基于线粒体COXⅠ基因变异探讨国内外猪种的遗传多样性及系统进化研究

基于mtDNA COXⅠ基因,探讨了6个猪种687个样本(大白猪、长白猪、杜洛克、藏猪、甘肃黑猪和八眉猪)的遗传多样性和各猪种间的亲缘关系。对各猪种样本mtDNACOXⅠ基因构建混合池,并利用直接测序技术获得6个猪种COXⅠ基因的序列,采用MEGA 6.0分析软件基于Kimurk双参数模型应用邻接法构建系统发生树。结果表明,6个猪种mtDNA COXⅠ基因序列共存在21个突变位点,其中8个突变为各群体特有。长白猪与杜洛克猪的多态性较丰富,含有13个相同位点的突变,核苷酸的转换数(si)和颠换数(sv)的比值(R)分别为12和15,序列替换远未达到饱和。而藏猪、黑猪和八眉猪的多态性较贫乏。系统进化树和遗传距离分析显示,6个猪种及野猪先聚为一支而后与同属为偶蹄目的牛、羊聚为一支,3个地方猪种间遗传距离较近。外来猪种引入中国后主要是用作父本以提高生产速度和瘦肉率等,对本地猪种未有母系贡献,线粒体COXⅠ基因可有效区别6个猪种的亲缘关系,在一定程度上为中国地方猪品种的有效保护和合理利用提供理论依据。     

用RAPD方法分析六个品种猪的亲缘关系

用１４０个１０碱基随机引物对外来猪种杜洛克猪、斯格猪、长白猪、大约克夏猪及地方猪种蓝塘猪、大花白猪的基因组ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ分析，其中２３个引物无扩增产物，６６个引物的扩增产物表现为多态，５１个引物的扩增产物表现为单态，扩增产物的电泳条带数在１～１１条之间，平均为４２条。从相似系数及聚类分析结果可以看出，斯格猪与长白猪、蓝塘猪与大花白猪的相似系数较高，亲缘关系也较近，而２个地方猪种与４个外来猪种之间则相应地较低、较远；在４个外来猪种中，除杜洛克猪外，另３个外来猪种又因曾直接或间接地引用过中国地方猪种作为育种素材，因而表现出与地方猪种相对较近的亲缘关系。     

甘南州蕨麻猪线粒体DNA控制区的分子遗传学研究

测定了甘南州27个蕨麻猪个体的mtDNA D-loop区序列,共检测到14个单倍型的43个多态位点,单倍型多样度和核苷酸多样度分别为0.945、0.007 17,表明蕨麻猪有较高的遗传多样性。结合已报道的13个中国地方猪种mtDNA D-loop序列及15个国内外野猪mtDNA D-loop序列进行分析,结果发现蕨麻猪和贵州可乐猪、Moncai、贵州香猪及藏猪都有较近的遗传关系,并且与东南沿海野猪有较近的亲缘关系,但没有发现东亚与东南亚野猪对蕨麻猪的起源有贡献的证据。     

贵州白香猪γ干扰素基因的克隆与序列分析

为获得贵州白香猪γ干扰素基因,以提取的经刀豆蛋白A诱导培养的贵州白香猪外周血淋巴细胞总RNA为模板,扩增全长猪γ干扰素基因,并克隆至pMD18-T Simple载体后测序分析。结果表明,pIFN-γ基因全长501bp,可编码166个氨基酸,其中前23位氨基酸为信号肽序列;pIFN-γ含有2个潜在N-糖基化位点;贵州白香猪与国内地方猪种之间pIFN-γ基因差异不大,具有很近的亲缘关系,其中与藏猪、成华猪、枫径猪、梅山猪的同源性达100%,而与内江猪的亲缘关系相对较远,与荣昌猪(DQ902588)亲缘最远。     

贵州剑白黑香猪的亲缘的关系

用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,测定贵州剑河白,黑香猪血清转铁蛋白、前白蛋白、后白蛋白的遗传多态性,计算其基因频率。同时,利用其他学者的研究结果与对贵州剑河白,黑香狸与湖南,江西等省的部分地方猪种的遗传距离进行估算,利用类平均聚类法对它们之间的亲缘关系进行研究;并绘制了类平稳聚类图。结果表明,贵州剑白香与黑香猪的遗传距离最近,可以认为是同一品种而两个不同毛色的品系或亚群;贵州省剑河白香与黑香狸与湖南的汀     

大河乌猪与大河猪(乌金猪)肉质性状研究

通过同步选留大河猪(乌金猪)(腌公猪20头)、大河乌猪(腌公猪40头)进行育肥试验,大河猪达85±5kg、大河乌猪达90±5kg时各试验群体随机选出10头共20头进行屠宰,主要测定肌肉pH值、肉色、大理石纹、熟肉率、失水率、滴水损失、等级肉比例、粗脂肪、干物质、氨基酸、脂肪酸、肌肉组织学特性、A-FAB基因和RYRI基因等肉质指标.其它胴体品质及产肉性能指标则按<胴体分割记录表>项目内容测定记录.结果表明,大河乌猪较大河猪胴体品质和产肉性能有较大幅度的改善,生产性能有较大幅度的提高,且有效地保持了大河猪在肉质性状上的优势,并在滴水损失、失水率、大理石纹等评分都优于大河猪,而大河猪具有极强的脂肪沉积能力,大河猪肌内脂肪超过6%,大河乌猪略有下降,仍保持较高水平.此外,两品种在氨基酸和脂肪酸组成上差异不显著,也说明大河乌猪的选育过程中保持了大河猪在脂肪和蛋白质组成与结构上的优良性.两品种检测结果,所有个体RYRI基因均为CC型纯合个体,表明大河猪及大河乌猪种群属于应激抵抗群体.     

赣西两头乌猪屠宰测定与肉质检测初报

[目的]赣西两头乌猪是江西地方猪品种之一,其生产性能未知,为充分了解赣西两头乌猪的屠宰性能和肉质性状,对其进行屠宰测定和肉质检测,研究结果可以为赣西两头乌猪的保护和利用提供参考依据.[方法]试验对6月龄的12头纯种赣西两头乌猪(公母各半)进行屠宰测定,分析胴体质量和屠宰率等屠宰性能、眼肌面积和瘦肉率等胴体性状以及大理石...     

猪血清蛋白质多态性与品种分类的研究

本文根据所测定的二花脸、梅山、枫泾、金华、姜曲海和长白猪的4个血清蛋白质系统——前白蛋白(Pa~A,Pa~B)、转铁蛋白(Tf~A,Tf~B,Tf~C)、铜蓝蛋白(CP~A,CP~B,CP~C)和淀粉酶(Am~A,Am~B,Am~C,Am~Y)的基因频率,估算了各品种间遗传距离和品种内平均基因多样度;并对各品种的4个血清蛋白位点的等位基因类型及分布特点进行了分析;进一步考证了我国猪种的起源与分化以及我国部分地方猪种的遗传结构和类缘关系;亦较系统地探讨了太湖猪不同类群的亲缘关系。     

用RAPD技术对三江白猪与其他三个品种猪的群体亲缘关系的分析

应用40条随机引物对四个品种猪,大白猪、长白猪、三江白猪及东北民猪的基因组进行亲缘关系的DNA多态性分析,结果筛选出12条效果良好的随机引物,并且通过RAPD技术方法和聚类统计分析得出结论;三江白猪、长白猪及东北民猪的亲缘关系较近,而大白猪与其它三种猪之间亲缘关系则相应的较远。     

河南地方猪mtDNA D-loop序列遗传多样性 及系统进化分析

为了解河南省地方猪种的遗传资源状况,探究猪种间的亲缘关系,对河南省地方猪种(南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪、豫西黑猪)及2个参考猪种(莱芜黑猪、二花脸猪)和野猪共计282个样本的mtDNA D-loop序列进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank中3个国外猪种(杜洛克猪、长白猪、约克夏猪)的38条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性、系统发育树、网络分析、歧点分布分析。结果表明,河南省地方猪4个品种共236条序列,定义了32种单倍型,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.788～0.854、0.001 56～0.004 55。构建的NJ系统进化树将所有样本分为2个独立分支,一支包含所有河南各猪种和部分约克夏猪,另一支全部为引进猪种,表明河南地方猪和3个国外猪种具有2个明显不同的母系起源。网络中介图和歧点分布显示,在历史驯养过程中,整个河南地方猪群体曾经历过群体扩张事件。说明河南地方猪种具有较为丰富的遗传多样性,且彼此之间有一定的基因交流。     

豫南黑猪、杜洛克、长白和大白猪FSHβ基因多态性与产仔性能的关联分析

采用PCR-RFLP技术测定了豫南黑猪、杜洛克、长白、大白猪FSHβ亚基基因多态性,测序发现豫南黑猪BB型的128与129 bp位点上插入277 bp的片段而产生多态性,限制性内切酶BamHⅠ酶切后共产生6种基因型,运用最小二乘模型将不同基因型与产仔数进行关联分析,结果显示:豫南黑猪就初产而言,基因型CC型比BC型的TNB和NBA分别多2.67和2.79头(P<0.05);经产基因型CC型比AC型的TNB和NBA分别多2.03和2.14头(P<0.05);而引进猪种初产和经产都没有显著差异。     

我国猪种的形成及其发展

早在六、七千年以前,随着生产的发展,猎获的野猪逐渐驯养成为家猪,出现了原始的养猪业。考古工作者在距今约六千到七千年前的浙江余姚河姆渡遗址(第三、四层),发现了四十八种之多的动物骨骼,并有出土陶猪(见图1)。家猪骨骼占其中很太一部分。证实了我国饲养家猪的历史,可以远溯到公元前五千年,也就是距今七千年以前的若干世代。     

不同品种猪肉质抗氧化性能比较分析

[目的]比较分析不同品种猪肉质抗氧化性能的差异。[方法]对山东省6个地方品种猪和杜长大三元猪的肉质抗氧化性能和肉质风味进行测定和比较分析。[结果]莱芜猪、大蒲莲猪、烟台黑猪、里岔黑猪、五莲黑猪较杜长大宰后肌肉总抗氧化性能高,并且莱芜猪、大蒲莲猪、烟台黑猪、里岔黑猪、沂蒙黑猪猪肉风味占优势。[结论]该研究为进一步加强地方品种猪的保护开发与利用提供基础资料。     

江西省主要外来猪种氟烷基因分布频率的初步研究

从耳组织提取基因组ＤＮＡ,利用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ技术检测了江西省三个主要外来猪种杜洛鸹９７头、长白１０２头、大约克１４０头共３３９头种猪的氟烷基因型。结果表明：在所有三个品种中均没有检测到隐性纯合子ｎｎ;显性纯合子ＮＮ和杂和子Ｎｎ在上述三个品种中的基因型频率分别为９５．８８％,９７．０６％,９１．４３％,４．１２％,２．９４％,８．５７％;等位基因ｎ的基因频率在上述三个品种分别为２．０６％,１．４７     

华中型地方猪品种资源变化分析

为了解华中型猪品种资源变化的情况,查阅20世纪80年代和21世纪初出版的猪品种志相关资料及相关文献,阐述了华中型猪品种的自然条件、社会经济条件的变化,对该地区猪的品种数量、产地分布、群体规模、体尺体重、繁殖性能和生产性能等性状进行比较,分析了社会经济、自然条件和地方猪性能变化对猪品种资源的影响。比较结果显示华中型地方猪品种减少,龙游乌猪、福州黑猪在2011出版的《中国畜禽遗传资源志—猪志》中已无记载;地方猪数量减少;其体尺体重、繁殖性能、生产性能均有不同程度的变化。     

应用微卫星标记对中国10个品种猪遗传变异的研究

对我国7个地方猪品种(二花脸、通城、清平、阳新、皖南花、赣东黑、万安)和3个引进品种(长白、大白、杜洛克)的4个微卫星位点的多态性进行了检测,并对品种内和品种间的遗传变异进行了群体遗传学分析。结果初步表明,地方品种中二花脸、赣东黑、通城的品种内遗传变异较高,万安的品种内遗传变异最低。除万安猪外,其它地方品种的品种内变异均大于引进品种。品种间的聚类结果基本符合品种的地缘分布。     

野猪和17个家猪群体SLA-DRB基因外显子2的多态性分析

采用PCR-RFLP方法对野猪和国内外17个家猪品种SLA-DRB基因第2外显子的多态性进行分析,进一步分析SLA-DRB基因与疾病抗性的关系.结果表明:经限制性内切酶Rsa Ⅰ酶切后,共检测到4个等位基因和10种基因型.在野猪中仅存在BB摹因型和B等位基因,而在家猪群体中出现了野猪群体中所没有的9种基因型和3个等位基因.五指山猪、临高猪、荣昌猪和藏猪的多态性较为丰富,且具有全部4个等位基因.A等位基因在大多数家猪群体中为优势等位基因,B等位基因在梅山猪、五指山猪、藏猪、荣昌猪中为优势等位基因;BB基因型仅在五指山猪、临高猪、藏猪、荣昌猪和太湖猪群体中分布,地方猪品种中梅山猪BB基因型和B等位基因的频率最高.野猪及17个家猪群体间SLA-DRB基因第2外显子遗传多态性可能是由生态环境差异及自然和人工选择所致,这些遗传差异性可能与抗病力有关.     

猪血清碱性磷酸酶(AKp)多态型的研究初报

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对我国4个地方猪品种(八眉猪,黑河猪,内江猪和荣昌猪)血清碱性磷酸酶(AKp)的遗传多态型进行了初步研究。发现猪血情 AKp 有 AA,BB,CC,AB 和 BC5种表现型,结果表明这些表现型分别受3个复等位基因 AKp~A,AKp~B 和 AKp~C 支配。计算了各品种AKp 基因频率和基因型频率,并对品种间的差异进行了分析和讨论。     

贵州地方猪品种脂蛋白脂酶基因第8内含子的多态性研究

以可乐猪、萝卜猪和香猪3个贵州地方猪种和欧洲猪种为材料,采用PCR-SSCP技术对脂蛋白脂酶（Lip-oprotein lipase,LPL）基因第8内含子的多态性进行了研究。以特异性PCR从样品基因组中扩增出163bp的DNA片段,经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,从两个猪群体的LPL基因第8内含子中都检测到了AA基因型和AB基因型,未检测到BB基因型;欧洲猪品种和贵州地方猪品种均以AB基因型占优势;与欧洲猪品种相比,贵州地方猪品种的B等位基因频率明显较高,A等位基因频率则较低。