早籼稻优质品种数量性状的遗传距离与聚类分析

32个细长粒形丝苗型的华南地区早籼稻优质品种数量性状的遗传距离进行聚类分析,分为5个类群。类群间差异比类群内大,水稻品质育种杂交亲本选配应在类群间进行。但在改良品种1—2个性状时,亲本之一符合育种目标,另一亲本也可不一定选用遗传距离大的品种。     

高粱主要杂交亲本的聚类分析

本研究对１８个高粱品种（品系）、１１个数量性状进行了遗传距离测定和聚类分析，并对部分亲本间遗传距离与其杂种优势进行了相关分析。结果表明：主成分分析是评价品种（品系）综合性状优劣，鉴定优良种质的有效方法。在对亲本聚类时，将供试材料分为８个类群。分类结果和杂种优势利用的育种实践基本吻合。遗传距离与杂种优势正相关不显著，而中亲值与杂种优势相关极显著。因此，在选配亲本时，应根据性状表现，计算主成分值进行综合评定后，再依遗传距离的大小来选配。     

油松优良家系数量性状遗传距离分析

以21 a生油松子代测定林中34个油松优良家系为对象,对生长和干形数量性状的遗传变异、性状间的相关关系进行研究,并利用主成分分析和遗传距离聚类分析方法对油松家系进行了综合评价.结果表明:油松优良家系间在树高、胸径、材积、结实、干形和保存率等方面存在着显著差异,这些差异主要受遗传因素控制;生长性状之间的遗传相关达到极显著水平(P<0.01),胸径和材积与结实性状遗传相关也达到显著水平(P<0.05);3号家系、31号家系和16号家系主成分值较大,是生长和结实都较好的优良家系.聚类结果表明:34个油松优良家系分为6个明显类群,同一类群内家系间遗传距离小,不同类群间遗传距离大.生长量大的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类家系可作为进一步遗传改良的优良家系.     

苦瓜品种资源聚类分析

对14个不同绿苦瓜、白苦瓜和广西野生苦瓜品种的种子可溶性蛋白、盐溶性蛋白、醇溶性蛋白和碱溶性蛋白进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,运用遗传距离系数对14个苦瓜品种进行聚类分析方法;同时利用8个数量性状计算主成分遗传距离,对14个苦瓜品种进行聚类分析.结果表明,广西野生苦瓜与其他13个栽培品种之间遗传距离系数大,数量遗传距离也大,亲缘关系远,分别归为不同的品种类群;栽培品种间差异小,很难进行类群的清晰划分.     

基于表型和ISSR标记的小株型荷花遗传多样性分析

采用表型性状和简单重复序列间扩增(ISSR)标记,对36个碗莲品种(系)进行遗传多样性分析。基于23个表型性状,品系间欧氏遗传距离系数平均值为7.78,范围在3.54～15.78间,聚类分析显示,以欧氏距离系数E=11.0,可将所有材料分为4组,其中32个聚在一个类群。基于10个ISSR引物,36个品系共获得62条扩增带,其中44条具有多态性,多态带百分率为71.0%,品系间的遗传相似性系数平均值为0.40,范围在0.10～0.71间,以遗传相似系数GS=0.60,可将所有材料分为3组。ISSR标记分析与表型性状分析都说明,碗莲资源遗传背景狭窄,互相间亲缘关系比较接近。     

玉米478近缘系的性状分析

对７个玉米４７８近缘的１５个数量性状进行了遗传距离测定。结果供试材料之间在多一状上存在显著差异，遗传距离差异也较大；通过聚类将其分为３个类群，类人的性着差异较小，类群间的性状差异较大。     

花生35个品种的主成分分析及遗传距离测定

根据各品种的主要成分值判断其表现特点,并从主成分值中选出最佳组合,进而选出综合性状比较理想的亲本。按遗传距离将参试品种划为8个类群,这些类群有以类型为界的明显趋势,但是遗传差异的大小则不完全依赖于类型之间。在不同的类群间进行亲本选配,可以提高育种效果,遗传距离则可以作为亲本选配的一个较理想的指标。     

玉米骨干自交系及其遗传距离的测定分析

本文通过统计分析和数据处理测定了25个玉米自交系间遗传距离,并聚成7类。通过遗传距离的测定和分析现有推广的杂交种亲本之间的遗传距离都大于类内平均距离,因此,类群间差异较大遗传距离较大的自交系做为杂交组合的亲本为好。以自交系间表现型和地理起源的差异不能代替遗传距离上的差异。遗传距离的分析,对自交系的选育、改良群体、选配杂交组合可提供科学依据,所以遗传距离是重要的遗传参数。     

利用SRAP技术分析茭白种质资源遗传多样性

采用简化的SRAP分析方法,用47对SRAP引物对35份茭白材料进行遗传多样性分析,共获得153个扩增位点,其中多态性位点11个,平均多态水平为7.2%,扩增产物的片段大小范围在50～400 bp。利用UPGMA法进行聚类分析,以遗传相似系数0.51为阈值,将35个茭白品系分为2个类群。单双季茭间遗传距离大于各类型内部差异,来源地相同的材料具有更高的遗传相似性。     

河南地方野生小鼠与近交系小鼠的RAPD分析

选用120个随机引物,对河南地方野生小鼠及其他4个近交系小鼠品系进行RAPD分析,筛选出36个多态性引物,检测到380条扩增片段,其中多态性片段304条,且野生小鼠具有若干特异条带,反映出野生小鼠与4个近交系小鼠品系间存在遗传差异。多态性分析表明,野生小鼠与PWK之间的遗传距离指数为0.009 24,遗传关系最近;与DDK遗传距离指数为0.011 30,遗传关系最远。试验结果表明,河南地方野生小鼠与4个近交系小鼠品系之间有遗传相似性,也存在差异,同时也证明RAPD技术可以很好地用于检测小鼠品系间的遗传变异及区分不同的小鼠品系。     

基于AFLP的垂乳银杏种质遗传多样性分析

采用AFLP分子标记技术对14份垂乳银杏种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明,8对引物在14份垂乳银杏种质扩增后检测出935条谱带,有920条多态带,多态带比例为98.40％,表明所试垂乳银杏材料具有丰富的多样性;遗传相似系数为0.4404～0.7299,平均值为0.4752,说明各种质之间有一定的遗传分化;聚类分析和主坐标分析将垂乳银杏分成5类,来源相同的种质并没有严格的聚在一起,表明垂乳银杏的变异与地理来源无严格的相关性。     

滩地13个杨树无性系遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记手段,研究杨树无性系的遗传多样性。在探讨杨树叶片基因组DNA提纯方法和优化PCR扩增反应体系的基础上,采用18个引物对13个杨树无性系的基因组DNA进行扩增;每个引物扩增的DNA片段数为1～14个,共产生126条带,其中多态带53条,占42%,平均每个引物扩增出3条多态带。结果表明:通过对126条谱带的聚类,分析了供试杨树无性系的系统发育,并通过比较各品种间的特异带或特征带的差异进行无性系鉴别和测定,运用特殊谱带,建立了杨树无性系的分子检索表。     

甘蔗数量性状遗传的研究 Ⅱ.甘蔗F_1代群体的遗传距离和聚类分析

从1982年甘蔗育种计划中选取8个家系的F_1群体,根据它们的遗传距离进行聚类分析和主分量分析,结果表明,两种数量分类方法效果相当一致。家系1和4两个F_1群体被归入一个聚类(Ⅰ),家系3,7,2,6,5和8被归入另一聚类Ⅱ。发现一些家系,虽然来自地理位置十分不同的国家和地区,但是它们的遗传距离很近,可看作是血缘相近的、亲缘效应大体相似的无性系,并可划入同一聚类。初步认为聚类内的不同家系实际上是同一组合的重复杂交。     

98份甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析

【目的】甘蔗蔗糖产量约占中国食糖总量的92%。具有遗传多样性的甘蔗种质资源是甘蔗杂交育种的基础,杂交亲本的选择和组合的选配是杂交育种成败的关键,研究98份种质的遗传多样性及亲缘关系,为甘蔗杂交组合选配和种质创新提供参考依据。【方法】采用CTAB法提取甘蔗幼叶基因组DNA,利用扩增片段长度多态性（amplified fragment length polymorphism,AFLP）分子标记技术,对来源于10个国家的98份种质资源的基因组DNA进行酶切、连接、预扩增、选择性扩增,选择性扩增产物在5%变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳分离,银染显色。电泳结果得到“0,1”矩阵,使用POPGENE 32软件计算每对引物的多态性条带数、多态性比率、多态信息量、有效等位基因数、遗传多样性指数等指标,同时使用NTSYS pc-V. 2.1计算种质间遗传相似系数,根据相似性系数进行UPGMA（unweighted pair group method analysis）聚类分析和PCA（principal component analysis）主效应分析,对甘蔗种质资源进行分类。【结果】采用云南省甘蔗遗传改良重点实验室筛选出的10对引物组合共扩增出1 392条谱带,其中多态性条带为1 344条,多态性条带比率为96.55%,平均每对引物扩增出139.2个位点和134.4个多态性位点。98份种质的相似性系数在0.484-0.929,平均为0.734,多态信息量为0.2495,每个位点的有效等位基因数为1.4092,平均多样性指数为0.3890,遗传相似性系数最高的是KN90-418和KN90-455,达到0.929,最低的是云蔗94-375和IS76-126,为0.484。根据遗传相似性系数进行聚类分析,在遗传相似性系数0.64处切割时,可划分为4个类群,第I类群有5份澳大利亚种质,包括IK76-48、IS76-126、IK76-22、SES309和E.SARPET;第II类群有1份澳大利亚种质是IS76-199;第III类群有3份种质,包括KN93-06、90-110-9和BURMA;第IV类群有89份种质,在遗传相似性系数0.79处切割时,可将第Ⅳ类群划分为9个亚群（A、B、C、D、E、F、G、H和I）。基于Jaccard系数用PCA法对98份甘蔗种质AFLP标记结果进行主效应分析,主效应分析显示了不同种质的分类位置,分子主效应分析结果与分子聚类结果一致,集中在一个区域的种质亲缘关系较为紧密,澳大利亚种质位置较为分散,最分散材料为蔗茅属和细茎野生种。【结论】98份种质资源的遗传基础差异较小,亲缘关系较近,其中,澳大利亚种质遗传多样性相对较丰富。90-110-9、KN93-06和粤糖00-236较为特殊,在杂交组合选配中应给予重点关注。     

RAPD-PCR Analysis on Genetic Relationships Between Cultivars of Tree Peony

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) was used to analyze genetic polymophism of 35Tree Peony cultivars with 7 different color groups. Thirty four primers amplified 418 DNA fragments and 337polymorphic bands (80.6%), including specific DNA markers for 18 cultivars that could be used to differentiate cultivars. The UPGMA method was used to analyze the genetic relationship among cultivars. The results showed that 35 Peony cultivars could be divided into 2 cluster groups when using similarity criteria of 1.5, and into 4 cluster groups when using similarity criteria of 1.0. The result confirmed that the flower color has no relation to the genetic clusters and the Tree Peony cultivars originated from the same area has close genetic relationship. Therefore, genetic background has no large effect on the genetic relationship. The sequence based on polymorphic rate from high to low was Blue groups ＞ Yellow groups ＞ Bark red groups ＞ Blake groups ＞White groups ＞ Green groups ＞ Red groups.     

杂种马褂木无性系随机扩增多态DNA指纹图谱的构建

利用随机扩增多态（RAPD）分子标记技术对31个杂种马褂木无性系的研究结果表明，23个随机引物共扩增出128条谱带，其中76条（59．38％）谱带在无性系间呈多态性，无性系间的遗传距离最小为0．0813，最大为0．3522，这说明无性系间的遗传多态性相对较小，从而认为在今后杂交工作中应注意扩大亲本的遗传基础。聚类分析的结果证明RAPD指纹图谱在一定程度上反映了无性系间的亲缘关系，因此，可用于谱系分析。利用所构建的RAPD指纹图谱成功地对各无性系进行了区分，这对于无性系鉴定和知识产权保护具有重要的意义。     

福建黄兔的遗传多态性及分类

 用8个微卫星标记对福建黄兔的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果表明：（1）8个微卫星标记在所检测的福建黄兔群体中都表现出较丰富的多态性,在6个群体微卫星标记的平均多态信息含量（PIC）为0.6622(0.5723~0.7222),各群体的PIC差异不显著;全部群体平均杂合度为0.6857(0.5904~0.7267)。这显示黄兔群体的多态信息含量、杂合度等指标有较好的一致性,说明福建黄兔品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性。（2）根据奈氏标准遗传距离,并进行UPGMA聚类分析,结果显示6个群体间的遗传变异不大。福建黄兔地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;从遗传距离及聚类分析结果表明这些群体黄兔属于同一个地方品种。     

旱柳野生种质资源收集及多样性分析

目的在山东境内调查收集旱柳优树种质,探索旱柳种内遗传多样性水平。方法在试验区建立旱柳无性系苗期对比试验林,利用2年生苗木,分别进行表型数据观测和分子水平遗传多样性标记,分析旱柳种内遗传多样性。结果旱柳种质资源群体内存在丰富的表型变异和分子遗传变异:不同无性系枝干颜色呈黄绿、灰绿、绿色、灰褐、红褐、褐色,且色差重叠少,差异显著;主干有直立、稍弯、中等弯曲、较强弯曲、扭曲,小枝有上弯、直立、下垂,且形态差异显著;不同无性系树高变异范围为1.2~5.5m,地径为0.6~4.6cm,叶长为8.5~18cm,叶宽为0.92~3.49cm,叶面积为6.258~33.584cm2,差异极显著(P < 0.001)。叶长和叶面积的极端差异来源主要是旱柳无性系内,树高、地径、叶宽的极端差异则主要来源于无性系间。表型变异主要来源于无性系间,无性系间的性状分化对旱柳种内性状分化的贡献率达80%以上,说明无性系间的性状分化是旱柳种内性状分化的主要原因。AFLP结果显示,旱柳观测位点的平均多态性比率高达99.5%,显示出极高的多态性;多样性指数结果显示,Nei’s遗传多样度(H)为0.2322,Shannon信息指数(I)为0.3746,表明55份种质在种水平上属于同一个种,与主成分分析及聚类结果一致。结论试验证明旱柳种内存在丰富的表型及分子遗传多样性,是优良的选择和杂交育种材料。      

Genetic Analysis of Superior Clones and Identification of Specific Marker of Elite Clones of Pinus kesiya

In the present study, the genetic distances between 85 superior clones from seven natural populations of Pinus kesiya var. langbianensis were analyzed by RAPD-PCR assays, and then, a UPGMA cluster diagram was established based on the genetic distances to reveal their genetic relationship. In addition, specific markers of elite clones were identified by carefully comparing the fingerprints of the 85 clones. The results showed that the 85 P. kesiya clones were divided into three groups at a genetic distance of 0.59. Two specific markers that were able to distinguish some elite clones from others were identified. The results may provide a molecular basis for the identification and selection of elite clones of Pinus kesiya var. langbianensis.     

福建黄牛的遗传多态性及分类

用8个微卫星标记对福建黄牛的等位基因频率、多态信息含量(PIC)、遗传杂合度(H)和有效等位基因数(E)等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究.结果表明:(1)8个微卫星标记在所检测的福建黄牛群体中都表现出较丰富的多态性,4个群体8个微卫星座位共有58个等位基因,每个微卫星标记平均检测到7.2个等位基因(3-11);8个微卫星标记的PIC平均为0.6471(0.3942-0.8062),各群体的PIC差异不显著;全部群体的H为0.2930;各群体的E平均为3.37(3.03-3.84).这显示黄牛群体的等位基因频率、PIC、H和E等指标有较好的一致性,说明福建黄牛品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性.(2)根据Ne i氏标准遗传距离进行UPGMA聚类分析的结果显示,4个群体间的遗传变异不大.福建黄牛地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;遗传距离及聚类分析结果表明,这些群体黄牛属于同一个地方品种.