三倍体葡萄柚实生后代多倍体的发掘与SSR遗传鉴定

【目的】从三倍体葡萄柚自然授粉的实生后代中发掘多倍体,希望获得一批多倍体新种质,并为探索三倍体遗传规律奠定基础。【方法】秋季采摘三倍体葡萄柚成熟果实,剥取种子,MT+1 mg·L-1GA3培养基播种,待种子萌发后,用流式细胞仪快速检测其倍性,并采用SSR(simple sequence repeat)分子标记鉴定其不同倍性后代植株的来源。【结果】获得了二倍体、三倍体、四倍体、五倍体、六倍体和疑似非整倍体等不同倍性的再生植株各172、52、7、1、1、18株。用13对多态性SSR引物鉴定其来源,结果表明,由二倍体可能三倍体母本所产生的1X配子与周边其他二倍体品种的花粉授粉而来,也可能由三倍体母本产生的重组型2X配子的无融合生殖而来;三倍体大部分由珠心细胞发育而来;四倍体为杂交起源的四倍体;五倍体和六倍体与母本(三倍体葡萄柚)的带型完全相同。【结论】上述活体材料的发掘为柑橘多倍体育种奠定了种质基础。     

柑橘6个地方品种资源四倍体高效发掘及分子鉴定

[目的]基于柑橘多胚种子存在珠心细胞自然加倍的特点,发掘我国柑橘6个地方特色品种资源四倍体新种质.[方法]采摘柑橘成熟果实,剥取种子后催芽播种;待实生幼苗长至2～3片真叶大小时,采用"观根辨叶看油胞"形态初选法从实生幼苗群体筛选疑似多倍体;采用流式细胞仪鉴定疑似多倍体倍性并以SSR分子标记鉴定其遗传来源.[结果]基于幼...     

依据多倍体形态特征快速高效发掘柑橘四倍体

基于柑橘多胚性品种存在珠心细胞自然加倍的特点,建立了基于种子催芽、生长室实生播种、幼苗"观根辨叶看油胞"形态初选和流式细胞仪倍性鉴定的发掘柑橘四倍体的快速方法。采用该方法,分别从无酸甜橙、红江橙、贡柑、年橘、新会柑、滑皮金柑的432、506、1 356、1 870、2 749和685株实生苗中,发掘出疑似四倍体5、6、5、17、45、7株;通过倍性检测,从上述6个品种分别获得四倍体4、5、5、14、39、5株,形态初选准确率分别为80.0%、83.3%、100.0%、82.4%、86.7%和71.4%。与之前的四倍体发掘方法相比,本方法四倍体初选准确率高,并且从种子播种到获得四倍体植株耗时不超过40 d。SSR分子鉴定表明,所鉴定的四倍体均来自其二倍体品种珠心细胞自然加倍形成的双二倍体,为柑橘三倍体无核育种提供了珍贵的四倍体亲本资源。     

柑橘13个多胚品种同源四倍体高效发掘与分子鉴定

【目的】基于柑橘珠心细胞存在自然加倍的特点,实生播种发掘千山红蜜橘等13个品种的同源四倍体。【方法】种子催芽萌发后实生播种,待幼苗长出3片以上真叶后,依据形态特征初选法“观根辨叶看油胞”从实生苗中筛选疑似多倍体,再通过流式细胞仪倍性分析与根尖染色体压片计数对疑似多倍体进一步鉴定倍性,并通过SSR分子标记分析鉴定所获多倍体的遗传来源。【结果】基于形态初选,分别从9个地方特色品种千山红蜜橘、八月橘、衢橘、早橘、扁平橘、瓯柑、狮头柑、冰糖橙、锦蜜冰糖橙和4个砧木品种磨坪香橙、日本香橙、枳雀、油皮金柑的343、499、892、385、519、290、457、241、119、690、828、114、129株实生苗中发掘获得2、1、3、2、7、3、1、3、1、3、17、1、2株疑似多倍体;用流式细胞仪对以上46株疑似多倍体进行倍性鉴定,获得45株四倍体和1株衢橘六倍体,采用根尖染色体计数法验证了上述结果;SSR分子鉴定表明,13个品种的45株四倍体所扩增条带大小与其相应二倍体亲本完全一致,推测其可能是由二倍体亲本珠心细胞自然加倍形成的同源四倍体。【结论】发掘的四倍体资源不仅丰富了我国柑橘多倍体类型...     

沙田柚多倍体遗传差异的SSR分析

应用21对柑橘SSR引物对7份有沙田柚血缘的不同倍性材料进行了基因组的遗传差异分析。平均每对引物扩增出3个等位基因,每对引物可检测到的等位基因数目为2～5个不等,多态性带纹为62.5%。NTSYS软件进行相似系数计算,7份材料的相似性系数为0.763～0.892。UPGMA法聚类分析,在相似性系数为0.83处可划分为3类,即3株天然四倍体为第Ⅰ类;2株人工同源四倍体与1株天然三倍体为第Ⅱ类;二倍体母株为第Ⅲ类。天然三倍体与二倍体的遗传相似性较四倍体与二倍体的遗传相似性更高。4对引物(CAT01,TAA33,AG14 and TC26)可以区分天然四倍体与人工同源四倍体。与亲本二倍体母本相比,所试三倍体和四倍体均发生了DNA水平变异,表现为带纹缺失同时又增加了新的带纹。这些多倍体试材可为培育无核三倍体柑橘提供丰富变异的亲本材料。     

柑橘溃疡病抗性相关的SSR标记筛选

以抗柑橘溃疡病的‘宜昌橙2586’与易感病的‘岭南沙田柚’进行杂交,随机选取F₁ 代材料80 株,开展溃疡病抗性田间接种鉴定。鉴定结果表明,溃疡病抗性在F1 代分离明显,若将免疫和高抗类型均视为抗病,中抗、中感和感病类型均视为感病,则抗感的分离比例接近1︰1。采用集合分离分析法BSA (Bulked Segregant Analysis),结合SSR 分子标记技术,筛选到1 个与柑橘溃疡病抗性相关的分子标记CCR-110。利用F₁ 代分离个体和公认的抗感材料对标记进行验证分析,发现该标记表现较好的抗性相关性。F₁ 群体相关分析表明,该标记与柑橘溃疡病抗性的相关系数为0.79;采用最大似然法计算重组率为9.38%±3.5%,通过 Kosambi 函数将其转换成图距单位（cM）,遗传距离为9.11 cM;感病的甜橙类、柚类、枳类没有此标记,抗病的金柑类、宜昌橙类、香橙类、宽皮柑橘类的多数材料出现此标记。     

西瓜品种‘蜜多’种子纯度SSR标记鉴定

为了准确、快速鉴定西瓜杂交种纯度,建立8424类型西瓜品种的SSR分子标记纯度鉴定体系。基于23对西瓜SSR核心引物,对天津市静海区主要种植的8424类型西瓜品种‘蜜多’进行分子标记纯度鉴定。从供试引物中,总共筛选到4对在双亲上具有多态性差异的特异性引物,并从中选出2对多态性良好,条带清晰的引物10号和22号,应用于‘蜜多’的分子标记纯度鉴定。对4份杂交F_1代样品进行分子鉴定,结果分别为97.4%、94.9%、98.1%、97.8%,对比分子鉴定结果和田间形态学鉴定结果,结果偏差≤1.5%,表现出高度一致。研究结果表明,SSR分子标记适用于该品种纯度鉴定,并可以取缔田间表型鉴定,实现准确、快速检测。     

10个藕莲品种SSR指纹图谱的构建与品种鉴别

在开发出莲基因组SSR引物对的基础上,采用SSR分子标记技术尝试鉴别10个藕莲推广品种。筛选出16对SSR有效引物进行PCR扩增,其中6对引物CL1、CL2、CL4、CL9、CL14、CL16共扩增出15条多态性条带,对所得到的10个藕莲品种的SSR指纹图谱进行组合和综合分析,可以将供试的10个品种区分开来。表明利用SSR技术进行藕莲品种鉴定是可行而有效的。     

29个梨品种SSR特征指纹数据表的构建

【目的】为便于果树种质区分鉴定,资源交换、管理和利用,新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试,以29个梨品种SSR指纹数据作为基础数据,演示了一种二倍体果树品种SSR特征指纹数据表的构建方法。【方法】经过SSR位点基因型数目统计,SSR位点排序,供试品种排序区分和数据标示,表格优化等数据整合处理步骤,构建了29个梨品种SSR特征指纹数据表。【结果】12对SSR引物中,CH04h02和NAUpy65d 2对引物能将供试的29个梨品种全部区分开,可作为鉴定这29个梨品种时的核心引物加以利用。【结论】该方法简便易行,特征指纹数据表数据信息展示全面直观,品种区分关系一目了然,便于交流共享和指纹图谱数据库共建。     

80个梨品种SSR特征指纹数据表的构建

【目的】通过鉴定80份梨种质资源SSR指纹数据,构建梨品种指纹图谱数库表,为实现梨种质资源鉴定及新品种DUS测试的可视化和简便化奠定数据基础。【方法】利用荧光标记技术检测SSR位点,并对SSR位点基因数目进行统计,SSR位点排序,并对供试品种进行排序区分和数据标示,构建了80个梨品种的特征指纹数据表。【结果】12对引物中,可利用NH039A、NH007b、NAUpy97a、NB105a、NB141b、NAUpy82r 6对引物区分所有供试品种,可作为区分这80个梨品种的核心引物。【结论】筛选出了区分供试80个梨品种的核心引物,为梨指纹图谱数据库的共建和共享提供了数据基础。     

不同类型柑橘中黄脉病毒衣壳蛋白基因的保守性及复制水平

为研究不同柑橘品种对柑橘黄脉病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)变异的影响,将CYVCV毒株CQ01嫁接接种于4类共35个柑橘品种,对不同植株中CYVCV的衣壳蛋白(CP)基因进行分析,结果发现仅有少数位点发生了变异。运用RT-qPCR技术检测不同柑橘品种中CYVCV的相对含量,发现甜橙类品种中CYVCV的相对含量最高,墨西哥来檬中CYVCV的相对含量最低。植株中CYVCV的含量与其症状不存在明显的关联。     

Exploitation of SSR,SRAP and CAPS-SNP markers for genetic diversity of Citrus germplasm collection

The present study was to assess informativeness and efficiency of three different molecular markers for genetic diversity among 24 Citrus and its relative species. Sixty one SSR, 33 SRAP and 24 CAPS-SNP markers were used to evaluate the level of polymorphism and discriminating capacity. A total of 596, 656 and 135 polymorphic amplicons were observed in SSR, SRAP and CAPS-SNP markers with average polymorphism information content (PIC) of 0.97, 0.98 and 0.89, respectively. High levels of polymorphism were recorded for SSR and SRAP compared with CAPS-SNP markers. The highest correlations (r = 0.930) were obtained between SSR and SRAP markers, whereas SSR and CAPS-SNP were poorly correlated (r = 0.833). Cluster analysis was performed to construct dendrograms using UPGMA. And the dendrogram from SSR data was most congruent with the general dendrogram. These findings provide basis for future efficient use of these molecular markers in the genetic analysis of Citrus and its relatives.     

柑橘品种对不同基因型柑橘衰退病毒的抑制及变异的影响

为研究不同柑橘品种对柑橘衰退病毒（Citrus tristeza virus,CTV）不同基因型的抑制效果,将T36、T30、VT和T3等基因型CTV的毒源分别接种于‘赛蒙斯’甜橙、‘邓肯’葡萄柚、‘墨西哥莱檬’和‘强徳勒柚’,运用RT-qPCR技术检测被接种植株中CTV复制水平的差异。结果表明,‘墨西哥莱檬’最适于CTV各基因型的复制。‘邓肯’葡萄柚中VT、T3和T36基因型的复制水平最低。4种柑橘品种对T36基因型CTV都有明显的抑制作用。通过对CTV的CP基因进行分析发现,VT基因型CTV在‘赛蒙斯’甜橙中发生了较大变异。     

运用SSR分子标记分析蛹虫草遗传多样性

以蛹虫草全基因组为模板查找Simple Sequence Repeats(SSR)位点并设计筛选引物进行聚类分析。从100对SSR引物中选出30对多态性高、重复性好的SSR引物,共获得215条多态性条带。根据遗传相似系数(GS)采用不加权成对群算术平均法(UPGMA)进行遗传相似性聚类:材料间GS值的变化范围为0.527~0.995,以GS值为0.761水平可将46株蛹虫草分为6类;菌株亲缘关系与地域来源有一定相关性,且栽培菌株多为同一品种。     

柑橘钙调蛋白cDNA的克隆及序列分析

 以温州蜜柑(Citrus unshiu Marc. ) 幼果cDNA第1链为模板, 参照大麦钙调蛋白基因序列(Accession No. M27303) 合成5p端和3p端引物, 以PCR的方法扩增得到柑橘钙调蛋白cDNA, 将其克隆到PMD182T载体上并进行测序。序列分析表明, 柑橘钙调蛋白cDNA全长453 bp, 共编码148个氨基酸, 与大麦和大豆钙调蛋白基因的同源性均高达83%以上, 所编码氨基酸序列同源性达97%以上。以该cDNA作探针进行点杂交, 得到良好的杂交信号。     

甜瓜种质资源遗传多样性的SSR 分析

利用SSR 分子标记技术对72 份甜瓜种质资源及育种材料进行DNA 指纹分类及亲缘关系研
究,20 对SSR 引物共扩增产生76 个多态性位点,平均每对引物产生3.8 个多态性位点。聚类结果将72 份
甜瓜种质资源分为7 个类群,其中类群I 包括新疆本地资源及几乎全部自育甜瓜种质资源64 份材料,这
说明本试验所选用的新疆厚皮甜瓜种质资源遗传背景比较狭窄。     

香橙苹果酸脱氢酶CjMDH基因表达特性及转基因烟草的耐铝分析

为研究柑橘砧木香橙对酸性土壤的适应机理,从‘资阳香橙’根cDNA文库中随机测序克隆了苹果酸脱氢酶基因CjMDH（Genbank Accession No. ABI75147）。该基因cDNA序列长1 368 bp,其开放阅读框为1 239 bp,推测其编码412个氨基酸残基,在编码氨基酸序列中存在苹果酸脱氢酶的NAD结合位点1个和苹果酸结合位点8个,iPSORT分析表明该基因编码氨基酸序列N端存在叶绿体转移肽。同源性分析显示CjMDH与拟南芥、烟草、大豆、豌豆、水稻、苜蓿等植物的MDH一致性约为80%,相似性在85%以上。在与苹果酸脱氢酶功能有关的NAD和苹果酸结合位点处氨基酸残基高度保守,表明这两个区域是MDH重要的功能区。Northern blot和Real Time RT-PCR分析结果表明该基因在香橙根和叶中优势表达,在根中表达量最高,茎中表达最低。将CjMDH基因构建到组成性启动子CaMV35S驱动的载体中,对烟草进行转化。从转基因烟草株系中筛选获得了CjMDH基因高表达的株系3个。将表达量高的转基因株系进行耐铝试验,初步结果表明在烟草中超量表达CjMDH,可以提高植株对铝毒的耐受能力。     

Analysis of genetic diversity among some Persian walnut genotypes (Juglans regia L.) using morphological traits and SSRs markers

There is a high diversity among cultivated walnut trees in Iran due to its long time of seed propagation and vast area of cultivation. In this study some morphological characters as well as Simple Sequence Repeat (SSRs) markers were used to analyze the genetic diversity and relationships among 31 Iranian walnut genotypes along with four foreign cultivars. The nut weight ranged from 7.52 to 17.73 g, kernel weight from 4.00 to 9.83 g, and kernel percentage ratio from 38.78 to 67.05% among studied genotypes. In SSRs analysis, nine primer pairs were tested that produced 39 alleles ranging from 2 to 8, with a mean value of 5.10 allele per primer. The Iranian genotypes showed relatively high diversity both for their SSRs loci and morphological traits. Although the foreign cultivars (‘Serr’, ‘Vina’, ‘Franquette’ and ‘Lara’) clustered with each other, they also laid close and within the Iranian genotype. The results of the study provided us with valuable diversity among our genotypes which could be used for breeding studies and also showed the power of genetic markers for analysis and evaluation of this diversity.     

利用简单重复序列分子标记分析我国侧耳栽培菌株的遗传多样性(英文)

采用FIASCO方法,从糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)菌株ACCC 50838分离简单重复序列分子标记(Simple sequence repeat,SSR),所得标记用于分析我国52个侧耳(平菇)栽培菌株多样性,对于SSR标记相同的菌株再进行ISSR PCR分析。结果表明:18个SSR标记在供试菌株中的等位基因的数量为3～12个,多态性指数(PIC)为0.34～0.84;除了2组(ACCC50618,ACCC 50866和ACCC 50915;ACCC 50249和ACCC50476)共5个菌株之外,其他47个菌株都能利用这18个SSR标记进行有效的鉴别。SSR标记相同的的菌株,其ISSR、体细胞不亲合性和出菇性状(温型、菌盖颜色)也相同,这些菌株可能是同物异名。利用这18个SSR标记分析52个菌株的遗传多样性,相似性指数为0.755～0.9995。根据相似性指数进行聚类分析,52个菌株分成两个大的类群,分别为糙皮侧耳(P.ostreatus)和肺形侧耳(P.pulmonarius)。结合这些栽培菌株的农艺性状和SSR分子标记的聚类分析结果,我国平菇栽培菌株的遗传多样性非常丰富。研究表明SSR分子标记技术在平菇遗传多样性和菌株鉴别中具有广泛的应用前景。