基于网络药理学及动物实验探讨欧李类黄酮成分抗骨质疏松作用

为了定性分析欧李果实中的类黄酮成分,通过动物实验研究欧李类黄酮抗骨质疏松作用,并基于网络药理学探讨其作用机制。采用液相色谱-质谱联用法,对欧李果实类黄酮粉末进行成分分析,建立维甲酸小鼠骨质疏松模型,检测小鼠血清中Ca、StrACP、AKP、MDA、T-SOD等含量及股骨长度等物理指标。利用Swiss和PubMed挖掘活性成分靶点信息,通过GeneCards、OMIM、TTD和PharmGKB数据库得到骨质疏松相关靶点信息,将成分靶点和骨质疏松靶点取交集。使用STRING建立蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。使用DAVID对欧李果实类黄酮治疗骨质疏松作用靶点进行KEGG通路分析,绘制KEGG富集分析高级气泡图。利用Cytoscape软件构建欧李果实类黄酮治疗骨质疏松“活性成分-靶点”网络图。结果表明：欧李果实类黄酮粉末正离子模式下共检测到50种活性成分;在小鼠骨质疏松模型中,欧李类黄酮显著提高血清钙和AKP水平,增强T-SOD活性,降低MDA含量及StrACP水平;基于网络药理学分析得到欧李果实类黄酮治疗骨质疏松作用前5位KEGG通路主要是催乳素信号通路、内分泌抵抗、C型凝集素受体信...     

基于网络药理学和分子对接探究杜仲防治骨质疏松作用机制

本研究运用网络药理学和分子对接的分析方法，探究杜仲防治骨质疏松的分子作用机制。通过TCMSP、GeneCards、OMIM以及DrugBank数据库分别对杜仲的入血有效活性成分、作用靶点以及与骨质疏松有关的疾病靶点进行汇总与筛选。将杜仲的有效活性成分与作用靶点经Cytoscape处理建立起药物靶点的网络关系图，找到药物疾病的共同作用靶点；通过STRING平台建立这些靶点的蛋白质言进行关键靶点的基因本体（Gene Ontology, GO）功能和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）信号通路富集分析，并将分析数据可视化，最后利用AutoDock进行分子对接验证。结果显示筛选后共得到25个杜仲的有效活性成分和202个预测作用靶点，对应的主要化学成分为槲皮素、山柰酚和?-谷甾醇，与骨质疏松有关的疾病靶点共计4 603个，与杜仲有共计144个共同作用靶点，在这144个关键靶点的PPI网络中筛选后得到14个关键靶点。关键靶点的基因富集结果显示，PTGS2、HSP90AA1、PPARG、ESR1和JUN等核心靶点主要通过...     

基于网络药理学和分子对接探讨上中下通用痛风方治疗痛风性关节炎的分子机制

本文探讨上中下通用痛风方治疗痛风性关节炎(GA)的潜在分子机制。检索中药系统药理学分析平台,挖掘上中下通用痛风方的活性成分和对应靶点,检索DisGeNET、GeneCards和DrugBank等数据库,挖掘GA疾病靶点,采用R语言Venn包,获取药物与GA的交集靶点基因。采用Cytoscape 3.8.0构建药物-成分-靶点网络并筛选核心成分;采用String平台构建交集靶点的蛋白互作网络并筛选核心靶点基因。采用R语言进行GO功能和KEGG通路富集分析,采用AutoDock Vina软件进行分子对接。共挖掘出上中下通用痛风方与GA交集靶点基因45个。筛选出槲皮素、黄芩素和汉黄芩素等7种核心成分,重组人趋化因子8(CXCL8)、白介素(IL)-1β等3种核心靶点基因。GO功能共富集1 561个条目,主要涉及对脂多糖的反应、细胞膜凹样内陷和氧化还原酶活性等;KEGG通路共富集120个条目,如AGE-RAGE、IL-17等。分子对接结果表明,核心成分与靶点蛋白结合活性良好。上中下通用痛风方核心成分槲皮素、黄芩素和汉黄芩素等可通过作用于CXCL8、IL-1β等核心靶点对AGE-RAGE和IL-...     

基于网络药理学的平胃散治疗溃疡性结肠炎的潜在机制研究

通过网络药理学研究平胃散对于溃疡性结肠炎(UC)的治疗作用及其潜在机制.通过检索中药系统药理数据库(TCMSP)收集平胃散中苍术、厚朴、陈皮、甘草4味中药的主要活性成分及其相关药物作用靶点;基于UC相关疾病数据库GeneCards、 TTD以及OMIM综合筛选疾病靶点;比对药物与疾病靶点筛选共同潜在靶点,通过STRING数据库、 Cytoscape软件构建平胃散治疗UC靶点相互作用网络并筛出核心节点;同时将药物和疾病的共同潜在靶点与筛选后的平胃散中活性成分通过Cytoscape＿v3.2.1软件生成体现活性成分-靶点相互作用的网络图并筛选出核心节点;利用STRING在线分析药物与疾病共同潜在靶点的GO生物富集过程和KEGG通路富集情况,构建活性成分-靶点-通路网络,并通过AutoDock＿Vina软件对药物活性成分与核心靶点进行分子对接验证.在平胃散活性成分-靶点-通路网络中有40个活性成分、 35条KEGG通路以及16个核心靶点,分子对接结果显示,10个活性成分与蛋白靶点MMP9,CAT,PTGS2,MAPK3,MAPK8,AKT1,MAPK14的最低结合能小于-7 kJ/mol,说...     

基于网络药理学探讨荔枝核抗炎作用机制

本文通过网络药理学探讨荔枝核抗炎作用机制.通过TCMSP及CTD数据库获取荔枝核与炎症相关的潜在基因靶点,采用String数据库构建蛋白相互作用网络图,运用Cytoscape 3.8.0软件构建荔枝核活性成分-靶点-通路网络图,利用WebGestalt对荔枝核潜在的关键靶点分别进行GO和KEGG的富集分析.结果 表明,...     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗慢性盆腔炎作用机制

目的 基于网络药理学探讨当归芍药散治疗慢性盆腔炎的作用机制。方法 利用TCMSP数据库筛选出当归芍药散活性成分及其相关靶标基因;使用Genecards数据库筛选慢性盆腔炎靶标基因;借助STRING在线数据库获取靶标基因相互作用关系;采用David数据库进行GO生物学过程分析和KEGG通路功能富集分析;利用cytoscape软件构建当归芍药散治疗慢性盆腔炎“活性成分-作用靶标-通路”网络。结果 当归芍药散的核心活性成分有山柰酚、β-谷甾醇等,核心作用靶标有PTGS2、TNF、JUN等;GO生物学过程分析结果表明当归芍药散活性成分的基因功能主要表现在药物反应、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调节、凋亡过程的负调节、信号转导等生物学过程; KEGG结果表明当归芍药散主要作用与TNF、Toll样受体等信号通路有关。结论 当归芍药散活性成分山柰酚、β-谷甾醇等可能通过TNF、Toll样受体等信号通路作用于PTGS2、TNF-α、JUN、IL-6等关键靶标基因进而发挥其临床功效,达到治疗慢性盆腔炎等疾病的目的。     

基于网络药理学的灵芝作用机制研究

通过TCMSP数据库,结合化合物含量信息,从灵芝中筛选出类药性好且含量较高的化合物;通过TCMSP、TCMIP、Swiss Target Prediction、SuperPred等数据库,预测化合物相应靶点;采用STRING数据库,构建靶点蛋白质互作(PPI)网络,并筛选出核心靶点;通过Enrichr数据库,预测核心靶点对应疾病;通过Cytoscape的ClueGo模块,对核心靶点进行基因本体分析(GO)及通路富集分析(KEGG),最终建立化合物-靶点、化合物-靶点-疾病-通路网络。根据试验结果,共筛选出60种化合物的22个核心靶点;核心靶点对应的疾病集中在肿瘤、自身免疫性疾病等;GO分析发现,核心靶点参与了88个生物过程,主要分为8个类别;KEGG分析发现,核心靶点参与了5个代谢通路,分为4个类别;化合物-靶点-疾病-通路网络显示了化合物、靶点、疾病、通路间的相互作用,如Lucialdehyde C、Ganoderic aldehyde A可通过DRD2靶点及22个相关生物功能通路,对30种疾病发挥作用。     

基于网络药理学探讨柴胡龙骨牡蛎汤治疗癫痫的作用机制

目的 基于网络药理学、生物信息学等方法研究神经递质参与柴胡龙骨牡蛎汤（CLMD）抗癫痫潜在机制。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）预测、筛选CLMD可能的生物活性成分,并预测其靶点。利用药物靶点数据库挖掘癫痫相关靶点,构建CLMD药效分子-靶点网络及CLMD药效分子-癫痫靶点网络,采用ClueGo分析CLMD治疗癫痫可能的分子机制,使用锂-匹罗卡品癫痫大鼠模型进行相关机制验证。结果 从TCMSP中获得CLMD中活性成分42个及110个药效分子靶点基因。利用数据库获得213个癫痫靶点。CLMD生物活性成分-癫痫靶点网络构建分析,最终得到CLMD治疗癫痫的169个关键基因,包括共同靶点11个,分别为：CHRNA2、CYP1A2、CYP3A4等。通路富集分析显示,这些重要靶点能够富集到在癫痫发生发展中发挥重要作用的通路上,如GABA-A受体、多巴胺能、谷氨酸能、神经递质受体等信号通路。动物实验验证,CLMD能提高锂-匹罗卡品癫痫大鼠GABA水平,降低DA水平,保护海马CA1区神经元细胞。结论 CLMD治疗癫痫具有多系统、多成分、多靶点的特点,特别是调整神经递质代谢水平。     

基于网络药理学探讨余甘子治疗糖尿病及其并发症的机制

基于网络药理学方法探讨余甘子治疗糖尿病（DM）、糖尿病肾病（DN）、糖尿病足（DF）的作用靶点、信号通路及潜在的分子生物学作用机制。通过中药系统药理学技术平台（TCSMP）、PubChem数据库筛选出余甘子的有效活性成分及作用靶点;利用DisGenet及GeneCards获取与DM、DN、DF相关的靶点基因;将余甘子活性成分的作用靶点与疾病的靶点基因取交集,得到共同的靶点基因。运用Cytoscape 3.9.1软件构建“成分-靶点-疾病”网络图;借助STRING在线数据库构建蛋白互作PPI网络图,使用Cytoscape 3.9.1软件插件ClueGo对共同靶点进行基因本体（GO）分析和信号通路（KEGG）分析,筛选出潜在的信号通路,并分析其作用机制。通过筛选得到余甘子的有效活性成分有7个,余甘子作用于DM、DN、DF的靶点分别为116、76、34个,余甘子可同时治疗3种疾病的共同靶点有32个。GO富集分析结果显示,余甘子-糖尿病及其并发症的交集基因的生物功能主要涉及到凋亡过程的负调控、细胞增殖、细胞迁移、蛋白质磷酸化、磷脂酰肌醇3激酶（PI3K）信号通路的正向调控等生物学过程。KEGG...     

基于网络的农机信息管理系统研究

本文介绍了我国农机信息化的发展现状,提出一种基于网络的农机信息管理系统,并对其系统结构、功能及系统的集成环境进行综述.     

基于方剂配伍理论和药理机制的中药有效组(成)分配伍研究思路

通过分析中药方剂配伍研兄的现状,认为中药有效组(成)分配伍研究模式是促进中药方剂研究现代化和国际化的一种重要模式,它对于创制新型中药有效组(成)分配伍复方,研制成分清楚、机制明确、质量可控的高效低 毒中药有效组(成)分配伍药物具有重要的意义〔提出了在方剂配伍理论和药理机制指导下的中药有效组(成)分配伍 研究思路,强调应加强方剂配伍理论对中药有效组(成)分配伍研究的指导,加强从经典方剂和中药药对入手研究有效 组(成)分配伍,加强用药理机制指导中药有效组(成)分配伍的研究.     

基于网络药理学黄精抗炎活性成分及作用机制研究

黄精属百合科黄精属，性味甘甜，食用爽口，具有重要的药用和食用价值。为探讨黄精抗炎可能活性成分及作用机制，借助TCMSP数据库筛选黄精活性成分，利用Pharmmapper和Uniprot数据库查找黄精活性成分靶点基因，借助GeneCards和MalaCards数据库筛选人体炎症相关基因，取交集获取黄精抗炎潜在靶点；在Metascape数据库进行GO富集和KEGG通路注释；使用Cytoscape3.6.1软件构建黄精抗炎潜在靶点的“成分-靶点-通路”网络图，STRING数据库构建PPI网络图。共筛选出(+)-丁香树脂醇-O-β-D-葡萄糖苷、中华在线1、甲基原纤细薯蓣皂苷、西伯利亚蓼苷A、3’-甲氧基大豆苷元、β-谷甾醇等12个潜在活性成分和ALB、EGFR、MAPK1、CASP3、ESR1等65个黄精抗炎潜在靶标，生物信息学富集分析中筛选出46个GO条目和13条KEGG通路，主要涉及Pathways in cancer（癌症的途径）、Prostate cancer（前列腺癌）、IL-17 signaling pathway（IL-17信号通路）、Hepatitis B（乙型肝炎）通路。该研究揭示了黄精抗炎多成分、多靶点、多通路的作用机制，为黄精抗炎机制研究和后续试验研究提供依据。     

基于网络药理学和免疫浸润的大蒜素对肝细胞癌作用机制分析

利用网络药理学和免疫浸润探讨大蒜素对肝细胞癌的作用机制。利用TCMSP数据库收集大蒜素的有效成分信息,利用PharmMapper数据库筛选大蒜素的作用靶点;通过STRING11.0数据库进行蛋白互作分析,并利用Cytoscape3.7.1软件进行可视化展示。通过GeneCards数据库收集肝细胞癌相关靶点,将化合物靶点与疾病相关靶点进行比对,利用Venny2.1.0工具绘制韦恩图。利用GEPIA数据库对潜在靶点进行表达差异分析和生存预后分析,最后利用TIMER数据库进行肿瘤细胞免疫浸润分析。结果表明,筛选得到大蒜素的潜在靶点有194个,与HCC相关的靶点31个,其中高相关性靶点4个。大蒜素治疗肝细胞癌具有多靶点、多途径、多通路的特点,CCNA2、AURKA、MMP9、ESR1等靶点可能在治疗过程发挥重要作用。     

网络化复混肥优化配料专家系统的开发

通过对复混肥生产配料过程中所涉及的植物营养、配方施肥和复混肥生产加工等领域知识的分析、研究,利用计算机技术,开发了基于网络的网络化专家系统。本文主要介绍了利用信息技术将复混肥优化配料与Internet相结合的网络化复混肥优化配料专家系统的具体开发工作。     

基于注意力机制和深度学习模型的外来海洋生物命名实体识别

为解决因外来海洋生物领域实体复杂且实体间存在嵌套导致命名实体识别效果较差等问题, 提出基于融合注意力机制的卷积神经网络 (CNN) -双向门控循环单元网络 (BiGRU) -条件随机场 ( CRF) 网络模型进行外来海洋生物命名实体识别, 并构造词向量、词性特征向量等特征作为网络模型的联合输入, 以提升网络模型识别效果...     

基于网络药理学的余甘子保健作用机制研究

【目的】探索余甘子（Phyllanthus emblica L.）具食疗保健作用的有效成分和保健作用机制，为余甘子的开发利用提供参考。【方法】首先分别以“余甘子”、“Phyllanthus emblica”或我国台湾和香港地区的余甘子拉丁名“Phyllanthi fructus”为关键词，在中药化学数据库、传统中药化学成分及靶标数据库和台湾传统中药化学成分数据库中对其化学成分进行检索；在此基础上，筛选出口服利用度≥20%的有效成分，进而通过STRING数据库、BioGRID数据库、STITCH数据库和CTD数据库对有效成分的蛋白靶标进行筛选，最后通过靶标的基因本体论（gene ontology，GO）、KEGG（kyoto encyclopedia of genes and genomes）代谢通路和疾病本体论（disease ontology，DO）的富集分析，阐明余甘子保健功效成分的潜在作用机制。【结果】对余甘子化学成分初步的检索与核定发现，其含有亚油酸、并没食子酸、没食子酸、诃子次酸、诃子酸等10种具不同结构的化合物；经口服利用度筛选后，确定油酸、没食子酸、并没食子酸和诃子酸是余甘子中具潜在保健功效的有效成分；进一步的药物 靶标互作分析发现，这些功效成分可作用于前列腺素G/H合酶、维甲酸类受体、内源激素类受体和谷胱甘肽硫转移酶。GO富集分析结果表明，在生物学过程中，余甘子有效成分的靶标在甾体类激素响应、谷胱甘肽及其衍生物的生物合成和代谢过程等条目下富集；分子功能中，余甘子有效成分的靶标在氧化还原酶活性、过氧化物酶活性和谷胱甘肽转移酶活性等条目下显著富集。基于KEGG代谢通路的富集分析结果显示，余甘子功效成分靶标与多重肿瘤生物学途径及动脉粥样硬化、抗病毒、乙型肝炎和丙性肝炎等通路相关。DO的富集分析结果显示，余甘子活性成分靶点与前列腺癌、腺体癌、头颈部肿瘤、神经胶质瘤等恶性肿瘤存在重要联系。【结论】余甘子的功效成分可以通过谷胱甘肽硫转移酶、前列腺素G/H合酶等途径发挥抗肿瘤耐药性和抗动脉粥样硬化等功效，是研发具有抗炎、抗衰老、降血脂和免疫调节疗效保健食品的重要植物资源。     

基于Web网络管理体系结构

基于Web的网络管理是网络管理的重要发展趋势，本文介绍了实现基于Web的网络管理系统的体系结构，讨论了基于Web网络管理系统的实现方法。     

基于网络的教学资源平台的设计

为实现教学资源优化和共享,提高资源利用率,降低教师备课的劳动强度,采用网络教学资源共享的策略,设计和建设了基于数据库的教学资源网络化平台,就资源平台的设计思路、设计规范和设计功能等进行了论述,旨在为网络教学资源的共享与优化提供解决方案。