利用RAPD和ISSR分析百日草自交系间的种质遗传多样性

首次运用RAPD与ISSR技术分析了百日草20个自交系的种质遗传多样性.结果表明：从供试材料中147条RAPD引物和44条ISSR引物筛选到具有多态性的RAPD引物12条,ISSR引物9条.RAPD引物共扩增出147条带,多态性位点数为100,多态性位点比率为68.03%,平均多样性指数为0.3559,有效等位基因数为1.4169;ISSR引物共扩增出128条带,多态性位点数为97,多态性位点比率为76.38%,平均多样性指数为0.4013和有效等位基因数为1.4728.试验表明,RAPD、ISSR及两种分子标记整合后的结果较为相似,呈极显著的正相关.聚类结果将20个自交系基本分为2类：一类群来源虹越种子集团公司;另一类群来源甘肃酒泉种子集团公司,分类与原产地相关.RAPD与ISSR标记是研究百日草种质遗传多样性有效的工具,在分析百日草的亲缘关系特别是系谱关系时,ISSR是一种多态性和重复性优于RAPD的分子标记.两种分子标记整合后既能鉴定出自交系的系谱先后关系,也能反应来源相同自交系的亲缘关系.     

适于草果遗传多样性分析的RAPD引物筛选

以云南省文山州西畴县和德宏州陇川县的12株草果优良无性系为材料,利用RAPD标记技术,选用192个RAPD随机引物,对草果进行PCR扩增,并用UPGMA法对RAPD引物扩增条带进行聚类分析,计算其遗传相似系数,以期筛选出适用于草果遗传多样性分析的RAPD有效引物。实验共筛选出21个条带清晰、多态性丰富并具有可重复性特点的有效引物。21个引物在实验选用的12份样品中共扩增出177条DNA带,其中多态性带数为119条,占扩增总带数的67.2%,每个引物平均扩增出8.4条带。结果表明,12份草果样品聚为A组和B组,其中A组又分为两个亚组,聚类结果与所选用材料的地理来源基本一致,这也说明该研究所筛选得到的21个RAPD引物适用于草果的遗传多样性分析。该研究为应用RAPD标记技术对草果进行遗传多样性分析等研究奠定了基础。     

赤竹亚族Sasinae Keng f分子系统学研究

对赤竹亚族Sasinae 4属33个竹种样品进行RAPD和ISSR分析,在30条RAPD引物和100条ISSR引物中进行筛选,筛选出9条RAPD和11条ISSR多态性较好的引物,分别产生249、271个多态位点,利用Popgen32、MEGA4分析软件,构建聚类图,分析结果表明:1RAPD聚类分析支持异枝竹属单独成组;2RAPD和ISSR聚类分析都支持铁竹属单独成属;3两种聚类分析都支持华箬竹亚属单独成属,鄂西箬竹与华箬竹属关系密切;4不支持具耳箬竹和巫溪箬竹归并的处理;5RAPD聚类分析结果与传统形态分类更加接近。     

组培苗百合种质资源ISSR分析

本研究应用ISSR分子标记对日本百合、荷兰百合以及湖北野生百合共34份组培苗材料进行了遗传多样性分析。从40条引物中筛选出4条重复性好,条带清晰的引物进行PCR扩增,共扩增出多态性条带76条。供试百合材料的观察等位基因数(Na)为2,有效等位基因数(Ne)为1.2623,Nei's(1973)基因多样性指数(H)为0.196 3,Shannon信息指数(I)为0.338 8。湖北野生百合遗传多样性较高,日本百合和荷兰百合相对较低。根据标记分析结果,基于供试样品间遗传距离,采用UPGMA分析方法构建了聚类图,对不同来源百合样品的亲缘关系进行了初步分析。     

核桃DNA的提取及RAPD分析的引物筛选

以核桃叶片为材料,对其DNA提取方法和RAPD引物的筛选进行了研究。结果表明,采用核沉淀法从核桃叶片中能提取到高质量的DNA,可以用于RAPD分析;从120条随机引物中筛选出了14条显示核桃遗传差异的多态性引物。     

利用RAPD分析药用石斛的遗传多样性及亲缘关系

通过对9种药用石斛进行遗传多样性和亲缘关系的分析,为更好地开发利用石斛资源奠定基础。采用RAPD技术,应用NTSYS软件对9种石斛的RAPD-PCR结果进行分析。利用从103条随机引物中筛选出的70条随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,共得到520条带,其中多态性带有491条,多态性百分率为94.42%。采用UPGMA类平均法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,得出反映各种间亲缘关系的树状图。在遗传距离（D）=0.44处,可将供试材料分为2类,RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果差异不大。试验结果表明,RAPD技术可有效地应用于药用石斛的遗传多样性及亲缘关系的研究。     

LO型百合杂种后代的RAPD分析

以麝香百合系的"新铁炮"品种为母本、东方百合系的"帝伯"品种为父本,通过离体受精和胚挽救技术培育出LO型百合杂种植株LO-1,LO-2。对其进行了RAPD鉴定。结果表明:从25个随机引物中筛选出3个扩增效果较好的引物,3个引物扩增的结果表明,2个杂种后代都具有父本和母本的特征条带,并且分别具有各自的特征条带,说明杂种后代LO-1和LO-2均来自2个不同株系,是其母本与父本的杂交种。     

膝柄木三个单株RAPD的亲缘关系

以膝柄木(Bhesa sinica)3个单株为研究对象,用RAPD技术对其亲缘关系进行分析。从96个随机引物中筛选出17个,对所有供试材料进行扩增,共获得52个DNA条带,其中30条为多态性条带,其多态性条带比率为57.69%。采用UPGMA法对RAPD结果进行聚类分析,可得出单株B和D亲缘关系较近,B、D两单株与单株A亲缘关系较远。     

李品种的RAPD分析

从96条S系列RAPD引物中筛选出能稳定扩增并具有多态性的13条引物,对25个李品种进行了RAPD分析.结果表明,只用S17、S459和S1169等3条引物就能鉴别出所供试的25个李品种.利用PopGene软件中的UPGMA方法对供试25个李品种进行分子聚类分析,取LD=0.45,可将这25个李品种分为8类.     

不同地域的代表性基因型龙眼RAPD分析

利用RAPD标记技术对不同地域之间有代表性的16个基因型龙眼进行遗传分析。结果表明,6条随机引物共扩增出84个多态性位点,平均每条引物扩增出14条多态性条带;地域不同的基因型龙眼具有丰富的遗传多样性,云南、贵州和广东的龙眼遗传多样性较高,其次是福建、台湾、广西、泰国、四川,而印度尼西亚最低;同一龙眼产区中,福建不同基因型龙眼之间多态性最高,达34.52%,其次是贵州、广东、广西、泰国,四川龙眼之间多态性最低,仅为15.48%。聚类分析结果表明,在相似系数0.59的水平上16个基因型龙眼可以分为3个遗传群体;龙荔作为龙眼近缘种与龙眼栽培种的DNA指纹具有明显差异;泰国和印度尼西亚的基因型龙眼可以归类到中国的部分基因型龙眼群体中,印证了泰国、印度尼西亚基因型来源于中国。此外还讨论了利用RAPD构建不同基因型龙眼指纹图谱的可行性。     

用RAPD技术估测柳树种及无性系的变异

利用１２个引物对柳树２种１６个无性系基因组分别进行了ＲＡＰＤ检测，从电泳图谱可直观看出，引物ＣＨＬ－１可对柳树两种识别：引物Ｄｅｃａ－４可对１６个无性系基因组扩增产物经电泳产生的图谱中ＤＮＡ条的统计，利用ＮＴ－ＳＹＳ对其进行分析建立系统树，结果表明，利用ＲＡＰＤ获得的两种柳树种的分类结果与经典方法得到的结果一致。     

山茶属植物油茶组与金花茶组的分子分类

以山茶属5种油茶组植物和20种金花茶组植物的叶片为材料抽提DNA,利用筛选出的16种多态性随机引物进行PCR扩增,将扩增出来的多态型谱带转化为0-1数据,利用0-1型数据聚类软件进行RAPD聚类分析,将5种油茶组植物分为3大类,20种金花茶组植物分为4大类,分类结果与张宏达分类系统大致相同,并对差异很小的一些物种提出了合并建议.     

用RAPD技术测定黑荆树种源遗传关系初报

黑荆树(Acacia mearnsii Willd)系含羞草科(Mimosaceae)金合欢属(Acacia)植物,是一多用途、速生树种。我国引种时间较短,种源混杂,但黑荆树象其它树种一样,表型的变化受环境影响极大,种内各品种之间的差异很小,很难用常规的方法加以识别和划分。而应用RAPD技术可以快速、简便、灵敏地检测DNA的多态性,将品种间的差异显著地反映出来。这已在医学上、农业上得到广泛的应用。RAPD在林业上也已有应用,例如,苏晓华用RAPD技术估测了柳树种及无性系的变异;李宽鈺利用RAPD分子标记对白杨派,青杨派之间的系统进     

RAPD analysis on genomic DNA of male and female plants of Acer negundo L.

IntroductionRAPDisawidelyadoptedmolecularbiologicaltechniqueinmanyfieldsincludingforestry.J.1.Hormazaetsl.(1994)appliedthistechniquetosexrelatedresearchondioecioustreespeciesPistsciaveraL.andresultedverywell.Arandomprimerthatproducesspecificamplificationsolelyforfemaleplantwasscreened.Itwassupposedthespecificamplificationwascloselylinkedtofemafesexcontrolgene.AndtherandomprimerwasprovedapplicabletoseedlingsexidentificationofPiStscisveraL.bysystematicalexperiments.ApreliminarystudyonAcerne…     

黄心夜合的遗传多样性研究

运用随机扩增多态DNA（RAPD）技术,对黄心夜合[Michelia martinii（Levl.）Levl.]自然分布区的6个自然种群遗传多样性进行了研究。从100个随机引物中筛选出能产生清晰、稳定的多态性标记引物18个,共检测出110个位点,其中多态性位点为96个,占87.27%;在物种水平上,有效等位基因数目（Ne）,Nei’s基因多样性系数（He）和Shannon表型多样性指数（I）分别为1.735 2,0.416 3和0.597 1;总的遗传变异量（Ht）为0.339 8,其中居群内遗传变异量（Hs）为0.258 7,各居群间的遗传分化系数（Gst）达到0.323 1.应用UPGMA法对遗传距离进行聚类分析并构建树系图,结果表明：黄心夜合自然种群具有较高的遗传多样性,其种群间的遗传差异与其地理分布有关。     

RAPD analysis on genomic DNA of male and female plants ofAcer negundo L

Genomic DNAs were isolated from both male and female plants ofAcer negundo L., by modified CTAB method of Doyle and Doyle for plant genomic DNA isolation and consequently tested with RAPD technique. Some sex-related specific oxyribonucleic acid bands were amplified by a group of decamer oligonucleotide random primers. This indicated that some genetic marks related to sexes of the species were found, which laid a foundation for sapling sex identification ofAcer negundo L. Responsible editor: Chai Ruihai     

23个油橄榄品种的RAPD分析

采用RAPD技术对23个引种的油橄榄品种进行分类和鉴定研究.从80个10 bp的随机引物中筛选出11个扩增效果较好的引物进行扩增,共产生127条带,其中78条为多态性带,占61.4%,平均每个引物扩增的DNA多态性带数为7.09条.4个品种具有特异的位点,可作为种质鉴定的依据.根据扩增结果构建反映品种间亲缘关系的UPGMA聚类图,23个品种可划分为2大类.     

6个复叶槭品种间亲缘关系的RAPD分析

采用RAPD法对复叶槭5个品种及1个芽变品种进行基因组DNA多态性分析,从300个引物中筛选出具有丰富多态性的20个10bp的随机引物,这20个引物共扩增出170个DNA片段,片段大小在200bp～2800bp之间,其中多态性谱带为112条,多态率为65.88%,表现出较为丰富的RAPD多态性;利用UPGMA进行遗传距离计算的结果表明,6个复叶槭品种间的亲缘关系和遗传距离均有较大差异.