Windows应用软件LocalBLAST的设计

使用WinSDK编程,在C++环境下编译通过的可视化BLAST接口程序软件LocalBLAST,可运行在多种Windows操作系统下。该软件能构建本地核酸和蛋白序列数据库。经比较发现,该程序操作简便,并可根据实际需要随意定制相关数据库。     

基于ITS区序列的疑似野生双孢菇菌株的分子鉴定

通过提取新疆南疆疑似野生双孢菇基因组DNA,采用通用引物ITS1和ITS4扩增ITS区序列,在GenBank 中进行BLAST,对疑似菌株双孢菇进行初步分子鉴定.结果表明:在GenBank的核酸序列数据库中登陆的、与双孢菇ITS序列相似度为99％,达数十种之多,其中与登录号为EF460354的双孢菇同源性达100％,覆盖率达91％.根据rDNA ITS区序列分析准则和双孢菇的形态特征,鉴定新疆南疆疑似野生双孢菇为双孢菇(Agaricus bisporus).     

本地黑猪养殖优劣势分析

本地黑猪与长白猪等外来猪种相比具有繁殖率高、适应性强、猪肉品质好等优势,作为差异化养殖项目,具有一定的市场空间。但是生长周期长、瘦肉率低、养殖成本高的劣势,是本地黑猪养殖者需要面临的难题。     

都匀毛尖茶本地品种茶树研究

[目的]调查都匀毛尖茶本地品种茶树资源,培育本地优势茶树品种,制定无公害种植管理规范。[方法]通过资源普查、田间品比试验并参考有关标准得出都匀毛尖茶本地品种茶树的资源状况。[结果]都匀毛尖茶本地品种茶树地理分布广泛、基因资源丰富。在同一立地和相同气候条件下,不同无性系的腋芽萌动期不同,芽叶数与芽叶重呈极显著正相关,不同无性系的芽叶分枝数差异极显著。[结论]确定了都匀毛尖茶本地品种茶树在当地的分布特点,筛选出6个高产优质原生茶树品系,制定了茶树无公害种植管理规范。     

烟草核酸数据库管理系统的实现

针对课题在构建烟草cDNA文库的过程中,需要处理大量DNA序列的测序结果和进行相关的序列分析和管理,根据实验的具体要求,采用微软公司新一代的计算机编程语言.NET研究开发相应的管理分析软件,开发出烟草核酸数据库管理系统,软件能完成直接读取相应的测序报告文件,并将结果储存于数据库当中,并且具有远程自动比对功能,对结果进行分析。通过使用该软件系统,完成了对近1千条序列的直接管理和辅助分析,发现了烟草核酸新序列,设计探针以进行分子生物学有关研究,提高了整个实验过程的效率。     

波尔山羊冻精改良本地山羊技术难点分析

波尔山羊是世界上最优良的肉用山羊品种之一.以波尔山羊作父本对本地山羊进行杂交改良,其杂交优势明显,经济效果显著,一般波×本一代羊初生重比本地羊重1公斤以上.因此,这项肉羊杂交改良技术深受养殖户的欢迎.但实际工作中,利用波尔山羊冻精通过人工授精改良本地山羊,受胎率比较低,一般仅为40%左右,从而造成改良成本高、延长生产周期,在很大程度上影响了养殖户改良本地山羊的积极性,阻碍了肉羊业的发展.     

感染西葫芦的帕兰波番茄曲叶病毒检测与鉴定

2008年对印度北方邦东部Gorakhpur、Kushinagar与Maharajganj等3个地区的西葫芦种植区进行调查,发现西葫芦叶片呈现花叶斑点状、卷曲,植株黄化萎缩.以菜豆金色花叶病毒组外壳蛋白基因特异引物AV1-F、AV1-R对从不同地区收集的西葫芦病斑叶片样品进行PCR分析,获得约800 bp的扩增产物.对从Gorakhpur也区获得的分离物的扩增产物进行克隆和序列分析,测序结果提交GenBank核酸序列数据库;通过核酸BLAST比对和系统发育分析,该分离物与帕兰波番茄曲叶病毒株的同源性最高,达95%,两者遗传关系最近,认为此病毒分离物是帕兰波番茄曲叶病毒株.     

黄岩本地早优化栽培技术探讨

黄岩本地早品系较多,个性明显,管理难度较大.因此,认清种性,适地适种是优质生产的前提.回归自然,按照种性固有特点进行生产,改良传统农艺技术,创造新的集成栽培管理方法是传统橘区生存发展的机遇.本研究对黄岩本地早栽培管理技术进行长期的探索研究,集成了原产地栽培管理技术,收到较好的经济社会效益,这对不同地区的本地早品种种植有一定的借鉴作用.     

感染西葫芦的帕兰波番茄曲叶病毒检测与鉴定(英文)

2008年对印度北方邦东部Gorakhpur、Kushinagar与Maharajganj等3个地区的西葫芦种植区进行调查,发现西葫芦叶片呈现花叶斑点状、卷曲,植株黄化萎缩。以菜豆金色花叶病毒组外壳蛋白基因特异引物AV1-F、AV1-R对从不同地区收集的西葫芦病斑叶片样品进行PCR分析,获得约800 bp的扩增产物。对从Gorakhpur地区获得的分离物的扩增产物进行克隆和序列分析,测序结果提交GenBank核酸序列数据库;通过核酸BLAST比对和系统发育分析,该分离物与帕兰波番茄曲叶病毒株的同源性最高,达95%,两者遗传关系最近,认为此病毒分离物是帕兰波番茄曲叶病毒株。     

怀地黄液泡质子泵焦磷酸水解酶基因的克隆与生物信息学分析

为了克隆地黄功能基因,根据NCBI GenBank核酸数据库中5种已知植物生长素诱导的器官膨大基因(ARGOS)碱基序列的保守区,利用CLUSTAL 2.1和DNAMAN 4.0软件设计简并引物,采用RT-PCR技术扩增出一个cDNA片段,测序表明,获得基因cDNA片段序列长度为495bp。经过NCBI数据库BLAST分析,发现它与莲花、蓖麻、烟草、苜蓿、葡萄、碧桃、灰绿藜7种植物的液泡膜质子泵焦磷酸水解酶基因同源性很高,在83%～86%,因此获得的基因是地黄液泡膜质子泵焦磷酸水解酶基因。     

基于mtDNA中国地方鸡种系统发生数据库建立

在.NET编程环境下,运用代理程序的方法从GenBank中获取中国地方鸡种数据,并将有关mtDNA的数据进行整理,引用Matlab生物信息学工具箱,以组件技术将其打包和发布,建成中国地方鸡种mtDNA数据库。实验人员可以应用系统发生分析组件、经过运算得到中国地方鸡种进化树图结果。说明通过Matlab、SQL和.NET混合编程构建中国地方鸡种mtDNA数据库系统,实现了基于mtDNA的中国地方鸡种生物进化关系分析功能。     

西部地方高校图书馆特色数据库建设的实践与思考——以《刘三姐专题文献数据库》为例

结合《刘三姐专题文献数据库》的建设实践,提出西部地方高校图书馆应该关注地方文化、经济发展的重大决策和举措,从地方经济、文化的热点中寻找特色数据库建设的切入点,挖掘地方文化中的特色资源,突出资源的差异化、个性化,走渐进式建设道路,重视数据库衍生成果的开发,打造数据库资源的个性品牌。     

地方特色文化数据库建设探讨——以“惠州龙门农民画数据库”建设为例

结合"惠州龙门农民画数据库"建设实践,认为高校图书馆要关注地方文化事业建设,挖掘具有地方特色的文化资源,重视数据库开发的社会价值,打造出特色鲜明、实用性强的品牌数据库,为传承和弘扬本土文化服务,为高校开展创意教学,培养创新型人才服务,为发展地方文化事业,振兴地方旅游经济服务。     

乡土植物营造地方特色园林景观探讨

本文提出了乡土植物营造地方特色园林景观的创作途径,归纳了"一本三元"的乡土植物营造地方特色园林景观的创作手法,同时以重庆地区乡土植物营造地方特色园林景观作了实例探讨。     

一次超级单体风暴引发的局地大暴雨成因分析

从大暴雨发生前后气象要素变化、环流背景、影响系统、区域流场入手,对2009年8月28日发生在驻马店市的突发性局地大暴雨天气过程进行了分析。结果表明,这次突发性大暴雨过程具有明显的中小尺度系统特征,主要影响系统是850、700 hPa切变线和地面辐合线。通过对多普勒天气雷达基本反射率因子、径向速度和风廓线产品的分析,发现＂V＂型缺口、钩状回波、中气旋的特征明显,充分说明了这次局地大暴雨过程是超级单体风暴造成的。     

农业地方立法中的农民参与问题研究

从农民参与农业地方立法的必要性出发,分析了农民参与农业地方立法存在的问题,并提出了完善农民参与农业地方立法的具体制度设想。     

棉花GhRGL基因克隆及其原核表达研究

GA信号转导途径是通过DEUA蛋白来抑止的.通过对Genbank进行Blast比较,首次克隆了棉花DELLA蛋白基因,长度为1644bp,分离的棉花DELLA蛋白进行生物信息学分析显示,该蛋白具有与拟南芥中的DEUA蛋白一样的保守结构域,对克隆的基因进行原核表达研究,将克隆的基因转化原核表达载体pET22b,在E.coli BL21(DE3)菌株中成功表达了与标签蛋白融合的GhRGL蛋白,大小约为64kDa.首次实现了棉花DELLA蛋白基因在原核系统中的表达,为棉花DELLA蛋白的抗体制备及其表达定位研究奠定了基础.     

Web的微生物信息资源平台的构建

在Linux系统下构建基于Web的微生物信息资源平台,以BLAST和Primer3为基础功能模块,实现核酸相似性检索及引物设计。构建的微生物信息资源平台具有使用简单、保密性强、便于扩展等优点,通过与实验室微生物数据库连接整合,可对数据充分挖掘和利用,以期对微生物资源研究作出贡献。     

本土特色材料的景观应用

从常规角度入手分析非常规的景观材料,介绍了开发本土特色景观材料的意义及选择的原则,以期引起更多景观从业者对本土特色材料的重视,推动景观业的进一步发展。