指纹图谱在作物品种鉴定中的应用

综述指纹图谱的特点、分类及其在作物品种鉴定中的应用。     

茶树DNA分子指纹图谱研究进展

分子指纹图谱直接反映生物个体在DNA水平上的差异,可有效鉴别茶树品种,保护品种权。本文概述了指纹图谱的分类、概念和特点,近年来国内外7种分子指纹图谱方法在茶树中的研究进展,以及指纹图谱在茶树种质资源与育种研究中的应用,探讨了我国茶树分子指纹图谱研究中存在的一些问题,并由此提出构建茶树标准指纹图谱的设想。     

棉花品种指纹图谱构建及棉种鉴定技术研究

采用单粒棉种DNA快速提取方法,以18份陆地棉和3份海岛棉品种为材料,从78对棉花SSR引物中筛选出55对具有多态性的引物,并确定了33对棉种鉴定用的备选核心引物。通过构建棉花品种DNA指纹图谱,所选21份材料只需要6对引物就可以完全鉴别。该方法也可以用来鉴定棉花种子真实性和检测品种纯度。     

吉林省大豆骨干亲本及主推品种DNA指纹图谱的构建

以６４份吉林省大豆骨干亲本及主推品种为试材,利用ＲＡＰＤ分子标记技术,经过１４０个引物的重复筛选,构建了一套完整的ＤＮＡ指纹图谱,其中ＯＰＡ－０４能区分４０份材料,结合引物ＯＰＧ－０７、ＯＰＯ－１１、ＯＰＦ－１４的扩增结果即可完全区分供试６４份材料。聚类分析表明,具有相同骨干亲本的育成品种遗传距离较近,这与以往的农艺性状研究及生理生化研究结论相符。     

基于SSR标记的68份红毛丹种质资源DNA指纹图谱构建

本研究利用筛选出的10对多态性高、条带清晰的SSR引物,以海南岛68份红毛丹种质为材料,进行遗传多样性分析和SSR指纹图谱的构建。结果表明:10对引物在供试材料中共检测出20个等位位点,多态性条带比例为100%,平均多态性信息含量(PIC)为0.393;对68份红毛丹种质做聚类分析,遗传相似系数为0.290～0.664;采用引物?带型组合法构建了68份红毛丹种质的指纹图谱。该结果为今后红毛丹种质鉴定和分子育种提供重要依据。     

不同品种（系）凤凰单丛茶DNA指纹图谱的构建

为能够快速、准确地对不同品种（系）凤凰单丛茶进行鉴定,建立不同品种（系）凤凰单丛茶的DNA指纹图谱,本研究利用ISSR分子标记技术,以4份凤凰单丛茶品种为材料,对UBC802~UBC899等58条ISSR引物进行筛选,得到了12条多态性好的ISSR引物。在确定引物最佳退火温度后,利用这12条ISSR引物对39份凤凰单丛茶进行了扩增,结果显示,从其中筛选出的6条核心引物共扩增出84条带,平均每个引物扩增出14条带,其中多态性条带78条,多态性条带比例为92.86%,多态信息量平均为0.9456,其中引物UBC843多态性最为丰富,品种相似性系数在0.4063~0.9836之间;为将39份凤凰单丛茶品种全部区分开,本研究对6条核心引物进行了组合,发现其中UBC827/UBC846的组合鉴别效率最高;通过综合品种名称、国家地区编号、采样地点、高效核心引物组合名称以及ISSR数据代码,本研究建立了39种凤凰单丛茶的DNA指纹代码。之后,通过整合软件录入如品种指纹图谱代码、香型、海拔、ISSR-PCR扩增数据图片等更多相关信息,形成指纹图谱二维编码,构成凤凰单丛茶的DNA指纹图谱,为凤凰单丛茶品种权益保护及信息平台的建立提供数据支持。     

茶叶HPLC指纹图谱研究进展

茶叶HPLC指纹图谱技术研究对于茶叶的质量控制与其功能性成分的定性和定量具有重要意义。本文综述了茶叶HPLC指纹图谱研究的意义、起源、特点、研究方法和技术,并对其面临的问题提出了一些见解。     

中国作物品种DNA指纹库的研究进展

概述了近年来中国作物品种DNA指纹库的研究进展。从建库材料收集、建库标记选择、建库方法、品种鉴定标准、检测体系优化、DNA指纹库的应用等几个方面分别进行了分析和综述。     

利用SSR分子标记构建水稻品种DNA指纹图谱的研究进展

SSR分子标记具有数量丰富、共显性遗传、操作简单、结果稳定等优点,已成为水稻品种指纹图谱构建的理想标记。本文综述了水稻品种DNA指纹图谱构建原理、技术要点、发展趋势及其在水稻科研和生产中的重要作用,并就SSR分子标记构建水稻指纹图谱的发展前景进行了分析。     

20个云南无性系茶树良种的DNA指纹图谱构建

以20个云南无性系茶树良种为材料,选用7对多态性丰富、品种区分率高、易统计的ISSR引物对茶树良种进行分析。结果显示,7对ISSR引物共扩增出110条带,其中多态带93个,多态条带比例为84.54%,多态信息量平均为0.417,品种相似性系数在0.574~0.854之间,其中引物UBC835,ISSR2不仅多态性丰富,且单个引物就可区分所有品种,是最有效的核心引物;7对核心引物两两组合的效率分析表明,UBC835/UBC811、ISSR2/UBC835和UBC835/ISSR3是高效引物组合,可以完全有效区分所有品种,且品种相似性系数较低;同时使用15个地方品种验证3个高效引物组合,结果表明,UBC835/ISSR2是最佳引物组合,不仅能有效区分所有云南无性系茶树良种,而且能将云南无性系良种与15个地方品种最有效地区分开。使用品种的国家地区代码、育种单位英文缩写、核心引物名称和分子数据组成云南无性系茶树良种的DNA指纹图谱,不仅包含了品种的重要信息,而且其中的分子数据可用作茶树品种的真伪鉴定和遗传关系分析,为茶树品种的知识产权保护提供有效的科学依据。     

鲜食玉米渝糯7号DNA指纹图谱建立及应用研究

利用RAPD-PCR分子标记技术,对鲜食玉米渝糯7号及其亲本的DNA指纹进行了分析研究,从220个随机引物中筛选出2个特征引物,构建了相应的DNA指纹图谱,用于渝糯7号、s147-1(母本)、s181(父本)的种子质量鉴定。     

咖啡种质资源DNA指纹图谱的构建

选用4份咖啡种质资源为材料,对S1-S100共100个RAPD引物进行筛选,选出多态性好的引物10个。利用这10个RAPD引物对28份咖啡资源进行扩增,共获得86条带,平均每个RAPD引物扩增出8.6条带,多态性谱带74条,多态性条带比率为86.0%。结果表明：供试咖啡种质资源遗传多样性较丰富;10个多态性好的RAPD引物中S8的鉴别效率最高,能将全部供试材料全部区分开,通过整合软件录入如所属种类、种质名称、采样地点、引物、RAPD-PCR 扩增数据以及电泳图片等相关信息,形成指纹图谱二维编码,构成咖啡种质资源的DNA指纹图谱,为咖啡种质资源品种权益保护及分子身份证构建奠定了基础。     

基于SSR标记的菠萝种质DNA指纹图谱构建

以来自9个国家或地区的26份菠萝种质为材料,利用SSR标记进行了DNA指纹图谱的构建。筛选出多态性高、稳定性好的8对SSR引物共检测到35个多态性位点,每对引物的多态性位点数平均为4.38,引物的多态性条带百分比平均高达92.92％,PIC值介于0.26～0.39之间,平均为0.33。利用这8对SSR引物构建了26份菠萝种质的指纹图谱,并对菠萝种质做遗传相似性分析和聚类分析。结果表明,菠萝种质遗传相似系数分布在0.421～0.974之间,平均为0.689,26份菠萝种质在遗传相似系数0.633处被划分为3类。该研究结果将为菠萝种质鉴定、分类及分子育种提供重要科学依据。     

睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

利用ISSR分子标记技术对从国内外引种的46份睡莲种质资源进行遗传多样性分析,并对其中的原生种及原生变种构建DNA指纹图谱,旨在阐明其亲缘关系基础上,为睡莲分类鉴定、杂交育种、功能基因的挖掘和利用及图位克隆等提供理论依据。结果表明：从100条ISSR引物中筛选出10条多态性高、重复性好的引物,在46份睡莲种质资源中共扩增出281条带,平均每条引物扩增条带数为28.1条,多态性条带281条,多态性比例为100%;平均Shannon信息指数（I）为0.4197,平均Nei’s基因多样性指数（H）为0.2657,平均有效等位基因数（N）1.4139,表现出丰富的遗传多样性;遗传相似系数值在0.51~0.98之间,基于遗传相似系数建立了聚类树状图,揭示了46份睡莲种质资源的亲缘关系,并在相似系数水平为0.68时,可将所有供试材料聚为6类。对总计24个睡莲原生种及原生变种构建了DNA指纹图谱,依据图谱差异可鉴定不同的睡莲种质。     

绿茶数字化多元化学指纹图谱建立初探

本文在针对提取率和异构化现象优化了样品制备程序的基础上,对杭州、丽水和新昌三个地区以龙井43、群体种和迎霜品种加工制作的9类扁形绿茶产品,尝试了由两个色谱图采用多元信息融合方法进行象素级融合,制作出各自的数字化多元化学指纹模式图谱,并用独立样本进行了验证,分析了不同类样本模式图谱间的相似性程度。结果表明,所建立的化学指纹模式图谱较好地代表了其来源样本的特征属性,同一品种不同产地或同一产地不同品种绿茶样本指纹图谱间,其相似度存在显著差异,但前者间的差异不如后者间差异大,此结果表明特色名优产品应该考虑由一种或几种相类似的品种来制作,从而保证其风味品质的相对统一。     

基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

以48份石斛兰种质资源为对象,采用iPBS分子标记技术对其遗传多样性进行分析并构建DNA指纹图谱.结果表明:从83条iPBS引物中筛选出7条扩增条带清晰、多态性高、重复性好的引物;利用筛选出的引物对48份石斛兰基因组DNA进行PCR扩增,共获得279条谱带,其中多态性条带279条,多态性比例为100％;采用GenAlE...     

花生AFLP指纹图谱

ＡＦＬＰ是一种以ＰＣＲ为基础的ＤＮＡ指纹图谱技术。利用ＡＦＬＰ技术对从国际半干旱所（Ｉ－ＣＲＩＳＡＴ）引进的９份花生抗旱品种绘制指纹图谱,通过引物Ｅ—ＡＣＡ和与之匹配的ＭＣＡＧ和Ｍ—ＣＡＴ,在３００～６０００ｂｐ的范围内共获得１５７７条ＡＦＬＰ扩增产物,每个品种有主带和次带至少７１条之多,其中１０条为多态性的带纹。     

42个花生品种的SSR标记指纹图谱构建

以不同地区的42个花生品种为材料,利用23对SSR引物进行分析。23对SSR引物在42个花生品种中共检测到92个等位变异,平均每对引物4个等位基因,平均PIC值为0.49。进一步分析表明,8对引物就可以将42个花生品种完全区分开,8对引物共产生40个等位变异,利用这40个等位变异构建了42个花生品种的DNA指纹图谱。聚类分析结果显示,在相似系数0.74处,可将42个供试品种分为4个类群。本研究结果为花生品种保护和育种实践提供了理论依据。     

基于SSR标记的向日葵DNA指纹图谱构建

本研究利用SSR分子标记技术对124份向日葵参试材料和育成品种进行遗传多样性、亲缘关系分析及指纹图谱构建,旨在为向日葵育种、品种纯度鉴定提供参考。利用19对条带清晰、多态性稳定的SSR引物对群体材料进行扩增分析,发现这些引物的多态信息含量变化范围为0.30~0.62,平均值为0.41。聚类分析结果表明,参试材料间遗传多样性相对较低,其最小遗传相似系数为0.62,亲缘关系与地理来源关系不明显。构建了124份材料的指纹图谱,结果表明除SPQ3和SY7外,19对引物能很好地将其余122份材料鉴别出来,但部分位点具有高度的一致性,基因来源范围较小。以上研究结果表明,参试向日葵材料遗传背景较为狭窄,在育种中应拓宽亲本来源,提高遗传多样性。     

黑老虎新品系的SSR指纹图谱构建

由于黑老虎种质的特异性评价以其果实及经济性状为主,未结实时仅依据形态性状较难区分,因此,构建黑老虎DNA指纹图谱有助于黑老虎种质的快速精准鉴定。选择15对引物对20个黑老虎品系进行SSR分析,依据Nei’s(1972)遗传距离,采用非加权组平均法（UPGMA）进行聚类分析,通过位点间的组合构建SSR指纹图谱。结果表明：15对引物在20个黑老虎品系中共扩增出15个位点75个等位基因,每个位点的等位基因数为2～15,其Shannon信息指数（I）为0.199～2.456,多态信息含量（PIC）为0.095～0.894。20个品系间遗传相似系数为0.328～0.891,基于UPGMA聚类可分为2个类群。所有15个位点均不能单独完全区分20个黑老虎品系,以KCZ023位点的区分能力最强;KCZ023与KCZ135、KCZ023与KCZ100以及KCZ023与KCZ147的2位点组合以及28个3位点组合能够将20个品系完全区分。20个黑老虎品系的遗传多样性较丰富,应用3个2位点组合和28个3位点组合能够完全区分各品系,该研究结果可为黑老虎种质鉴定以及杂交亲本选配提供科学依据。