梨品种SSR分子鉴定体系的建立及应用

为了建立梨品种鉴定的分子标记技术体系,本研究以主栽梨品种和育成的梨新品种为试材,开展了梨品种SSR分子标记鉴定体系试验.通过PCR产物的毛细管电泳检测,从200个SSRs中筛选出扩增稳定、多态性高、退火温度较一致的13个SSRs,并将这13个SSRs在68个梨品种上进行扩增,共获得110个等位基因,平均每个SSR的扩增等位基因数为8.46个.13个SSRs的多态性信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.53～0.88,平均PIC值为0.72.用CH02d1ob、CH02b10、NH009b、NH203a、NH013a和NH031a 6个SSR标记能将68个梨品种全部区分开.其中,CH02d1ob、CH02b10和NH009b 3个标记可以区分60个梨品种.本研究建立的SSR分析技术得到了3家检测机构的验证.因此,该SSR分子鉴定体系具有高效性和稳定性的特点,可用于梨的品种鉴定.     

SSR分子标记在苹果品质性状分析中的应用

对SSR分子标记的原理、特点及其在苹果抗性、果实色泽、酸度、苹果种质资源保存、品种鉴定和遗传连锁图谱构建等方面的应用作了简要概述,并结合其自身特点展望其应用前景。     

利用SSR标记进行品种权有争议品种的鉴定

近年来涉及作物品种权争议的事例逐年增加,仅根据形态学性状进行鉴定不易作出明确的结论。本文提出利用SSR标记的多等位基因、共显性遗传特性和SSR分析技术重复性好的特点,通过比较争议品种之间和争议品种与亲本间SSR位点上等位基因的异同,进行品种权有争议品种的鉴定,并就具体鉴定方法进行了探讨。     

利用SSR分子标记进行棉花品种鉴定的研究

利用均匀分布于棉花26条染色体上的39对SSR核心引物对16个不同来源的棉花品种样品进行区别与鉴定实验,探讨了棉花品种鉴定的取样方案和位点异同判读方法。通过比较不同取样量样品包含的遗传信息,确定了基本的取样量,并将样品间位点异同类型分为相同位点、疑似相同位点和差异位点。据此对16个品种进行位点异同性分析,结果表明同一品种的不同样品间差异位点数均在0~2间,而不同品种间的差异位点数介于5~25。结合品种间差异位点的阈值分析,研究认为当两样品间差异位点数2时,即判定为不同品种;当差异位点数≤2时,即判定为近似或极近似品种。     

花菜类SSR分子标记筛选及其在品种鉴定上的应用

青花菜(B.oleracea var.italica)和花椰菜(B.oleracea var.botrytis)均为以花球为产品的甘蓝变种,亲缘关系较近,生产上常以花菜类来统称。为筛选出一套花菜类品种简单重复序列的鉴定引物,分三批从已公布的SSR引物中挑选出70对引物,以8份品种为材料,根据扩增多态性好、稳定性高、染色体上分布均匀等原则筛选出36对引物,用于花菜类品种鉴定。经173份品种验证,该引物组合可以很好地区分花椰菜与青花菜,能鉴定出绝大部分品种,只有3个品种相似系数达1,无条带差异,无法区分开。形态性状观测发现这3个品种差异极小,验证了本研究建立的SSR标记鉴定品种方法的准确性。36对引物中只需要10对核心引物就可以达到最大区分能力,不同组合理论分辨力不同,最大可达2.92×10¹²,推荐染色体上分布均匀的组合作为花菜类品种鉴定的最优组合,其理论分辨率为1.09×10¹²。本研究表明SSR分子标记可以用于花菜类品种鉴定,可为今后花菜类产业化中种苗纯度和真实性鉴定及种质资源管理提供技术支撑。     

利用SSR标记鉴定柚和杂柑品种

采用SSR技术,从105对柑桔SSR引物中,筛选出10对在柑桔大类品种间多态性位点丰富、带型清晰、重复性好的SSR引物.利用其中5对SSR引物对5个柚和7个杂柑品种DNA进行PCR分析,共扩增出35条谱带,其中27条谱带呈现多态性,引物多态性带纹比例均在60%以上.扩增片断的大小集中在100 bp～500 bp之间.分别针对柚和杂柑品种筛选出两个高效的引物组合(SSR17、SSR15、SSR16、SSR12与SSR17、SSR18、SSR16),利用这两组引物成功构建出了我国主推的5个柚和7个杂柑品种的特征指纹图谱.并应用指纹图谱自动识别软件Gel 2.0对各品种指纹图谱进行识别,建立了相应品种的指纹模式图谱库.     

使用梨和苹果的SSR标记来鉴定楹椁品种

为了进行遗传鉴定，用梨和苹果中开发的SSR标记来鉴定了不同属的楹椁品种（Cydonia oblonga）。试验表明，所用的118个SSR标记中，77个标记产生了1个或多个可再现的扩增显带，这77个标记可用于鉴定楹椁，其中20个SSR标记来自梨树，57个SSR标记来自苹果。用39个多态SSR标记来分析了20个楹椁品种，其中包括15个种质系，3个‘Srnyma’品系和2个‘Kaori’品系。用39个SSR标记获得了总共122个多态性扩增断片，而这122个多态性扩增断片可以把这20个品种划分成12个基因型。     

罗田八个主栽板栗品种的SSR鉴别

湖北省罗田县是中国著名的板栗(Castanea mollissima BL.)之乡,栽培的板栗品种多,这些品种仅依据形态特征难于准确区分。本研究以该地8个主栽板栗品种为研究对象,分别以嫩叶、老叶及树皮为材料提取DNA,然后进行SSR标记分析,以建立品种的分子标记识别卡及鉴别体系。结果表明,嫩叶、老叶及树皮三种材料提取的DNA均可用于SSR实验;13对SSR引物对8个品种共扩增出了115条带,其中,多态性条带98条,多态性带百分率85.22%;建立了各品种的SSR标记识别卡;两两品种间的遗传相似系数在0.47～0.82之间;构建了基于遗传相似系数的品种遗传关系聚类图,在遗传相似系数0.47处,可将这8个品种分为2组;依据SSR分子标记,13对引物中,有3对引物可以单独将8个品种完全区分开,用引物S13的SSR标记编制了8个板栗品种的鉴别检索表。研究结果为这些品种的推广应用及进一步遗传育种提供了科学依据。     

利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱

为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系,构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物,构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235个等位基因,平均每个等位基因检测到多态性位点7个,多态性位点变化范围为2~12个。20个高粱品种36个SSR位点的遗传多样性指数和多态性信息量的变化范围分别为0.3490~0.8813和0.3144~0.8696,平均值分别为0.6976和0.6571。从36对SSR引物中筛选到多态性丰富的2对引物作为高粱品种鉴定的特征引物,2对SSR特征引物组合可区分所有供试品种。20个高粱品种的SSR指纹图谱互不相同,可以作为各品种特定的图谱,为品种鉴别提供依据。     

苹果栽培品种的微卫星标记鉴定

利用SSR标记技术,根据11对引物的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱分析了20个主要苹果栽培品种的遗传多样性。共扩增出163个位点,其中多态性位点74个,每对引物的多态位点百分率在33.33－63.16%之间。利用NTSYSpc2.1软件进行相似性系数计算,并构建聚类树状图,可将供试苹果品种分为四大类,与传统系谱分类基本一致,并初步建立了一个供试苹果品种的SSR基因型图谱库,为建立中国苹果品种的SSR基因型数据库奠定了基础。说明SSR分子标记技术应用于苹果品种鉴定和品种权保护是可行的。     

基于SSR分子标记技术的葡萄种间杂交F1代鉴定

SSR分子标记技术以其多态性高、重复性好和检测方便快捷等优点,被广泛应用于植物F1代真假杂种的鉴定.为了长期有效的开展葡萄杂交育种工作,本研究以葡萄杂交组合'北冰红'×'贵人香'F1代159个单株及'双红'×'贵人香'F1代121个单株为试验材料,利用SSR分子标记技术结合田间形态学性状对葡萄杂交后代的真伪进行鉴定.在...     

利用SSR标记进行优质冬小麦品种(系)的遗传多样性研究

遗传多样性研究对于作物育种具有重要意义. 选择分布于21条小麦染色体上的59对SSR引物对48个优质冬小麦新品种(系)进行了遗传多样性分析. 共检测出209个等位位点, 每对引物等位位点数在2～9之间, 平均为3.5个. 位点多态性信息含量PIC变幅为0.16～0.87, 平均0.56. 8个引物组合在一起可将全部品种区分开来, 48个品种可分为五类,     

利用AFLP分子标记鉴定苹果砧木

利用AFLP分子标记技术,对30个苹果砧木进行研究。从64对引物组合中筛选出3对多态性高、分辨能力强的引物用于扩增,共获得199条带,其中多态性带176条,多态性率为88．4％。扩增结果显示,3对引物组合在12个砧木中扩增出特征带,且每对引物组合均能将所有砧木鉴别开,表明AFLP技术用于苹果砧木鉴定的效率很高。通过聚类,对供试砧木的遗传关系进行分析,为中国优良苹果砧木资源的进一步收集和利用提供科学依据。     

棉花杂交种种子纯度的SSR分子标记鉴定方法

种子的纯度是影响杂交棉发挥其杂种优势的重要原因。本研究基于不同棉花品系之间的遗传变异,筛选出杂交种亲本间具有多态性,且为共显性的SSR核心引物,用于杂交种种子纯度鉴定。通过统计每个检测引物扩增带型的差异或一致性,综合得出杂交种的种子纯度。利用该方法,对4个棉花杂交种种子的纯度进行SSR分子标记鉴定,为棉花杂交种纯度鉴定提供参考。     

利用SSR快速鉴定棉花品种真实性和纯度

利用SSR分子标记技术对棉花品种真实性和纯度进行分析研究,旨在为棉花品种提供分子鉴定依据。以具有代表性的棉花品种为材料,经过引物初筛和复筛,确定26对均匀分布于棉花染色体上的SSR核心标记。结果表明,26对核心标记在120份材料中筛选得到138个等位位点,其中129个为多态性位点,多态性比率达93.48%。以标准样品为对照,利用26对核心标记对10份棉花常规种进行真实性鉴定,发现仅有源棉6号与标准品种的DNA图谱高度一致,其他9份常规种与标准品种均存在8~18个差异位点,分子鉴定结果与田间鉴定相符。另外分别筛选5对特征引物作为纯度检测标记,采用单位点平均法统计4份常规棉品种检测结果表明,源棉6号纯度最高,为98.0%,源棉1号最低,为90.5%,检测结果与田间纯度鉴定呈现正相关性。研究表明利用SSR标记技术鉴定棉花品种真实性和纯度的方法完全可行。     

吉林省主推玉米品种的SSR分子标记纯度鉴定

针对吉林省主推玉米品种,构建了一套科学高效的纯度鉴定体系。以吉林省主推的50个玉米品种为研究材料,从GB/T 39914-2021公布的40对SSR引物中筛选出9对用于吉林省主推玉米品种的纯度鉴定。筛选出的9对引物杂合度在82%~100%,平均杂合度为91.5%,PIC值在0.44~0.75,平均PIC值为0.63。该组引物多态性高、稳定性强、分辨率高且非特异扩增片段少。将9重扩增体系进行优化,形成吉林省主推玉米品种纯度鉴定体系。用这9对引物对吉林省主推的6个品种进行纯度鉴定,可准确检测出品种的典型株、自交苗和异型株,共检测出10个自交苗和7个异型株,6份样品最高纯度为98%,最低纯度为96%,鉴定结果与田间鉴定结果相关性系数为0.766,相关性较高,结果可靠。     

棉花常规种种子纯度的SSR分子标记鉴定

棉花是新疆重要的经济作物,寻找一种有效的棉花品种(系)纯度检测方法是解决目前市场上棉花品种多、乱、杂问题的有效途径.本研究选取新疆棉花品种(系)中的41个常规种为试验材料,利用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)分子标记技术筛选出15对条带清晰、多态性高的核心引物,对41份试验材料进行...