广西鸡传染性支气管炎病毒地方分离株核蛋白基因的遗传变异分析

应用RT-PCR方法扩增了广西1985～2008年的24株传染性支气管炎病毒(IBV)分离株的核(N)蛋白基因,并对此24株IBV的N蛋白基因进行了克隆、序列测定及分析.结果发现24株IBV分离株N蛋白均舍有一个长1 230 bp的开放阅读框,编码由409个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的缺失和插入,但存在较多点突变现象.与疫苗株H120核蛋白的3个保守碱性氨基酸区序列进行比较分析发现,大多数毒株在183～232位存在较多的氨基酸替代现象,部分毒株在334～363位也存在较多的氨基酸替代现象.与GenBank中的13个IBV参考毒株N蛋白基因序列进行比较分析,发现2004～2008年的21个分离株中有19个分布于第Ⅰ群中;1985～1988年的3个分离株之间N蛋白核苷酸及其推导氨基酸的同源性均达99%以上,均属于第Ⅲ群中,可见广西不同时期的IBV分离株在N基因进化关系上形成了自己独立的进化群.同时研究还发现GX-NN5分离株可能为基因重组病毒.以上结果表明了广西IBV毒株存在基因突变和基因重组现象.     

鸡传染性支气管炎病毒地方分离株核蛋白基因的遗传变异分析

对2006-2009年从山西各地疑似传染性支气管炎的病例中分离到的7株IBV地方分离株的核蛋白基因片段进行序列测定及分析。结果发现,7株IBV地方分离株核蛋白基因有5株含有一个长1 230 bp的ORF,其余2株含有1 227 bp,编码410/409氨基酸残基组成的多肽,与常用疫苗株H120推导的氨基酸序列比对发现,存在基因突变现象。与GenBank中的34株国内外分离毒株核蛋白基因推导的氨基酸序列进行比较和分析,系统进化关系显示41株IBV毒株分属于4个群,至少有3个群在我国流行,7个分离株分布在第Ⅳ群中,第IV群大多来自我国的北方地区地方分离毒株,第Ⅱ群来自我国南方地区的部分地方分离毒株,从N基因推导氨基酸进化树上分析可见,我国的IBV地方分离毒株主要分布在第Ⅱ和第Ⅳ群中,具有较明显的地理区域性,可见IBV地方分离株在基因进化关系上形成了自己较为独立的进化群。     

鸡传染性支气管炎病毒中国地方分离株S1基因5''端的变异

对自海南海省、广西省发生鸡传染性支气管炎（IB）鸡群分离的4株IBV分离株（HaN-1/95、HaN-2/95、GX-1/98、GX－2／98）的主要免疫原纤突蛋白S1基因经RT－PCR扩增其5'端的1．2kb的目的片段，将其插入载体pMD 18-Tk ,在大肠杆菌中实现目的的基因的克隆。对克隆的目的基因经限制性酶切分析及PCR鉴定后，以双脱氧链终止法测定其核苷酸序列，并与GenBank中的参考毒株（H120、SD－1／97和Holte）相应序列作比较，分析其同源性。结果表明，HaN-1/95、HaN-2/95、GX-1/98及SD－1／97与疫苗株H120的核苷酸序列同源性分别为99．5％、99．2％、97．9％和99．5％，其推导氨基酸序列同源性分别为99．1％、98．9％、96．9％和99．2％。GX－2／98与Holte株的核苷酸序列同源率为99．0％，其推导的氨基酸序列同源性为98．6％，而与其他中国分离株的核苷酸序列的同源性仅为70％左右，氨基酸序列的同源性仅为68％左右。     

鸡传染性支气管炎病毒中国地方流行株的分离与鉴定

对海南省和广西省的几个发生呼吸罗音、鸡群全群发病、死亡率不高的疑是鸡传染性支气管炎病（IB）的鸡群，进行了病毒分离和鉴定。结果分离到了4株IBV分离株（HaN-1/95、HaN-2/95、GX－1／98、GX-2/98），并对分离病毒进行了病毒的致病性、病理组织切片、鸡胚矮小化、对NDV的干扰、电镜特征等生物特性鉴定及IBV基因组特异性3′末端非编码区的一段保守序列的RT－PCR和巢氏PCR鉴定。结果表明4株IBV分离株，均能产生呼吸困难、罗音等临床症状；病理组织切片，气管、肾脏等组织表现为上皮细胞受损、固有层充血、出血和淋巴细胞的浸润及组织坏死；对NDV－B1株有明显的干扰作用；其各自的传代物都有明显的致鸡胚矮小化作用；在透射电镜下观察到典型的冠状病毒粒子，多数近似为圆形，直径75-200nm，有囊膜，表面有一圈杆状纤突排列成花冠状，符合IBV的典型特征；基因组3′末端UTR的RT－PCR和巢氏PCR鉴定，4个分离株分别都扩增到293bp和172bp的特异目的片段，通过测序比较毒株间的核苷酸序列同源性在99％以上，与GeneBank中IBV H52等标准株的3′末端UTR的核苷酸序列高度同源。以上结果表明4株分离病毒都是IBV，为下一步的IBV分子流行病学的研究打下了基础。     

鸡传染性支气管炎病毒DB株核蛋白基因的克隆及在杆状病毒系统中的表达

利用PT－PCR方法扩增鸡传染性支气管炎病毒（IBV）DB株的核蛋白基因，并对其序列进行了测定，DB株IBV的核蛋白基因长度为1230bp，编码蛋白由409个氨基酸残基组成。与已发表的参考毒株进行核苷酸同源性比较，发现DB株与澳大利亚群毒株的亲缘关系最为密切。同时构建了杆状病毒重组转移载体pBlue-DB-N，将其与线性化的杆状病毒DNA共转染Sf9昆虫细胞，经过3轮蚀斑纯化和聚合酶链式反应（PCR）鉴定，获得重组杆状病毒rBac-DB－N。SDS－PAGE分析和Western blot检测的结果表明DB株IBV核蛋白基因基因在重组杆状病毒感染原Sf9昆虫细胞内获得表达，融合蛋白最大表达量占细胞蛋白总量的19．4％左右。     

我国鸡传染性支气管炎病毒地方分离株生物学特性的研究

从我国新疆维吾尔自治区某鸡场发病症状及病理变化疑似鸡传染性支气管炎的病鸡有出血点病变的腺胃组织中分离病毒，在9－11日龄SPF鸡胚上连续传代9次，通过病毒对鸡胚的致病作用、病毒在电镜下的形态观察、病毒在鸡胚中的增殖动态变化、病毒在CEF中的增殖特性、凝集鸡红细胞的特性以及动物回归试验等来研究我国鸡传染性支气管炎病毒地方流行株的生物学特性。结果表明，该毒株的第一代尿囊液对鸡胚无肉眼可见的致病作用，当继代到第5代后，胚体严重病变；电镜观察该病毒为典型的冠状病毒；病毒在鸡胚中随着接种病毒时间的延长，其效价增高，96小时可达到48小时的1倍，该毒株可在CEF上生长，但不能形成明显的蚀斑；并且经1％胰酶处理后可疑集鸡红细胞；鸡胚的第4代尿囊液病毒回归动物体，可致鸡病变病死鸡肾脏病变尤为明显，呈典型的花斑肾，腺胃则未见肉眼可见的病变，接种鸡、同居鸡和对照鸡之间NDV疫苗免疫后其HI抗体水平无明显差异，但从发病症状来看，IBV对ND疫苗具有干扰作用。     

鸡传染性支气管炎病毒国内分离株核蛋白基因的克隆与序列分析

本研究参考已发表的鸡传染性支气管炎病毒核蛋白基因序列，设计了一对核蛋白基因的特异性引物NP5、6，经RT-PCR扩增得到了IBV国内分离株DB株、XJ株、DC株、HD株的1199bp的核蛋白基因片段，并进行了克隆和序列测定。将4个国内分离株核蛋白基因的序列与国外发表的参考毒株的核蛋白基因序列进行了比较和分析，结果显示这4个毒株与澳大利亚群的参考毒株亲缘关系最为密切，核苷酸序列同源性86%-91%。其中DC株发生了较大程度的变异。国内分离株核蛋白基因核苷酸的变异引起了蛋白质二级结构的部分改变。     

鸡传染性支气管炎病毒核蛋白基因免疫的研究

将已经序列测定的鸡传染性支气管炎病毒ＨＢ株的核蛋白基因亚克隆到真核表达载体ｐｃＤＮＡ３的Ｋｐｎｌ酶切位点。快速筛选鉴定出含有ＨＢ核蛋白基因的重组质粒，经酶切、ＰＣＲ及Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交鉴定为正向插入的重组ＨＢ核蛋白基因后，将其命名为ｐｃＤＮＡ－Ｎ。对重组质粒ｐｃＤＮＡ－Ｎ进行大量扩增，应用聚乙二醇方法进行纯化，将纯化后的 ｐｃＤＮＡ－Ｎ按 １００／只免疫１４日龄雏鸡，并以ＰＢＳ免疫作为空白艰照。免疫后的攻毒试验结果表明，在基因免疫组的１０只雏鸡中，有４只雏鸡存活，保护率为４０％（４／１０）；而空白对照组的１０只雏鸡则全部死亡，无保护率。本试验认为，ＩＢＶ核蛋白在抗感染和致死方面起着一定的免疫保护作用。     

鸡腺胃型传染性支气管炎病毒金坛分离株核蛋白基因分析及与标准强毒株同源性比较

根据已发表的鸡传染性支气管炎病毒 (infectious bronchitis virus,IBV) Beau株、M41株的核苷酸序列 ,设计并合成 1对引物。应用该引物 ,通过 RT- PCR扩增出 IBV金坛分离株 (JT株 )的核蛋白基因 (N基因 ) ,片段大小为 82 8bp,与设计相符。对 JT株的 N基因进行序列测定 ,并与标准毒株 KB85 2 3、CU - T2、Beau和 M41的 N基因进行同源性比较 ,结果表明 ,JT株与 KB85 2 3、CU- T2、Beau和 M41毒株的 N基因同源性分别为 87%、87%、86 %和 85 %,说明 JT株与标准毒株在 N基因上存在一定的差异。     

鸡腺胃型传染性支气管炎病毒金坛分离株核蛋白基因的克隆和测序

应用逆转录多聚酶链反应技术，参照Boursnell等发表的鸡传染性支气管炎病毒核蛋白基因序列，自行设计并合成1对引物，应用该引物，从感染IBV金坛株的第五代SPF鸡胚尿囊液中扩增出片段大小为828bp的JT N基因，与设计相符，表明扩增片段为IBVJT株N基因。将扩增片段与pGEM-T Easy载体连接，经核酸序列测定，与Genebank中报道的IBV其它株N基因同源性较高。     

鸡肾型IBV山东分离株核蛋白基因的遗传变异分析

应用RT-PCR方法扩增到了山东省2006-2007年分离的10株肾型IBV核蛋白(N)基因片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析.结果发现,10株肾型IBV分离株核蛋白基因均含有1个长1 230 bp的ORF,编码由409个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失.与GenBank中的20个IBV参考毒株核蛋白基因序列进行比较和分析,发现10株肾型IBV分离株主要分布于2个群中.第Ⅰ群与弱毒疫苗株H120和参考毒株D41、D1466的亲缘关系较近,第Ⅱ群与参考毒株LX4、GDS14的亲缘关系较近.对核蛋白基因及其局部功能区序列比较发现,山东分离株与H120疫苗株核蛋白相比存在广泛的氨基酸变异,以点突变为主,突变位点无明显规律性.     

S1 and N gene analysis of avian infectious bronchitis viruses in Taiwan

The disease caused by infectious bronchitis virus (IBV) produces great economic for the poultry industry. The purpose of this study is to investigate the molecular epidemiology of IBV in Taiwan. An old IBV strain isolated in 1964 and another 31 strains isolated from 1991 to 2003 were selected for N-terminal S1 gene analysis. Based on their phylogenetic tree, 13 strains were selected for sequencing the entire S1 and partial nucleocapsid (N) genes. The results indicated that Taiwanese IBV strains could be divided into two distinct lineages, Taiwan Group I and Taiwan Group II, with one Massachusetts strain and one Chinese strain. No recombination was found between H120 and the Taiwanese strains in the S1 gene. However, the S1 gene showed a noticeably higher divergence than the N gene. The phylogenetic trees constructed from the S1 and N genes indicate that intergenic recombination has occurred. Since most local strains are in Taiwanese clusters, developing vaccines from local strains is necessary for IBV control in Taiwan.     

鸡传染性支气管炎病毒东北分离株S1基因的序列分析

鸡传染性支气管炎(IB)是由冠状病毒科冠状病毒属的传染性支气管炎病毒(AIBV)引起的一种急性高度接触性传染性疾病.其呈世界性流行,我国为高发区.该病毒基因因点突变和重组易发生变异,故该病毒血清型较多.     

禽传染性支气管炎病毒地方株N基因的克隆及序列分析

禽传染性支气管炎(IB)是鸡的一种急性、高度接触性的传染病,其特征为病鸡呼吸道症状、产蛋数量和品质下降以及肾脏病变等。IBV可感染所有日龄的鸡,导致生长迟缓、死亡、影响增重和饲料报酬降低;还常常引起霉形体混合感染以及大肠杆菌等继发感染而增加鸡群的死亡率,给养鸡生产带     

Genetic diversity of avian infectious bronchitis virus isolates in Korea between 2003 and 2006

Thirty-three field isolates of avian infectious bronchitis virus (IBV) were recovered from commercial chicken flocks in Korea between 2003 and 2006 and were characterized phylogenetically by nucleotide sequence analysis of the IBV S1 gene hyper-variable region. Our phylogenetic analysis revealed that recent field isolates of IBV formed at least three distinct phylogenetic types, including K-I, K-II, and K-III. K-I type IBV consisted of indigenous, 13 IBV isolates which evolved from the Kr-EJ/95 strain and then separated into the lineages of type K-Ia and type K-Ib. K-II type IBV isolates (n = 19) were closely related to nephropathogenic IBV variants from China and Japan. The K-III type isolate (Kr/D064/05), first identified by this study, was closely related to enteric IBV variants from the Chinese strains that cause proventriculitis. Sequence comparisons showed amino acid differences of >27.5% between IBV types. The molecular epidemiologic characteristics of IBV field isolates are briefly discussed.     

Genetic and pathogenic characterization of H6N1 avian influenza viruses isolated in Taiwan between 1972 and 2005

This article reports the genetic and pathogenic characteristics of 34 isolates of H6N1 avian influenza viruses isolated in Taiwan between 1972 and 2005. Genetic analyses showed that a unique lineage of H6N1 viruses has been established in domestic chickens in Taiwan since 1997, and this lineage of viruses differs from the H6N1 viruses circulating in Hong Kong and Southeastern China. Pathogenicity tests showed that all Taiwanese H6N1 viruses were of low pathogenicity but might lead to economic loss when associated with other diseases. Hemagglutination inhibition tests showed that antigenic drift has occurred in Taiwanese H6N1 viruses, and sequence comparison has identified a total of five possible antigenic sites on the hemagglutinin molecule of the H6N1 viruses. Some Taiwanese H6N 1 viruses could replicate in mice without preadaptation, indicating that these viruses have the potential to cause cross-species infection into mammals.