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相似文献
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1.
2.
任小巍  王瑜  袁庆华 《草业科学》2012,29(3):411-416
采用L9(34)正交试验设计方法,对草地早熟禾(Poa pratensis)基因组DNA SRAP PCR反应体系中的Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物及dNTP四因素的用量进行优化,并比较不同模板DNA用量对扩增的影响,建立草地早熟禾SRAP PCR最佳反应体系,同时,利用该体系对SRAP引物进行筛选。结果表明,草地早熟禾SRAP PCR最佳反应体系为Taq DNA聚合酶1.0 U、Mg2+ 1.75 mmol·L-1、引物0.25 μmol·L-1、dNTP 220 μmol·L-1、40 ng模板DNA、2 μL 10×PCR buffer,总体积20 μL。运用该体系从100对SRAP引物中筛选出43对引物能够产生清晰稳定的扩增条带且多态性丰富。优化体系的建立及引物的筛选可为今后利用SRAP标记技术对草地早熟禾进行遗传多样性分析、图谱构建、种质资源鉴定奠定技术基础。  相似文献   

3.
杂花苜蓿SRAP-PCR反应体系的正交优化   总被引:2,自引:1,他引:2  
利用正交设计L16(45)对杂花苜蓿(Medicago varia Martin.)SRAP-PCR反应体系的5因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP、引物)在4个水平上进行优化试验,旨在建立一套适用于苜蓿属(Medicago L.)种质资源的SRAP标记技术体系。结果表明:各因素对PCR反应结果都有显著影响,由F值可知,dNTP的量对反应结果影响最大,其次是Taq酶的量,模版DNA浓度的影响最小,各因素水平的变化对PCR反应的影响依次为:dNTP>Taq酶>Mg2+>引物>模板DNA;筛选出各反应因素的最佳水平,建立杂花苜蓿SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL)为:dNTP 2μL(0.20 mmol·L-1),TaqDNA聚合酶0.3μL(1.50 U),Mg2+3μL(1.50mmol·L-1),上、下游引物各1μL(0.40μmol·L-1),50ng模板DNA1μL,10×PCR buffer 2.5μL(不含Mg2+)。这一优化体系的建立,为今后利用SRAP标记技术进行苜蓿属植物遗传图谱构建、遗传多样性分析及种质资源鉴定等研究奠定了技术基础。  相似文献   

4.
正交设计优化假俭草SRAP-PCR反应体系及引物筛选   总被引:9,自引:7,他引:9  
以假俭草叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2 、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶4种因素3个水平,对假俭草SRAP反应体系进行研究,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了假俭草的SRAP最佳反应体系.结果表明,假俭草SRAP-PCR最佳反应体系为:2 μL 10譖CR buffer、60 ng模板DNA、Mg2 1.50 mmol/L、dNTP 260 μmol/L、引物0.25 μmol/L、Taq DNA聚合酶0.5 U,总体积为20 μL.各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg2 浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小.运用该体系对4份假俭草种源进行验证,证明该体系稳定可靠,并从45个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的26个引物组合.这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行假俭草分子遗传学研究提供了科学依据.  相似文献   

5.
以崇明白山羊基因组DNA为模板,利用正交试验设计L16(45),对影响崇明白山羊SSR-PCR反应体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP及引物的浓度)进行优化。结合单因素完全随机试验筛选各因素的最佳水平,针对MCB3224引物建立了崇明白山羊SSR-PCR的最佳反应体系。结果表明:在20μL的反应体系中,5个因素的最佳水平分别为Taq DNA聚合酶0.5 U、Mg2+2.5 mmol/L、模板DNA 30 ng、dNTP 0.20 mmol/L,引物0.8 mol/L;引物的最佳退火温度为57.3℃。利用16份崇明白山羊的DNA模板和2个微卫星引物验证此反应体系,聚丙烯酰胺凝胶电泳,结果显示该体系稳定可靠且普适性较好。  相似文献   

6.
根据土源性寄生线虫体外发育期间受温度、湿度、季节和宿主动物影响的原理,采用电子计算机对上述四因子和食道口线虫从卵发育到侵袭性幼虫速度、数量进行回归分析,制定出模拟模型,设计了在牧地上该种线虫从卵发育到侵袭性性幼虫数量预测预报公式,用该公式和气象资料计算出的侵袭性幼虫季节消长曲线,与牧地上宿主羊体内成虫数量消和曲线相一致,初步显示可以采用气象资料和计算机预牧地上粗纹食道口线虫侵侵袭性幼虫量的季节动态  相似文献   

7.
狗牙根SRAP-PCR反应体系优化及引物筛选   总被引:10,自引:7,他引:10  
利用正交设计,从Mg2 、dNTP、引物浓度和DNA聚合酶4种因素3个水平以及不同的模板DNA浓度来优化狗牙根SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了全面筛选。狗牙根SRAP-PCR优化反应体系结果为:2μL 10×buffer4、0 ng模板DNA、Mg2 1.25 mmol/Ld、NTP 260μmol/L、引物0.2μmol/L、Taq DNA聚合酶1.0 U,总体积20μL。运用该结果从90对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物34对。优化体系的建立及其引物的筛选为今后利用SRAP标记技术进行狗牙根遗传分析、图谱构建、基因定位与种质资源鉴定奠定了技术基础。  相似文献   

8.
1临床症状2002年8月6日,我县淮河乡冯某饲养的40头3月龄山羊开始拉稀、精神不振,食欲逐渐减少,羊体消瘦,4~5d衰竭死亡。当地兽医用青霉素、庆大、链霉素等治疗无好转,到30日已死亡13头,还有15头生病。2剖检病变病死羊只剖检可见眼结膜苍白,肝脏色淡,呈灰白色,表面有少量白色坏死灶、心肌、肾色淡,肠系膜淋巴结苍白色,小肠、大肠内有大量的虫体,盲肠内有很多细小的白色虫体。3实验室诊断3.1粪便检查采集病羊粪便,饱和盐水飘浮法,可见有三角形、四角形或卵圆形,内含有六钩蚴,六钩蚴被梨形器所包围,…  相似文献   

9.
本研究旨在分析长沙市四棘食道口线虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况。应用聚合酶链反应(PCR)扩增四棘食道口线虫虫株的pcox1,应用Clustal X 1.83程序对序列进行比对,同时利用DNAStar 5.0中的MegAlign程序进行同源性分析,并与GenBankTM中已知四棘食道口线虫相应基因序列进行比较分析。所得pcox1序列长度一致,均为393 bp,与GenBank公布的线虫相关序列进行比较分析结果表明,各个分离株与已知四棘食道口线虫相应基因的相似性分别在98%以上,与其它科线虫的相似性均小于91%。四棘食道口线虫pcox1序列种内相对保守,种间差异明显。本研究为进一步研究四棘食道口线虫的群体遗传学奠定了基础。  相似文献   

10.
为了方便临床上鉴定羊消化道常见且易混淆线虫虫卵并丰富相关资料,试验从羊消化道中采集疑似捻转血矛线虫、夏伯特线虫、食道口线虫和奥斯特线虫共4种线虫,采用形态学和分子生物学方法鉴定虫种,将4种线虫于体外短暂培养后得到纯种虫卵,通过观察虫卵不同发育阶段的胚胎形态变化获取每种线虫虫卵形态特征,并对虫卵的长径、宽径和长宽比进行测定。结果表明:经鉴定4种线虫分别为捻转血矛线虫、绵羊夏伯特线虫、粗纹食道口线虫和普通奥斯特线虫。4种线虫虫卵初期胚胎多呈收缩状态且形似桑葚,在外观形态上具有相似性,均为双层卵壳,多数对称,少数不对称。捻转血矛线虫虫卵呈短椭圆形,颜色较浅;绵羊夏伯特线虫虫卵呈椭圆形,颜色较捻转血矛线虫虫卵深;粗纹食道口线虫虫卵呈长椭圆形,颜色较捻转血矛线虫虫卵深,与绵羊夏伯特线虫虫卵相近;普通奥斯特线虫虫卵亦呈长椭圆形,颜色与捻转血矛线虫相近,较绵羊夏伯特线虫和粗纹食道口线虫虫卵浅。虫卵在生理盐水中培养1~6 d后,捻转血矛线虫、绵羊夏伯特线虫和普通奥斯特线虫依次进入蝌蚪期和幼虫期,但仅凭肉眼依然难以区分虫卵种类;绵羊食道口线虫未观察到含蝌蚪或含幼虫的虫卵,仅在桑葚期观察到胚胎收缩成1团及...  相似文献   

11.
The assay was aimed to optimize the extraction process of the compound Epimedium by orthogonal experimental design. The extraction process of the compound Epimedium was optimized with water volume, extraction times and extraction time as independent variables. The extraction ratio of icariin was choosed as an evaluation index. The optimized extraction conditions were as follows, extracted in 10 times water (solid-liquid rate at 1∶10) for 3 times and heated for 1.5 h per time. These results indicated that the optimum extraction technology by the orthogonal experimental design provided experimental bases for improving the content of icariin and its industrial production.  相似文献   

12.
采用正交设计对黑褐苔草(Carexa trofusca)ISSR-PCR反应的Mg2+、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物和DNA模板进行优化,以期建立最佳反应条件并筛选退火温度。结果表明:黑褐苔草20μLISSR-PCR最佳反应体系为:1.80μmol·L-1 Mg2+、0.60 U Taq DNA聚合酶、0.125μmol·L-1 dNTP、0.3μmol·L-1 Primer和50ngDNA模板;引物UBC807适宜退火温度为55℃。该体系能在不同个体中扩增出清晰的、稳定性好的条带。  相似文献   

13.
2004年9月中旬,广东省汕头市濠江区某山羊饲养场发生以腹泻与便秘交替出现,进行性消瘦、衰弱死亡为主要症状的传染病。根据临床检查,解剖病理变化及实验室检验,确诊为羊哥伦比亚食道口线虫病,经采取对症防治措施后,病情得到了有效控制,收到了较好的疗效。  相似文献   

14.
根据土源性寄生线虫体外发育期间受温度、湿度、季节和宿主动物影响的原理,采用电子计算机对上述四因子和食道口线虫从卵发育到侵袭性幼虫速度、数量进行回归分析,制定出模拟模型,设计出了在牧地上该种线虫从卵发育到侵袭性幼虫数量预测预报公式,用该公式和气象资料计算出的侵袭性幼虫季节消长曲线,与牧地上宿主羊体内成虫数量消长曲线相一致,初步显示可以采用气象资料和计算机预测牧地上粗纹食道口线虫侵袭性幼虫量的季节动态,从而为防治措施的制定提供依据。  相似文献   

15.
正交设计优化星星草ISSR-PCR反应体系研究   总被引:10,自引:2,他引:10  
采用正交设计法优化适合于星星草的ISSR体系,对影响ISSR-PCR的多个因素,包括引物浓度、Taq酶的用量、Mg2 和dNTP浓度进行了比较、优化;同时又对DNA模板浓度,PCR扩增程序中的退火温度及循环次数进行了筛选.结果确定了星星草ISSR PCR反应体系的最佳方案为:PCR扩增程序,94℃预变性5min;进行40个循环的94℃变性45s,55℃复性45 s,72℃延伸2 min;72℃延伸10 min,4℃保存.20μl反应体系包括10%buffer 2μl、模板DNA60ng、dNTP 100μmol/L、TaqDNA聚合酶1.5U、引物0.8mmol/L、Mg2 2.0mmol/L.  相似文献   

16.
正交设计法优化淫羊藿多糖的提取工艺   总被引:1,自引:0,他引:1  
为了优选淫羊藿多糖的最佳提取工艺条件,通过单因素试验和正交试验,以料水比、提取时间、提取温度和提取次数为考察目标,以多糖提取率为评价指标,优选最佳提取工艺。结果表明,淫羊藿多糖最佳提取工艺为料水比为1∶25,提取时间2h,提取次数为3次,提取温度为90℃。多糖醇沉浓度为700mL/L。该工艺为淫羊藿多糖的提取奠定了基础,并为进一步的工业化生产提供了科学依据。  相似文献   

17.
靳晓丽  田新会  杜文华 《草地学报》2015,23(6):1303-1309
鹰嘴豆(Cicer arietinum)ISSR反应体系的建立可以为鹰嘴豆种质资源遗传多样性分析、遗传图谱构建和基因定位提供理论依据和技术参考。本研究以CTAB法提取的鹰嘴豆DNA为模板,采用L16(45)正交设计直观分析法,对鹰嘴豆ISSR-PCR反应中的4个主要因素(Mg2+浓度,引物浓度,TaqDNA聚合酶浓度,dNTPs浓度)在4个水平上进行优化,并在最优ISSR-PCR反应体系的基础上对引物UBC826的最适退火温度进行筛选。结果表明:Mg2+和引物浓度对PCR扩增结果有显著影响,dNTPs和Taq酶的浓度变化对PCR扩增结果无显著影响。鹰嘴豆ISSR-PCR优化反应体系(25 μL)为:3 mmol·L-1 Mg2+,0.2 mmol·L-1 dNTP,0.24 μmol·L-1引物,2 U Taq DNA聚合酶。UBC826最适退火温度为56℃。  相似文献   

18.
以4个代表性海雀稗(Paspalum vaginatum)种质的叶片DNA为模板,采用L9(34)正交试验设计,对影响海雀稗SRAP-PCR反应的Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶的用量进行了优化,并比较了不同浓度模板DNA对扩增的影响,以确定适合海雀稗的SRAP-PCR最佳反应体系。结果表明:海雀稗SRAP-PCR最佳反应体系为10×PCR buffer 1 μL、模板DNA50 ng、Mg2+2.5 mmol·L-1、dNTP150 μmol·L-1、引物0.4 μmol·L-1、TaqDNA聚合酶1.0 U,总体积10 μL。利用该反应体系从100对引物中筛选出可扩增清晰条带的引物83对,在83对引物中选出多态性丰富的引物44对。SRAP-PCR反应体系的优化及引物筛选,为今后利用SRAP标记技术进行海雀稗遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱的构建以及分子标记辅助育种提供技术支持。  相似文献   

19.
羊食道阻塞的原因主要是因为食道被食团或异物而突然阻塞,表现的主要症状是羊群吞咽障碍.根据阻塞的程度可分为两种类型,即不完全阻塞和完全阻塞.养羊生产中一般是因为羊采食过多的块根类饲料,吞咽过急或受到突然的惊吓而造成食物将食管阻塞,给养羊生产造成不同程度的经济损失.本文主要分析羊食道阻塞的表现,并且根据多年的实践工作经验总...  相似文献   

20.
基于猪有齿食道口线虫和四棘食道口线虫IGS rDNA序列的遗传变异情况,于种内保守、种间差异明显的序列片段设计1对引物,建立了区分2种猪食道口线虫的熔解曲线分子鉴定方法。研究结果显示,该方法可通过熔解曲线差异而准确鉴定猪食道口线虫2个种,与其他线虫和吸虫无交叉反应,特异性良好;能检测猪食道口线虫单虫卵样品和FTA卡片的DNA模板。该研究为猪食道口线虫种类准确鉴定提供了一种新的准确、敏感、特异且快速的分子手段。  相似文献   

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