SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究进展

种子纯度在种子生产中的地位日益提高,以往的形态鉴定等方法难以满足种子强度鉴定的要求。分子标记技术越来越多地被应用到种子纯度鉴定中。本文介绍了SSR分子标记技术的基本原理和特点,简要叙述了SSR标记技术在农作物种子纯度鉴定上的研究进展,并就其在杂交种纯度方面的应用潜力进行了探讨。     

快速检验玉米种子纯度的方法

本文主要是对目前发展较为成熟和有较大发展前景的快速测定玉米种子纯度的方法,进行比较和评价。苗期标记性状在种子纯度检验上的优越性被深入研究;蛋白质电泳法因表达稳定、容易操作被广泛应用;SSR分子标记测定法随着分子标记技术的发展被不断完善;计算机智能识别技术测定种子纯度具有快速性和准确性,也具有非常大的应用潜力。未来玉米种子纯度鉴定的方法会向着更加直接、快速、准确的方向发展,以适应现代种子市场发展的要求。     

玉米种子纯度快速分子检测技术研究

种子纯度检测是产品质量检测的中心，检验种子纯度是促进农业发展和维护种业秩序的必经之路。随着信息化发展，种子纯度快速分子检测技术不断更新优化，如何使用现代化纯度快速分子检测技术验证玉米种子纯度是值得思考的问题。文章阐述了机器视觉技术、分子标记技术、DNA快速提取法，分析了玉米种子纯度快速分子检测技术应用方法，结合试验结果得出玉米种子纯度快速分子检测技术步骤以及梯度要求。     

SSR分子标记技术在甘蓝型油菜杂交种陕油16纯度鉴定中的应用

利用微卫星(SSR)分子标记技术对甘蓝型油菜杂交种陕油16及其双亲进行了引物筛选和纯度鉴定技术研究.结果表明:在已筛选的80对SSR引物中,分别有3对引物SSR313、SSR354、SSR359表现稳定的共显性,利用这3对引物对陕油16杂交种进行纯度鉴定结果均低于田间鉴定结果,说明SSR分子标记技术的鉴定结果比田间鉴定结果更准确、可靠,SSR分子标记技术可以应用于杂交种陕油16的纯度鉴定.     

利用SSR技术快速准确鉴定杂交玉米种子纯度

利用一种快速、廉价的DNA提取方法,提取了两个玉米杂交种及其亲本的DNA用于SSR分子标记分析。分析结果显示,10对被分析的引物中有4对在两个杂交种双亲之间显示出多态性,可以用于相应的杂交种纯度分析。另外,分别利用同工酶技术和SSR分子标记技术同时分析了来自这两个杂交种的种子样品的纯度,分析发现,对于一个杂交种,两种方法都能可以鉴定,并且两者检测的结果是一致的,但是对于另外一个杂交种,由于其父母本非常接近,同工酶不能将其区分。因此,这些结果显示SSR分子标记技术可以很好地用于杂交玉米种子的纯度鉴定,即使是这个杂交种是来自两个非常接近的自交系的。     

应用SSR分子标记方法检测玉米种子真实性的几点思考

SSR分子标记方法已经越来越多地应用到玉米种子真实性检测试验中。针对在实际应用过程中遇到的样品纯度、检测引物、PCR产物检测方法及试验结果的数据对接等问题进行了分析和探讨，为进一步完善SSR分子标记方法检测玉米种子真实性提供参考。     

杂交玉米种子纯度的SSR技术分析和控制对策

采用SSR分子标记分析法对玉米种子纯度进行分析,探讨影响杂交玉米种子纯度的因素并提出相应对策.     

DNA分子标记在作物杂交种纯度鉴定中的应用

作物杂交种的纯度鉴定是实现植物新品种保护及种子商品化生产的关键技术环节,对农业生产的经济效益和社会效益具有重要影响。本文全面的归纳了近年来DNA分子标记技术在作物杂交种纯度鉴定中应用,并具体分析了RAPD、SSR、AFLP、SARP、In Del和SNP等分子标记技术在杂交种纯度鉴定中的特点,显示其在作物杂交种的纯度检测上的广阔应用前景。     

SSR技术及其在果树研究上的应用

SSR分子标记技术有丰富的多态性、重复性好和操作简便等优点,它已经成为植物遗传育研究中不可缺少的分子标记技术。对SSR技术的原理和特点作了介绍,分析了如何获得SSR引物,着重介绍了SSR技术在果树种质资源和构建果树遗传图谱的研究现状,指出了SSR技术将在果树科研上起到重要的作用。     

利用SSR鉴定水稻杂交种子纯度的研究

为发展DNA标记技术在种子纯度鉴定上的应用，对12个目前在生产上大面积推广的水稻杂交种进行了SSR纯度鉴定。筛选出一批在常用亲本上具有较高多态性的SSR引物，并与田间纯度鉴定结果进行比较研究。结果表明：SSR鉴定的平均纯度与田间鉴定结果无显著差异，SSR可以用于杂交水稻种子纯度鉴定。     

甜菜全基因组SSR引物的筛选与评价

旨在筛选出适合于甜菜分子生物学实验的SSR核心引物,为后续构建甜菜指纹图谱及遗传多样性分析奠定重要基础。本文利用4种不同的甜菜种质资源和4个不同的甜菜品种,对基于甜菜全基因组编码区序列设计的247对SSR引物进行了初步筛选。结果表明,247对引物中绝大多数引物没有多态性或者多态性不好,只有27对引物具有较高的多态性,这27对引物总共扩增出103条带,其中多态性条带95条,多态性比率为90.43%。这些引物多态性信息量(PIC)范围为0.549~0.983,平均每一对引物的PIC值为0.841。试验结果表明虽然经过了电子PCR的筛选,想要找到合适的甜菜SSR引物依然比较困难,说明甜菜的遗传基础比较狭窄。这27对SSR引物适用于甜菜分子标记,为甜菜品种标准化鉴定体系的大规模构建和应用奠定了重要基础。     

早籼稻浙106与近缘系的主要遗传鉴别方法研究

对遗传背景较为接近的不同近缘系水稻品种的鉴别是水稻育种和种业部门常常遇到的问题,本文为了明确早籼稻浙106和近缘系浙205、浙206、浙207共4个品种(系)的主要遗传差异,利用形态标记鉴别技术和SSR分子标记鉴别技术对4个品种(系)的主要农艺性状、种子形态及基因组DNA进行性状考查。结果表明:4个材料具有各自所特有的外观形态标记,但只运用形态标记很难来鉴别浙106与近缘系,从选用的32对引物中筛选出13对在品种(系)间表现明显的多态性特征的引物,SSR分子标记结合形态标记用于浙106和近缘系间的品种鉴别较为合适。     

早籼稻近缘系的主要农艺性状与SSR标记鉴定

以早籼稻浙106与近缘系浙205、浙206和浙207共4个品种(系)为研究对象,利用农艺性状为观测指标的形态标记鉴定技术和简单重复序列(SSR)分子标记鉴定技术对4个品种(系)的农艺性状和基因组DNA进行性状考查。结果表明:4个材料具有各自所特有的外观形态标记,但只运用农艺性状的观察很难来鉴定浙106与近缘系,选用的32对引物中有13对引物在品种(系)间表现明显的多态性特征,SSR标记结合形态标记用于近缘系间的品种鉴别较为合适。     

基于油菜F1杂种种皮鉴别其母本的SSR检测方法及应用

甘蓝型油菜杂交种中雄性不育母本假杂种是影响种子纯度的关键。为了探索一种能准确鉴定油菜杂交种中母本假杂种的方法,利用CTAB小样法分别提取油菜F1杂种种皮和幼苗的总DNA,进而筛选种皮与幼苗的SSR谱带存在差异的引物,并用于鉴别杂交种制种样品中母本基因型假杂种。结果表明：F1杂种种皮的SSR电泳谱带与其母本相同,利用筛选到的多态性SSR引物对2个国审品种的6份杂交制种样品中母本基因型假杂种鉴定的结果与田间单株鉴定吻合率达98%以上,说明利用F1杂种种皮与幼胚存在多态性的SSR标记鉴定杂交种的母本基因型假杂种是可靠的。该技术方法可以克服目前油菜杂交种SSR纯度鉴定对亲本的依赖,为种子生产、管理和经营部门种子纯度质量的有效监控提供技术参考。     

与黄瓜白粉病抗病基因紧密连锁的SSR分子标记

黄瓜白粉病是影响黄瓜生产的主要病害,为建立黄瓜抗白粉病分子标记辅助选择体系,我们以黄瓜抗白粉病亲本WIS2757和感白粉病亲本19032以及它们的F2群体为试材,采用SSR分析技术,对相关抗性基因的连锁分子标记进行了研究。获得了2个与黄瓜白粉病主效抗病基因连锁的SSR分子标记SSR97-200,SSR273-300,连锁距离分别为5,13cM,这些SSR标记可以作为黄瓜抗白粉病辅助选择的分子标记。     

Genetic diversity of resistance genes controlling fusarium head blight with simple sequence repeat markers in thirty-six wheat accessions from east asian origin

Summary Fusarium head blight (FHB) is a serious disease of wheat worldwide that may cause substantial yield and quality losses. Breeding for FHB-resistant cultivars is the most cost-effective approach to control FHB. The objective of the present study was to determine the relationship of resistance between new resistant sources and Sumai 3 using five simple sequence repeat (SSR) markers closely linked to the major QTL for FHB resistance on chromosome arms 3BS and 6BS. All five SSR markers were highly polymorphic between Sumai 3 (and its derivatives) and susceptible Canadian wheat lines. Most of the Sumai 3-derived Chinese wheat accessions and three Canadian FHB-resistant lines had all the Sumai 3 SSR marker alleles on chromosome arms 3BS and 6BS. The Chinese landrace Wangshuibai and two Japanese accessions Nobeokabozu and Nyu Bai had the same banding patterns as Sumai 3 for all five SSR marker alleles, and another Chinese landrace Fangshanmai had three of the five SSR markers in common with Sumai 3, and therefore most likely carries the same QTL as Sumai 3 on 3BS and 6BS. The Brazilian cultivar Frontana had no alleles in common with Sumai 3 on either QTL, and the Chinese landrace Hongheshang had only one of the five SSR markers in common with Sumai 3, therefore likely carrying resistance genes different from Sumai 3. The Italian cultivar Funo is not the donor of either the 3BS QTL or 6BS QTL. All five SSR seem to be effective candidates for marker-assisted selection to increase the level of resistance to FHB in wheat breeding programs.     

甘蓝型双低油菜杂交种丰油10号纯度的SSR鉴定

品种纯度影响品种的一致性和稳定性,是品种鉴定的一项重要指标。为建立甘蓝型油菜杂交种丰油10号的SSR标记纯度鉴定方法,以丰油10号及其亲本为材料,利用SSR荧光标记与毛细管电泳相结合的方法,在128对SSR引物中筛选出2对可用于丰油10号纯度鉴定的引物。2对SSR引物对丰油10号的纯度鉴定结果为85.64%,与田间表型纯度鉴定的结果87.18%相比,纯度值非常接近,说明筛选的SSR标记可用于丰油10号杂交种纯度鉴定。     

27份含D基因组山羊草属种在高产基因座Barc1183的多态性分析

具有D基因组的山羊草属种是小麦重要的野生近缘植物,携带丰富的优异基因,是改良现代小麦的重要遗传资源。SSR标记Barc1183是在川麦42遗传背景中发现的一个来源于人工合成小麦的高产基因座,位于4DL染色体上。本研究,利用基因座Barc1183及其紧密连锁的SSR标记Barc48,以川麦42和川农16为对照,对27份含D基因组的山羊草属材料进行了多态性分析。结果表明,27份山羊草属材料在Barc1183基因座,发现8种等位变异类型,其中6种等位变异类型为不同于对照川麦42和川农16的新类型;而在Barc48基因座,发现5种等位变异类型,这5种等位变异均为不同于对照川麦42和川农16的新等位变异类型。结合Barc1183和Barc48基因座结果分析表明,27份山羊草属材料中均含有不同于川麦42、川农16的等位变异类型,没有一份与川麦42和川农16基因型完全一致的材料。     

DNA profiling of pineapple cultivars in Japan discriminated by SSR markers

We developed 18 polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers in pineapple (Ananas comosus) by using genomic libraries enriched for GA and CA motifs. The markers were used to genotype 31 pineapple accessions, including seven cultivars and 11 breeding lines from Okinawa Prefecture, 12 foreign accessions and one from a related species. These SSR loci were highly polymorphic: the 31 accessions contained three to seven alleles per locus, with an average of 4.1. The values of expected heterozygosity ranged from 0.09 to 0.76, with an average of 0.52. All 31 accessions could be successfully differentiated by the 18 SSR markers, with the exception of ‘N67-10’ and ‘Hawaiian Smooth Cayenne’. A single combination of three markers TsuAC004, TsuAC010 and TsuAC041, was enough to distinguish all accessions with one exception. A phenogram based on the SSR genotypes did not show any distinct groups, but it suggested that pineapples bred in Japan are genetically diversed. We reconfirmed the parentage of 14 pineapple accessions by comparing the SSR alleles at 17 SSR loci in each accession and its reported parents. The obtained information will contribute substantially to protecting plant breeders’ rights.     

7个粳稻SSR和SRAP分子标记遗传距离比较及其与产量性状杂种优势的关系

本研究选用产量性状有显著差异的7个粳稻品种,按照Griffing双列杂交方法Ⅳ配制21个杂交组合,用SSR和SRAP分子标记分析亲本遗传距离及其与粳稻产量性状杂种优势问的关系,并比较分析两种分子标记在估算遗传距离时的差别.结果表明,每对SSR引物产生1～11条多态性带,平均3.8条,而每对SRAP引物组合产生1～15条多态性带,平均5.2条.SRAP引物所扩增的条带数和多态性何点数分别是SSR引物的3.3倍和1.3倍.两种分子标记对遗传相似系数较小的品种进行聚类分析时可获得一致的结果,但对遗传相似系数较大的品种进行聚类分析时所得结果并不一致;粳稻产量性状杂种优势的表现大小因件状和杂交组合不同而异;F_1杂种产量性状的表现与亲本自身的性状特点和互补关系密切,用SSR和SRAP分子标记遗传距离难以预测粳稻杂种后代的产量表现和杂种优势强弱.