山东地方鸡保种现状及研究进展

山东拥有5个地方优质鸡种,均具有适应性强、耐粗饲、肉蛋品质好等特点,开展地方鸡的保护与研究具有重要的现实意义,本文针对汶上芦花鸡、济宁百日鸡、日照琅琊鸡、寿光鸡、鲁西斗鸡等山东省5个地方良种鸡的品种介绍、保种现状、遗传和畜产品方面的相关研究进展做了简要综述,以供参考。     

山东省公布《山东省地方畜禽品种保护名录》

为更好地保护山东省地方畜禽资源,搞好开发利用,日前,山东省公布地方畜禽品种保护名录。山东省地方畜禽品种保护名录一大家畜鲁西黄牛、渤海黑牛、德州驴二猪莱芜猪、大蒲莲猪、里岔黑猪、烟台黑猪、五莲黑猪三羊小尾寒羊、济宁青山羊、沂蒙黑山羊、崂山奶山羊、洼地绵羊、大尾寒羊四家禽寿光鸡、济宁百日鸡、鲁西斗鸡、微山麻鸭、五龙鹅山东省公布《山东省地方畜禽品种保护名录》     

山东地方鸡种遗传距离与聚类分析方法比较研究

选用5个多态性较好的微卫星标记，检测了山东省仅存的5个地方鸡种：寿光鸡、日照麻鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡、鲁西斗鸡，以及一个外来鸡种——安卡黄鸡和一个外省地方鸡种——广西黄鸡共7个鸡种的遗传多样性。根据测试结果计算了每个等位基因的频率，并以基因频率为基础计算了Nei氏标准遗传距离(Ds)和DA遗传距离，发现日照麻鸡与济宁百日鸡的距离最近，而鲁西斗鸡与其他6个鸡种距离都较远。根据两种遗传距离分别进行了NJ法和UPGMA法聚类，得到4个聚类图。结果表明：DA遗传距离的UPGMA聚类图比较可靠。     

论山东地方鸡品种资源的开发与利用

近年来,地方鸡和土种鸡表现出良好的发展走势,无论是鸡肉还是鸡蛋,市场行情和发展速度都好于外来品种。这是以市场为导向调整养鸡生产结构,适应市场的极好时机。山东地方鸡品种资源比较丰富,有寿光鸡、,济宁百日鸡、汶上芦花鸡、琅琊鸡、烟台糁糠鸡和鲁西斗鸡等。这些地方品种既是珍贵的自然资源,也是价值极高的经济资源。作为生物多样性的组成部分,地方品种资源基因库是未来鸡品种改良和适应生产条件变化的遗传基础。特定的地方品种还是开发名、特、优产品的资源潜力所在。因此,做好地方鸡品种资源的保存与开发工作,对调整养鸡生产结构,保持我省养鸡业长期可持续发展具有重要意义。     

华东27个地方鸡品种(品系)的遗传变异

应用30个微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）进行了遗传多样性分析，计算了多态信息含量、平均杂合度和遗传距离等遗传参数，并用类平均法进行了聚类分析。结果表明：平均杂合度最高的是河田鸡，为0．6870，最低的是狼山鸡，为0．6170；27个地方鸡品种（品系）的杂合度都较高，反映了这些品种的多种多型；各品种的平均遗传距离反映了各品种分化时间的长短；UPGMA的聚类分析将27个品种（品系）聚为10类：丝绒乌骨鸡、济宁百日鸡、河田鸡、安义瓦灰鸡、仙居鸡、江山乌骨鸡、溧阳鸡、金湖乌风鸡、灵昆鸡、余干乌骨鸡、康乐鸡、萧山鸡、琅讶鸡、淮北麻鸡、淮南三黄鸡为第1类，白耳鸡为第2类，浦东鸡为第3类，崇仁麻鸡与丝羽乌骨鸡为第4类，狼山鸡与寿光鸡为第5类，鹿苑鸡、东乡绿壳蛋鸡、汶上芦花鸡各独自聚为第6、7、8类，鲁西斗鸡与宁都三黄鸡聚为第9类，漳州斗鸡独自聚为第10类。通过微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）遗传变异的分析说明这些地方品种的遗传多样性极其丰富，各具特色，应促进资源优势向经济优势转化。     

肌纤维发育相关基因在不同地方鸡种早期生长发育中的表达分析

为研究肌纤维发育相关基因在不同地方鸡种的表达调控作用,选用1日龄体重相近的汶上芦花鸡、济宁百日鸡和鲁西斗鸡,分别在1日龄、1～5周龄采集同一部位的胸肌、腿肌,应用实时荧光定量PCR测定Myf5、Myf6、MyoD1和MSTN等基因的表达量。结果显示:汶上芦花鸡胸肌中MSTN基因1周龄表达量显著高于其他周龄(P0.05),鲁西斗鸡腿肌中MSTN基因4周龄表达量显著高于其他周龄(P0.05),济宁百日鸡胸肌中MSTN基因4周龄和5周龄表达量显著高于其他周龄(P0.05),腿肌中4周龄显著高于其他周龄(P0.05);汶上芦花鸡腿肌Myf6基因2周龄的表达水平明显高于其他周龄(P0.05),济宁百日鸡胸肌中Myf6基因5周龄时表达量显著低于鲁西斗鸡和汶上芦花鸡(P0.05);4～5周龄时,济宁百日鸡腿肌MyoD1基因的表达水平最低,在3周龄时,汶上芦花鸡胸肌MyoD1基因表达水平显著高于其他周龄(P0.05);在0和1周龄时,鲁西斗鸡中胸、腿肌Myf5基因表达水平均高于汶上芦花鸡和济宁百日鸡。研究表明Myf5、Myf6、MyoD1和MSTN基因在3个地方鸡种胸肌、腿肌中均呈现出不同的表达调控模式。     

山东省四个地方鸡种体尺及屠宰性状比较研究

为了解汶上芦花鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡和鲁西斗鸡的体型及产肉性能,随机选取相同营养和管理条件下170日龄的四个品种各20只(公母各半),测定其体尺和屠宰性状。结果显示:鲁西斗鸡体重最大,莱芜黑鸡和汶上芦花鸡次之;鲁西斗鸡的体斜长、龙骨长、胸宽、胸深、胫长、胫宽、屠体重、半净膛重、全净膛重、腿重、胸肌重、胸肌率等显著高于其他三个品种(P0.05),但其公鸡的腿肌率显著低于其他3个品种(P0.05);体斜长和龙骨长与宰前体重、屠体重、半净膛重、全净膛重、腿重、腿肌重、胸肌重均有强正相关(相关系数在0.575~0.701之间),胫长、胫宽和胸宽与上述绝对产肉性状间也有中等程度的正相关(相关系数在0.3~0.55之间)。由此可见,鲁西斗鸡的体型最大,产肉性能最好,其余三个品种在大多数屠宰性状上差异不明显,体尺可以作为绝对产肉性能的间接选育指标。     

中国斗鸡mtDNA遗传多样性及起源研究

本研究旨在探究中国斗鸡的遗传多样性和起源.运用DNA测序的方法测定了河南斗鸡、鲁西斗鸡、吐鲁番斗鸡、西双版纳斗鸡和漳州斗鸡5个斗鸡品种40个个体的mtDNA细胞色素b(Cytb)的部分碱基序列(535 bp).结果表明,这5个斗鸡品种共有6种单倍型;单倍型多样度为0.428 57～0.785 71;核苷酸多样度为0.000 80～0.006 54;漳州斗鸡与其它斗鸡的遗传距离均较远;基于单倍型构建的系统发生树分析表明中国斗鸡母系起源于多个红色原鸡亚种.结论,漳州斗鸡的遗传多样性最丰富,而西双版纳斗鸡和吐鲁番斗鸡最贫乏;中国斗鸡母系起源于多个红色原鸡亚种.     

相对定量Real-time PCR分析不同品种鸡胚H-FABP基因表达的差异

选用孵化5d的9只莱芜黑鸡,9只汶上芦花鸡和8只济宁百日鸡胚以及孵化11d的12只莱芜黑鸡,11只汶上芦花鸡和9只济宁百日鸡胚作为研究对象,采用相对定量Real-timePCR的方法,研究心型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因在不同品种鸡胚中表达的差异。结果显示检测的3个品种孵化11d的鸡胚中H-FABP基因的表达高于孵化5d的鸡胚。其中莱芜黑鸡的H-FABP基因的表达量变化最小,孵化11d的表达量约为孵化5d的2.64倍;变化最大的是济宁百日鸡,孵化11d的表达量约为孵化5d的4.17倍;汶上芦花鸡H-FABP基因在孵化11d的表达量约为孵化5d表达量的2.96倍。     

山东地方鸡种屠宰及体尺性状的比较分析

本试验随机选取相同环境条件下饲养的170日龄汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡各30只,测定其屠宰性能和体尺性状,并进行品种间的比较分析。结果表明,170日龄的活体重济宁百日鸡为1532.03 g,莱芜黑鸡为1431.20 g,汶上芦花鸡为1369.83 g;莱芜黑鸡的屠体率、半净膛率、全净膛率和腿比率值均为最高,且与其他品种间存在显著（P＜0.05）或极显著（P＜0.01）差异;3个地方鸡种的肌肉pH在宰后15 min至宰后24 h内均呈下降趋势,各时期pH均符合正常肌肉要求范围。肌内脂肪含量以济宁百日鸡最高,剪切力和肌内脂肪含量均以汶上芦花鸡最低;各品种的体型特征比较接近,胫围和髋骨宽以汶上芦花鸡最小,莱芜黑鸡最大。     

Genetic Diversity Analysis of Three Newly Discovered Native Chicken Breeds in Yunnan Using mtDNA D-loop Region Sequences

This study was aimed to evaluate the information of their genetic background of Frizzle chicken (FM),Naked-neck chicken (CB) and YN chicken (YN) that were three newly discovered native chicken genetic resources with excellent characteristics,which had been found in Nujiang prefecture and mountainous area of Yunnan province.The variation in a total of 168 individuals sampled from the three chicken populations was assessed using the mitochondrial DNA (mtDNA) D-loop region sequences as genetic marker.The results showed that there were a total of 27 haplotypes were defined in the three native chicken as well as the haplotype diversity of these three chicken were 0.947,0.938 and 0.596,respectively.The nucleotide diversity of these three chicken were 0.01268,0.01434 and 0.00239,respectively.Phylogenetic tree displayed that all 168 individuals distributed in maternal lineage A,B,C,E,F and G.Frizzle chicken contained lineages E,F and G,and Naked-neck chicken contained all 6 lineages,of which the main lineages were E,F and G.YN chicken included lineages E,F and G,and lineage E was the highest percentage in this population.Also,it found that YN chicken was closely related to Gallus gallus murghi,White Plymouth Rock chicken,White Leghorn chicken and New Hampshires chicken,while Naked-neck chicken was closely related to Gallus gallus spadiceus,Gallus gallus jabouillei,Gallus gallus gallus Linnaeus,Indonesian cockfight and Laos chicken.The Frizzle chickens shared more haplotypes with Naked-neck chicken,and the evolutionary relationship between the two species was closer.This study provided a basis for the origin and genetic assessment of three newly discovered Yunnan local chicken breeds.     

鸡VLDLR基因多态性与蛋黄性状的关联分析

本研究采用PCR-RFLP方法,检测VLDLR基因在山东地方鸡种汶上芦花鸡、济宁百日鸡和莱芜黑鸡中的多态性,并分析各多态位点不同基因型与4个蛋黄性状的相关性。结果表明,在3个供试群体中共检测到2个具有生物学意义的SNPs位点,即第6外显子8 467nt处的G→A突变(V8467)和第17内含子13 876nt处的A→G突变(V13876)。最小二乘分析结果表明,V8467对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄高度有显著影响(P<0.05);V13876对蛋黄质量有极显著影响(P<0.01),对蛋黄比率和蛋黄高度有显著影响(P<0.05);而双倍型对蛋黄质量、蛋黄比率的影响均达到极显著水平(P<0.01),对蛋黄高度的影响达到显著水平(P<0.05)。结果提示:本研究检测到的VLDLR基因的V8467和V13876多态性位点可以作为蛋黄性状的候选分子标记。     

Polymorphism in PLIN Gene Intron 6 and its Association with Carcass and Fatness Traits in Chicken

The genetic polymorphisms in PLIN gene were detected by PCR-RFLP method in four Chinese local chickens including Jining Bairi chicken,Laiwu Black chicken et al.,and one breeding strain.The correlations between the SNP and the carcass and fatness traits were analyzed.As a result,a novel G→A mutation at 2 467 bp in PLIN gene was identified in the five populations.Three genotypes (A1A1,A1A2 and A2A2) were detected,and allele A1 was predominant in all the five experimental populations.The statistical analysis showed that the 2 467 bp polymorphism locus was significant association with some carcass and fatness traits (P<0.05).The living body weight,carcass weight,eviscerated weight,abdominal fat weight and percentage of abdominal fat of A1A1 genotype was higher than A2A2 genotype in chickens (P<0.05).The breast intramuscular fat of A1A2 genotype was higher than that of A1A1 and A2A2 genotypes in chickens (P<0.05).The results showed that PLIN gene had effect on carcass and fatness traits in chickens.     

鸡脂滴包被蛋白基因内含子6多态性与胴体及脂肪性状的相关性研究

试验采用PCR-RFLP方法检测脂滴包被蛋白(perilipin,PLIN)基因内含子6在济宁百日鸡、莱芜黑鸡等4个地方鸡种和1个培育品系中的遗传多态性,分析了多态位点不同基因型与鸡胴体及脂肪性状的相关性。结果发现,在5个供试群体中检测到1个多态位点,测序证实为新发现的鸡PLIN基因2 467 bp处G→A突变,该突变位点在供试群体中检测到3种基因型:A1A1、A1A2和A2A2,2个等位基因:A1和A2。等位基因A1在所有供试群体中均表现为优势等位基因。关联分析结果表明,PLIN基因2 467 bp位点对鸡部分胴体性状和脂肪性状影响显著(P<0.05)。多重比较结果表明,A1A1基因型个体活体重、屠体重、全净膛重、腹脂重和腹脂率均显著高于A2A2基因型个体(P<0.05)。A1A2基因型个体的胸肌肌内脂肪含量显著高于A1A1和A2A2基因型个体(P<0.05)。研究结果表明,PLIN基因对鸡胴体及脂肪性状有一定影响。     

鸡Apo VLDLⅡ基因内含子Ⅰ的多态性研究

本研究根据鸡Apo VLDL-Ⅱ基因内含子Ⅰ的基因序列设计3对引物,分别采用PCR-RFLP、PCR-SSCP技术对文昌鸡、如皋黄鸡、丝羽乌骨鸡、安卡肉鸡及红色原鸡5个鸡种进行多态性研究。结果表明,鸡Apo VLDL-Ⅱ基因内含子Ⅰ存在4处突变,分别为:1950处G/A、2522处A/C、2705处A/C及2793处C/T。统计结果显示:安卡肉鸡基因型频率的分布与如皋黄鸡、红色原鸡存在显著差异,文昌鸡基因型频率的分布与乌骨鸡差异不显著,除安卡肉鸡外所有鸡种均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

鸡TLR4突变位点对蛋白结构的影响及其遗传多样性

为研究TLR4不同SNPs位点对TLR4蛋白结构的影响及其在不同鸡种中的遗传变异,采用直接测序法发掘TLR4基因外显子中的SNPs,分析每个SNP位点对TL尺4蛋白结构的影响,并检测对蛋白结构影响较大的两位点在不同鸡种中的遗传多样性。结果表明,在7个鸡群中共发现了17个SNPs;C77T和G247A位点对TLR4蛋白功能影响较大;C77T位点在汶上芦花鸡偏离Hardy—Weinberg平衡,在其它4个地方鸡种和2个商业品种都处于Har—dy—Weinberg平衡,其多态信息含量在寿光鸡最高;G247A位点在5个地方鸡种中均处于Hardy—Weinberg平衡状态,而在两个商业品种偏离Hardy—Weinberg平衡,其多态信息含量在寿光鸡最低。本研究表明,TLR4基因C77T和G247A位点在7个鸡群中具有不同程度的遗传多样性,推测与该基因的功能存在相关。     

不同类型肉鸡线粒体单倍型与遗传起源研究

旨在探讨鸡线粒体D-loop区单倍型特性以及与生长速度的相关性,并分析其遗传起源。选取不同类型肉鸡品种（配套系）6个,测定其生产性能,并对6个群体共计314个个体线粒体D-loop区全长进行测序,分析其单倍型特性;同时与不同红色原鸡亚种进行聚类,分析其母系起源。结果显示,6个群体D-loop区全序列共检测到37个突变位点,构成40种单倍型,分为A、B、C和E 4个单倍型群,其中AA肉鸡、罗斯308、禽雁麻鸡和裕禾1号肉鸡主要为E单倍型,占比分别为85.92%、50.00%、100.00%和70.21%;园丰麻鸡2号和港丰瑶黑麻鸡E单倍型占比相对较低,分别为15.00%和22.39%,园丰麻鸡2号B单倍型含量最高,占比66.67%,港丰瑶黑麻鸡C单倍型含量最高,占比40.30%。相关性分析显示,初生重与E单倍型比例之间呈极显著正相关（P<0.01）,与A、B和C单倍型比例之间均呈负相关;E单倍型比例与公母平均体重约1.8 kg时日龄之间呈显著负相关（P<0.05）,而与公母平均体重约1.8 kg时饲料转化比之间呈极显著负相关（P<0.01）。聚类分析显示,A、B单倍型所有个体均与原鸡滇南亚种聚为一枝;E单倍型所有个体均与原鸡印度亚种聚为一枝;C单倍型所有个体与原鸡印度亚种、滇南亚种、指名亚种以及印尼亚种交叉聚为一类。结果提示,线粒体单倍型与肉鸡生长速度之间相关显著,E单倍型与肉鸡生长速度具有较强的正相关;我国家鸡群体母系起源丰富,但主要起源于原鸡滇南亚种。     

鸡脂滴包被蛋白基因内含子5多态性与胴体及脂肪性状的相关性分析

本试验采用PCR-RFLP方法检测脂滴包被蛋白基因(perilipin,PLIN)在济宁百日鸡、汶上芦花鸡等5个地方鸡种和1个培育品系中的遗传多态性,并分析了多态位点不同基因型与鸡胴体及脂肪性状的相关性。结果发现,在6个供试群体中检测到1个Pst Ⅰ酶切突变位点,测序证实为新发现的鸡PLIN基因2224 bp处G→T突变,该突变位点在供试群体中共检测到两种基因型(A1A1和A1A2),等位基因A1在所有供试群体中均表现为优势等位基因。关联分析结果表明,PLIN基因2224多态位点对鸡胴体性状和脂肪性状影响均不显著(P＞0.05)。多重比较结果表明,A1A1基因型个体在胴体和脂肪性状上总体优于A1A2基因型个体,但各性状均值在两种基因型个体间差异均不显著(P＞0.05)。本研究结果表明,该位点不能作为鸡胴体和脂肪性状的有效分子标记。