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采用CTAB法提取总DNA,应用PCR产物直接测序法,测定了山药原植物薯蓣及其近缘种共10个种和1个变种的trnL-F和rbcL序列.序列分析结果表明:薯蓣及其近缘种trnL-F序列长689~834 bp,当空位始终作缺失处理时,有变异位点67个,其中信息位点11个,占序列总长度的1.43%;种间碱基差异百分率为1.6%,其中转换率为0.6%,颠换率为1.0%;序列的G+C含量为32.5%.薯蓣及其近缘种rbcL序列长1 096~1 160 bp,存在变异位点42个,其中信息位点10个,占序列总长度的0.93%;种间碱基差异百分率为0.6%,其中转换率为0.3%,颠换率为0.3%;序列G+C含量为44.1%.基于2个序列分别重建了薯蓣及其近缘种的系统发育树.结果表明2个系统树的结构基本一致,均支持经典分类方法对薯蓣及其近缘种的亲缘关系的划分.同时,本研究也证实叶绿体基因组序列测定是鉴定山药原植物薯蓣及其近缘种的快速、可靠、有效的方法. 相似文献
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《河南农业科学》2017,(11)
为揭示黔产薯蓣属植物9个种之间的亲缘关系,根据叶绿体mat K、rbc L、psb A-trn H序列片段对其进行种间分子鉴别研究。结果表明,黔产薯蓣属植物9个种的mat K、psb A-trn H、rbc L序列长度分别为1 076~1 144 bp、361~382 bp、1 160~1 209 bp,当空位始终做缺失处理时,其变异位点分别占序列总长度的14.3%、7.8%及8.7%。系统进化分析显示,来自9个种31份样本的薯蓣属植物分为了4个大组。其中,黄独单独为一组,为基生翅组;黑珠芽薯蓣和高山薯蓣聚为一组,为复叶组;光亮薯蓣和毛胶薯蓣聚为一组,为顶生翅组;光叶薯蓣、薯莨、日本薯蓣以及薯蓣聚为一组,为周生翅组。表明mat K、rbc L、psb A-trn H序列片段对薯蓣属植物的系统分类具有明显的指导价值。 相似文献
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应用RAPD技术研究甘蔗属及其近缘属种间亲缘关系 总被引:2,自引:1,他引:2
利用DNA随机扩增多态性(random amplified polymorphic DNA,RAPD)技术,研究了甘蔗属及其近缘属种间的亲缘关系。选择20个引物扩增,在得到的193个片段中,有3个片段是10个材料共有的,多态性达98%。聚类分析结果表明:甘蔗属可划分为两个组群,即热带种组群(包括热带种、印度种、大径野生种、中国种)和割手密种组群。该结论与Irvine的分类结果非常相似。 相似文献
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以包括野梅在内的15个梅品种、1个野生种和其近缘种杏、山杏、桃、山桃、李和‘垂枝’毛樱桃、‘紫叶’李为试材,运用AFLP标记,采用7对引物组合(E-ACTM-CAT、E-GAM-CTC、E-ACTM-CCA、E-ACTM-CAC、E-ACTCTC、E-ACTCAG、E-ACCM-CAG)选择性扩增得到287个多态性条带的6888条带数据,使用NTSYSpc2.1t软件,采用Nei’s(72)遗传距离,SAHNClustering进行不加权成对算术平均法聚类分析,得到了梅品种与近缘种的亲缘关系与形态学、育种记录等相关记录相符的结论,并支持梅花二元分类系统的相关分类。 相似文献
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以密叶挺叶苔为外类群,利用ClustalX2.0和MEGA4.1软件对10种苔藓植物的基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果表明:10种苔藓植物的trnL-F序列长度在434~487 bp之间,排序后总长度为505 bp,其中变异位点127个,信息位点81个。遗传距离在0.007~0.207之间,平均遗传距离为0.122。利用MP法建立的系统树显示,10种苔藓植物可分为两组,其中4种丛藓科苔藓聚为一组,3种青藓科和3种灰藓科苔藓聚为一组。序列分析结果与形态学结果基本一致,表明trnL-F序列可用于苔藓植物的亲缘关系分析。 相似文献
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萱草是极具观赏价值的多年生宿根草本植物,在我国具有悠久的栽种历史。为了探明36个萱草品种间的亲缘关系,利用毛细管电泳荧光标记技术对36个萱草品种进行了EST-SSR分子标记检测,利用11对多态性良好的引物对36份供试萱草材料进行PCR扩增。结果显示:11对引物共获得40个多态性位点,样本平均有效等位基因数为2.58个,平均Shannon多样性指数为1.00,平均期望杂合度为0.57,平均观察杂合度为0.52;以遗传距离矩阵为分析对象,36个萱草品种间的遗传距离为0.05~0.70,利用NTSYS软件按UPGMA法聚类结果显示,遗传距离0.48为阈值时,36种萱草品种分为2个大类,遗传距离0.414为阈值时,可进一步将第1大类分为4个亚类。综上,供试的36个萱草品种之间具有较高的遗传多样性和较为丰富的遗传背景,为今后培养萱草优良新品种提供了一定的理论依据。 相似文献
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分子标记是随着分子生物学技术的发展出现的一类重要的遗传标记。近年来发展非常迅速.已在果树遗传育种研究的各个方面得到广泛的应用,在介绍分子标记在果树种质资源亲缘关系研究方面应用的基础上,对其在果树应用上的研究现状、存在的问题进行了分析,并对未来研究方向进行了评述。 相似文献
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本研究以118个分子标记在108份萝卜种质中进行筛选,得到56个带型清晰、多态性好的标记用于亲缘关系分析。用这56个标记共扩增出130条多态性条带,每个标记2~5条,平均2.3条;观测等位基因数的平均值为2.3214,有效等位基因数的平均值为1.8643,Nei基因多样性指数的平均值为0.4573,Shannon多态性指数的平均值为0.6766,PIC值介于0.29~0.55之间。UPGMA聚类和PCA分析结果较为一致,在遗传相似系数为0.61处可将108份种质分为4大类,黑皮白肉萝卜、樱桃萝卜、心里美类型萝卜种质各聚为一类,其余种质聚为一类,表明萝卜种质亲缘关系与肉质根皮色、肉质色、大小的联系较密切。 相似文献
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利用微卫星分子标记法研究水稻亲缘关系 总被引:2,自引:0,他引:2
为探明水稻品种的亲缘关系,合理利用水稻品种资源,选用55对微卫星标记引物对23个水稻品种的亲缘关系进行了研究,采用UPGMA构建系统树图进行聚类分析和计算遗传距离.结果表明:引物的扩增产物带型清晰,结果稳定;23个品种分为4种类型,其中籼型8个,粳型6个,偏籼型5个,偏粳型4个;籼型品种之间和粳型品种之间的亲缘关系均较近,偏籼型品种之间和偏粳型品种之间的亲缘关系均较远.为了提高籼稻或粳稻品种和杂交种的优势,应注意采用偏籼或偏粳材料作为亲本之一. 相似文献
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为探究广丰千金薯和铁棍山药在分子水平的差异,以广丰千金薯(QJS)和铁棍山药(TGSY)试管苗的微型块茎为试验材料进行转录组分析。结果表明:QJS组和TGSY组样本间相关系数为0.42。QJS组和TGSY组表达量FPKM的对数值在0~1.5,表达量密度在0~1.0。与TGSY组相比,QJS组有4 765个基因下调,有5 112个基因上调。QJS组和TGSY组表达的共有基因有25 207个,QJS组单独表达的基因有5 261个,TGSY组单独表达的基因有3 571个。QJS组和TGSY组共发现611 498个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点和12 056个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)。与TGSY组相比,QJS组的淀粉合成酶3、α-淀粉酶3、β-淀粉酶、类黄酮3'-单加氧酶、类黄酮3'-羟化酶、花青素合酶等基因上调,而颗粒结合淀粉合酶2、蔗糖合酶1、扩展蛋白2和苯丙氨酸解氨酶等基因下调。这可能是广丰千金薯微型块茎肉质绵密粉嫩、软糯爽口、胁迫防御、食后易胀的内在原因。结果可以为广丰千金薯的品种鉴定和分子育种提供参考。 相似文献
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采用高效液相色谱(HPLC)法研究铁棍山药与太谷山药特征图谱,通过索氏提取法、蒸馏法和超声提取法提取并比较2种山药间成分组成及其含量差异,为铁棍山药的品种鉴定提供依据。使用Agilent ODS色谱柱(5μm,4.6mm×250mm),以甲醇-水(95∶5)为流动相,流速1.0mL/min,柱温30℃,检测波长215nm,对2种山药的成分进行HPLC分析。结果表明,超声提取法效果较好。2种山药图谱峰的个数和出峰时间有一定区别,峰面积有明显差别,可以做为指纹图谱来甄别2种山药,所建立的方法可用于铁棍山药的品种鉴定。铁棍山药和太谷山药中均没有检测到皂苷元。 相似文献
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盾叶薯蓣(Dioscorea zingiberendidC·H·Wright),又名黄姜,为薯蓣科薯蓣属多年生缠绕植物,其根状茎内的薯蓣皂素(薯蓣皂苷元)的含量最高可达16·15%,是目前世界上用于合成甾体激素类药物的重要药源植物[1~2]。根据国内生物技术医药产品开发的现状和国际生物医药的应用前景,因盾叶薯蓣用途广泛、利用价值极高,我国十分重视其生产及其有效生物活性成分的开发研究,并将之列为国家生物医药工程发展的重点项目之一。但生产中底肥施用缺乏相关规程,种植者普遍认为底肥越多越好,因而盲目施肥,造成肥害,致使部分植株死亡和根状茎严重腐烂,对其产… 相似文献
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辽东桤木种子休眠特性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]探讨辽东桤木种子的休眠特性及打破休眠的处理方法。[方法]通过种子发芽抑制物检测和种子发芽试验研究了辽东桤木种子萌发的影响因素。[结果]辽东桤木种子不同浓度的水、乙醇和丙酮提取液对白菜种子萌发有明显的抑制作用。辽东桤木种子自然发芽率低,只有8%。采用GA3处理可提高种子发芽率,且种子发芽势整齐;当GA3浓度在50mg/L以上时,浸种48h可显著提高种子发芽率,极显著提高种子发芽势,但当GA3浓度高于200mg/L时,幼苗明显徒长。与其他处理相比,层积处理30d以上可显著提高种子发芽率和发芽势;层积处理30和40d,不仅显著提高了种子发芽率,而且种子发芽势整齐。有光条件下种子发芽率和发芽势高于无光条件下种子发芽率和发芽势。[结论]该研究为辽东桤木种子育苗提供了参考依据。 相似文献