福建黄兔微卫星标记的遗传多样性分析

为了从DNA分子水平揭示福建黄兔群体遗传多态性和遗传结构,选择16个微卫星标记检测了40只福建黄兔的遗传变异及多态性。结果表明,在福建黄兔群体中,16个微卫星位点共检测到了100个等位基因,各位点的等位基因数在3～13,平均等位基因数为6．25个,平均有效等位基因数为4．2652。各位点平均基因频率取样方差V（pij）为8．7611×10^-3。16个微卫星位点观察杂合度（Ho）在0．4893～0．8801,平均H。为0．7227;各位点期望杂合度（He）在0．4959～0．8914,平均He为0．7324;各位点多态信息含量（PIC）变动范围为0．3814～0．8679,平均PIC为0．6766,其中有14个位点处于高度多态（PIC〉0．5）,16个微卫星位点的平均固定指数（F）为0．0132。经卡方检验,在这16个微卫星位点上,群体偏离Hardy-Weinberg平衡的程度不大。     

福建黄兔的遗传多态性及分类

 用8个微卫星标记对福建黄兔的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果表明：（1）8个微卫星标记在所检测的福建黄兔群体中都表现出较丰富的多态性,在6个群体微卫星标记的平均多态信息含量（PIC）为0.6622(0.5723~0.7222),各群体的PIC差异不显著;全部群体平均杂合度为0.6857(0.5904~0.7267)。这显示黄兔群体的多态信息含量、杂合度等指标有较好的一致性,说明福建黄兔品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性。（2）根据奈氏标准遗传距离,并进行UPGMA聚类分析,结果显示6个群体间的遗传变异不大。福建黄兔地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;从遗传距离及聚类分析结果表明这些群体黄兔属于同一个地方品种。     

鲁山牛腿山羊体尺性状与微卫星标记的相关分析

根据比较基因组学和相关文献资料,选择与山羊和牛生长性状相关的6个微卫星基因座(BM6444,MAF70,BM315,BMS1678,BM1818和BMC1206)作为分子标记,研究了牛腿山羊的群体遗传变异,并分析了体尺性状与6个微卫星标记之间的关系.结果表明:6个微卫星标记在牛腿山羊群体中的多态信息含量(PIC)分别为0.887,0.863,0.773,0.840,0.888和0.791,遗传杂合度(He)分别为0.904,0.883,0.808,0.864,0.904和0.824,有效等位基因数(Ne)分别为9.62,8.05,5.02,6.96,9.68和5.46.6个微卫星标记与体尺性状的最小二乘分析结果表明:BM6444基因座165bp和145bp等位基因对体质量、体高、体长、胸围和胸深有正效应,而154bp和137bp等位基因对体高、胸围和胸深性状有负效应;MAF70基因座180bp和159bp等位基因对体质量性状有正效应,159bp和144bp等位基因对体高、胸围和胸深有负效应;BM315基因座140bp等位基因对体高有正效应,而136bp等位基因对胸深有负效应;BM1818基因座298bp和27...     

福建黄兔专门化父系选育

利用福建黄兔保种群,采用家系内个体综合指数法,纯种选育福建黄兔父系。结果表明：第3世代公、母兔4、10、13周龄的体重比第1世代同期体重提高7．4％～13．2％,差异均极显著（P〈0．01）;公、母兔4至13周平均日增重分别为17．55g、18．25g,比第1世代分别提高9．6％、12．4％;第3世代公、母兔13周龄的体长、胸围、耳长、耳宽比第1世代提高3．1％～13．7％,差异均极显著（P〈0．01）;第3世代公、母兔13周龄体重变异系数与第1世代相比均有下降,13周龄的体长、胸围、耳长、耳宽的变异系数在3个世代内均小于12％,体型外貌均匀整齐;3个世代的产仔数和各世代内公、母兔13周龄性别间体重差异均不显著（P〉0．05）。     

养殖好项目--福建黄兔

福建黄兔是国内优良的肉兔品种，毛色亮丽，全身被毛黄色，腹部白色，耳大直立，后躯丰满。属快大型兔，前期生长速度快，日增重３０克以上，成年体重２－３公斤，比其他品种的彩色肉兔体重大ｌ－２倍。 福建黄兔是节粮型的草食家畜，是发展畜牧业的最佳畜种之一。主要饲料就是各地常见的青菜、牧草、植物根茎叶等青粗饲料，养殖条件简单且成本极低，所以效益极高。既适应工厂化高标准养殖，也适合一家一户养殖。种兔饲养６月即可配种，一只母兔年产仔兔８窝，每窝１０～１５只；商品兔养２个月达２公斤就可上市，目前市场价１５～１８元／…     

福建黄兔饲养管理浅析

福建黄兔为福建兔的黄毛系,是福建省古老的地方优良品种,具有适应性广、抗病力强、繁殖率高、胴体品质好和药用功能等优点,素有"药膳兔"之称,深受消费者喜欢。为此,笔者开展了肉兔地方品种资源的保护、提高和创新开发利用研究,旨在满足人们对优质兔肉的需求,以实现优质高效养兔业的健康持续发展。     

南江黄羊体重性状的微卫星标记研究

通过10个微卫星位点,对周岁体重差异较大的南江黄羊极端个体基因组DNA进行扩增检测, 方差分析寻找与体重性状显著相关的微卫星标记。然后,利用该引物对随机群体进行检测,应用线性模 型计算含有相应标记个体体重性状的标记效应和替代效应。结果发现,BM3413位点的186bp和190bp 等位基因、MFA70位点的109bp等位基因、INRA063位点的178bp和184bp等位基因、MB066位点的 110bp等位基因、MB3501位点的176bp等位基因,这些标记基因与南江黄羊周岁体重呈极显著正相关, 相关系数在0．5180-0．7375之间。BM3413位点的182bp等位基因、MFA70位点的115bp等位基因、 MB066位点的98bp等位基因,这些标记与南江黄羊周岁体重呈显著(极显著)的负相关．相关系数在- 0．6539--0．388之间。     

大黄鱼微卫星标记与生长性状的相关分析

利用51个大黄鱼微卫星标记,以一个F1 家系为实验材料,分析了微卫星标记与体长、体高、体质量之 间的相关性,发现51 个位点中有9 个位点(LYC0401,LYC0076,LYC0077,LYC0078,KPC43,KPC86, LYC0403,LYC0079,LYC0080)与体长、体高、体质量显著或极显著相关(p<0.05 或p <0.01).其中 LYC0401,LYC0076,LYC0078,KPC43,LYC0403和LYC0079的各等位基因与3性状的相关达到显著或极显 著水平(p<0.05或p<0.01).     

养殖好项目—福建黄兔

福建黄兔是国内优良的肉兔品种,毛色亮丽,全身被毛黄色,腹部白色,耳大直立,后躯丰满.属大型兔,前期生长速度快,日增重30克以上,成年兔体重2～3千克,高于其它品种的彩色肉兔.     

夏南牛体尺性状与微卫星DNA的相关分析

试验选择18月龄的夏南牛母牛40头,选用8个微卫星DNA标记,研究了夏南牛群体遗传变异,并分析了体尺性状与8个微卫星标记的关系.结果表明:8个微卫星标记BM2113,BM1824、ETH225、IDVGA2、IDV-GA46、IDVGA55、BM3413和TGLA44等位基因数分别为7,6,6,6,6,4,6争6;多态信息含量分剔为0.764,0.775,0.786,0.701,0.723,0.570,0.759和0.776;杂合度分别为0.801,0.784,0.824,0.744,0.772,0.648,0.802和0.815.8个微卫星标记分别对夏南牛不同体尺性状存在正效应或负效应.

Abstract：

Forty 18-month-old Xianan cows and 8 microsatellite DNA markers(BM2113,BM1824,ETH225,IDVGA2,IDVGA46,IDVGA55,BM3413 and TGLA44)were used to study the population genetic variation Xianan cattle and the relationships between the gene loci and their body size traits.The resuits showed that the these 8 microsatellite markers had 7,6,6,6,6,4,6 and 6 alleles,their(polymorphism information content)PIC was 0.764,0.775,0.786,0.701,0.723,0.570,0.759 and 0.776 and their heterozygosis was 0.801,0.784,0.824,0.744,0.772,0.648,0.802 and 0.815,respectively.The microsatellites were found to be in positive or negative correlation with some body size traits in the population.     

夏南牛体尺性状与微卫星DNA的相关分析

试验选择18月龄的夏南牛母牛40头,选用8个微卫星DNA标记,研究了夏南牛群体遗传变异,并分析了体尺性状与8个微卫星标记的关系.结果表明:8个微卫星标记BM2113、BM1824、ETH225、IDVGA2、IDV-GA46、IDVGA55、BM3413和TGLA44等位基因数分别为7,6,6,6,6,4,6和6;多态信息含量分别为0.764,0.775,0.786,0.701,0.723,0.570,0.759和0.776;杂合度分别为0.801,0.784,0.824,0.744,0.772,0.648,0.802和0.815.8个微卫星标记分别对夏南牛不同体尺性状存在正效应或负效应.     

哲罗鲑微卫星标记与重要生长性状的相关性分析

采用10对微卫星荧光标记分析哲罗鲑Hucho taimen同池养殖群体的遗传多样性,通过SPSS13.0的GLM模型筛选出与生长性状(体质量、体长、体高和体宽)相关的微卫星标记。结果显示,10个微卫星位点的平均有效等位基因个数为2.301 4;多态信息含量0.366 6~0.557 6;观测杂合度范围0.652 2~0.989 1,均大于期望杂合度;Fis值为负数,存在杂合子过剩现象。基因座BJT4、BJT6、BJT8、BJT12、BJT18、BJT19、BJTH4和BJTH19均与体质量和体长性状极显著相关(P0.01),BJT6、BJTH6和BJTH17均与体高和体宽性状极显著相关(P0.01),发现存在"一因多效"和"多因一效"现象。不同基因型的多重比较表明,BJT12、BJT18和BJTH4基因座的AA基因型、BJT4基因座的BB基因型、BJT6基因座的AB基因型与体质量、体长呈正相关,BJTH6和BJTH17基因座的AB基因型与体高、体宽呈正相关。研究结果为哲罗鲑的分子标记辅助育种提供依据,同时也为下一步构建哲罗鲑的遗传连锁图谱提供基础数据。     

绵羊微卫星标记与体重的相关分析

根据绵羊的遗传图谱及相关报道选择了位于4号和6号染色体上连锁的10个微卫星基因座，并在中国美利奴肉用品系群体中对这些基因座进行群体遗传学特性分析和体重的相关性分析。微卫星不同基因型在体重上的多重比较和微卫星标记对体重相关效应的F检验结果表明：紧密连锁的OARHH35 和BMS648 与体重间存在显著的相关性（P<0.05），有一个影响体重的QTL；染色体进行同源比较发现表明：在这两个位点之间可能有一个ob基因；6个微卫星基因座的基因型（BM9058（131/149 ）、BM4621（149/181）、BM4311（119/119）、OARJMP8（131/145）、OARHH35（123/155）和BMS648（176/208））在体重上存在显著的差异。     

虾夷马粪海胆群体的遗传多样性及微卫星标记与生长性状的相关性分析

为了明确性腺性状和分子标记之间的关系,在海胆选育工作中提高性腺性状,利用微卫星标记对海胆各生长性状及性腺颜色进行相关分析。选用28个虾夷马粪海胆多态性微卫星分子标记对虾夷马粪海胆自交F1代家系群体的进行了检测分析,结果表明:共检测到80个等位基因,平均等位基因数为2.857 1个;平均有效等位基因数为0.827 0个; 观测杂合度平均值0.515 0,期望杂合度平均值为0.530 4;平均多态信息含量（PIC）为0.402 6,卡方检验显示其中有9个位点发生了偏离(P<0.01)。采用一般线性模型(GLM)进行连锁显著性检验,发现与壳高、体重和体积显著相关（P<0.05）的微卫星标记各1个,分别为TS131、TS38和TS105;与海胆颜色L*值（暗-亮）显著和极显著相关的微卫星标记分别为4个 (TS38、TS85、TS105、TS108)和1个(TS41);与海胆颜色a*值（绿-红）显著和极显著相关的微卫星标记各1个(TS101 TS41);与海胆颜色b*值（蓝-黄）显著相关的微卫星标记3个(TS41、TS114和TS128);与海胆口器重显著和极显著相关的微卫星标记各1个(TS114和TS46)。该研究结果可以为虾夷马粪海胆的相关性状进一步QTL定位提供参考数据,并为虾夷马粪海胆的养殖和选育提供理论指导。     

福建黄牛的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄牛的等位基因频率、多态信息含量（PIC）、遗传杂合度（日）和有效等位基因数（E）等指标进行统计分析，并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究、结果表明：（1）8个微卫星标记在所检测的福建黄牛群体中都表现出较丰富的多态性，4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因，每个微卫星标记平均检测到7、2个等位基因（3—11）；8个微卫星标记的PIC平均为0.6471（0.3942—0．8062），各群体的PIC差异不显著；全部群体的日为0.2930：各群体的E平均为3．37（3.03—3.84）、这显示黄牛群体的等位基因频率、PIC、H和E等指标有较好的一致性，说明福建黄牛品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性．（2）根据Nei氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析的结果显示，4个群体间的遗传变异不大．福建黄牛地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性；遗传距离及聚类分析结果表明，这些群体黄牛属于同一个地方品种．     

福建黄牛的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄牛的等位基因频率、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度(H)和有效等位基因数(E)等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究.结果表明:(1)8个微卫星标记在所检测的福建黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7.2个等位基因(3-11);8个微卫星标记的PIC平均为0.6471(0.3942-0.8062),各群体的PIC差异不显著;全部群体的H为0.2930;各群体的E平均为3.37(3.03-3.84).这显示黄牛群体的等位基因频率、PIC、H和E等指标有较好的一致性,说明福建黄牛品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性.(2)根据Ne i氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析的结果显示,4个群体间的遗传变异不大.福建黄牛地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;遗传距离及聚类分析结果表明,这些群体黄牛属于同一个地方品种.     

生长相关的微卫星标记在镜鲤繁殖群体中的验证

利用大样本镜鲤繁殖群体分析和验证8个生长相关微卫星标记与体质量和体长的相关性：结果显示：8个微卫星标记在镜鲤繁殖群体中均获得了稳定、清晰的DNA条带,片段大小在100-322bp之间,共检测到33个等位基因、75种基因型。对每个微卫星座位的基因型与体质量、体长性状进行相关性分析发现,HLJ343与体质量、体长显著相关;HLJ319、HLJ302及HLJE339与体长显著相关。本研究用大样本随机群体证实了此4个QTL位点与体质量或体长性状具有相关性,下一步可根据优势基因型指导家系配组,开展基于QTL结果的分子聚合育种研究。