悬钩子属野生种及品种亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR分子标记方法,对39份悬钩子属(Rubus L.)野生种或变种及17份栽培品种进行分析,探讨这56份材料间亲缘关系的远近.通过试验从35个引物中筛选出12个能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出166条DNA片段,分子量在250～2300 bp之间,平均每条引物扩增出13.83条DNA片段,多态性比率为96.33％,然后采用NTSYS-pc软件和UPGMA法构建了系统树.聚类分析结果将野生种分成5大类群,其中15份栽培品种包含在内,而有2份栽培品种(酷它它和宝森)另成一类,区别于其他54份材料.试验认为ISSR分子标记技术适合作悬钩子属植物组间亲缘关系的分析.     

利用cp DNA PCR-RFLP分析中国山楂属植物的亲缘关系

以8个山楂种的39份种质资源为试材,采用10对叶绿体DNA(chloroplast DNA,cp DNA)通用引物对总DNA进行扩增.并用7种限制性内切酶对PCR扩增产物酶切.结果表明:5对引物(cp01、cpP3、cp04、cp05、cp10)在山楂属植物上扩增出特异谱带,2种限制性内切酶(HinfⅠ和Taq Ⅰ)的酶切产物在供试材料间存在差异.山楂属种间存在较为丰富的cp DNA PCR-RFLP多态性,但山楂(C.pinnatifida)不同基因型间未检测到变异位点.麻核组(Sect.Santguineae)的甘肃山楂、光叶山楂、毛山楂、辽宁山楂和羽裂组(Sect.Pinnatifidae)的伏山植的cp DNA PCR-RFLP标记完全相同,但麻核组的阿尔泰山楂与其他山楂种的亲缘关系较远,距离系数达0.91.可见山楂属植物起源和演化的复杂性.伏山楂并非山楂的变种而很可能是一个新种.     

部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选

为了建立柿属植物目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。     

部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选

为了建立柿属植物目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。     

泡桐属植物遗传多样性的FISH-AFLP分析

运用FISH-AFLP技术对泡桐属14个种及变种进行了基因组DNA分子水平上的检测.结果表明,从64对AFLP引物组合中筛选出9对,共获得1 171条清晰可辨的条带,其中多态性条带1 158条,多态性带百分率达98.89%,14份供试材料的遗传相似系数为0.603 4~0.740 2,平均相似系数为0.671 8,反映出泡桐属不同种质间差异明显,具有丰富的多态性.本研究运用NTSYS 2.1版软件对样品进行UPGMA聚类,分析了泡桐属植物14个种的遗传多样性和亲缘关系,并对泡桐属部分植物的分类问题进行讨论.     

金枣柿与部分柿属植物亲缘关系的ISSR分析

应用ISSR标记对柿属(Diospyros)17份植物材料的亲缘关系进行分析,以明确金枣柿的分类地位。用君迁子(D. lotus L.)进行预扩增后,从100条引物中筛选出37条扩增清晰的多态性引物,这些引物共扩增出997条DNA条带,平均每个引物扩增的DNA条带数为26.94条,其中多态性DNA条带973条,占97.59%。根据ISSR扩增结果,进行聚类分析,结果表明: 17份柿属材料可明显分为2个大类群,其中金枣柿的6份试材为一个大类群,与组成另一类群的3个种形成明显遗传界限。通过聚类分析,结合形态观察,认为金枣柿极有可能是柿属的又一个新种。     

基于AFLP标记的贵州及其邻省薏苡种质资源 遗传多样性分析

[目的]分析贵州及其邻省薏苡种质的遗传多样性,为薏苡种质资源的保护、遗传改良及创新利用提供理论依据.[方法]利用AFLP标记对来源于贵州及其邻省的141份薏苡种质进行遗传多样性分析及聚类分析.[结果]6对AFLP引物组合从141份薏苡种质中共扩增出830条清晰的条带,其中多态性条带为742条,多态性比例为89.40%,平均每对引物组合扩增多态性条带123.67条,有效等位基因数(Ne)为1.35~1.50,平均1.44;Nei's遗传多样性指数(H)为0.21~0.30,平均为0.26;Shannon's信息指数(I)为0.33~0.45,平均为0.40.来自贵州及其邻省的141份薏苡种质分为两大类群,第Ⅰ大类群包含63份薏苡种质,其中来源于贵州27份、广西6份、湖南15份、云南7份、重庆5份和四川3份,该类群可细分为Ⅰ-A和Ⅰ-B 2个亚群;第Ⅱ大类群包含78份薏苡种质,其中来源于贵州44份、广西3份、湖南5份、云南18份和四川8份,该类群可细分为Ⅱ-A、Ⅱ-B、Ⅱ-C和Ⅱ-D4个亚群.在每个亚群中,同一地区或毗邻地区的薏苡种质亲缘关系较近,跨区跨省的薏苡种质资源亲缘关系远,仅有少量不同地区的薏苡种质被聚为一个类群.[结论]贵州及其邻省的薏苡种质交流相对较频繁,遗传基础较狭窄,遗传多样性较低.     

利用SRAP标记构建山东省苹果资源指纹图谱

构建山东省苹果属植物资源指纹图谱,为该地区资源保护、利用及创新奠定基础。以山东省内59份苹果属植物资源为试材,采用改良CTAB法提取基因组DNA,从15条正向引物和16条反向引物随机组合的240对SRAP引物中筛选出25对条带清晰、多态性高的引物组合用于试验。根据电泳胶图,计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon’s信息指数(I),并进行遗传多样性分析。用NTSYS-pc2.10e软件UPGMA方法进行聚类分析,并计算遗传相似性系数。采用引物对组合的方法,构建59份山东苹果资源数字指纹图谱。共检测出176个条带,其中多态性谱带158条,多态性比率达89.77%,平均每对引物组合产生7.04个条带和6.31个多态性条带。样品间平均观察等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性指数及Shannon’s信息指数分别为1.8898,1.4945,0.2861及0.4302。UPGMA聚类结果表明,59份样品...     

薏苡种质资源ISSR分子标记筛选及亲缘关系分析

利用ISSR标记对92份薏苡种质进行遗传多样性分析,结果表明,从100条ISSR通用引物中筛选出11条多态性较好的引物,共扩增出49条多态性条带,多态性条带占各自总条带的比例为66.6%～100.0%;非加权组平均法(UPGMA)和主成分分析法(PCA)对92份薏苡种质的聚类结果一致,均分为3个类群,云南、贵州、福建3个省份的种质表现出比较丰富的遗传多样性,其他省份的多样性水平相对较低。     

槭属种质遗传多样性及亲缘关系的SRAP分析

采用SRAP分子标记分析31份槭属植物材料的遗传多样性及亲缘关系。从90对SRAP引物中筛选出11对引物分别对供试材料基因组DNA进行扩增,共获得186条清晰可辨谱带,其中183条为多态性谱带,多态性位点比率为98.04%,多态性较高。用NTSYS-pc软件计算得到31份槭属植物间相似系数介于0.462和0.849之间,采用UPGMA法在相似系数0.594处将31份材料划分成6大类。根据SRAP聚类结果探讨了供试材料间的亲缘关系及新品种选育前景。