猪附红细胞体MSG1部分基因片段的全基因合成及克隆表达

通过人工合成猪附红细胞体MSG1基因的编码序列,以提高目的基因在大肠杆菌中的高效表达。根据Gen-Bank注册的AM407404的544～942氨基酸序列,选择大肠杆菌偏爱的密码子,设计并合成了12条寡核苷酸片段。用重叠区扩增法(PAS)全基因合成MSG1部分目的基因,克隆入pjet1.2/blunt载体。经测序证实正确后,构建原核表达载体pET-28c/MSG1,并转化入大肠杆菌BL21(DE3)中,获得含重组表达质粒的转化子,IPTG诱导表达,并进行SDS-PAGE分析。测序、酶切鉴定等结果表明,表达载体构建成功,诱导表达后大约在16000的位置出现明显的蛋白条带。     

猪源附红细胞体rnpB基因的克隆与序列比较

为了解猪源附红细胞体(Mycoplasma spp.)RNA酶P RNA(RNase P RNA,rnpB)基因序列变异状况,将实验室保存的经16S rRNA基因序列分析鉴定的53份猪源附红细胞体阳性DNA样品用于rnpB基因的扩增,扩增产物克隆至pMD18-T载体并进行序列测定。将获得的序列与GenBank登录的猪附红细胞体(Mycoplasma suis)德国分离株rnpB基因序列(登录号:EF523602)进行分析和比对,利用MEGA5.0软件构建系统发育树,并与16S rRNA判定结果进行比较。结果共得到42条猪附红细胞体rnpB基因和11条小附红细胞体(M.parvum)rnpB基因序列。猪附红细胞体上海分离株rnpB基因与GenBank登录的猪附红细胞体德国分离株rnpB基因之间的核苷酸序列相似性为98.1%~100.0%;小附红细胞体上海分离株rnpB基因与猪附红细胞体德国分离株rnpB基因序列的相似性为91.0%,与猪附红细胞体上海分离株rnpB基因序列相似性为90.0%~91.0%。系统进化分析显示猪附红细胞体rnpB基因与小附红细胞体rnpB基因分布在不同聚簇上,与16S rRNA基因序列鉴定结果一致。     

吉林延边地区猪附红细胞体A1基因的克隆与原核表达

采用PCR方法扩增吉林延边地区猪附红细胞体A1基因片段,将扩增产物与pMD18-T载体连接,重组质粒经PCR、酶切鉴定后测序;分别构建A1重组pGEX-4T-1和PET-28-a表达质粒,经IPTG诱导表达后,进行SDS-PAGE、Western blot分析。结果显示:克隆的A1基因片段长1 044 bp,含有1个999 bp的开放阅读框,编码333个氨基酸,与GenBank中A1基因序列(AM265536)的同源性为97%;表达的融合蛋白分子量分别为64 ku和40 ku,能被猪附红细胞体阳性血清识别。表明该融合蛋白具有较好的免疫反应活性。     

猪附红细胞体MSG1蛋白的表达和多克隆抗体的制备

本研究将附红细胞体的MSG1蛋白基因按大肠杆菌密码子偏嗜性改造后进行全基因人工合成,合成的基因连接入pBAD/HisB载体后导入大肠杆菌Top10感受态细胞中,进行MSG1诱导表达,确定诱导表达的最佳时间和最佳诱导剂浓度。对表达的蛋白应用His单抗进行了特异性鉴定,对鉴定后的蛋白应用Ni-NTA纯化试剂进行了不同条件下的蛋白纯化。试验结果表明,诱导蛋白的分子量在45 ku左右,加入0.2%的L-阿拉伯糖,诱导2 h后所表达的蛋白量最高。经Western-blot鉴定,该蛋白可以被His单抗特异性识别,经纯化后可以得到较高纯度的MSG1蛋白。表达的MSG1蛋白经纯化后免疫家兔制备多克隆抗体,Western blot证明制备的抗体具有高度的特异性。MSG1蛋白的表达和多抗的制备可以为后续研究附红细胞体的吸附机制、致病机理,以及附红细胞体病的治疗等提供理论基础。     

猪附红细胞体SRP54基因的克隆及表达质粒的构建

根据GenBank上发表的猪附红细胞体全基因组序列(登录号:NC_015153.1),针对其中的信号识别颗粒(SRP)基因设计合成一对特异性引物,应用PCR方法扩增猪附红细胞体信号识别颗粒54 (SRP54)基因片段,克隆至pMD18-T simple载体上,经PCR、酶切初步鉴定正确后进行测序,对所克隆片段进行生物信...     

猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法的建立及应用

为建立一种特异、敏感、准确的猪附红细胞体诊断技术,本试验根据GenBank上发表的猪附红细胞体全基因组(NC-015153.1)中的DnaJ基因序列设计合成了一对特异性引物,建立了猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法,进行了特异性和敏感性试验,并与姬姆萨染色镜检方法进行了临床应用比较.结果,猪附红细胞体DnaJ基因PCR诊断方法扩增片段大小为868 bp(GenBank登录号为;JN247670),与GenBank中(NC_015153.1)同源性为99％,该方法扩增不出犬新孢子虫、牛附红细胞体、犬附红细胞体等基因片段,最低检测猪附红细胞体DNA量为124 fg/μL,通过对53份猪血液样本的检测,并与血液涂片姬姆萨染色镜检比较,说明建立的PCR诊断方法具有特异、敏感、准确等优点,完全适用于猪附红细胞体的诊断.     

猪附红细胞体膜蛋白OxaA基因的克隆及生物信息学分析

为研究猪附红细胞体膜蛋白OxaA的结构及其在免疫保护中的功能,根据GenBank上发表的猪附红细胞体(猪支原体NC_015153.1)全基因组序列中膜蛋白OxaA基因,对猪附红细胞体膜蛋白OxaA基因进行PCR扩增、克隆、序列测定及生物信息学分析。结果:PCR扩增基因全长840 bp,编码279个氨基酸,与GenBank(NC_015153.1)中对应序列同源性为98%,测序结果已提交GenBank(登录号为JN247625);生物信息学软件分析表明,膜蛋白OxaA是稳定型亲水性的蛋白,柔性区域呈散在性分布,以α-螺旋为主,主要有3个抗原表位区域。     

猪附红细胞体的诊治

猪附红细胞体(又名红细胞胞子虫),寄生于血液中,附于红细胞表面或细胞里。是猪的一种热性、溶血性、散发为主的传染病。病原能使红细胞变性、红细胞变形、破坏,从而导致猪自身免疫溶血性贫血,血液凝固障碍,而引起出血、低血糖和酸中毒以及机体免疫抑制。     

牛附红细胞体16SrRNA基因的克隆测序及分析

无菌采集自然感染附红细胞体的牛血液,提取全血基因组,用血营养菌16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增,得到长约1 500 bp的扩增片段,将其克隆到pMD18-T载体后进行测序和分析.结果,所克隆的牛附红细胞体基因片段大小为1 454 bp,GenBank登录号为FJ375309(丰都株).序列比对结果显示,牛附红细胞体丰都株与武汉株(AY946266)最高,达99.7%,与支原体科代表种同源性为60.7%～76.2%,而与立克次氏体科的立克次氏体和无形体科的无形体同源性仅为51.4%～56.4%,表明牛附红细胞体应归为支原体科,附红细胞体属,而不应属于立克次氏体目,无浆体科.对国内外牛温氏附红细胞体的亲缘关系分析表明,牛温氏附红细胞体无明显的地域性差别趋势.     

猪肺炎支原体P46基因的克隆及序列分析

根据GenBank中登录的猪肺炎支原体J株P46基因序列设计一对引物,扩增得到P46全基因序列,将克隆得到的P46基因片段克隆至pEasy-T载体中进行测定.将SC株P46基因与232株、J株、7448株及168株进行比对,结果表明SC株与这些株同源性分别为99.9%、99.6%、99.2%、99.0%.     

抗猪(嗜血)支原体MSG1蛋白单克隆抗体的制备及鉴定

以原核表达纯化的猪(嗜血)支原体MSG1蛋白免疫BALB/c小鼠,运用细胞融合技术筛选分泌针对MSG1蛋白抗体的融合细胞。通过间接ELISA方法筛选获得2株能稳定分泌抗体的融合细胞株,分别命名为1A7和3G6,Western blot结果证明这2株细胞分泌的抗体能够与重组MSG1蛋白发生特异性反应。细胞上清和腹水中的ELISA抗体效价分别为1∶4 096、1∶1 024和1∶1 638 400、1∶51 200,其单抗亚类鉴定均属于IgG1,轻链为κ型。抗原识别位点分析结果表明,2株单抗所识别的抗原位点相同。猪(嗜血)支原体MSG1蛋白特异性单克隆抗体的制备成功,为制备免疫诊断试剂盒和致病机制的研究奠定了基础。     

猪链球菌9型cps9G基因的克隆与序列分析

根据GenBank中猪链球菌9型(SS9)基因的核酸序列,设计一对引物,采用PCR方法从确诊为猪链球菌的阳性样品中扩增cps9G基因片段,将其克隆到pMD18-T载体上,转化DH5a感受态细胞,提取重组质粒pMD18T-cps9G,经PCR和酶切鉴定后测序,并与GenBank上SS9相应序列进行同源性分析.结果表明,经PCR扩增,鉴定为SS9的有8株.序列分析发现,8株SS9的cpsgG片段的核苷酸序列较稳定,该基因片段长度均为562 bp,彼此间的核苷酸同源性达96.8%～99.8%,亲缘关系密切;与GenBank上已发表的SS9参考毒株的同源性介于96.0%～98.6%.     

猪链球菌ZJ株溶血素基因的克隆和序列分析

猪链球菌ZJ株溶血素（suilysin）基因（sly)用特异引物进行PCR扩增后，采用T-A克隆策略将其克隆至E.Coli DH5a。PCR产物和重组质粒酶切分析表明该基因与已报道的sly基因一致，核苷酸序列分析表明sly基因与P1/7株和1933株的同源性分别为99.6%和99.7%。     

猪支原体重组MSG1蛋白间接ELISA检测方法的建立

为确定猪支原体在临床的感染情况和进行血清流行病学调查,本研究以原核表达纯化的猪支原体MSG1重组蛋白为包被抗原,建立了检测猪支原体的间接ELISA诊断方法。通过对ELISA反应一系列条件的优化,确定了最佳抗原包被浓度为0.5μg/mL;最佳封闭条件为用1%BSA37℃温箱内封闭2 h;血清最适稀释度为1∶200,作用时间为1.5 h;酶标二抗最适稀释度为1∶15 000,最适作用时间为1 h;最后37℃显色15 m in。判定标准为OD450≥0.239时判为阳性,OD450<0.198时判为阴性,0.198≤OD450<0.239时判为可疑。敏感性、特异性和可重复性试验证明,该检测方法敏感性高、特异性强和可重复性好。该研究表明建立的间接ELISA方法为猪支原体的检测和区域流行病学调查提供了一种快速简便的血清学诊断方法。     

水牛LPIN1基因克隆及序列分析

试验旨在克隆获得水牛脂素1（LPIN1）基因,并对其进行生物信息学分析,为揭示该基因在水牛脂肪沉积、生殖发育和泌乳调控中的作用奠定基础。本研究以水牛卵巢组织cDNA为模板,PCR扩增获得了LPIN1基因CDS区全长后测序,并结合生物信息学分析方法预测及分析蛋白质理化性质、二级结构及三级结构等。结果表明,水牛LPIN1基因编码区长2 793 bp,编码930个氨基酸。MegAlign软件分析显示,水牛LPIN1基因核苷酸序列与水牛（预测）、牦牛、黄牛、山羊、藏羚羊、绵羊、猪、骆驼、人和小鼠LPIN1基因的同源性分别为99.6%、97.9%、97.7%、97.5%、97.4%、97.1%、89.9%、89.8%、86.2%和83.5%;水牛lipin1蛋白氨基酸序列与黄牛、牦牛、山羊、藏羚羊、骆驼、猪及人的同源性分别为99%、99%、99%、99%、94%、94%及90%。应用Mega 5.0软件构建系统进化树发现,水牛与黄牛的亲缘关系最近,其次为绵羊和山羊,LPIN1基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。对lipin1蛋白分析发现,其二级结构由α-螺旋、β-折叠、T-转角和无规则卷曲组成;蛋白呈弱酸性,无信号肽,亚细胞主要定位于细胞核中,存在Lipin_N、LNS2和AF1Q等结构域,其中Lipin_N、LNS2为保守结构域。     

牛支原体内蒙古分离株脂蛋白vspY基因的克隆和序列分析

旨在为进一步研究牛支原体内蒙古分离株（NM 2012）的vsp Y1、vsp Y2基因功能提供依据。根据已发表的牛支原体vsp Y1、vsp Y2基因序列设计引物,对NM 2012株的vsp Y1、vsp Y2基因进行克隆、测序,并与已发表的相关序列进行相似性比较;采用在线生物信息学分析工具对NM 2012株的vsp Y1、vsp Y2推导的氨基酸的相似性、保守结构域、跨膜结构、信号肽、脂蛋白、抗原表位进行预测。结果表明,牛支原体内蒙古分离株（NM 2012）的vsp Y1、vsp Y2基因大小分别为1 029 bp和804 bp,分别编码342和267个氨基酸组成的完整开放阅读框;vsp Y1与已发表的牛支原体vsp Y1基因相似性为99.4%~100%,其推导的氨基酸序列相似性为98.6%~99.7%,vsp Y2与已发表的牛支原体vsp Y2基因相似性为100%。根据生物信息学软件分析结果推测,vsp Y1蛋白是潜在的毒力因子。     

猪嗜血支原体酶标单抗阻断ELISA检测方法的建立

为确定猪嗜血支原体(M.suis)在临床的感染情况和进行流行病学调查提供检测方法,本研究以纯化的猪嗜血支原体重组MSG1蛋白和辣根过氧化酶标记的MSG1蛋白单抗建立了检测猪嗜血支原体的阻断ELISA方法.经筛选确定,抗原最佳包被浓度为0.5μg·mL-1,待检血清最佳稀释度为1∶1,作用时间为37℃1.5h,酶标单抗最佳稀释度为1∶10 000,作用时间为37℃1h.通过对100份M.suis阴性血清阻断ELISA检测结果进行统计学分析,确定本方法的判定标准为当阻断率PI≥23.71％时判为阳性,PI≤36.35％时判为阴性,23.71％＜PI＜ 36.36％时判为可疑.敏感性、特异性和重复性试验证明该检测方法敏感性高、特异性强、可重复性好,可用于M.suis流行病学调查和疾病诊断.     

Cloning and Sequence Analysis of P97 Gene R1 Region of Mycoplasma hyopneumoniae in Guangxi Luchuan Pig

Through in-depth understanding of sequence characteristics, structure and genetic variation of adhesion factor P97 gene R1 region of Mycoplasma hyopneumoniae (Mhp) epidemic strains in Guangxi Luchuan pig, the assay was aimed to provide theoretical basis for mycoplasmal pneumonia of swine (MPS) integrated effective prevention and control measures of Guangxi local variety Luchuan pig, and lay a solid foundation for further study the characteristics of Mhp epidemic strains in Guangxi Luchuan pig.A pair of primers was designed to amplify P97 gene R1 region according to Mhp genome sequence, the MPS positive disease materials of Guangxi Luchuan pig from 2011 to 2014 as the object of study, after genomic DNA extraction and PCR amplification of P97 gene R1 region, the PCR products were sequenced.The base composition and deduced amino acid sequence of P97 gene R1 region of Mhp epidemic strains of Guangxi Luchuan pig were compared.The analysis of DNAStar showed that there were multiple base mutations in P97 gene R1 region of 15 strains of Guangxi Luchuan pig Mhp strains (GXLC-1, GXLC-2, GXLC-3, GXLC-4, GXLC-5, GXLC-6, GXLC-7, GXLC-8, GXLC-9, GXLC-10, GXLC-11, GXLC-12, GXLC-13, GXLC-14 and GXLC-15) and 3 strains of Guangxi other breeds of pigs Mhp strains (GX227, GX595 and GX674).The statistical repeat number of five amino acid (AAKPV/E) of P97 R1 region were 9 to 18, the average value was 12, TN repeats were 1 to 4.We found that Guangxi Luchuan pig Mhp strains mutation made its virulence and adhesion ability enhancement, and respiratory of Luchuan pig with the special structure of short and narrow, which could more easily lead to the occurrence of Guangxi Luchuan pig MPS.