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为了研究重庆地方鸡品种的遗传多样性,试验采用将微卫星标记与荧光标记引物测序相结合的技术进行基因分型,计算各群体在每个位点上的等位基因频率,以及各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)。结果表明:在12个微卫星位点中共检测到88个等位基因,Ne在3.158 5~8.480 6之间,位点平均杂合度在0.416 7~0.875 0之间,品种平均杂合度在0.587 3~0.722 5之间,平均杂合度最高的是南川鸡,最低的是城口山地鸡;3个鸡品种在12个微卫星位点上的基因频率存在明显差异,H为0.659 9,PIC为0.741 2;聚类分析显示,南川鸡和大宁河鸡聚为一类,城口山地鸡独自聚为一类。 相似文献
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利用微卫星标记分析江苏三个地方鸡品种的遗传多样性 总被引:2,自引:0,他引:2
利用30个微卫星DNA标记对3个江苏地方鸡品种进行遗传多样性分析,通过计算等位基因频率、多态信息含量、平均杂合度、有效等位基因数和遗传距离,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关。结果表明:江苏的3个品种在30个微卫星上共发现196个等位基因,其中96个等位基因为三个品种共有,47个等位基因为各品种所特有;3个地方鸡品种的平均杂合度:狼山鸡为0.655,鹿苑鸡为0.681,溧阳鸡为0.687;狼山鸡与溧阳鸡的遗传距离较小,而两鸡与鹿苑鸡的遗传距离较远。 相似文献
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运用微卫星标记对淮南麻黄鸡、皖南三黄鸡和五华鸡3个地方品种遗传多样性进行了分析。在5个座位中,共检测到23个等位基因数,平均有效等位基因数为1.5396,杂合度为0.2920,多态信息含量为0.4156。3个地方品种中,淮南麻黄鸡遗传多样性最低,五华鸡遗传多样性最高。根据5个微卫星座位等位基因频率计算群体遗传一致度和标准遗传距离并构建系统发生树,五华鸡与皖南三黄鸡遗传关系最近,皖南三黄鸡与淮南麻黄鸡最远。研究结果与这些地方品种的地理分布、育成历史相一致,同时也佐证了微卫星标记是研究鸡群体遗传关系的一个有用工具。 相似文献
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江西7个地方鸡品种遗传多样性的微卫星分析 总被引:5,自引:1,他引:5
选用30个多态性较好的微卫星标记.检测了丝毛鸟骨鸡、康乐鸡、宁都三黄鸡、余干乌骨鸡、瓦灰鸡、崇仁麻鸡、东乡绿壳蛋鸡等江西省7个地方鸡品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)、群体间的Nei氏标准遗传距离(Ds)和DA遗传距离。结果表明.30个微卫星位点中有24个微卫星位点在7个鸡群体中的多态信息含量均为高度多态.可作为有效的遗传标记用于鸡品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;在7个品种中.杂合度最低的是余干乌骨鸡.为0.6155.杂合度最高的是崇仁麻鸡.为0.6525,各地方鸡品种的杂合度都偏高,反映了群体的遗传多样性非常丰富;7个鸡品种间的DA、Ds遗传距离远近关系一致.但DA距离均比Ds距离大;用UPGMA法对DA和Ds的聚类结果相同.7个鸡品种被聚为3类.余干乌骨鸡、瓦灰鸡、康乐鸡、宁都三黄鸡聚为一类.崇仁麻鸡、东乡绿壳蛋鸡聚为一类.丝毛乌骨鸡独自为一类。 相似文献
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利用20个微卫星标记对新疆南疆和静县、拜城县、阿合奇县和塔什库尔干县家鸡的203个样本进行检测分析,结果表明,除MCW0248位点(PIC=0.487)外,其它19个位点均为高多态性位点(多态信息含量PIC=0.575-0.920)。四个家鸡群体均显示出较高的多态性水平(观测杂合度Ho=0.455-0.833;期望杂合度He=0.542-0.927),塔什库尔干鸡群体的多态性水平最低。群体间分析表明群体间总体遗传差异不显著,其中拜城县家鸡和阿合奇家鸡群体间遗传差异最小,塔什库尔干鸡与其它三个家鸡群(拜城县家鸡、阿合奇家鸡、和静黑家鸡)之间的遗传距离均大于拜城县家鸡、阿合奇家鸡和静黑家鸡两两之间的遗传距离。Nei氏遗传距离表明拜城油鸡和阿合奇鸡的遗传距离最近,塔什库尔干鸡与其他群体的遗传距离都较远。基于Nei氏遗传距离的UPGMA系统聚类树显示,塔什库尔干鸡聚为一个单独的分支,与其它三个家鸡构成的分支成姐妹群关系,拜城县家鸡和阿合奇家鸡聚在一起,两者之间具有紧密的亲缘关系。塔什库尔干是位于帕米尔高原的一个县,推测由于地理环境与外界相对隔绝,此地的鸡品种与外界的基因交流较少,遗传多样性低,与其它的家鸡品种之间的遗传距离较远,逐渐演变为一个较为独立的品种。 相似文献
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《中国畜牧杂志》2015,(19)
为评估坝上长尾鸡保种群的遗传结构和其他地方品种鸡的遗传关系,本研究利用20个微卫星DNA标记,采用微卫星荧光标记与毛细管电泳相结合的方法,检测了4个地方鸡品种共120个个体的遗传多样性。结果表明:20个微卫星位点中有19个微卫星位点均为高度多态,120个个体中共检测到253个等位基因,单个位点的等位基因数从4(MCW0103)~27(LEI0094)不等,平均为12.65。所有位点的平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0.697 5和0.673 6;所有群体均显示较高的期望杂合度,坝上长尾鸡最高,为0.747 2,太行鸡相对比较低,为0.698 0,平均遗传分化系数为0.098,群体内的近交系数为20.4%,杂合子缺失的水平不高;群体的Nei′s遗传距离从0.059 7(广西麻鸡-太行鸡)~0.689 0(北京油鸡-太行鸡)不等。UPGMA系统发生树中,广西麻鸡和太行鸡聚为一类,然后又于坝上长尾鸡聚在一起。北京油鸡独自聚为一类。UPGMA系统发育树结果与这些鸡品种的外貌形态相吻合。 相似文献