A-FABP 在不同鸡种中遗传多态性分析

利用PCR—RFLP技术和DNA测序检测了尤溪麻鸡、鹿苑鸡、隐性白羽鸡3个鸡种共计96只鸡的脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白（A—FABP）第85位点和第1805位点的遗传变异。结果表明：1）在这2个位点上，3个鸡种均存在变异，外来品种隐性白羽鸡以杂合子Cc居多；地方鸡种以cc居多，3个鸡种均含有较高频率的等位基因c，其中以尤溪麻鸡最高，而以隐性白羽鸡最低。2）A—FABP第85位点不影响A—FABP的氨基酸序列；而第1805位点的遗传多态性影响氨基酸序列的变化：由脯氨酸变为丝氨酸，说明该多态性可能通过A-FABP基因的表达水平从而影响鸡的肉质。本试验为进一步分析A-FABP基因的遗传变异与肌内脂肪含量的关系及该分子标记在育种计划中的应用奠定基础。     

孟德尔分离群体验证候选基因遗传效应的策略

由候选基因法得到的基因变异-目标性状的关联性,其准确性和可靠性受群体遗传背景、连锁不平衡和样本含量大小等因素的影响,所以变异-性状关联性在某群体建立后,应进一步在其它群体中加以验证。在存在低等位基因频率的情况下,如果想得到一定数量低频率等位基因纯合子基因型个体的表型记录,就需要维持很大的试验群体,且试验费用和工作量非常大。本研究提出了一个解决群体内纯合子频率低的策略,即利用杂合子交配产生孟德尔分离群,不但可以获得符合要求的群体规模,而且群体的遗传背景更为相近,同时可以充分考虑家系效应,可以提高验证候选基因遗传效应的准确性。本研究以验证鸡垂体特异转录因子基因POU1F1-6位点对鸡生长性状的遗传效应为例,表明此策略在低等位基因频率情况下验证候选基因遗传效应是可取的,且大大降低了工作量和试验成本。     

鸡IGFBP-2基因的遗传多态性及其遗传效应分析

采用PCR-SSCP方法检测京海黄鸡、AA鸡、尤溪麻鸡、边鸡4个鸡品种胰岛素样生长因子结合蛋白2(IGFBP-2)第2内含子部分序列和第3外显子的多态性,并分析其对京海黄鸡生长和繁殖性能的遗传效应。结果表明:在该区域中,共检测到4个等位基因,10种基因型。χ2检验结果表明,除边鸡外其余3个品种群体在该座位均达到Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。关联分析结果显示,除开产蛋重和12周龄体重外,其他生长和繁殖性状在不同基因型间均存在显著差异(P<0.05)。因此,推测IGFBP-2基因对个体的生长和繁殖性能有一定影响,将IGFBP-2基因应用于鸡育种过程中的标记辅助选择可以加快鸡的育种进程。     

京海黄鸡IGF-IR基因外显子3多态性及遗传效应分析

结合PCR-SSCP与PCR-RFLP技术,检测分析了京海黄鸡母鸡IGF-IR基因第3外显子SNPs的特点及其对京海黄鸡母鸡生产性状的遗传效应。结果在该段序列检测到2个点突变:P1(G11 0996C)、P2(C11 1014A),2位点均表现出3种基因型,其中P1位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态。最小二乘方差分析表明,P2位点AA型个体初生重显著高于CC、CA型个体(P<0.05)。联合基因型分析表明,GC/AA基因组合型母鸡开产较晚但开产蛋重较高;CC/CA型个体,其12周龄、300日龄体重极显著低于CC/AA型个体(P<0.01),初生重、4周龄、12周龄、16周龄和300日龄体重显著低于其他基因组合型个体(P<0.05);CC/AA型个体12周龄、300日龄体重极显著高于GC/CC、CC/CA型个体(P<0.01),16周龄体重显著高于GC/CC、GC/CA、GC/AA、CC/CA型(P<0.05)。利用基因组合型GC/AA、CC/CA、CC/AA与生产性能间的关联特性指导京海黄鸡,能够为利用分子标记加快京海黄鸡的保种和育种进程提供有益参考。     

利用实时荧光定量RT-PCR检测鸡A-FABP和H-FABP基因的差异表达

依据鸡A-FABP和H-FABP基因及参照基因GAPDH序列设计引物,以鸡心肌、胸肌和腿肌、肝脏和腹脂总RNA逆转录合成的cDNA为模板,GAPDH基因为参照基因,应用SYBRGreenI实时荧光定量PCR检测如皋黄鸡和安卡红鸡A-FABP和H-FABP基因的差异表达。结果表明:A-FABP、H-FABP基因和参照基因GAPDH基因融解曲线为单峰,无杂峰及二聚体,其扩增效率分别为99.7%、99.8%和100.0%。如皋黄鸡H-FABP基因在心肌、胸肌和腿肌的差异表达量分别是安卡红鸡的0.0860、0.0680倍和0.0580倍(P0.05)。H-FABP基因mRNA表达量与肌内脂肪含量呈显著负相关。如皋黄鸡A-FABP基因在腹脂和肝脏的表达量分别是安卡红鸡的15.9640倍和10.9640倍(P0.05),而在心肌、胸肌和腿肌的表达量差异不显著。     

雪山鸡A-FABP基因编码区SNPs与肌内脂肪酸含量关联分析

本研究利用MALDI-TOF-MS技术对67只雪山鸡A-FABP基因编码区候选单核苷酸多态性(SNPs)位点进行扫描,进一步验证SNPs是否存在,并且与脂肪性状进行关联分析。结果表明:A-FABP基因在外显子1中存在同义突变:即T/C突变,得到3种基因型,T、C等位基因频率分别为0.239和0.761,并处于遗传平衡状态;TT型个体的腿肌中C16∶0脂肪酸含量显著高于CT和CC型个体(P0.05)。初步认为A-FABP基因应是肌肉脂肪酸性状的候选标记。     

固原鸡不同群体ADSL基因遗传特性的研究

固原鸡是经过宁夏当地群众长期自发选育形成的地方肉蛋兼用品种,是唯一的地方鸡品种资源,具有肉质细嫰、味道鲜美、营养丰富等遗传特性。然而如何对这些遗传特性进一步开发利用,迄今为止育种工作者尚未达成共识。因此,研究旨在探索与鸡肉品     

MyoD基因在不同猪种中的PCR-RFLP遗传多态性及其遗传效应研究

采用PCR—RFLP的方法分析了MyoD基因在10个中外猪种及部分杂交群体中的分布情况，并分析了MyoD基因对肌纤维、胴体品质、胴体等级性状和肉质性状的遗传效应。结果表明：MyoD基因内含子1内的DdeI酶切位点多态性较丰富。在多数地方猪种群体中，C基因的分布具有绝对优势，且主要以杂合子AC形式存在。突变型A基因对胴体性状和胴体等级性状的影响较大，可极显著地增加胴体瘦肉率和眼肌面积，降低皮脂含量，提高腿臀比例，增加胴体长度（P〈0．01），同时会降低猪肉品质。具体讲，A基因对增加肌纤维面积的加性效应值和显性效应值分别为457．915μm^2和431．055μm^2；对增加嗣体瘦肉率的加性效应值和显性效应值分别为3．594％和-0．153％；对增加眼肌面积的加性效应值和显性效应值分别为3．084cm^2和-0．46cm。；对皮脂率的加性效应值和显性效应值分别为～3．916％和0．666％；对提高腿臀比的加性效应值为0．771％，显性效应值为0．068％。A基因对屠宰后45min和冷藏24h后的肉色评分的加性效应值分别为-0．145和-0．160，显性效应值分别为-0．052和-0.213．     

A-FABP基因内含子2多态性及A-FABP基因在鹅组织中的差异表达研究

采用PCR-RFLP技术检测160只雄性五龙鹅和172只雄性朗德鹅A-FABP基因内含子2的遗传变异,并与体重和肥肝性状进行关联分析;同时利用Real-timePCR技术检测A-FABP基因在朗德鹅10种组织中的表达情况。结果表明:克隆的五龙鹅和朗德鹅A-FABP基因内含子2序列长461bp(GenBank登录号为DQ647701、EF639390)。该扩增产物酶切后,发现有HaeⅢ-RFLP,并出现AA、AB和BB3种基因型;五龙鹅和朗德鹅的基因型频率分别为0.7、0.2、0.1与0.372、0.465、0.163。填饲的朗德鹅在体重和肥肝重上基因型AA与AB和BB之间存在显著差异(P<0.05),而五龙鹅在体重性状上3种基因型之间差异不显著(P>0.05);A-FABP基因在朗德鹅各组织中的表达量为肝>脂肪>腿肌>脾>肺>心>胸肌>肾>睾丸>脑,A-FABP基因在肝脏和脂肪的表达量之间差异不显著(P>0.05),而与其他组织的表达量相比差异显著(P<0.05)。     

鸡传染性支气管炎病毒基因型与血清型相关性初步研究

为研究鸡传染性支气管炎病毒(IBV)基因型与血清型之间的相关性,本研究以国内不同地区的17株IBV分离株、2株疫苗株(M41、W93)和1株强毒株(X株)为研究对象,经RT-PCR扩增获得20株IBV的S1基因并进行测序.将其分别与GenBank中的20株国内外参考IBV株的S1基因进行序列比较,绘制S1基因系统进化树...     

拜城油鸡公鸡A-FABP基因多态性及其与生产性能的相关性分析

试验旨在研究拜城油鸡公鸡中脂肪型脂肪酸结合蛋白（adipocyte fatty acid binding protein,A-FABP）基因的多态性及其与生产性能的相关性,寻找可用于拜城油鸡选育的分子遗传标记。随机选取92只6周龄拜城油鸡公鸡,采用PCR-RFLP方法检测A-FABP基因的多态性。每种基因型选取15只体重相近的个体随机分为3组,每组每种基因型个体各5只,分别在12、18、24周龄时屠宰并对生产性能指标进行测定。结果显示,在拜城油鸡公鸡中检测到A-FABP基因有3种基因型：AA、AB、BB,BB为优势基因型,B为优势等位基因,不符合哈代-温伯格平衡定律（P<0.01）。12周龄时,各基因型间各生产性能指标差异均不显著（P>0.05）;18周龄时,BB基因型肌间脂宽显著高于AA基因型（P<0.05）,BB和AB基因型腹脂重极显著高于AA基因型（P<0.01）,腹脂率显著高于AA基因型（P<0.05）;24周龄时,BB基因型体重、肌间脂宽、腹脂重均显著高于AA基因型（P<0.05）。推测A-FABP基因可以作为与拜城油鸡公鸡脂肪性状相关的候选标记之一。     

Polymorphism of A-FABP Gene and Its Association Analysis with the Productive Performance in Male Baicheng Fatty Chicken

In order to search the molecular genetic markers for breeding of Baicheng fatty chicken, the relationship between the polymorphism of adipocyte fatty acid binding protein (A-FABP) gene and the productive performance of the male chickens at different ages was studied. Ninety two chickens with age of 6 weeks were randomly selected. The polymorphism of A-FABP gene was detected by PCR-RFLP method. In each genotype group, fifteen chickens with similar body weight were categorized, each group was randomly divided into three sub-groups with equal numbers. The productive performance of the chickens was measured at their age of 12, 18 and 24 weeks. The results showed that there were three genotypes of A-FABP gene:AA,AB and BB, BB genotype was the dominant genotype,allele B was the advantageous allele,and it was not in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.01). At the age of 12 weeks,no significant difference was found among the measured productive performance (P>0.05). At the age of 18 weeks, it was found that the intramuscular fat width of BB genotype was significantly higher than AA genotype (P<0.05), the abdominal fat weight of BB and AB genotypes were extremely significantly higher than AA genotype (P<0.01),and the abdominal fat weight percentage of BB and AB genotypes were significantly higher than AA genotype (P<0.05). At the age of 24 weeks, it was found that the body weight, intramuscular fat width and abdominal fat weight of BB genotype were significantly higher than that of AA genotype (P<0.05). Therefore, this results suggested that A-FABP gene could be used as a potential candidate marker for the association of fatty traits in male Baicheng fatty chicken.     

巨型玫瑰冠鸡H-FABP、A-FABP基因表达的发育性变化及其肌内脂肪含量研究

为探讨心脏型脂肪酸结合蛋白（heart-type fatty acid-binding protein,H-FABP）和脂肪型脂肪酸结合蛋白（adipocyte fatty acid-binding protein,A-FABP）基因与巨型玫瑰冠鸡生长发育及肌内脂肪含量（IMF）的关系,研究H-FABP、A-FABP基因对巨型玫瑰冠鸡IMF含量和腹脂沉积的作用机制,本试验采集了巨型玫瑰冠鸡与良凤花鸡在不同周龄（2、4、6、8、10、12周龄）的腹脂、心肌、胸肌、腿肌组织样品共480份,采用实时荧光定量PCR对巨型玫瑰冠鸡与良凤花鸡不同生长阶段组织中H-FABP、A-FABP基因mRNA表达量进行了检测,并采用索氏浸提法测定了两种鸡12周龄的胸肌与腿肌的IMF含量。结果表明,巨型玫瑰冠鸡与良凤花鸡的H-FABP、A-FABP基因mRNA在腹脂、心肌、胸肌和腿肌组织中均有不同程度的表达,且两种鸡H-FABP基因mRNA在心肌组织中高度表达,在脂肪组织中表达量较低,在胸肌、腿肌组织中中度表达,而A-FABP基因相反,推测H-FABP基因主要在肌肉组织中表达,而A-FABP基因主要在脂肪组织中表达。良凤花鸡生长速度高于巨型玫瑰冠鸡;巨型玫瑰冠鸡的腹脂率均低于同性别的良凤花鸡,但胸肌、腿肌的IMF均高于同性别的良凤花鸡,表明巨型玫瑰冠鸡的肉品质优于良凤花鸡。本试验结果为巨型玫瑰冠鸡H-FABP、A-FABP基因分子选育奠定了基础。     

鸡H-FABP和A-FABP基因表达与肌内脂肪含量相关研究

选用H-FABP和A-FABP基因作为影响鸡肌内脂肪沉积的候选基因,以北京油鸡、矮脚鸡、白莱航鸡和AA肉鸡为研究群体,利用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术,分别对56、90、120日龄H-FABP和A-FABP基因mRNA进行定量分析,结合IMF含量及屠体性状测定,分析H-FABP及A-FABP基因表达水平对IMF含量等的影响.结果表明：H-FABP基因mRNA随日龄的增长表达量显著降低,而A-FABP基因mRNA随日龄的增长表达量显著升高,并表现出显著的品种效应（P＜0.01）,性别因素对A-FABP基因表达影响显著.北京油鸡、白莱航鸡和AA鸡群体的H-FABP基因mRNA表达水平与IMF含量及屠体重呈现显著的负相关,而A-FABP基因mRNA表达水平与屠体重显著相关,与IMF含量没有显著的相关性.矮脚鸡A-FABP基因mRNA水平与IMF含量呈现显著的负相关,其H-FABP基因mRNA水平对屠体重影响显著,表现出显著的品种差异.     

苏姜猪A-FABP基因遗传多态性及其与肉质性状的关联分析

研究采用PCR-RFLP技术分析苏姜猪、姜曲海猪、长白猪群体A-FABP基因遗传多态性,并用统计学方法分析基因座多态与肉质性状的相关性。结果表明:3个猪种A-FABP基因内含子1均具有Bsm I酶切多态性,分别检测到3种基因型(AA、AB和BB),χ~2适合性检验显示,3个猪种A-FABP基因型分布处于Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。多态信息含量(PIC)分析显示,3个品种猪均为中度多态;基因型与肉质性状关联分析显示,不同基因型肌内脂肪含量、大理石纹差异显著,大理石纹AA、AB型显著高于BB型(P0.05),肌内脂肪含量AA显著高于AB、BB型(P0.05)。结论显示,苏姜猪、姜曲海猪、长白猪A-FABP基因intron 1多态性对肉质性状影响显著。     

安卡鸡Mx基因A2032G变异位点对经济性状的效应分析

采用错配PCR-RFLP对安卡鸡Mx基因2032位点多态性进行检测,结果表明,安卡鸡Mx基因2032位点经Rsa Ⅰ酶切后,检测到AA、AG和GG 3种基因型,基因型频率分别为0.232、0.681和0.087,抗性等位基因A的频率为0.572.X<'2>适合性检验结果表明,安卡鸡Mx基因在Rsa Ⅰ酶切位点上等位基因的分布显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态.分析这3种基因型与安卡鸡一些经济性状间的关联性,结果表明,抗性纯合子AA基因型的个体各阶段体重、体尺、主要屠宰性状及常规肉质与AG和GG基因型的个体差异不显著,安卡鸡Mx基因2032位点对重要经济性状没有显著的负效应.