基于微卫星标记的7个番鸭群体遗传多样性分析

为探讨不同番鸭群体遗传多样性和亲缘关系,本研究选取24对微卫星引物,对7个番鸭群体的DNA片段进行PCR扩增及毛细管电泳产物信息检测.结果表明,24个微卫星位点在7个番鸭群体上共检测到80个有效等位基因,基因流(Nm)为2.4181,多态信息含量(PIC)为0.4561,F-统计量(F-statistic)平均为0.0...     

亲本番鸭微卫星标记遗传距离与半番鸭主要经济性状的相关性分析

利用8个微卫星标记测定半番鸭亲本间的遗传距离,并分析了亲本遗传距离与半番鸭主要经济性状的相关关系.结果表明：亲本间微卫星标记遗传距离与杂交后代日增重相关程度较高,相关系数0.9285～0.9978;与饲料转化率呈负相关关系,相关系数-0.7838～-0.8965;与10周龄的半净膛率和全净膛率呈正相关,相关系数0.9094和0.8838;与胸肌率、皮脂率和腹脂率也呈强正相关,相关系数0.9027、0.9378和0.7983,与腿肌率则呈强负相关,相关系数-0.8898.     

兔微卫星标记研究进展

微卫星DNA,亦称简单序列重复,是指以2~6个核苷酸为基本序列串联重复的短片段〔1〕。微卫星标记与其它分子标记技术相比,具有分布广泛、多态信息含量高、呈共显性遗传等优点,因此在品种资源分类及畜禽遗传多样性的评估和保存中,微卫星被作为重要的遗传标记之一〔2〕。我国家兔分子生物学标记的研究起步较晚,最近几年才开始,利用微卫星标记来研究家兔的群体遗传特性是在2003年才开始的,相比较而言,国外则开展的较早,技术比较成熟,研究也相对较深入。1国内研究进展殷宝法、魏万红等,使用8对微卫星引物对高原鼠兔血样中的DNA微卫星位点(Sol33…     

家禽微卫星标记研究进展

有关微卫星的报道始见于Skinner等(1974)在研究寄生蟹的卫星DNA时发现一种简单的串联重复序列。Ali等(1986)首次将合成的寡聚核苷酸用于人的指纹研究，才受到重视。Jeffreys等和Gao等(1988)进一步将其发展成为一种新的遗传标记系统。Tautz等(1989)报道微卫星具有丰富的多态性。早期将微卫星称为“简单序列”、“简单序列重复(SSR)”、“简单串联重复(STR)”等。     

畜禽微卫星标记的研究进展

微卫星具有数量多、分布广、多态性丰富和共显性遗传等优点,是继RAPD、RFLP之后的第二代分子标记,近年来以其独特的优点被广泛应用于畜禽遗传育种研究的各个领域中.对微卫星标记在构建畜禽遗传连锁图谱、群体遗传多样性分析和遗传结构分析、标记辅选择等方面的研究进展作一阐述.     

微卫星分子标记的研究进展

微卫星是指以少数几个核苷酸(一般1～6个)为单位多次串联重复的DNA序列，是1974年Skinner在研究寄居蟹的卫星DNA时发现的。微卫星广泛均匀地分布在基因组上，其重复数和重复单位序列都是可变的，故多态信息含量大。但由于微卫星无位点特异性，无法确切定位。因此以微卫星核心序列为中心，两侧各加上1个侧翼序列，形成所谓的序列示踪微卫星位点(STMS)。由于侧翼序列在基因组中是单拷贝的，具有位点特异性，而微卫星本身又使STMS具有多态性，只需根据微卫星侧翼序列设计一对PCR引物，通过PCR反应从模板DNA中将该位点扩增出来，然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，溴乙锭或银染法显色进行研究。     

微卫星DNA标记及其应用

微卫星DNA存在于大多数生物的基因组中,一般由1～6个核苷酸的串联重复片段构成,由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富,所以微卫星DNA标记的应用范围非常广泛。笔者就微卫星DNA标记在基因组连锁图构建、基因定位、QTL分析、标记辅助选择、杂种优势预测、亲缘关系鉴定、近交动物以及医学等方面的应用作逐一概述。     

长毛兔微卫星标记初步分析

为在长毛兔群体中实施标记辅助选择,对200只长毛兔的sat13、sol33、sat4、so1444个微卫星位点进行了检测。结果表明:这4个微卫星位点都具有高度的多态性,sat4位点杂合度(H)和多态信息含量(PIC)最高,分别为0.8920与0.8790;sat13和so144位点等位基因数为7个,而sat4和so133位点分别有10个等位基因。     

家兔群体遗传变异的微卫星标记

选用欧洲野兔的 5个微卫星位点 ,分析了 5个品种 (系 )家兔群体的遗传变异。结果表明 :Vc- 系獭兔的群体内平均多态信息含量和平均杂合度最大 ,分别为 0 .5 5 2 6和 0 .6 2 0 2 ;新西兰兔群体内平均多态信息含量和平均杂合度最小 ,分别为 0 .4 5 15和 0 .5 2 6 1。由此说明 ,5个品种 (系 )家兔中 ,新西兰兔群体内变异较小 ,相对较纯 ;Vc- 系獭兔群体内变异较大 ,纯度相对较小。但总的来看 ,5个品种 (系 )家兔的平均多态信息含量和平均杂合度相差都不大 ,说明Vc獭兔在遗传性能上已接近其他优良品种兔。聚类结果表明 :Vc- 系獭兔与 Vc- 系獭兔亲缘关系最近 ,与日本大耳白兔、青紫蓝兔亲缘关系较近 ,与新西兰兔亲缘关系最远 ,这与 Vc獭兔育种历史事实相符。另外 ,在 Sat4和 Sat8位点上分别检测出了 1条 Vc獭兔所特有的条带 ,从而为进一步研究 Vc獭兔的遗传特性打下良好的基础     

利用微卫星DNA多态性预测半番鸭的杂种优势

为探究微卫星DNA多态性与鸭肉用性能杂种优势的相关关系,选取10对微卫星标记对金定鸭、樱桃谷鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)和番鸭进行遗传多样性检测。利用ONEDscan、GENEPOP、Mstools软件对目的基因进行分型,计算遗传多样性参数以及群体间标准遗传距离,并测定半番鸭各杂交组合F1代体重杂种优势。结果表明:在4个鸭群体共检测到52个等位基因,金定鸭、F1(樱桃谷鸭×金定鸭)、樱桃谷鸭与番鸭群体间标准遗传距离分别为0.57678、0.52220、0.46356,樱桃谷鸭与金定鸭遗传距离为0.38949。并根据遗传距离,采用对数曲线模型对半番鸭体重杂种优势进行了预测,χ2检验结果显示,预测结果与实验测定结果无显著性差异,表明本研究建立的根据微卫星DNA多态性预测半番鸭部分生长阶段体重杂种优势是可行的。     

微卫星DNA标记与亲子鉴定

本文阐述了几种家畜亲子鉴定中使用的微卫星座位及其在亲子鉴定中的应用,并对微卫星DNA标记与亲子鉴定研究急待解决的问题与发展方向做了阐释。     

家兔群体遗传变异的微卫星标记

选用欧洲野生穴兔的5个微卫星座位,分析了5个品种(系)家兔群体的遗传变异.结果表明:Vc-Ⅱ系獭兔的群体内平均多态信息含量和平均杂合度均最大,分别为0.552 6和0.620 2;新西兰兔群体内平均多态信息含量和平均杂合度都最小,分别为0.451 5和0.526 1,说明在5个品种(系)家兔中,新西兰兔群体内变异较小,相对较纯;Vc-Ⅱ系獭兔群体内变异较大,纯度相对较小.但总的来看,5个品种(系)家兔的平均多态信息含量和平均杂合度相差都不大,说明Vc獭兔在遗传性能上已接近其他优良品种兔.聚类结果表明:Vc-Ⅰ系獭兔与Vc-Ⅱ系獭兔亲缘关系最近,与日本大耳兔、青紫蓝兔亲缘关系较近,与新西兰兔亲缘关系最远,这与Vc獭兔育种事实相符.在Sat4和Sat8座位分别检测出了一条Vc獭兔所特有的条带,从而为进一步研究Vc獭兔的遗传特性打下良好的基础.     

微卫星标记与动物遗传育种

微卫星标记具有数量多、在基因组中分布广、多态性丰富，呈孟德尔式共显性遗传、检测快速方便等优点，在动物遗传育种中显示出较好的发展前景。笔者综述了微卫星标记及其在动物遗传育种中的应用。     

微卫星标记与动物遗传育种

微卫星技术是20世纪80年代末期发展起来的一种能有效区别不同物种，不同群体及不同基因型个体的分子标记。微卫星标记广泛分布于各真核生物基因组中，且随机分布，本文就微卫星标记的结构特点及其在动物遗传育种中的应用作一综述。     

基于微卫星标记鉴定湖羊家系

试验旨在基于微卫星（simple sequence repeats,SSR）多态性探索一种鉴定与划分湖羊家系的方法,通过查阅文献筛选出9个分布于多个常染色体、具有高多态性信息、高杂合度的湖羊微卫星位点BM3051、HH64、TGLA137、MAF33、FCB48、VH72、INRA023、ETH152和MCM527。采集30只湖羊种公羊血液,使用试剂盒提取血液基因组DNA,合成筛选出的9个微卫星引物并使用荧光基团标记,利用降落式PCR进行扩增,扩增产物在基因分型后使用CERVUS3.0.7进行基因型分析,使用POPGENE1.32基于Nei氏遗传距离构建树状聚类图,根据图示的亲缘关系远近划分湖羊家系。结果显示,当双亲基因型未知时,9个微卫星位点的单亲累积排除概率为99.2094%;当单亲基因型已知时,9个微卫星位点的累积排除概率为99.9688%;当双亲基因型未知时9个微卫星位点的双亲累积排除概率为99.9999%,排除概率能够满足遗传育种中亲子鉴定和系谱分析的要求。根据Nei氏遗传距离构建UPGMA聚类图,将30只种公羊划分为6个家系,为育种工作提供了一定参考。本方法能够进行湖羊家系的鉴定与划分,对湖羊育种工作具有一定的应用价值。     

塞北兔群体遗传变异的微卫星标记

检测了125只塞北兔在6个微卫星座位的基因型,分析了等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量等参数值,并对塞北兔在6个微卫星座位Hardy-Weinberg平衡检验。结果显示:塞北兔在6个微卫星座位共检测到的等位基因30个,每个基因座位为4~6个,等位基因大小在129~244bp之间,塞北兔除了在SOL03基因座位呈中度多态性变异以外,在SOL33、SOL44、7L1B10、L7C11和SAT12等5个微卫星座位呈高度多态性变异;除了在基因座位SOL33和SAT12以外,塞北兔在其他4个基因座位SOL03、SOL44、7L1B10、L7C11均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

微卫星标记与动物遗传育种

微卫星标记具有数量多、在基因组中分布广、多态性丰富,呈孟德尔式共显性遗传、检测快速方便等优点,在动物遗传育种中显示出较好的发展前景。本文综述了微卫星标记及其在动物遗传育种中的应用。     

猪EST序列的微卫星标记定位

通过对 Gen Bank中猪的表达序列标签数据库进行序列扫瞄 ,结果检测到大约 10 0个包含一个微卫星重复或简单重复 (SSR)的序列文件。这些重复单元多数是二核苷酸(CA/GT)重复 ;而且检测到 3～ 6个核苷酸的重复序列。通过 6个二核苷酸和 14个中度串联重复序列的初步分析 ,仅二核苷酸重复序列标记产生丰富的标记信息。 (二核苷酸为10 0 % ,中度串联重复序列为 14 % )。另外对 5 0个二核苷酸和 1个三核苷酸 SSRs设计了几对引物 ,结果在 MARC的参考家系中 ,发现 4 2个标记具有多态性 ,17个标记不具有多态信息 ,12对引物没有扩增产物。通过二核苷酸和 3～ 6个核苷酸重复单元的比较 ,二核苷酸标记 72 %能够反映标记信息 ,而其它重复单元仅有 7%。不同的是 ,在 3～ 6个碱基重复单元中 ,非多态标记占较高的比率 (6 4 % ) ,而 2个碱基重复单元仅 14 %。这或许是因为在猪基因组 DNA中 ,中度重复单元的多态性较少 ;或是由于我们选择 17个以上连续重复碱基长度的标准太低。本研究将定位的微卫星标记加入猪的遗传图谱上 ,并为人和猪的基因组之间提供了有用的联系     

微卫星标记预测肉羊杂种优势的研究进展

杂种优势是一个复杂的数量性状,是育种工作的重要指标,利用微卫星标记技术估算亲本间的遗传差异,再通过对遗传差异的分析预测杂种优势,大大改善了传统育种费时费力的状况。通过对国内外相关文献阅读分析,总结了微卫星标记在预测肉羊杂种优势方面的研究现状,使微卫星标记预测肉羊杂种优势的可行性更加显而易见。     

微卫星DNA标记的研究与应用

阐述了微卫星DNA标记的结构、特点,较之其他标记的优点。简要介绍了其在构建基因图谱,标记辅助选择（MAS）,遗传多样性研究,定位QTL,预测杂种优势等方面的应用。