基于SSR标记的核桃种质资源遗传多样性与遗传结构分析

以58份核桃品种(优株)为试材，利用荧光SSR分子标记方法评价了58份种质资源的群体遗传多样性，分析其遗传结构特征，构建NJ聚类图，以期准确了解58份核桃种质的遗传背景和亲缘关系，为核桃属种质资源的合理利用、遗传资源的保存以及开发合理的育种方案和策略提供参考依据。结果表明：1)试验筛选出的15对SSR引物具有较高的多态性，共扩增出109个多态性等位基因(Na),平均每对引物的观测等位基因数(Na)为7.267,平均有效等位基因(Ne)3.069,平均观测杂合度(Ho) 0.519,平均期望杂合度(He)0.653,平均多态性信息量(PIC)0.603 5,平均香农指数(I)1.327。2)58份核桃品种(优株)间遗传距离范围为0.181～0.742,变幅为0.561,品种间遗传距离≥0.5的比例为44.19%,≥0.6的比例为13.5%,遗传基础较宽广，遗传信息丰富，遗传多样性水平较高。3)基于Nei遗传距离聚类分析，58份核桃品种(优株)可聚成3个类群，聚类结果与表型性状、亲缘来源有关，与地理位置相关度不大。4)群体遗传结构分析中，Q>0.6占比81.03%,基因混合来源比例较...     

魔芋种质资源形态标记遗传多样性分析

对96 份魔芋种质进行形态学标记,以评价魔芋种质的遗传多样性水平。结果表明：供试魔
芋种质的形态学性状均存在显著的遗传变异,种质间各性状平均变异系数为48.1%,其中芽形状的变异系
数最大,为130.6%;裂片颜色的变异系数最小,为25.6%。对魔芋表型性状进行聚类分析,以Pearson 相
关系数15 作为聚类阈值,将96 份魔芋品种分为11 类。     

茄子种质资源遗传多样性的形态标记分析

对76 份茄子种质进行形态学标记,以评价供试茄子种质资源的遗传多样性水平,结果表明：
供试茄子种质的形态学性状均存在明显的遗传差异,种质间各性状平均变异系数为54.83%,其中叶刺的
变异系数最大,为493.3%,果实弯曲度的变异系数最小,为10.9%;对茄子表型性状进行聚类分析,以
Pearson 相关性系数23 作为聚类阈值,将76 份茄子材料划分成三大类群,以Pearson 相关性系数19.5 作
为聚类阈值,将76 份茄子材料划分成七个类群。     

芫荽种质资源形态标记遗传多样性分析

为合理利用芫荽种质资源,该研究以96份芫荽种质为材料,采用形态学标记评价芫荽种质的遗传多样性,并对芫荽19个生物学性状进行分析。结果表明:抽薹天数与始花期、终花期、收获天数、基生叶数、基生叶长、株高、植株生叶状态、分枝数均呈极显著正相关,基生叶数与最长基生叶长、基生叶形、植株有叶状态、植株分枝数均呈极显著正相关,最长基生叶长与株高呈极显著正相关,抽薹天数及基生叶数均与千粒重呈负相关。在遗传距离6.40处将96份种质分为5类。     

黄瓜种质资源遗传多样性及其亲缘关系的AFLP分析

 采用AFLP分子标记技术，对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析， 结果表明8对AFLP引物在70份黄瓜种质中共扩增出425条带，多态性带的比例为66％。供试黄瓜种质的平 均期望杂合度为0．376，中国种质的平均期望杂合度为0．387，明显高于国外种质的n 291。西双版纳黄瓜和印度野生黄瓜具有一些栽培种质没有的特异位点，中国栽培种质的特异位点多于外来栽培种质，后者也有一些中国栽培种质没有的特异位点。聚类分析将70份种质分为三大组群，即西双版纳黄瓜(Cucumis sativus L.vaF．xishuangbannanesis Qi et Yuan)组群，e sativus var．hardwickii野生黄瓜组群和栽培黄瓜组群。西双版纳黄瓜与栽培黄瓜的距离最远，与野生黄瓜次之。按一定的遗传距离可以将中国和外来栽培种质分开。大多数 华南型和华北型种质归属于不同的亚组。这些结果有助于有目的地利用这些变异拓宽育种材料的遗传背景。     

基于InDel标记的茄子种质资源遗传多样性分析

用19对InDel标记对来自国内外的46份茄子种质资源进行遗传多样性分析。结果表明:19对InDel标记的多态性信息含量(PIC)范围在0.48～0.66之间,均值为0.59。46份茄子种质资源的遗传相似系数在0.32～1.00之间,均值为0.70,说明46份茄子种质资源之间的遗传差异不大,遗传基础相对狭窄。利用UPGMA法进行聚类分析,在遗传相似系数为0.66处,将46份茄子种质资源划分为4大类群。聚类的结果与叶色、花冠色和果实性状具有一定的关联性,而与来源地的关联性并不大。     

基于InDel 标记的茄子种质资源遗传多样性分析

用19 对InDel 标记对来自国内外的46 份茄子种质资源进行遗传多样性分析。结果表明：19 对InDel 标记的多态性 信息含量（PIC）范围在0.48～0.66 之间，均值为0.59。46 份茄子种质资源的遗传相似系数在0.32～1.00 之间，均值为0.70， 说明46 份茄子种质资源之间的遗传差异不大，遗传基础相对狭窄。利用UPGMA法进行聚类分析，在遗传相似系数为0.66 处， 将46份茄子种质资源划分为4大类群。聚类的结果与叶色、花冠色和果实性状具有一定的关联性，而与来源地的关联性并不大。     

鲁甸县核桃种质资源坚果性状多样性分析

对云南省鲁甸县核桃种质坚果性状多样性进行了研究。结果表明,该区域核桃坚果描述性状中的形状、仁色和种仁食味的Simpson多样性指数较高,分别为0.785、0.638和0.695,具有丰富的多样性。数量性状中坚果单果重和坚果壳厚的变异系数较高,分别为25.68%和25.74%,多样性较丰富。     

菠菜种质资源遗传多样性研究进展

我国是世界上最大的菠菜种植国及消费国,但由于受种质资源材料的限制,可用于育种研究的材料极度匮乏,这加大了具备优良商品性状菠菜新品种的培育难度,对菠菜强大的需求与其较不完善的种质相关研究间形成了鲜明的矛盾。综述菠菜的生物学特性、种质资源的基础性研究,基于形态学标记和分子标记的菠菜种质遗传多样性研究进展,并对其进行展望。     

云南芋种质资源遗传多样性的AFLP分析

 采用荧光标记引物的AFLP分子标记技术, 用筛选出的“3 + 2”引物组合, 对48份云南芋种进行遗传多样性分析, 3对引物共扩增出184个DNA位点, 平均每对引物可检测出56.3个多态性位点,多态性位点高达91.8% , 云南芋种质资源在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。聚类分析表明: 野生种质和栽培种质的亲缘关系较远, 栽培种质基于AFLP标记的分类结果与形态性状基本一致, 少数材料差异较大。     

基于SSR标记的海南54份榴莲种质资源遗传多样性和群体结构分析

对海南省引种种植的54份榴莲种质资源采用荧光SSR分子标记技术，进行SSR多态性分析、聚类分析、群体结构分析、遗传多样性分析。结果表明，筛选获得19对多态性较高的SSR引物，通过DNA扩增共检测出117个多态性等位基因，平均多态性等位基因数为6.158个，平均有效等位基因数为3.398个，香农指数平均值为1.372，观察杂合度和期望杂合度的平均值均为0.689，多态信息指数平均值为0.643，表明具有一定的遗传多样性。基于UPGMA方法进行聚类分析，在遗传距离0.6处54份榴莲种质资源可以分成3个类群，第一类群共45份种质资源，包括引种于不同国家的不同榴莲品种；第二类群共8份种质资源，均为引种于不同国家的猫山王榴莲；第三类群共1份种质资源，是引种于泰国的红榴莲。以遗传距离0.3为阈值，第一类群又可以分为9个亚群。基于Structure可以将54份榴莲种质资源划分为5个亚群。综合聚类和群体结构分析，明确了部分未知种质资源的品种所属，对不同亚群的遗传变异、遗传距离和遗传分化分析发现，个体的变异是总变异的主要来源，亚群5与其他亚群的遗传距离和遗传分化程度最大，不同亚群整体基因流较大，遗传分化...     

西瓜种质资源的遗传多样性分析

对88份来源不同的西瓜种质资源,采用37个表型性状和22对SSR分子标记进行遗传多样性分析。结果表明:表型性状变异主要体现在果实形状、品质和叶片等性状上,第1、第2、第3主成分的方差贡献率分别为13.6%、11.8%和9.0%,前3个主成分的累计为34.4%,依据表型性状进行聚类分析,在欧氏距离15.0时,可将材料分成2类,在欧氏距离13.5时,可将材料分为3类;SSR分子标记共扩增出的55个多态性位点,平均多态性信息含量为0.41,利用UPGMA法进行聚类分析,88份西瓜种质可以被分为4个组。第1、第2、第3主坐标的方差贡献率分别为22.8%、10.8%和9.1%,前3个主坐标累计为42.7%。     

基于表型性状及SNP标记的豆瓣菜种质资源遗传多样性分析

对保存在国家种质武汉水生蔬菜资源圃内来自国内外不同地区的19份豆瓣菜种质资源的8个农艺性状进行调查分析,并利用SLAF-seq技术对豆瓣菜种质资源进行简化基因组测序,研究其遗传多样性.结果 表明:质量性状(叶色、茎色、顶端小叶形状)变异不明显;数量性状(顶端小叶长、顶端小叶宽、株高、茎粗、叶柄长)变异系数较低(7.69...     

牡丹种质资源遗传多样性研究进展

种质资源是现代育种和生物技术研究的物质基础.牡丹种质资源的研究为探讨牡丹的起源、进化、分类、育种和资源利用提供科学依据.通过对牡丹种质资源概况的介绍,综述牡丹形态学、细胞学及DNA分子标记等几方面种质资源遗传多样性的研究进展,探讨牡丹种质资源遗传多样性的研究现状及尚需解决的问题,并就进一步开展牡丹种质资源的研究进行了分析.     

青海核桃种质资源表型多样性研究

以青海省6个核桃产区152份样本为研究对象,通过对主要性状指标的变异分析、聚类分析和主成分分析,初步探讨青海核桃的表型多样性。结果表明:单果重、核壳厚、露仁情况、取仁难易、核仁饱满度等的变异系数相对较高,品种选育宜将这些指标作为主要参考指标;在6个核桃产区中,循化产区各性状的变异程度总体最大,遗传多样性最丰富,综合表现以尖扎产区的最好;聚类分析结果表明,当遗传距离为5时,青海的6个核桃产区可聚为3类。不同地理位置下,不同的气候与降水条件导致核桃表型变异程度不同、遗传多样性丰富度不同。     

杨梅种质资源遗传多样性研究进展

针对如何充分利用现有杨梅种质资源进行育种,简要介绍了杨梅的起源及其分类,从杨梅种质资源的形态学水平、生化水平以及DNA水平的遗传多样性等方面对杨梅遗传多样性的研究进展进行了综述,展望了今后杨梅种质资源的研究方向。     

不同生态类型西瓜种质资源遗传多样性的SSR分析

采用SSR分子标记技术对96份不同生态型西瓜种质资源的遗传多样性进行研究。从398对引物中筛选出38对扩增条带清晰、多态性高的引物分析供试材料,共得到7043条清晰可辨条带,其中多态性条带826条,占11.7%。平均每对引物对96份材料扩增出185.34条带,其中21.74条具有多态性。96份材料间的相似系数为0.42～0.99。聚类分析结果表明,野生西瓜与栽培西瓜的亲缘关系较远。在栽培品种内华北生态型、华南生态型和西北生态型西瓜的亲缘关系较近,说明我国西瓜种质资源同源性较高,遗传基础狭窄,有必要引入更多种质资源以拓宽西瓜育种背景。     

洋葱种质资源遗传多样性的SRAP和ISSR分析

利用SRAP和ISSR分子标记技术对58份洋葱种质资源进行遗传多样性分析,筛选出9个扩增效果较好的ISSR引物,共扩增出105条清晰的条带,其中有多态位点的条带数为104条,多态性条带比率为99％;筛选出11个扩增效果较好的SRAP引物,共扩增出132条清晰的条带,其中有多态位点的条带数为115条,多态性条带比率为87...     

番茄种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术,对63份番茄种质资源进行了遗传多样性研究。结果表明:从180个RAPD引物当中,筛选出22条稳定性好、多态性强的RAPD引物,共扩增出多态性带207条,多态性条带比率为86.96%,63份番茄栽培品种或品系间的相似系数介于0.28～0.99之间,说明RAPD能很好的对番茄野生种、近缘野生种和栽培种进行多态性分析。采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果。     

甜瓜种质资源形态学性状遗传多样性分析

为合理利用甜瓜种质资源和选配育种亲本,对164份甜瓜种质资源的42个形态学性状进行了遗传多样性分析。结果表明：164份甜瓜种质资源的24个质量性状和18个数量性状的多样性指数平均值分别为0.86、1.90,表明数量性状具有更丰富的遗传多样性。各数量性状间存在复杂的相互关系,其中单瓜质量与果实发育期、果实纵径、果实横径、果肉厚、茎粗、叶柄长、叶柄粗、叶片长、叶片宽、种子千粒重、产量呈极显著正相关;中心糖含量与单瓜种子数呈极显著正相关,而与果实发育期、果实纵径、果实横径、果肉厚、茎粗、叶柄粗、种子千粒重呈极显著负相关。主成分分析结果表明,前3个主成分的累计贡献率为85.689%,包含了甜瓜果实性状指标的大部分信息,164份种质的综合得分范围为-2.792～5.614分,综合得分较高的5份种质分别为S24(MT010)、新引甜22号（MT112）、PI-315401(MT133)、真正哈密瓜（MT028）、网纹甜瓜（MT048）。聚类分析结果表明,在欧式距离为5时可将164份种质分为5个类群,分别包含69、62、7、23、3份种质。综上,参试甜瓜种质资源具有丰富的遗传多样性。