SSR标记检验玉米杂交种子纯度核心引物的构建

利用50对SSR引物对收集到的18个玉米杂交种及其亲本进行SSR标记分析,以期筛选一套适于玉米杂交种纯度鉴定的核心SSR引物。试验结果表明,50对SSR引物在18个杂交种及其亲本中,有20对引物扩增出多态性特异条带,进一步对20对引物进行重复试验和PCR反应条件的优化,筛选出了8对SSR标记引物,分别在18个玉米杂交种及其亲本中扩增到了条带清晰、多态性好的条带,可用于其玉米杂交种子纯度鉴定和检验。这为玉米杂交种种子真实性和纯度检验、解决玉米种子质量纠纷提供了更为准确可靠的参考依据。     

基于单拷贝SNP标记的棉花杂交种纯度高通量检测技术

利用有代表性的材料进行SNP位点的全基因组扫描分析与综合评估,基于KASP技术开发1套适用于我国棉花杂交种纯度高通量检测的核心SNP组合。从63K的棉花全基因组芯片中筛选获得具有单拷贝特性的SNP标记分别为5474个(中棉所TM-1基因组版本)和1850个(南京农大TM-1基因组版本)。根据芯片扫描分析结果,权衡考虑位点多态性、分型效果、纯合率与杂合率等因素,最终从每条染色体上优选1个杂交种杂合率高且分型效果理想的核心SNP位点,合计26个。采用KrakenTM软件将SNP位点转化成KASP标记,利用SNPline平台进行SNP分型检测,实现了对大量样品的高通量基因分型,尤其适用于品种纯度快速检测,为SNP标记技术在棉花品种鉴定及指纹数据库构建等方面的应用奠定基础。     

玉米杂交种纯度检测方法及其评述

玉米杂交种纯度鉴定问题是当前我国种子工作中的重点与难点问题之一，也是玉米种子质量管理中的迫切需要解决的问题。根据玉米不同品种间各种性状的差异和不同纯度鉴定方法的适应性与特点，合理地选择适宜的方法进行纯度鉴定可以为种子工作提供可靠的依据，为玉米增产提供有力的保障。     

花菜类杂交种纯度鉴定SSR核心引物筛选

采用SSR分子标记方法对70份青花菜及花椰菜杂交种进行DNA指纹分析,根据多态性和杂合率2个指标,确定一套适于花菜杂交种纯度鉴定的SSR核心引物。结果表明,BoGMS0624、OI11G11 和 BoGMS0941等3个SSR 标记的多态性和杂合率较高,利用这3个引物进行鉴定,共有68个品种(占97%)为杂合带型,可作为花菜品种纯度检测的核心引物;此外本研究还筛选出 11个品种的纯度鉴定特异引物,可以满足快速检测的需求。     

提高玉米杂交种纯度的对策

玉米杂交种纯度的高低,直接关系到玉米生产的丰歉。１９９０以来,我国的玉米杂交种质量出现大幅度滑坡。为此,农业部玉米检测中心从１９９５年起连续三年进行抽查。从抽检结果看,合格率呈上升趋势,但无根本性转变。笔者认为,造成这种现状的原因是：玉米自交系纯度低...     

6个玉米杂交种种子纯度的SSR鉴定

玉米杂交种纯度是影响玉米产业发展的重要因素之一,建立快速、准确可靠的纯度检测技术是控制杂交种纯度的有效措施。从30对SSR引物中筛选出6对表现为双亲互补型的引物,建立了6份杂交种纯度鉴定的SSR体系。Umc1002、bnlg1112、bnlg238、Umc1153、phi072、bnlg240可分别用于玉米杂交种农大108、浚单20、郑单958、莱农14、莱农15和鲁玉16的纯度检测。双亲互补型等位变异基因频率在0.028～0.072之间,可较准确地检出样品中的自交株和大部分异型株。SSR鉴定玉米杂交种纯度结果略低于幼苗鉴定,但二者差异不显著,相关系数为r=0.8434。本试验建立的SSR技术体系可用于6个玉米杂交种纯度的快速检测。     

利用冬暖式大棚鉴定玉米杂交种子纯度

玉米杂交种质量高低，纯度是首要指标。如何确保种子纯度，是一项非常重要的工作。对玉米杂交种来讲，室内检验虽是一个重要方面，但由于受一些客观条件限制，准确性差。3a来，我们利用冬暖式大棚鉴定玉米杂交纯度，取得了较好的效果。……     

利用叶龄数鉴定玉米杂交种纯度

玉米杂交种的纯度鉴定有多种方法.不同的方法各有其优缺点.但最准确最可靠的鉴定方法还是田问种植鉴定.传统的田间种植鉴定方法虽最为准确可靠,但因鉴定周期长、费用高,应用有很大局限性.     

应用SSR标记技术鉴定玉米杂交种纯度

以张玉1号、纪元1号、蠡玉6号、万佳11杂交种及其各自亲本为实验材料．利用16对玉米SSR引物进行SSR扩增,筛选出了适合该杂交种纯度鉴定的SSR引物．建立了一套利用SSR标记技术快速、准确、简便易行地进行玉米杂交种纯度鉴定的技术。     

玉米杂交种纯度鉴定新方法——冬暖式大棚种植鉴定

随着农业生产的不断发展,玉米杂交种子的纯度也越来越被种子部门和广大群众所重视。全国每年都有因种子纯度达不到国家标准而被送上法庭的单位和个人。我公司针对这一问题,根据当地情况,采用了冬暖式大棚种植鉴定玉米种纯度的方法:即把当季所收或调入的玉米杂交种,种入冬暖式大棚,另加标准对照种作对照对各生育期进行观察、记载、对比。最后鉴定出玉米杂交种纯度的新方法,从而为销售玉米杂交种子的纯度提前做好鉴定。1　冬暖式大棚的建造建造冬暖式大棚的时间应为秋收后(夏玉米收获后,10月1日前后),跨度7m中后坡(屋脊至北墙南侧1.67m),拱形…     

基于高通量测序开发玉米高效KASP分子标记

SNP (Single Nucleotide Polymorphism)在基因组中数量多、分布广,适用于大规模、自动化基因型检测。本研究利用205份不同来源的玉米自交系全基因组重测序数据鉴定出一系列多态性高的二态性SNP位点并开发出700个KASP分子标记。其中, 202个在46个玉米代表系中得到验证的KASP标记进一步用于系统进化树构建及群体结构分析。结果显示,开发成功的KASP标记在染色体上分布均匀,平均PIC为0.463,平均MAF为0.451。基于KASP标记位点和总SNP位点的聚类分析结果高度吻合。KASP标记位点与总SNP位点的遗传距离相似性系数高达89.5%,能成功区分玉米的杂种优势群。该KASP标记可在玉米种质资源分析、连锁群构建以及杂种优势群划分等方面发挥重要作用。     

Development and mapping of gene-tagged SNP markers in laccases of maize (Zea mays L.)

Laccases, EC 1.10.3.2 or p -diphenol : dioxygen oxidoreductases, have been proposed to be involved in the oxidative polymerization of monolignols into lignins in plants. While 17 laccases have been identified in Arabidopsis , only five ( ZmLac1–5 ) have so far been identified in maize. By a bioinformatic approach, 14 putative laccases were identified in maize. One putative laccase was identical to ZmLac1 , while five were highly homologous to either ZmLac4 or ZmLac5 . Sequence alignment of allelic sequences enabled the development of TaqMan single nucleotide polymorphism (SNP) markers for nine putative laccases. Four of these gene-tagged SNP markers were validated in a doubled-haploid mapping population of 140 individuals, mapping these loci to chromosomes 1, 2, 3 and 7, respectively.     

Application of isozyme electrophoresis for purity testing and cultivar identification of F1 hybrids of Brassica oleracea

Summary Six isozyme genes were analyzed in seed samples of 65 commercial F₁ hybrids of four horticultural groups of Brassica oleracea (cabbage, Brussels sprouts, sprouting broccoli and cauliflower). Results obtained from electrophoretic assays led to the following conclusions: 1) the electrophoretic test of F₁ hybrid purity was possible in 59 (91%) of the hybrids analyzed, since their inbred parents were apparently fixed each for a different allele in at least on of the loci studied; 2) forty-eight (74%) of the hybrids were individually distinguished by their isozyme phenotype; 3) high levels of segregation in the inbred parents were inferred from the analysis of a sample of seeds of each hybrid.     

适于陆地棉品种身份鉴定的SNP核心位点筛选与评价

利用全基因组SNP信息, 筛选陆地棉品种特异的核心SNP位点组合, 可为陆地棉品种身份鉴定提供准确高效的检测手段。本研究利用棉花CottonSNP80K芯片对326份不同来源的陆地棉种质进行SNP分型。以南京农业大学陆地棉TM-1基因组Gossypium hirsutum (AD1) genome NBI v1.1版本为参考序列, 对SNP位点进行注释。结果表明, 93.85% (72 990/77 774)的位点检出率超过99%, 61 595 (79.20%)个SNP位点具有多态性, 其中76.32% (47 009)的位点最小等位基因频率(MAF)大于0.1。基于位点检出率大于0.99、位点具多态性、MAF大于0.2、杂合率小于0.05、每条染色体的SNP密度为400 kb/SNP左右等要求, 最终获得4857个覆盖全基因组的高质量核心SNP位点组合。这些核心SNP位点组合平均检出率接近100%; 平均MAF值为0.34; 平均杂合率为0.02; 99%以上的陆地棉材料均能够被准确鉴定。统计分析表明利用核心SNP位点组合与CottonSNP80K的鉴定结果呈极显著相关。本研究提供了包含4857个SNP位点, 适于陆地棉品种指纹图谱绘制的核心SNP位点组合, 可实现陆地棉品种身份鉴定和品种确权。     

不同玉米杂交品种吐丝持续期特性及其对播期的响应

吐丝期是决定玉米产量的关键时期,研究其相关特性,对玉米生产意义重大。为准确分析不同玉米品种吐丝特性的差异及其对播期的响应,于2014年和2015年设置了3个玉米主推品种(郑单958、先玉335和京科968)的3个播期处理(早播:4月10日,中播:5月10日,晚播:6月10日),分析了各个处理间吐丝持续期的差异以及吐丝持续期与雌穗穗长变异及产量构成因素的关系。结果表明:(1)群体吐丝持续期在品种间存在显著差异,表现为先玉335 (9.12 d)郑单958 (8.94 d)京科968 (7.68 d)。随时间推进,玉米每天吐丝的比例与天数为先升高后降低的二次函数关系,每天最大吐丝比例为先玉335 (16.51%)郑单958 (17.07%)京科968 (19.98%)。京科968较郑单958和先玉335呈现吐丝集中,每天吐丝比例较高、吐丝持续期短的特点;(2)吐丝持续期在不同播期间差异显著,郑单958、先玉335和京科968不同播期间的吐丝持续期变幅分别为8.10～9.55 d、7.54～10.53 d和6.65～8.66 d,郑单958的吐丝持续期在不同播期间最稳定(CV=6.57%),其次为京科968 (CV=9.40%),先玉335的吐丝持续期在不同播期间的变化最不稳定(CV=11.68%);(3)吐丝持续期与雌穗穗长的变异系数呈显著正相关,与产量和穗粒数呈显著负相关,与千粒重不相关。播期对玉米吐丝持续期具有显著的调控作用。随吐丝持续期增加,玉米雌穗穗长的变异系数显著增大,群体果穗的整齐度降低,穗粒数显著减少,是玉米产量显著降低的主要原因。     

利用种子蛋白聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定向日葵种子纯度的研究

采用种子贮存蛋白SDS-PAGE技术，对13份向日葵杂交种和自交系进行了鉴别，结果表明，它们的种子蛋白电泳图谱差异明显，特征谱带稳定。种子蛋白电泳鉴定与田间小区种植鉴定种子纯度结果之间存在极显著的线性正相关性。该技术可作为向日葵杂交种和自交系种子纯度鉴定的一种新手段。     

甘蓝型CMS杂交油菜品种种子纯度的分子鉴定及其吻合率研究

本研究在大量引物筛选和重复验证的基础上对目前生产上大面积推广的CMS杂交油菜品种秦优7号、秦杂优1号及其对应亲本进行了RAPD标准图谱的构建,并规模化的对该两杂交种的生产商品用种种子纯度进行了检测。对所检样品所代表的种子群体进行了大田吻合率比对研究和群体纯度跟踪,结果显示两品种的室内检测结果和田间表现的单株育性吻合率皆在97%以上,这表明利用该技术进行杂交油菜种子纯度分析方法是可靠的,该方法在连续5年上百份样品、数万单株和20多万公斤的杂交油菜种子纯度分析应用实践中得到检验和证明。     

The use of AFLP markers for the identification of carrot breeding lines and F1 hybrids

Four inbred lines of carrot (cytoplasmic male‐steriles and corresponding maintainers) and eight of their F₁ hybrids were studied with the amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique to examine their genetic relationship and produce markers useful for testing hybrid seed purity. Eighty‐six polymorphic amplicons were identified in bulked DNA samples using eight primer pair combinations. Genetic distance was estimated on the basis of the presence or absence of polymorphic bands. The dendrogram plotted on the basis of the AFLP data closely represented the pedigree relationships of the lines and their hybrids. From one to six amplicons specific for a breeding line were identified. Most of them were also present in the DNA bulks of respective F₁ hybrids. However, screening performed on individual plants of two parental lines and the corresponding hybrid indicated insufficient uniformity of parental lines, limiting the applicability of AFLP markers for testing hybrid seed purity.     

Identification of QTLs for niacin concentration in maize kernels

A genetically induced increase in the niacin concentration of maize kernels is important for the improvement of kernels nutrition. In this paper, the correlation, heredity and variation of free niacin concentration and total niacin concentration in maize kernels were analysed. The results showed that a low or moderate correlation existed between free niacin concentration and total niacin concentration, and that the heritabilities of the two traits were approximately 70%. Quantitative trait loci (QTL) analysis showed that qFNA4a‐HC and qTNA4a‐HC were detected to have a common marker, umc1294 (Bin4.02), in different populations. In population A, qFNA8b and qTNA8a were detected in two generations or two sites, qTNA8c‐F₂ and qFNA8b‐HC have a common interval. These QTLs explained 9.7%–17.3% of phenotypic variation. In population B, qFNA4a, explaining 9.3%–11.2% of phenotypic variation, was detected in two environments. Two marker intervals, umc1294‐bnlg490 (Bin4.02‐4.03) and umc1959‐umc1562 (Bin8.05), harbored the QTL for free niacin concentration and total niacin concentration. Furthermore, among a total of 78 QTLs obtained from all datasets, 19, 9 and 9 QTLs were located in Bin8.05‐8.06, Bin4.02‐4.04 and Bin10.01‐10.03, respectively.