鹅产蛋性状全基因组选择信号分析

【目的】利用选择信号分析方法在伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅中筛选与产蛋性状相关的候选基因。【方法】选取健康状况良好、饲养管理水平一致的2岁伊犁鹅母鹅和霍尔多巴吉鹅母鹅各24只,采集血液样本,提取基因组DNA,利用全基因组重测序技术进行选择信号检测分析,筛选出受到选择的候选区域,针对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选出与鹅产蛋性状相关的候选基因。【结果】全基因组重测序的平均测序深度为15.28×,与参考基因组比对率在97.31%以上。通过群体分化指数(Fst)对伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅2个群体进行分析,共筛选到1 231个候选区域。与核苷酸多样性(Pi)进行联合分析后,伊犁鹅群体共筛选出10个候选区域,得到5个注释基因;霍尔多巴吉鹅群体中共筛选出353个候选区域,得到263个注释基因。GO功能和KEGG通路富集分析发现,初步筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因(BMP2、BMP6、MIS、ENO1、LIF、EP300),还发现了IL-18基因可能与禽类的免疫有关。【结论】本研究筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因,为揭示鹅产蛋性状的分子调控机制提供了参考。     

催乳素受体的研究进展

介绍催乳素受体的结构、功能,催乳素受体基因的定位、表达及调节,催乳素受体基因的多态性与生产性状和疾病的关系等.提示催乳素受体基因可作为生产性状及疾病的一个候选基因.     

海兰鸡PRL、OVR、OIH和GnRHR基因多态性及其与产蛋性能的关联分析

本研究以海兰褐与海兰白两个蛋鸡品系作为研究素材,选择催乳素基因(PRL)、卵细胞卵黄受体基因(OVR)、卵抑制剂基因(OIH)以及促性腺激素释放激素受体基因(GnRHR)4个基因作为产蛋性状相关候选基因,采用PCR-RFLP方法对候选基因进行多样性检测,并与蛋重及产蛋数两性状进行关联分析.结果表明,PRL、OVR和OIH3个基因候选位点在本研究海兰蛋鸡群体中存在SNPs,但3个基因候选位点不同基因型与产蛋性状关联分析均未能达到显著水平(P＞0.05);GnRHR基因候选位点在本研究群体中未检测到多态性的存在.     

我国地方鹅种肉品质研究进展

本文主要综述我国地方鹅品种常规肉品质、营养成分、风味物质、组织学特性以及与肉质性状相关的候选基因的研究,并对发展趋势进行预测。     

鹅H-FABP基因多态性及其与屠宰性能的相关研究

本试验旨在探讨心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因作为影响鹅屠宰性能候选基因的可能性,寻找与鹅屠宰性能相关的分子标记。选用四川白鹅和朗德鹅为试验材料,采用PCR-SSCP方法对H-FABP基因的部分编码区进行单核苷酸多态性(SNPs)检测,发现了1个多态性位点(T→A),使试验鹅群表现出AA和AB 2种基因型;利用SAS(8.01)软件统计分析了基因型与鹅屠宰性能的相关性。结果表明:H-FABP基因的多态性对鹅活重、屠体重、半净膛重、全净膛率、腿肌率有显著影响(P0.05),对其它屠宰性状无显著影响(P0.05)。初步推断H-FABP基因可能是影响鹅屠宰性能的主效基因或与主效基因连锁。     

猪基因组分析现状

分子遗传学技术的不断发展促进了家畜基因组分析,候选基因法与连锁分析法为其中的两种基本方法。雌激素受体基因是在猪基因组分析中第一个使用的候选基因,因为雌激素在猪的生殖循环中起着重要的作用,Ｒｏｔｈｓｃｈｉｌｄ等人将其作为研究猪产仔数性状的候选基因,结果...     

催乳素受体的研究进展

介绍催乳素受体的结构、功能,催乳素受体基因的定位、表达及调节,催乳素受体基因的多态性与生产性状和疾病的关系等。提示催乳素受体基因可作为生产性状及疾病的一个候选基因。     

简化基因组测序在安格斯牛繁殖性状候选基因筛选中的应用研究

为了确定与安格斯牛繁殖性状相关的遗传标记和功能基因,试验采用简化基因组测序(dd-RAD)技术对安格斯牛繁殖相关基因进行研究,与初配月龄(AFS)、初产日龄(AFC)和产犊间隔(CI)等性状进行全基因组关联分析。结果表明：共检测到314 718个SNPs位点,与AFS和AFC性状显著关联的SNPs位点各27个,两性状相同候选基因为16个;与CI性状显著关联的SNPs位点和候选基因各3个。GO功能注释分析发现位于6,24,15,10号染色体的SLIT2、LAMA3、TEAD1和MCC基因为AFS和AFC性状的共同关键候选基因,5号染色体的KCNC2基因为CI性状的关键候选基因。说明筛选到的SLIT2、LAMA3、TEAD1、MCC和KCNC2基因可能是安格斯牛繁殖性状选育的分子标记。     

与太湖流域地方猪种产仔性状相关的候选基因和QTL研究进展

研究太湖流域地方猪种繁殖性状相关基因对于揭示影响猪繁殖性能遗传机制和高繁殖力猪的选育具有重要意义。本文综述了与太湖流域地方猪种高产相关的定位数量性状基因位点(QTL)与主效基因雌激素受体基因(ESR)和促卵泡素β亚基基因(FSHβ)以及其他候选基因如催乳素受体基因(PRLR)、视黄酸受体γ亚基(RARG)、视黄醇结合蛋白4基因(RBP4)和骨桥蛋白位点(OPN)等基因的定位与产仔性状的关联性的研究进展。     

家禽繁殖性状相关基因的研究进展

家禽的繁殖性状主要包括产蛋数、蛋重、蛋品品质。一般认为畜禽的繁殖性状是受到多基因控制的门阈性状或数量性状,因此探究与繁殖性状相关的候选基因对于提高家禽繁殖能力十分重要。目前认为,与家禽繁殖性状相关的基因主要包括脂肪调控、生殖激素受体基因等。文章旨在总结可能直接或间接影响繁殖性状的基因,对脂肪代谢调控基因和已发现的调控家禽生殖激素受体基因进行概述,探究不同基因在家禽繁殖功能的作用,对其调控机理进行解释,以期对家禽繁殖性能调控提供理论依据。     

羊MHC基因的研究现状

MHC即主要组织相容性复合体(MHC)由紧密连锁、高度多态的基因位点所组成的染色体上的一个区域[1],连锁于一条染色体上的MHC基因构成一个单倍型.MHC分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类分子,其中Ⅰ、Ⅱ类分子分别提呈内源性和外源性抗原肽,Ⅲ类分子与免疫因子相关.MHC基因产物在各种细胞表面表达,控制免疫细胞之间的相互作用.它早期源于解释器官移植中受体排斥供体组织细胞的现象.1936年,Gorer在小鼠体内首次发现了主要组织相容性复合体(MHC),MHC基因是一个多基因家族,是基因组中多态性最丰富的基因之一.随着研究的深入,MHC的内涵已经得到拓展,不仅涵盖抗感染相关分子,还泛指整个免疫基因群.近年来,在畜禽研究中发现MHC基因与许多疾病和生产性状密切相关,已成为抗病性、易感性及生产性状的候选标记基因.羊MHC名称OLAP(绵羊)、CLA(山羊).与牛相比,有关绵羊和山羊MHC的研究要少得多.     

利用加权基因共表达网络分析筛选天农麻鸡胴体性状候选基因

旨在通过转录组测序(RNA-Seq)与加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选慢速型黄羽肉鸡天农麻鸡胴体性状相关候选基因。本研究以104只天农麻鸡为素材,在126日龄时进行屠宰,测定胸肌重等7个胴体性状,采集胸肌组织进行RNA-Seq。基于RNA-Seq数据获得基因表达矩阵后,结合表型进行WGCNA分析,确定目标模块,筛选目标模块的枢纽基因,并分别进行KEGG通路富集、蛋白质互作网络(protein-protein interaction network,PPI)构建和相关性分析。104份胸肌组织RNA-Seq质控后获得15 092个基因的表达量。与胴体表型进行WGCNA,共得到19个模块,其中4个模块与胴体性状极显著相关。功能富集结果表明,目标模块内基因主要富集在ECM-受体相互作用、黏着力等通路。以|Module membership|> 0.8、|Gene significance|> 0.2为标准筛选到58个枢纽基因,并通过PPI网络构建鉴定到5个网络节点基因,整合相关性分析确定COL1A2和SPARC为最重要候选基因。本研究通过大样本量转录组分析,发现ECM-受体相互作用等通路在天农麻鸡胴体性状调控中发挥主要作用,筛选到COL1A2和SPARC是影响全净膛率性状的重要候选基因,研究结果为鉴定选育分子标记,解析胴体性状分子机制奠定理论基础,为慢速型黄羽肉鸡育种提供重要参考。     

辽宁绒山羊RARG基因的初步研究

以视黄酸受体γ(retinoic acid receptor-gamma,RARG)基因为候选基因,,运用测序法寻找辽宁绒山羊RARG基因第3外显子单核苷酸多态性.结果表明,在辽宁绒山羊中RARG基因第3外显子区域内未发生突变,可初步判定辽宁绒山羊双羔性状与RARG基因第3外显子不相关.     

秦川肉牛分子育种与新品系选育扩繁

以秦川牛肉用选育为目标,采用分子育种等技术,研究了影响秦川牛肉用性状的候选基因,对21个候选基因进行了多态性检测,发现了123个SNP位点,其中72个为首次发现;分布在15个基因上的20个分子标记位点与秦川牛生长及胴体性状显著相关,其中13个标记在秦川牛上首次发现;同时利用基因芯片技术确定了6个影响秦川肉牛肉用性状的新基因;     

鸡性早熟候选基因研究进展

分子标记辅助选择技术是动物育种工作中强有力的工具,尤其是候选基因法在育种中的应用.目前,鸡性早熟等性状的研究最为广泛.本文综述了影响鸡性早熟性状的候选基因及研究进展,为进一步的研究提供参考.     

籽鹅羽束性状在肝脏中相关候选基因关联性分析

本研究旨在分析籽鹅头顶部羽束性状(crest trait)相关调控基因,从而进一步揭示禽类表型性状与调控基因的作用机制,为后续分子遗传育种、禽类基因编辑等提供理论基础。本试验选取同家系同世代1日龄籽鹅作为试验样本,构建2个资源群体,每群体60只雏鹅,饲养周期为21 d。有羽束鹅群(crest population,C):该群体均为有羽束公雏;无羽束鹅群(non-crest,NC):该群体均为无羽束公雏,2个群体同舍分栏饲养。随后,为测定肝脏组织中eomes、hoxc8、sox5、mnr2、wnt5a、bmp2、gh候选基因相对表达量,在1,7,14,21日龄进行采样,应用qRT-PCR技术进行检测。结合生物信息学分析方法,分析调控羽束性状的关联基因。在qRT-PCR分析结果中,sox5基因在1日龄雏鹅肝脏组织中相对表达量,C组高于NC组,并且差异极显著(P<0.01)。其他时期虽无显著差异,但羽束鹅群仍高于无羽束鹅群相对表达量高。wnt5a基因在1日龄雏鹅肝脏中相对表达量,C组高于NC组,差异极显著(P<0.01),在其他时期无显著差异。通过生物信息学分析,结合Multiexperiment Viewer软件对候选基因进行聚类分析,sox5、wnt5a、bmp2基因可能均在同一调控通路中。结果提示,sox5基因可能为羽束性状调控基因,与wnt5a基因在同一信号通路中,并对羽束性状发育起到调控作用,sox5、bmp2基因可能在肝脏发育、代谢过程中起到调控作用。     

绵羊生长性状关键基因挖掘研究进展

利用候选基因法和全基因组关联分析法等方法能准确筛选出绵羊生长性状相关的关键基因,挖掘关键基因相关遗传变异位点作为DNA标记进行应用,以提高选择准确性、加快遗传进展。文章综述了正向调控和负向调控基因的研究进展,及其对生长性状的遗传效应,为绵羊生长性状的分子育种提供科学资料。     

扬州鹅ACSF2和MAGI-1基因多态性及其与产蛋性状的关联分析

本研究旨在探讨ACSF2和MAGI-1基因多态性对扬州鹅产蛋性状的影响,以期筛选出可用于提高扬州鹅产蛋性能的分子标记。采用PCR扩增结合直接测序的方法对ACSF2和MAGI-1基因内含子区域进行单核苷酸多态性（SNP）检测,分析SNP的遗传多样性及其与产蛋性状的关联性。结果显示,扬州鹅ACSF2基因内含子中有1个与扬州鹅产蛋性能相关的SNP位点,为Record-106582 A>C,包含3种基因型,分别为AA、AC和CC。关联分析结果显示,Record-106582 A>C位点对产蛋量有显著影响,AA基因型扬州鹅的产蛋量显著高于AC和CC基因型个体。本研究中MAGI-1基因Record-106975 A>G突变位点对扬州鹅群体产蛋量、开产体重和蛋重均无显著影响。结果表明,ACSF2基因对扬州鹅部分产蛋性状有显著影响,可作为扬州鹅早期选育的分子标记。     

鸡繁殖性状相关候选基因研究进展

鸡繁殖性状是由多基因控制的数量性状,繁殖力水平的高低受到环境和遗传多种因素的影响。文章对目前发现的调控繁殖性状的HPG轴相关基因,与繁殖关联的主效基因、生长发育基因,以及其他调控卵泡、卵巢发育和成熟的相关基因进行概述,总结目前家鸡繁殖性状候选基因研究遇到的困难,并对未来鸡繁殖性状的分子遗传机制研究方向进行展望。