番茄种子宇宙飞行后的过氧化物同工酶及PAPD分析

翻茄种子经搭载返地卫星宇宙飞行355h,回收后地面种植,选择3个同工酶有差异的宇宙飞行处理群体植株进行RAPD检测,结果表明：在50个供试引物中,有18个扩增出了DNA带,共有166条,其大小在200-2000bp之间,与地面对照相比,宇宙飞行处理植株的DNA在5个引物出现差异,其突变的程度分别为4.5%、1.3%和3.2%。     

大白菜和紫菜薹自交系染色体组DNA的RAPD分析

用８个随机引物（１０ｂｐ）对２个紫菜薹自交系的３个单株和４个大白菜自交系的４个单株的染色体组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增，共有４０条带分离清晰、明亮，其中引条带在７个单株中表现出差异，可作为遗传标记（ＲＡＰＤ标记）。４个大白菜自交系之间的平均差异条带数为１２．３，２个紫菜薹自交系之间为９．５，大白菜与紫菜薹之间平均有１５．５条带的差异。用７个引物在９３Ｗ０５－７（紫菜薹）和９３Ｗ５８－５（大白菜）之间检测出对个ＲＡＰＤ标记。从同一自交系的不同单株抽提的染色体组ＤＮＡ扩增出较一致的ＤＮＡ谱带，而不同自交系间扩增出的ＤＮＡ谱带差异很大，这表明此方法也可以象ＲＦＬＰ一样，用于大白菜和紫菜薹的分子标记。     

PEG渗调引发处理对菜薹老化种子DNA损伤的修复作用

利用ＲＡＰＤ技术对菜薹人工老化种子ＤＮＡ的损伤及ＰＥＧ渗调引发处理的修复作用进行了研究。在６１种引物中，有６种在菜薹人工老化的种子上获得了基因组ＤＮＡ指纹图谱，平均每种引物扩增的总ＤＮＡ带数为２．１６，多态性ＤＮＡ带数为１．１７，有１１种引物在ＰＥＧ渗调引发的菜薹老化种子上获得了基因组ＤＮＡ指纹图谱，平均每种引物扩增的总ＤＮＡ带数为３．９１，多态性ＤＮＡ带数也是３．９１。人工老化对菜薹种子基因组Ｄ     

应用AP—PCR技术检测香菇栽培菌株的遗传差异

利用３个随机引物对２１个香菇栽培菌株进行了ＰＣＲ扩增,结果表明,３个引物共产生４５条ＤＮＡ谱带,其中分子量最小的０．１８ｋｂ最大的１．１６ｋｂ,聚类分析表明,２１个香菇菌株的相似系数为０．６４～１．００,其中大部分菌析遗传差异较小而相似程度较高。     

厚皮甜瓜亲缘关系及纯度的RAPD标记

利用２０个随机引物对厚皮甜瓜８个亲本与４个杂交种进行ＲＡＰＤ分析。１０个引物的扩增ＤＮＡ谱带具有多态性,亲本具有各自的特异谱带,绝大部分Ｆ１的扩增带型是双亲的互补带。各试材的相似系数范围为６３．６％－９６．５％。遗传距离聚类分析图表明,Ｆ１易与双亲或其一聚在一起。上述结果说明,可以利用ＲＡＰＤ标记在ＤＮＡ水平上进行厚皮甜瓜的亲缘关系及纯度的鉴定。     

厚皮甜瓜亲缘关系及纯度的RAPD标记

利用２０个随机引物对厚皮甜瓜８个亲本与４个杂交种进行ＲＡＰＤ分析。１０个引物的扩增ＤＮＡ谱带具有多态性,亲本具有各自的特异谱带,绝大部分Ｆ１的扩增带型是双亲的互补带。各试材的相似系数范围为６３．６％－９６．５％。遗传距离聚类分析图表明,Ｆ１易与双亲或其一聚在一起。上述结果说明,可以利用ＲＡＰＤ标记在ＤＮＡ水平上进行厚皮甜瓜的亲缘关系及纯度的鉴定。     

与枣核性状相关联的RAPD标记的筛选

用 ３４０个随机引物，对枣有核池和无核池进行了扩增，共扩增出 ３ ３４８条 ＤＮＡ带，选出 １１个多态性引物，进一步用这１１个引物进行个体验证，发现只有引物 Ｓ１５４在金丝小枣的 １６个类型中（占供试有核类型 ８８．２１％）扩增出一条８２０ ｂｐ的特异带，而无核小枣的６个类型中（占供试无核类型８５．７１％）无此特异带。综合分析初步认为，Ｓ１５４８２０是与枣有核性状相关的分子标记，该标记需进一步验证。     

利用RAPD技术快速鉴定番茄杂种纯度

从两个番茄杂种Ｌ４０２、Ｌ４０４及它们的亲本共６份材料的叶片中提取ＤＮＡ,使用国产ＰＣＲ仪,建立了适合番茄ＲＡＰＤ分析的ＰＣＲ条件,进一步在１００个随机引物中找到了５个可用于鉴定这两个杂种纯度的引物,其中ＯＰＫ１４引物可同时用来鉴定两个杂种。利用该法鉴定杂种纯度不仅简单、迅速、可靠,而且因ＤＮＡ的用量少,不影响被检植株的后期生长。     

桃果实ACC合酶cDNA的克隆

根据其它植物ＡＣＣ合酶氨基酸保守区设计两组简并引物,用套式ＰＣＲ技术从桃成熟果实ｃＤＮＡ中扩增出１．１ｋｂ大小特异性片段,将其克隆至ｐＧＥＭ－Ｔ载体上,对重组克隆ｐＰＡＣＳＩ进行全序列测定表明,插入片段全长１１００个碱基,编码３６６个氨基酸,该基因与番茄、笋瓜、小西葫芦、康乃馨、苹果ＡＣＣ合酶ｃＤＮＡ氨基酸序列同源性分别为７２．７％,７１．３％,７１．１％,６９．１％,６５．４％。ＲＮＡ点杂交表明ｐＰＡＣＳＩ基因随着桃果实成熟表达活性增强,乙烯处理能诱导桃果实该基因的表达。     

利用RAPD技术快速鉴定番茄杂种和纯度

从两个番茄杂种Ｌ４０２，Ｌ４０４及它们的亲本共６份材料的叶片叶提取ＤＮＡ，使用国产ＰＣＲ仪，建立了适合番茄ＲＡＰＤ分析的ＰＣＲ条件，进一步在１００个随机引物中找到５个可用物鉴定这两个杂种纯度的引物，其中ＯＰＫ１４引物可同时用来鉴定两个杂种，利用该法鉴定杂种纯度不仅简单，迅速，可靠，而且因ＤＮＡ的用量少，不影响被检植株的后期生长。     

黄瓜抗炭疽病相关基因AFLP标记的SCAR转换

将黄瓜抗炭疽病相关基因的一个共显性AFLP标记成功地转换成了简单实用的SCAR标记。对AFLP标记片段进行序列测定,根据序列特点设计了特异的SCAR引物,引物长18～21 bp。PCR结果表明,引物对（1）可以扩增出131 bp和125 bp两条带,引物对（2）可以扩增出178 bp和172 bp两条带,分别为抗炭疽病的特征带和感炭疽病的特征带。将该两个标记命名为SCEM131/125和SCEM178/172,两对引物在F2单株和抗感病材料验证中符合率高达97.27%,可以用于黄瓜炭疽病的分子鉴定。     

13个阿月浑子品种的RAPD分析

为探明引进的阿月浑子品种间的亲缘关系,采用RAPD 标记技术对引入的12 个国外品种和‘新疆优株’进行了分析。用筛选的21 条10 bp 随机引物进行PCR 扩增可扩增出137 个位点,其中多态位点122 个,多态位点比率89.05%;品种间遗传距离在0. 2015 ~ 0.5163 之间,表明各品种间存在一定的遗传差异。UPGMA 聚类分析表明,13 个阿月浑子品种在遗传距离0.40 处可划分为3 个类群,第1 类包括 ‘Kerman’、‘Larnaka’、‘M-38’、‘M-P3’、‘Ashoury’、‘N’、‘Joley’、‘Aegina’、‘Avidon’、‘B’和‘Peter’11 个品种;第2 类为‘Xinjiang select tree’品种;第3 类为‘Mateur’品种。     

甘蓝细胞质雄性不育材料的分子鉴定

根据Genebank中orf224和orf138基因序列的保守区设计特异引物,对2个甘蓝不育材料PM、QM的mt DNA进行PCR扩增。试验结果表明,orf138特异引物对2个不育材料的mt DNA扩增出350 bp大小的清晰条带;不育材料的特异片段与萝卜Ogu CMS所具有的Ogu orf138基因同源度达92.55%,长度均为297 bp,因此,初步推断2个不育材料是Ogura胞质雄性不育类型。     

‘石硖’龙眼芽变系双引物RAPD鉴定的研究

 以‘石硖’龙眼芽变系及其普通系(对照) 为材料, 从80对双引物中筛选出4对双引物在二者之间扩增出稳定清晰的多态性片段。4对双引物共扩增出35条带, 其中多态性带5条, 表明通过双引物扩增可成功地将‘芽变’与母株(对照) 区分开来。在此基础上对双引物产生多态性扩增的原理进行了分析。     

不同山楂品种亲缘关系的RAPD分析

为探讨山楂品种间的亲缘关系,采用RAPD技术对20个不同品种的山楂材料进行了基因组DNA多态性分析。从120个引物中筛选出15个10bp的随机引物对所选山楂品种的DNA样品进行PCR扩增,共得到216条谱带,177条表现多态性,多态性比率达81.9%,其中包含27条特异性谱带,揭示了山楂植物丰富的遗传多样性。且利用NTSYS软件和UPGMA法对扩增结果进行了品种间相似系数的计算及聚类分析,结果表明相似系数在0.71～0.87,实生楂与其他山楂品种亲缘关系较远。     

苹果属山荆子MbNramp1基因克隆、序列与表达分析

以苹果属山荆子为试材,根据Nramp1同源序列保守区设计两对简并引物进行PCR,结合RACE技术获得了3'末端和5'末端片段,将3段片段序列拼接,根据拼接序列获取了MbNramp1基因全长cDNA序列。MbNramp1cDNA长2090bp,包含一个长度为1656bp的开放阅读框,编码551个氨基酸的多肽,分子量约为59.7kD。该基因编码的蛋白是一个膜蛋白,76%以上的氨基酸为非极性。MbNRAMP1与二价铁、锰转运蛋白NRAMP基因家族保守性很高,具有NRAMP1金属转运蛋白家族基因典型特征,即含有推断的N–端相连的糖基化位点、10个预测的跨膜结构域(TMs),在第6和第7跨膜结构域间有一个相同的转运基序(CTM)。低铁胁迫时MbNramp1在根中表达量增加。     

秋子梨品种‘龙香’S基因型的鉴定及梨S_(42)-RNase新基因的序列分析

利用特异引物对秋子梨品种‘龙香'的基因组DNA进行PCR扩增.通过对扩增片段的回收、克隆和测序,获得2条大小分别为469 bp和653 bp的DNA序列,将其推导氨基酸序列与GenBank中已登录的梨S基因的序列进行比对.结果表明:469 bp序列与已登录梨的S16-RNase基因完全一致,确定‘龙香'的1个等位基因为梨S16基因;653 bp序列与梨S基因的相似性在75%～90%之间,且在高变区存在6个以上氨基酸的差异,近一步分析确定为1条新的梨S基因,命名为S42-RNase基因,该基因在GenBank的登录号为:EF088497.确定秋子梨品种‘龙香'的S基因型为S16S42.     

苹果柱型基因Co的一个AFLP 标记的SCAR转换

 将苹果柱型基因的一个AFLP 标记成功地转换成了简单实用的SCAR 标记。首先对AFLP 标记片段进行序列测定, 然后根据序列特点设计了两对特异引物CoA1/ CoA2 和CoA1/ CoA3 , 每条引物长20 bp。PCR 结果表明CoA1/ CoA2 可以扩增出216 bp 和148 bp 两条带, 其中216 bp 的为柱型性状的特征带; CoA1/CoA3 可以扩增出273 bp 和205 bp 的两条带, 其中273 bp 的为柱型性状的特征带。两对引物在杂交后代中扩增出的特征带与柱型性状的分离重组率都很低(CoA1/ CoA2 为6. 3 % ±2. 5 %; CoA1/ CoA3 为7. 3 % ±2. 6 %) , 所以它们都可以作为该SCAR 标记的特异引物所用。     

草菇丝/苏氨酸蛋白激酶同源基因的克隆及序列分析

根据担子菌丝/苏氨酸蛋白激酶同源基因编码的氨基酸序列设计两对简并引物,通过巢式简并PCR方法获得草菇(Volvariella volvacea)丝/苏氨酸蛋白激酶同源基因(vv-stpk1)的保守片段,然后通过基因组步行的方法获得了vv-stpk1全长序列。vv-stpk1全长为2 003 bp,含有8个内含子,长度分别为72、57、53、54、45、50、55和48 bp,可编码522个氨基酸残基的多肽。推定的氨基酸序列与玉米黑粉菌(Ustilagomaydis)、木糖发酵酵母(Pichia stipitis)、新型隐球菌(Cryptococcus neoformans)中与细胞形态发生相关的丝/苏氨酸蛋白激酶Orb6的相似性分别为81%、77%和76%,对VV-STPK1蛋白的系统发生学分析的结果表明,VV-STPK1与Orb6同源蛋白聚在同一进化枝上,这些数据都支持VV-STPK1蛋白为与细胞形态发生相关同源蛋白的推定。