绵羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析

利用PCR-SSCP技术对8个绵羊群体的806个个体的线粒体DNA控制区(D-loop)5′端部分序列进行遗传多样性分析,以探讨山西省的3个绵羊品种(系):山西肉用绵羊母本品系、山西细毛羊和晋中绵羊与其它国内外品种的遗传多样性差异。共检测出6种单倍型,依次记为A、B、C、D、E和F。杜泊和大尾寒羊的主单倍型分别为B和E,其他群体均为F。单倍型多样度以考力代最低,为0.109;其它7个群体的单倍型多样度都较高,最高的为杜泊,达0.741;山西肉用绵羊、山西细毛羊和晋中绵羊的单倍型多样度分别为0.579、0.724和0.624。主成分分析显示山西肉用绵羊和小尾寒羊聚在一起,表明其间亲缘关系较近,与其它6个国内外品种遗传关系较远。     

不同品种绵羊D-loop区遗传多样性研究

线粒体DNA(Mitochondria DNA,mtDNA) D-loop区的进化速度快且多态性丰富,因此在生物的遗传多样性和起源进化研究中具有重要意义.采用PCR扩增和基因测序的方法分析甘肃高山细毛羊(G)、欧拉羊(O)、杜泊羊(D)、蒙古羊(M)、小尾寒羊(S)和湖羊(H)的线粒体DNA D-loop区遗传多样性和...     

中国主要地方绵羊品种遗传共适应的检测及其与近缘物种山羊的比较

【目的】探讨用于遗传共适应分析的合适组合座位模型,为遗传共适应理论增添关于绵羊品种间及与近缘物种山羊间遗传共适应进化机制差异比较的研究内容。【方法】以中国主要地方绵羊品种湖羊、同羊、小尾寒羊、滩羊和洼地绵羊为研究对象,以近缘物种山羊作为对照群体,选择多态程度不同的9个结构基因座。【结果】(1)"显隐性-显隐性"模型不适合遗传共适应的分析;"共显性-显隐性"和"共显性-共显性"模型可用于遗传共适应的分析。(2)对于与具有过多稀有等位基因的Tf座位组合的座位间的遗传不平衡的原因,经典的中性遗传不平衡原理并不能给出合理的解释或解释的原因前后不一致。(3)不同物种、不同品种的遗传共适应系数、遗传不平衡系数以及连锁不平衡系数与座位的组合有关。【结论】(1)在"显隐性-显隐性"组合不存在遗传共适应现象,而在"共显性-显隐性"模型和"共显性-共显性"模型中有可能发现存在遗传共适应现象。(2)由于起源不同,绵羊与山羊间遗传共适应存在较大差异,而绵羊物种内不同品种间由于起源相同,在遗传共适应上差异不大,有趋向一致的倾向。(3)本文首次拟合得到的不同座位组合模型的遗传共适应系数与遗传不平衡系数的回归方程,对于探讨遗传共适应的作用机理与计算具有一定的借鉴意义。     

微卫星标记OarFCB128在5个绵羊品种中的遗传多样性研究

[目的]研究微卫星标记OarFCB128在5个绵羊品种中的遗传多样性。[方法]利用微卫星标记OarFCB128对5个绵羊品种（藏羊、兰州大尾羊、蒙古羊、小尾寒羊、无角道赛特）的基因频率、多态性信息含量、有效等位基因数和杂合度进行分析。[结果]微卫星标记OarFCB128在藏羊、兰州大尾羊、蒙古羊、小尾寒羊、无角道赛特中的多态信息含量、有效等位基因数及群体杂合度分别是0.8404、0.8922、0.9075、0.9094、0.7728,7.2414、11.5140、12.6820、12.8750、5.2674,0.8619、0.9131、0.9211、0.9223、0.8102。[结论]微卫星标记OarFCB128在绵羊品种中的多态性丰富,可用于绵羊遗传多样性评估。     

7个微卫星标记对5个肉用绵羊品种的遗传多样性分析

[目的]为肉用绵羊的品种资源保护和杂交利用提供理论依据。[方法]利用7个微卫星标记分析国外3个绵羊品种和我国2个地方绵羊品种的遗传多样性,研究其品种内遗传变异和种间遗传关系。[结果]从5个绵羊品种中共检测到105个等位基因,在各群体中每个微卫星座位上均可检测到5个以上等位基因,说明7个微卫星标记含有丰富的遗传信息。位点平均杂合度和品种平均杂合度分别为0.790 1~0.889 7和0.795 1~0.867 5,属于高度杂合位点和高度杂合品种。7个位点均为高度多态位点,PIC为0.762 6~0.879 6,而5个绵羊品种的平均PIC为0.770 3~0.865 0。NJ系统树分析表明3个国外绵羊品种遗传关系较近。[结论]7个微卫星标记均具有高度多态性,可用于绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。     

中国西北6个地方绵羊品种mtDNA的遗传多样性研究

基于PCR-SSCP和克隆测序技术,分析了西北6个绵羊品种的群体内和群体间的遗传变异,通过对DNA序列的多重比对,得出A、B、C 3种单倍型,在D-loop区内的碱基替换全部为转换;绵羊mtDNA D-Loop区中存在着明显的长度变异,引起变异原因主要是由于1个或几个碱基或串联重复基元序列的插入(或缺失)造成的,不存在绵羊品种特异性;本试验研究的绵羊在各个不同片段中所扩增出的A、B、C 3种单倍型基本一致,但不是完全连锁,存在着微小的差异;用NJ法构建了系统进化树,可明显看出中国6个绵羊品种3种单倍型的分类情况,单倍型树表明新疆的巴音布鲁克羊和卡拉库尔羊之间的遗传关系最近.     

利用微卫星DNA标记分析贵州3个地方猪种的遗传多样性(英文)

[Objective] The research aimed to provide the genetic basis for the protection, development and utilization of Guizhou local pig breeds. [Method] From 27 pairs of porcine microsatellite primers recommended by Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) and International Society for Animal Genetics (ISAG), six pairs (S0155, SW240, IGF1, SW951, SW857, SW24) were selected for microsatellite DNA detection of three Guizhou local pig breeds, including Nuogu Pig, Kele Pig and Guanling Pig. Subsequently, their genetic diversities were analyzed. [Result] The three pig breeds were high polymorphic at the six microsatellite loci (PIC>0.5). The Nei's standard genetic distance of them was 0.206 3-0.481 5. The genetic distance between Nuogu Pig and Kele Pig was the closest, and that between Nuogu Pig and Guanling Pig was the furthest. [Conclusion] The three Guizhou local pig breeds are in high genetic diversities. Nuogu Pig is a special type of Kele Pig, an excellent Chinese local pig breed.     

利用微卫星DNA标记分析贵州3个地方猪种的遗传多样性

[目的]为贵州地方猪种的琛护开发与利用提供遗传学依据。[方法]根据联合国粮农组织（FAO）和国际动物遗传学会（ISAG）联合推荐的27对猪微卫星引物,从中筛选出6对（S0155,SW240,IGF1,SW951,SW857,SW24）,用于对糯谷猪、柯乐猪、关岭猪3个贵州地方猪群体进行微卫星DNA检测,进而分析其遗传多样性。[结果]3个品种（类型）猪呈高度多态（PIC〉0．5）,Nei氏标准遗传距离为0．2063～0．4815。群体间遗传距离最远的是关岭猪与糯谷猪,最近的是柯乐猪与糯谷猪。[结论]3个贵州地方猪种的遗传多样性较好;糯谷猪是中国优良地方猪种柯乐猪中的一个特殊类型。     

利用微卫星DNA标记分析贵州3个地方猪种的遗传多样性

1材料与方法 1．1材料 采集3个地方猪种血液样品,共90份（表1）。采集个体品种特征明显,公母各半。     

中国小型猪品种遗传多样性的RAPD研究

小型猪是地方猪品种中的宝贵资源。我国有 4个小型猪品种 ,即香猪、五指山猪、藏猪和滇南小耳猪[1 ] 。这些猪成年体型较小 ,体重 30kg左右 ,在解剖学和生理学上与人颇为相似 ,因此可作为理想的实验动物模型和异种器官移植供体。随机扩增多态DNA(randomamplifiedpolymor phicDNA ,RAPD)是 2 0世纪 80年代末发展起来的一种分子标记 ,因其数量多、检测快捷方便 ,已成为目前动植物群体遗传变异和遗传关系研究的常用技术。周俊玲等采用RAPD标记对二花脸和杜洛克的遗传变异进行检测和分析[2 ] ,刘德武等利用RAPD标记分析兰塘猪、大花白猪…     

六个绵羊品种遗传距离的微卫星分析

利用30个微卫星DNA标记对乌珠穆沁羊、苏尼特羊、内蒙古细毛羊、宁夏滩羊、小尾寒羊和无角多赛特羊共237个体进行遗传距离分析,结果表明：（1）苏尼特羊和乌珠穆沁羊遗传距离为0．0833最小,无角多赛特羊与其它5个绵羊品种的遗传距离在1．0146-1．2876之间,滩羊、内蒙古细毛羊和小尾寒羊彼此之问及与乌珠穆沁羊和苏尼特羊的遗传距离为0．3623-0．6020;（2）聚类图将6个绵羊品种划分为4个分支,即苏尼特羊和乌珠穆沁羊,内蒙古细毛羊和小尾寒羊,宁夏滩羊,无角多赛特羊。（3）6个绵羊品种间遗传距离和聚类图与品种的历史演化和资料记载基本符合,为绵羊种质资源的利用和保护提供了科学依据。     

Analysis of the Genetic Diversity and Origin of Some Chinese Domestic Duck Breeds

Twelve fluorescence-labeled microsatellite markers were used to analyze the genetic diversity of 12 domestic duck breeds and 2 wild duck breeds to determine the relationship and origin of Chinese domestic duck breeds. Gene frequency, effective number of alleles （Ne）, expected heterozygosity （He）, polymorphism information contents （PIC）, inbreeding coefficient in population （Fis）, standard genetic distance （Ds）, and genetic distance （DA） were calculated by FSTAT and distance and phylogenetic analysis after the dates which were output from the Microsatellite-Toolkit software. Genetic distances between 12 domestic duck breeds and 2 wild duck breeds were analyzed by variance analysis. Unweighted pair group method with arithmetic mean （UPGMA） and phylogenetic trees used for cluster analysis were structured. The results indicated that 11 loci had medium- or high-level genetic diversity among the 12 loci, which could be efficiently used in the detection of the genetic parameters of each population. The values of He were 0.5414 to 0.7343, those of PIC proved similar, and those of Fis were 0.1101 to 0.3381 among all populations. All breeds were clustered into three groups by UPGMA phylogenetic trees. Banzui duck was clustered into a separate group. Differences of the DA were analysed by t-test. The results showed that difference in DA between the 12 domestic duck breeds and Lvtou duck and the Banzui duck were very significant （P〈0.01）, indicating that these 12 domestic duck breeds originated from Lvtou wild duck, but not Banzui duck.     

Study on Genetic Diversity of Some Cattle Breeds

Four microsatellites IDG VA-11, IDG VA-27, IDG VA-44 and IDG VA-46 were used to analyzegenetic diversity of five cattle breeds. The average gene diversity of the four loci was 0. 57, of which IDG VA-11 was 0.66. Genetic diversity of five cattle breeds was 0.57, Nanyang was the highest 0.66, Yanbian andKorea cattle were 0.51 and 0.53, respectively. The fact that the observed diversity was lower than expected inSimmental and Piemontese crossbred showed existing selection and inbreeding impacts. The gene flow betweenYanbian and Korea cattle, and that between Simmental and Piemontese crossbred were as high as 23.79 and7.15 for each pairs of them, which showed their closer origins.     

部分黄牛品种(群体)遗传多样性分析

 用 4个微卫星位点分析了延边牛、南阳牛、西门塔尔牛、皮埃蒙特杂种牛和韩国牛的遗传结构。结果表明 ,4个位点平均基因多样性为 0 .5 7,IDVGA 11位点最高 ,为 0 .6 6 ;5个品种的遗传多样性平均为 0 .5 7,南阳牛达0 .6 6 ,延边牛和韩国牛的多态性相对较低 ,西门塔尔、皮埃蒙特杂种的观测多样性明显低于期望的多样性 ,反映存在选择和近交 ;延边牛和韩国牛、西门塔尔牛与皮埃蒙特杂种牛之间有很高的基因流 ,说明它们的来源相近 ,由于品种间杂交 ,延边牛和西门塔尔牛、皮埃蒙特杂种牛和南阳牛之间也有较大的基因流 ;群体间遗传距离与基因流结果相符。     

利用微卫星标记分析3个鹅品种的遗传多样性

为进一步验证伊犁鹅与非洲雁的起源,以伊犁鹅、灰雁、非洲雁为对象,利用微卫星标记技术对3个鹅品种资源的遗传多样性进行研究。结果表明,5对微卫星引物在3个品种的平均期望杂合度(He)为0.513 5~0.644 7,平均多态性信息含量(PIC)为0.425 8~0.588 3。3个品种的平均杂合度都较高,非洲雁最高(0.573 7),伊犁鹅最低(0.546 6),说明各鹅品种的杂合度和遗传多样性水平都较高,而且杂合度的高低与PIC的大小有较高的一致性。通过计算Nei’s标准遗传距离发现,3个品种的遗传距离较远;UPGMA聚类结果将新疆的伊犁鹅和灰雁聚为一类,再与非洲雁聚到一起。     

湖北省3个地方鸭品种遗传多样性研究*

 通过选用28个多态性较好的微卫星标记，检测了湖北3个地方鸭品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度（H）、多态信息含量（PIC）和群体间的标准遗传距离（D_s）。结果表明：28个微卫星位点中有26个微卫星位点在3个鸭群体中的多态信息含量均为高度多态，可作为有效的遗传标记用于各鸭品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。3个鸭品种中，平均杂合度范围是0.596~0.603，各鸭种的杂合度都较高，最高的是荆江麻鸭（0.603），最低的是沔阳麻鸭，而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性。对D_s遗传距离的计算表明：用UPGMA法进行聚类分析，结果3个鸭品种被聚为2类：荆江麻鸭和沔阳麻鸭为第1类；恩施麻鸭为第2类。这与各鸭品种的起源、分化、选育历史及地理分布基本一致。本研究结果为中国地方鸭品种种质特性研究提供了基础，也为中国地方鸭品种资源的合理保护和开发利用提供了科学依据。     

家养梅花鹿品种Y染色体遗传多样性和父系遗传结构

为研究家养梅花鹿的遗传多样性及遗传结构,利用PCR直接测序法,测定了我国培育的家养梅花鹿品种和品系389头雄性梅花鹿Y染色体AMELY基因部分序列,针对测序得到的序列利用生物信息学软件进行分析,筛选出6个SNPs位点,得到了6种单倍型(H1、H2、H3、H4、H5和H6)。结果表明:我国家养梅花鹿Y染色体遗传多样性较低,种群之间没有发生显著的遗传分化。单倍型H1为优势单倍型,在种群中有较高的频率,其次为单倍型H2,其他单倍型频率较低。     

Analysis of Genetic Diversity and Relationships of Seven Chinese Indigenous Pig Breeds and Three Exotic Pig Breeds Using the DNA Differential Display Technique

The genetic diversity and relationships of seven Chinese indigenous pig breeds （Meishan, Erhualian, Hezuo, Bamei, Qingping, Tongcheng, and Huainan） and three exotic pig breeds （Large White, Landrace, and Duroc） were analyzed using the DNA differential display technique by means of eight primer combinations. A total of 123 reproducible bands were used to calculate mean Nei＇s gene diversity, and mean Shannon＇s information index for each pig population. Based on these the Nei＇s standard genetic identity and distance were estimated, which was used to construct a dendrogram tree for the 10 pig breeds. The experimental results obtained and the method used in this study for evaluating the genetic diversity and relationships of pigs were also discussed.     

利用结构基因座分析中国蒙古羊系统内部分不同生态型绵羊品种遗传分化关系及距离隔离机制

 【目的】探讨蒙古羊系统内部分品种间的遗传分化关系,揭示蒙古羊系统内主要不同生态型地方绵羊品种形成的地理距离隔离机制。【方法】以中国蒙古羊系统内5个地方绵羊品种,湖羊、同羊、小尾寒羊、滩羊和洼地绵羊为研究对象,以多座位电泳法检测5个地方绵羊品种的20个结构基因座（包括Al、Gc、Tf、Cp、Alp、Ary-Es、Lap、Hb-α、Hb-β、Xp、CA、Dia-I、Dia-Ⅱ、MDH、GPI、EsD、α2-M、Cat、Ly和Ke）的变异。【结果】5个绵羊群体间的系统发生关系不满足距离隔离模式,绵羊群体间的遗传分化关系的远近与其地理分布并未表现出紧密的线性相关。【结论】5个绵羊品种分别起源于不同时期的蒙古羊始祖群体,同时在品种间存在一定程度的基因交流,并在各自特有的生态环境中经历不同程度的自然选择和人为选择培育而成。