type II and III or with other avian viruses. The ability of LAMP to detect Group I avian adenovirus isolates was further evaluated with 184 cloacal swab samples from poultry. In total, 72 out of 184 cloacal swab samples from poultry were identified as positive by LAMP, whereas 45 out of 184 were identified as positive by conventional PCR test. The Group I avian adenovirus specific LAMP results were further confirmed by real-time PCR. This specific LAMP method holds promise as a rapid and specific diagnostic assay for detection of samples from birds suspected of adenovirus infection.     

鲤浮肿病毒环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立及应用

为了给鲤浮肿病(carp edema virus disease,CEVD)的防控提供特异、灵敏、快速的检测方法,针对鲤浮肿病毒(carp edema virus,CEV)的P4a基因序列设计5条特异性引物,建立CEV的环介导等温扩增检测方法(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)。结果表明该方法具有很高的特异性。最低可检出6 000拷贝/μL,检测灵敏度与Real-time PCR方法相当。对30个鲤及锦鲤养殖场样品进行检测并与Real-time PCR方法进行比较,该方法的检测结果符合率达到96.7%以上。本方法的建立及应用为CEVD的防控提供依据。     

利用环介导等温扩增技术对人工感染弓形虫小鼠早期诊断的研究

弓形虫病是由细胞内寄生龚地弓形虫(Toxoplasma gondii)引起的一种人畜共患病.目前本病的诊断主要依靠血清学方法检测特异性抗体.但是在急性感染期由于抗体没有产生,无法对该病做出及时诊断;在免疫力低下和免疫缺陷病人血清中则可能检测不到抗体,往往延误治疗的最佳时机[1].对弓形虫感染早期确诊的需要,使得分子生物学技术PCR被应用于弓形虫病的诊断[2].     

Development of loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for diagnosis of equine piroplasmosis

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel nucleic acid method whereby DNA is amplified with high specificity, efficiency, and rapidity under isothermal conditions using a set of four specifically designed primers and a DNA polymerase with strand displacement activity. In this study, we used LAMP primer sets designed from EMA-1 and Bc 48 genes for detection of Theileria equi and Babesia caballi infections, respectively. These primer sets specifically amplified DNA of the respective parasites. Both primer sets amplified T. equi and B. caballi up to 10(-6) dilution of 10-fold serially diluted samples. Furthermore, DNA extracted from blood collected from a horse experimentally infected with T. equi was amplified by a T. equi LAMP primer set from days 2 to 35 post-infection, demonstrating the high sensitivity of these primers. Of 55 samples collected from China, 81.8% and 56.3% were positively detected by LAMP for T. equi and B. caballi infections, respectively. In contrast, 91.8% and 45.9% of the 37 samples collected from South Africa were LAMP positive for T. equi and B. caballi, respectively. These results suggest that LAMP could be a potential diagnostic tool for epidemiological studies of equine piroplasmosis.