3种方法提取辣椒根总RNA的效果比较

针对辣椒根中富含多糖多酚的特点,比较了Trizol法、改良Trizol法和改良CTAB法3种方法对辣椒根总RNA提取的效果。结果表明,Trizol法、改良Trizol法能提取到辣椒根总RNA,但效果不理想;改良CTAB法提取到的辣椒根总RNA,28 S rRNA的亮度是18 S rRNA的2倍,OD260/OD280和OD260/OD230值分别为1.88和1.80,RNA质量浓度为254.0 mg·L-1;用提取到的RNA进行RT-PCR后可扩增出acting基因特异片段。因此改良CTAB法提取辣椒根总RNA的效果好、质量高、完整性好,能够满足后续试验要求。     

小黑杨花粉总RNA提取方法的比较研究

以小黑杨(Populus simonii×P.ni gra)成熟花粉为试材,分别采用传统CTAB法、柱式植物RNAout试剂盒法、改良CTAB法及SDS法4种方法提取小黑杨花粉总RNA;通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度计及RT-PCR检测,研究比较了4种方法的优劣.结果表明:SDS法提取的总RNA纯度高、完整性好,总RNA质量显著高于其它3种方法,且该方法具有步骤简单、提取时间短、成本低等优点,是一种适用于小黑杨花粉总RNA提取的比较理想的方法.     

改良CTAB法提取冷季型草坪草基因组DNA的研究

为获得高质量的冷季型草坪草基因组DNA,用改良和优化常规CTAB提取方法,提取冷季型草坪草基因组DNA,并对所得DNA的质量和浓度进行了检测.结果表明:改良CTAB-B法要好于常规CTAB法和改良CTAB-A法,提取的基因组DNA的OD260/OD280在1.8～1.9之间,电泳条带清晰,RNA消化彻底,DNA无明显降解,其含量和纯度均能满足基因工程操作的要求,且酶切效果理想.     

核桃内果皮RNA提取方法研究

以核桃果壳硬化期的内果皮为试材,针对核桃内果皮木质化程度高且富含多酚多糖的特点,比较CTAB法Ⅰ、CTAB法Ⅱ和试剂盒3种方法提取核桃内果皮RNA的效果。结果表明:3种方法提取的RNA均可见3条带。CTAB法Ⅰ提取的RNA略微拖带,OD_(260)/OD_(280)为1.540,RNA产率为75.9μg/g,RNA完整性差,质量低;CTAB法Ⅱ的RNA图谱较完整,但亮度较弱,OD_(260)/OD_(280)为1.801,产率为86.1μg/g,但RNA提取过程耗时太长;试剂盒法提取的RNAOD_(260)/OD_(280)为2.055,RNA产率96.4μg/g,RNA图谱清晰、稳定、明亮,证明得到的RNA多糖及酚类等去除较彻底,纯度、完整性和产率均较高。因此,应用复杂植物总RNA提取试剂的试剂盒法可获得高质量与高产率的核桃内果皮总RNA,完全满足后续分子生物学研究。     

不同方法提取野生荔枝基因组DNA效果的比较

以广东、广西地区的3个野生龙眼的幼嫩叶片为试材,采用SDS法、常规CTAB法和改良2× CTAB法提取荔枝叶片基因组DNA,比较研究从富含多酚、多糖和色素等次生代谢物质的野生荔枝叶片中获得高质量DNA的提取方法.结果表明:采用改良的2×CTAB法提取的荔枝叶片基因组DNA纯度最高、质量最佳,可直接用于荔枝叶绿体DNA trnL-F基因的PCR扩增分析,且扩增后条带清晰.表明改良的2×CTAB方法获得的DNA纯度和产率较高,符合进行野生分子标记的实验要求.     

葡萄叶片中提取总RNA的三种方法比较

采用试剂盒法、热酚法和LiCl沉淀法3种方法提取葡萄叶片总RNA,通过琼脂糖凝胶电泳和Agilent 2100计检测总RNA的完整性和提取纯度.对红地球葡萄叶片总RNA提取方法做比较,以得到完整的、高质量的葡萄RNA.结果表明:LiCl沉淀法提取的RNA收率高,完整性好,OD260/OD280均在1.80～2.00,纯度高,28S、18S条带清晰完整.可以满足后续分子生物学的研究.     

菊芋基因组DNA提取方法的比较

采用改良CTAB法、改进的高盐SDS法及两种植物基因组DNA提取试剂盒法等４种方法提取菊芋基因组DNA,并进行电泳分析、质量检测及ISSR引物扩增检测。结果表明,改良CTAB法优于其他3种方法,提取的DNA质量较好、纯度较高,能够满足ISSR-PCR扩增要求。     

李果实果肉组织RNA提取方法的比较分析

以中国李品种‘槜李’的果肉组织为试材,比较了Trizol法、RNA提取试剂盒和改良的CTAB法提取RNA的效果,筛选出适合李果实果肉组织总RNA的提取方法。结果表明:Trizol法和RNA提取试剂盒均不能得到完整的RNA;改良的CTAB法能有效去除多糖,28S条带的荧光亮度是18S条带的1.5~2.0倍,D260/D280值都在1.8~2.1,样品的平均得率为770.96~1 029.04ng/μL,RT-PCR结果扩增出了特异性条带,说明改良CTAB法从李果实果肉组织中提取的RNA质量高、完整性好、产率高,完全可以用于后续的分子生物学试验。     

核桃不同组织高质量总RNA的提取方法

利用改良CTAB法,分别从富含多糖、多酚及黄酮类物质的核桃叶、绿果、茎、种子和根中成功提取高质量的总RNA。经电泳、紫外分光光度计、RT-PCR和Northern杂交分析,结果显示,各组织的总RNA至少有2条清晰的电泳条带,产量可达174μg/g,A260/A280比值在2.0左右,通过RT-PCR在不同组织中均能扩增出核桃18S基因的cDNA片段,而且以18S基因为探针在不同组织中也分别获得清晰的Northern杂交信号,说明利用此法分离核桃各组织的RNA纯度和浓度完全符合后续分子生物学研究的要求。     

青天葵叶片总RNA提取方法的比较研究

采用RNeasy Plant Mini Kit法、RNAiso Plus法、RNAiso for Polysaccharide-rich Plant Tissue法、CTAB法和SDS法,并结合4种抽提试剂组合,分别提取青天葵叶片总RNA.通过琼脂糖凝胶电泳、紫外检测及RT-PCR反应对提取效果进行了比较分析.结果表明:除RNAiso Plus法外,其它方法提取的总RNA均有一定程度的DNA污染.RNAiso Plus法组③(1/5体积KAC+4/5体积PCI)完整性最好,SDS法组④(1/5体积NaCl+ 4/5体积PCI)浓度最高,为372.4 ng/μL.5种方法共20个处理组获得的RNA反转录后均能扩增出18S rRNA基因片段.该研究建立起了适用于青天葵叶片的总RNA提取方法,为青天葵的基因克隆、表达及转录组分析奠定了技术基础.     

银杏RNA的提取

采用CTAB法提取银杏叶的RNA,结果表明:抽提的RNA经电泳检测,可见28SrRNA和18SrRNA两条主带;紫外吸收值测量,A260/A280接近2.0;反转录合成的cDNA经RAPD扩增,出现清晰的条带,这些说明提取的RNA纯度高,质量好。此方法简便易行,成本也较低,适合于富含多糖、多酚植物材料的RNA提取。     

茭白黑粉菌及茭白植株中DNA的提取方法

研究了茭白黑粉菌及茭白植株中基因组DNA的高效提取方法。采用改进的CTAB（十六烷基三甲基溴化铵）法提取DNA,根据琼脂糖凝胶电泳检测、A260/A280的测定和PCR扩增结果表明,用改进的CTAB法提取茭白黑粉菌及茭白植株基因组DNA,所得DNA无论是纯度还是完整性都比较好,适合于酶切和PCR扩增,可以用于分子生物学研究。     

适用于转录组测序的大白菜小孢子总RNA提取方法筛选

为了找到适用于转录组测序要求的大白菜小孢子总RNA 提取方法，以出胚率较高的吉红82 为试材，以热激诱导处理后的小孢子为研究对象，比较分析了TRIzol 法、改良CTAB 法及超纯试剂盒法3 种方法的RNA 提取效果。结果表明：TRIzol法（磨样）和改良CTAB 法提取的RNA 浓度较高，但完整性较差；超纯RNA 提取试剂盒法提取的RNA 质量最高，且完整性好，能够满足转录组测序的要求。     

山丹百合花蕾总RNA提取方法的比较

以SDS改进法、CTAB改进法及EASYAPIN试剂盒法3种方法提取山丹百合花蕾的总RNA,并通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测对其提取效果进行分析比较.结果表明:SDS改进法提取的RNA效果不显著,CTAB改进法提取的RNA产量高,但有大量的DNA污染,需进一步纯化；EASYAPIN试剂盒法提取的RNA质量好,纯度高,完整性强,可直接进行下一步的分子生物学研究.     

甜瓜种子中种传病毒的RT-PCR检测

为了建立葫芦科作物干种子主要种传病毒检测方法,在现有的TRIZOL法、CTAB法等提取植物总RNA方法的基础上进行改良,从富含有多糖的甜瓜干种子中提取高质量的总RNA。建立了18 S r RNA为内参基因的侵染葫芦科作物4种主要种传病毒的两重RT-PCR检测方法。应用改良TRIZOL法分别提取单粒和0.1 g(约20粒)带毒甜瓜种子的总RNA作为检测模板,分别对4种种传病毒进行RT-PCR检测,结果表明可分别从携带4种种传病毒的甜瓜种子上检测到对应的病毒,18 S r RNA基因能够很好的作为内参基因对病毒检测结果进行评估。     

三种提取酿酒葡萄不同组织总RNA的方法比较

通过对比改良SDS-酚法、改良CTAB法和改良Trizol法3种RNA提取方法,提取"赤霞珠"(‘Cabernet Sauvignon’)葡萄芽、叶片和果皮RNA的质量及浓度,并进一步分离、纯化得到较高质量的RNA。结果表明:改良SDS-酚法与改良CTAB法适用于芽和叶片的提取,可以获得较好质量、高浓度的总RNA,其28S与18S亮度极高,5S清晰可见,完整性较好;改良Trizol操作环节较少,省时,质量好,条带锐利,可清晰看出28S与18S亮度比为2∶1,虽提取的样品浓度较低,但足以供下一步研究使用。     

新疆阿魏RNA提取的不同方法比较

以新疆阿魏叶片为材料，采用3种不同的方法分别提取其总RNA，用核酸蛋白检测仪、琼脂糖凝胶电泳方法检测其浓度、纯度及完整性，旨在建立提取新疆阿魏总RNA的最适方法，为后续深入研究新疆阿魏生物合成途径及机制奠定基础。结果表明：3种方法均能提取出新疆阿魏叶片总RNA。试剂盒法提取的总RNA质量最好，28S RNA亮度是18S RNA的2倍，条带清晰，操作简单，耗时短；Trizol法提取的RNA质量次于试剂盒法，且过程中无法判断次级代谢产物对RNA提取的影响，Trizol裂解液存在毒性物质；改良CTAB法提取的总RNA质量较差，无法满足下一步试验的要求，操作复杂，耗时较长。因此，试剂盒法为提取新疆阿魏RNA最佳方法。以试剂盒法提取的总RNA为模板进行PCR检测，得到的扩增条带清晰，与目的片段大小一致，进一步证明此方法提取的总RNA质量能够满足后续试验的要求。     

一种高质量葡萄基因组DNA提取方法

针对葡萄组织中多酚、多糖类物质含量较高的特点,对比研究了利用植物总DNA提取试剂盒和改良CTAB法提取葡萄总DNA.结果表明:改良的CTAB法能够从不同葡萄品种和不同生长时期的叶片中获得高质量、完整性好的总DNA,其OD260/OD260介于1.7～1.9之间,无降解现象,RNA去除干净,完全适于进行PCR和酶切等研究.     

植物RNA提取方法的研究进展

高质量的RNA是进行植物分子生物学研究的重要前提,由于植物组织细胞内组成成分的复杂多样性,使得植物组织RNA的提取方法具有多样性。现对已报道的异硫氰酸胍法、苯酚-SDS法、CTAB法、改良CTAB法、Trizol法等RNA提取方法在各种植物组织中的研究结果进行概括,旨在为进一步开展RNA提取工作提供参考。     

刺山柑总RNA提取方法的比较研究

以刺山柑为试材,研究比较了改良SDS提取法、RNApure Plant Plus Reagent法、RNAplant Plus Reagent法和RNAprep Pure Plant Kit法提取总RNA的效果,以期寻找一种适于野生刺山柑叶片高质量总RNA最佳提取方法。结果表明:4种方法提取的总RNA均可见28S和18S2条电泳谱带,RNAprep Pure Plant Kit法获得的RNA图谱条带清晰、明亮、稳定,28S rRNA亮度约是18SrRNA的2倍,OD260/OD280为2.00,产率为175.3μg/g,除RNAprep Pure Plant Kit法能够从叶片中提取到完整性好、纯度高及产率高的总RNA外,其它3种方法提取的总RNA均存在降解及DNA和蛋白等污染,经cDNA-SRAP分析检测,此方法获得的RNA反转录后能扩增出清晰稳定的多态性条带,能够满足后续试验的要求。进一步采用RNAprep Pure Plant Kit法从刺山柑幼苗整株、根、茎及叶中能够获得高质量的总RNA,因此,RNAprep Pure Plant Kit法适合刺山柑总RNA的提取。