利用RAPD指纹分析技术分析3种鲤科鱼群体的遗传变异

[目的]研究鲤鱼、鳙鱼、武昌鱼这3种常见淡水鱼类的亲缘关系。[方法]利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对鲤鱼、鳙鱼、武昌鱼种群间的亲缘关系进行分析。[结果]结果表明,武昌鱼与鳙鱼、武昌鱼与鲤鱼的遗传距离相近,分别为0.654 70、.652 2,而鲤鱼与鳙鱼之间的遗传距离为0.5873。[结论]鲤鱼、鳙鱼间的亲缘关系比武昌鱼、鳙鱼,武昌鱼、鲤鱼之间的亲缘关系近。     

利用RAPD标记评价水稻种质的研究

用２１个引物不同籼、粳、野生稻进行了ＲＡＰＤ分析,聚类结果表明,籼、粳、野栽都可以清楚分组,不同稻种都有特异性带,通过ＲＡＰＤ分析制作的ＤＮＡ指纹可用于种质鉴定和利用。还对不同稻种的多态性分析及其用途,稻种类型划分的标准化、科学化等问题进行了讨论。     

新疆野生郁金香和栽培种的RAPD分析

用8个RAPD引物对10个郁金香栽培品种和4个新疆野生种的群体进行了RAPD-PCR扩增,共扩增出38个有效位点,各位点谱带大小0.2～1.5 kb,其中4个野生物种位点多态性为50%～68%、Nei's基因多样性(H)为0.18～0.21、Shannon's信息指数(I)为0.27～0.32;栽培种为无性系纯系,群体内部没有多态性片断,但各品种之间差异明显.聚类分析表明:供试群体可分为4大遗传类型,第一类为野生类型,包括4个野生物种,和其他国外栽培种之间遗传距离较远;第二类为单瓣晚花系列的栽培种Mrs J T Scheepers和Halcro, 与野生种之间的遗传距离相对较近,因而与其有较好的杂交亲和潜力;第三类为栽培品种Negrita,具有独特的红紫花,与栽培种和野生种的平均遗传距离近乎相等,似乎是它们的居间类型;其它栽培品种为第四类;这些研究结果为郁金香培育奠定技术基础.     

肉牛群体遗传变异的微卫星多态性分析

利用６个微卫星位点分析了８个肉牛杂交新本群体的遗传结构和遗传变异,结果表明：８个肉牛群体平均多态信息含量和平均杂合度较高,其范围分别为０．５７～０．７１和０．５９～０．７３。以海伏特牛和利木赞牛与三个母牛种群（ＦＮ,ＺＨ,ＦＵ）间遗传距离为最大。由邻结法绘制的系统聚类图能清晰、客观地反映８个肉牛群体的地理分布、遗传分化特点,以及亲缘关系远近程度。这些研究为肉牛的杂交改良奠定了基础。     

辣椒种质资源的RAPD分析

为明确辣椒种质资源的遗传基础,利用RAPD技术对来自不同生态环境不同类型的辣椒种质资源亲缘关系进行了研究．从160个随机引物中筛选9个用于PCR反应,88．68％的扩增条带表现多态性,聚类分析结果表明,46份辣椒种质资源可分为六大类,DNA分子水平上辣椒亲缘关系与传统方法研究结论基本一致．     

藏獒群体遗传变异的RAPD分析

[目的]从分子水平上研究藏獒群体的遗传变异状况,为藏獒种质资源的保护提供依据。[方法]采用RAPD技术对不同地区的20份藏獒基因组DNA进行分析,并用群体遗传学软件PopGene32测定藏獒群体的有效等位基因数（Ne）、Nei氏平均预期基因杂合度（H）和Shannon遗传信息指数（I）。[结果]共扩增出369条带,其中339条表现出多态性,多态性位点百分率为91.86%。PopGene32软件得到的藏獒群体的Ne、H和I值分别为1.7512、0.4162和0.6021。[结论]藏獒群体内存在着丰富的遗传变异。     

水稻显性矮秆新基因的RAPD分析

利用RAPD标记对中粳水稻新品种突变体Y98149中鉴定出的显性矮秆新基因进行研究。结果表明,在150对随机引物中,两对引物SAl530和SB930在亲本和近等基因池(均由10个高秆或矮秆植株组成)之间表现出多态性。用这两对引物对高秆和矮秆的F2群体的300个单株进行连锁分析,表明SAl530和SB930与新矮秆基因的连锁距离分别为15．3cM和9．3cM,两个RAPD标记位于同一侧。     

利用RAPD技术对蜜桃种质资源的分析

利用RAPD技术，采用从200个10碱基随机引物筛选的22个引物对14个蜜桃品种的基因组DNA进行扩增，通过扩增180个位点的谱带的聚类，分析供试蜜桃的系统发育，将供试的蜜桃品种分为3组；并运用特殊谱带，建立了蜜桃的分子检索表，提出了特殊保存的蜜桃种质有秋蜜，太原水蜜，深州红蜜和温州水蜜。     

锥栗不同品种遗传距离的RAPD 分析

运用RAPD 法对不同锥栗品种间基于DNA 基础上的遗传距离进行了研究, 建立了锥栗PCR 反应的标准程序, 得到的扩增片段大小在500 ～ 2 000 bp 之间, 确定了10 个品种基于DNA 分子水平上的相似系数。当相似系数等于0.74 时, 可把这10 个品种分为4 类, 即油栗仔, 蔓榛, 中尖嘴, 猴嘴榛 红紫榛, 大尖嘴, 材榛 仁嘴栗, 乌棒 和嫁接毛榛 。图2 表2 参6     

云南鹅群体遗传结构的随机扩增多态DNA分析

 采用随机扩增多态性DNA标记技术对云南鹅主产区6个不同地点的45个个体进行了群体遗传学分析，从85个随机引物中筛选出的23个引物对所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，共检测出178条DNA片段，其中150条属多态性片段（多态率84.27%），计算了各座位在群体中的基因频率、杂合度和群体Shannon多样性指数等参数。结果表明：云南鹅的群体遗传变异较丰富。     

应用RAPD技术对东北地区白桦种源遗传变异的分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）分子标记方法对白桦13个种源115个个体进行了遗传变异的比较分析。通过14个随机引物扩增共检测到233个位点。各种源多态位点百分率差异明显，在20.17%-32.19%之间，多态位点百分率最高的是帽儿山种源和清源种源，最低的是绰尔种源。遗传变异在大兴安岭、小兴安岭和长白山3个区域间占23.88%，种源间遗传变异占27.99%，种源内个体间遗传变异占48.13%。根据种源间的遗传距离，构建了白桦13个种源的遗传关系聚类图，结果大兴案岭地区的白桦和源聚为一类，小兴安岭、张广才岭、完达山和长白山分布区的白桦种源聚为另一类。同时，根据地理气候因子和遗传距离对白桦13个种源进行了种源区的划分，为种子调拨提供了依据。     

北京地区秀珍菇菌株遗传多样性的RAPD分析

[目的]找出一种适合秀珍菇的分子标记方法,研究其遗传多样性。[方法]应用RAPD技术对11株秀珍菇（Pleurotus geesteranus）菌株进行了遗传多样性分析。[结果]在供试的60条RAPD随机引物中,有13条可扩增出清晰、稳定的DNA条带。聚类分析表明,在相似系数0.820水平上,可将供试菌株分为4类：第1类包括土秀、灰平260、高平172、夏丰1号;第2类包括凤尾、秀珍菇、秀12、高678、秀18;第3类仅有3014;第4类仅有灰秀。[结论]该研究揭示了北京地区秀珍菇菌株的遗传多样性。     

滩地13个杨树无性系遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记手段,研究杨树无性系的遗传多样性。在探讨杨树叶片基因组DNA提纯方法和优化PCR扩增反应体系的基础上,采用18个引物对13个杨树无性系的基因组DNA进行扩增;每个引物扩增的DNA片段数为1～14个,共产生126条带,其中多态带53条,占42%,平均每个引物扩增出3条多态带。结果表明:通过对126条谱带的聚类,分析了供试杨树无性系的系统发育,并通过比较各品种间的特异带或特征带的差异进行无性系鉴别和测定,运用特殊谱带,建立了杨树无性系的分子检索表。     

地黄品种遗传多样性RAPD分析

用CTAB法提取10个地黄品种幼叶的基因组DNA，用紫外分析法和琼脂糖凝胶电泳方法检测基因组DNA的纯度、大小和浓度。结果表明，从80条RAPD引物中分别筛选出适合于地黄RAPD标记分析的引物17条。17条RAPD引物对10个地黄品种（系）扩增出177条带，多态条带比率（PPB）为61．58％，平均多样性指数（I）为0．3135，遗传相似系数（GS）在0．63～0．93，平均GS为0．7545。RAPD标记的聚类分析结果，将10个地黄品种分为2类：第1类含有6个品种，包括组培85—5、大田85—5、组培9302、金白地黄、金状元和大田9302；第2类含有4个品种，包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄。     

陕西地区油松天然群体遗传结构的RAPD分析

利用RAPD技术分析了陕西5个地区油松(Pinus tabulaeformis)天然种群100个个体的遗传多样性和遗传结构,10条10 bp的随机引物共扩增出73个位点.其中,多态性位点64个,多态位点百分率为87.67%.采用类平均法对100株油松材料进行聚类分析,结果表明其遗传相似系数为0.08～0.66.在遗传距离为0.39的水平上,聚类分析为3大类,表明陕西地区天然油松种群间产生一定程度的变异,在分子水平上呈现出遗传多态性,且大部分遗传变异存在于种群内.     

槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析

 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值，以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况，研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析，从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果15条引物共产生105种扩增片段，多态片段95条，平均每条引物的扩增带数为7，各引物多态性片段范围在2～12之间，多态频率在40%～100%之间，多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。