山羊脑多头蚴形态学与cox1基因鉴定

为鉴定山羊脑多头蚴,通过对虫体进行形态学观察并采用PCR扩增虫体线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(cox1)基因,将有效序列进行NCBI-Blast在线比对,利用MEGA6.0构建遗传系统进化树.结果 显示,山羊脑多头蚴cox1序列长度为446 bp,与多头带绦虫同源性达100％,系统进化分析显示分离株与多头带绦虫位于同一...     

黑龙江与广州颚口线虫幼虫分离株的形态学观察及其分子鉴定

本研究从来自黑龙江及广州地区的泥鳅中分离到10条颚口线虫幼虫,采用光学显微镜观察幼虫的形态特征,并对虫体的ITS2与CO1基因进行扩增测序、系统发育分析以鉴定虫种。结果显示10条颚口线虫幼虫头球均有3环小钩,其形态学特征与日本颚口线虫(Gnathostoma nipponicum)第3期幼虫相符。序列分析结果显示与GenBank中登录的日本颚口线虫ITS2和CO1基因的同源性分别为100%和99%。邻位连接法构建的50%一致树也均与日本颚口线虫处于同一分支。表明从黑龙江及广州地区泥鳅中分离的颚口线虫幼虫为日本颚口线虫幼虫,首次证明了中国存在日本颚口线虫。     

基于COⅠ和16S rRNA基因的涉案鸟类残体鉴定

利用线粒体DNA细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因（COⅠ）和16S核糖体RNA(16S rRNA)基因鉴定某公安机关查获的1件鸟类残体所属物种。结果表明：鸟类残体样本的COⅠ、 16S rRNA基因片段与白枕鹤（Antigone vipio）对应的序列相似度均不低于98.98%,遗传距离分别为0.001～0.007和0。基于这2个基因片段构建系统发育树,显示鸟类残体样本与白枕鹤均聚为一支,鉴定该鸟类残体属白枕鹤所有。得到的COⅠ和16S rRNA基因片段可作为鉴定鹤科（Gruidae）鸟类的分子标记。     

肝片吸虫蚴虫的形态学及分子学鉴定

为了找到青海地区肝片吸虫(Fasciola hepatica)的主要中间宿主,并对椎实螺(Lymnaeidae snails)体内的蚴虫进行虫种鉴定。对青海部分地区的椎实螺进行压片镜检,结果发现椭圆萝卜螺(Radix swinhoei)内无肝片吸虫蚴虫感染。狭萝卜螺(Radix lagotis)体内发现雷蚴,雷蚴为肝片吸虫的蚴虫,但是感染率较低为10%。青海萝卜螺(Radix cucnnorica)体内发现了雷蚴和尾蚴,并在养殖青海萝卜螺的水中青菜叶子上收集到囊蚴,经初步鉴定均为肝片吸虫的蚴虫,感染率较高为41.89%。主要中间宿主螺为青海萝卜螺。提取蚴虫体内DNA,通过PCR扩增18S rRNA片段并测序。将测序用DNAMAN软件进行比对后发现,与Gen Bank中发布的大片吸虫(Fasciola gigantica)和肝片吸虫的18S rRNA的序列进行比对其相似度分别为99.12%和92.03%。可以进一步确定所收集的蚴虫为肝片吸虫的蚴虫。     

一株寄生于大黄鱼的盾纤毛虫分子鉴定与系统进化分析

在大黄鱼稚鱼上发现一种可侵入患鱼体表、肌肉、腹腔和脑的盾纤毛虫,为了进一步明确该盾纤毛虫的分类地位,提取患鱼样品总DNA,对该虫株SSU rDNA和线粒体cox1部分序列进行PCR扩增、测序,与GenBank中纤毛虫的SSU r DNA和线粒体cox1序列进行同源性分析并构建系统发育树。结果显示,该盾纤毛虫874 bp的SSU rDNA部分序列与显赫针口虫（Porpostoma notata）同源性最高,相似性为98.97%。在基于SSU r DNA构建系统发育树中与显赫针口虫（P.notata）聚为一支,并独立于嗜污科（Philasteridae）的分支;获得该虫1 086 bp的cox1部分序列,与其SSU rDNA序列相比表现出更大的遗传变异度,在基于cox1部分序列构建系统发育树中,该虫株与嗜污科（Philasteridae）、尾丝虫科（Uronematidae）的分支也有一定距离。综上,该盾纤毛虫应是嗜污目（Philasterida）、针口虫属（Porpostoma）的显赫针口虫（P.notata）或其近缘种。     

小熊猫槽盘吸虫的形态学鉴定及分子进化研究

为鉴定我国黑龙江省分离的小熊猫肠道吸虫的种类及确定其在复殖吸虫中的分类地位,本研究首先对分离的吸虫进行染色制作虫体装片,根据虫体形态学特征初步鉴定为小熊猫槽盘吸虫。采用PCR方法扩增该吸虫的rDNA ITS序列,测序后与NCBI数据库中相关序列进行比对分析。结果表明,本研究分离的吸虫rDNA ITS序列全长为936 bp,其中ITS-1、5.8S和ITS-2序列分别为518 bp、126 bp和292 bp,与NCBI数据库中鹿槽盘吸虫(Ogmocotyle sikae)的同源性达到94.9%。最后,基于rDNA ITS-2序列构建系统发生树,探讨本研究中分离的吸虫在复殖吸虫中的分类地位。进化分析结果表明,在复殖目吸虫的分支中,本次分离的小熊猫肠道吸虫与槽盘属吸虫处于同一分支,因此鉴定本研究分离的吸虫为小熊猫槽盘吸虫。研究填补了槽盘吸虫的分子数据,为小熊猫槽盘吸虫病的流行及防控提供依据。     

拉合尔钝缘蜱的形态学及分子生物学鉴定

试验旨在建立拉合尔钝缘蜱的分子生物学鉴定方法。从新疆地区绵羊体表采集寄生蜱,借助体视显微镜和电子显微镜对其进行形态学特征的准确鉴别,初步筛选出疑似拉合尔钝缘蜱。经PCR扩增、测序获得其18S rDNA、16S rDNA及线粒体色素氧化酶亚基Ⅰ基因（cytochrome oxidase Ⅰ,COⅠ）序列,结合GenBank数据库中参考序列,比对分析同源性并构建系统进化树,进行遗传距离评估。本研究全面、清晰地揭示了拉合尔钝缘蜱卵圆形背板、背部圆形盘窝等显微形态特征的细节。同时,在基于16S rDNA与COⅠ序列的邻位相接系统进化树中,拉合尔钝缘蜱分布于两大进化枝之一的软蜱科,同种聚类良好,且拉合尔钝缘蜱种内K2P遗传距离为0~0.3%,本研究方法可快速、准确鉴定拉合尔钝缘蜱物种。     

波尔山羊MyoG基因的鉴定和序列分析

为了探明山羊MyoG基因的序列结构及其对肌肉的分化调控机制,用PCR产物直接测序的方法获得了波尔山羊MyoG基因2 363 bp长的DNA序列,并对该序列进行了分析.结果表明,波尔山羊MyoG基凶包括3个外显子、2个内含子及部分5'UTR(74 bp)和3'UTR(260 bp)区,编码序列长675 bp,共编码224个氨基酸.结构分析表明,该序列所编码的肽链没有信号肽,第1～138个氨基睃为波尔山羊MyoG基因的bHLH结构域.通过比对分析波尔山羊与已知的GenBank中的人类及其它物种MyoG基因发现,该基因编码区核苷酸以及推测的氨基酸同源性和物种间的亲缘关系相一致,无根系统进化树的聚类结果与这些物种本身的生理特性以及传统分类学中已知的生物分类结果相一致.波尔山羊MyoG基因的鉴定及序列分析为山羊肌肉发育调控的机理以及肉质改良等的研究提供了很好的生物学基础信息.     

德国牧羊犬复孔绦虫种类鉴定和遗传进化分析

为了对采集自3只德国牧羊犬小肠内的复孔绦虫进行种类鉴定和遗传进化分析,通过形态学方法对分离到的虫体进行孔雀绿染色后显微镜观察,并进一步基于线粒体部分基因(pcox1和pnad1)进行PCR扩增和序列分析.显微镜观察结果表明,分离到的虫体形态和内部结构符合犬复孔绦虫的特征.通过对扩增的靶基因序列及其遗传进化分析发现,3个...     

7个地方鸡种的分子评估

成熟的基因扩增及测序技术,结合比较发达的网络与信息技术,给我们提供了以DNA为基础的系统分类方法.一种新的DNA分类方法--DNA条形编码(DNA Barcoding)技术应运而生.本研究以线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome c oxidase Ⅰ,CD Ⅰ)基因的特定序列作为DNA条形码,对我国7个地方鸡种进行分子评估.研究结果表明:选择的这段CO Ⅰ基因序列有22个突变位点,为13个单倍型,其中11个单倍型为各品种所特有;6个鸡种有其特异位点,这些特异单倍型和特异位点作为DNA条形码可以对其进行分子评估,并可以作为辅助各品种鉴定的依据.7个品种间Kimura双参数遗传距离为0.017～0.389.7个品种的DNA分类和形态学分类基本一致,该基因可以探讨地方鸡种分类问题.     

山羊毛虱的形态结构和分子标志研究

为了解山羊毛虱形态结构和分子标志,用电子显微镜和三维立体显微镜观察了采自山羊的山羊毛虱形态结构,测定了其18SrDNA和cox1基因序列,并基于比对,揭示其序列特点。形态观察发现,触角3节,第1节短粗,第2、3节细长;中胸气门1对,位于前胸两侧;腹部有气门6对;跗节3节。序列分析显示,本样虱、山羊毛虱、具边毛虱和牛毛虱四者的18SrDNA基因序列高度相似,不适于做种间鉴定。cox1序列极不保守。     

中国不同地区羊吕氏泰勒虫分子流行病学调查及遗传进化分析

为了解吕氏泰勒虫在中国不同地区山羊和绵羊中的流行情况,本研究应用基于吕氏泰勒虫18S rRNA基因位点的PCR检测方法,对采自中国河南、甘肃、陕西、山西、贵州、云南、新疆7个地区的281份羊血液样品进行检测,并对阳性样品测序以进行序列分析。结果显示,羊吕氏泰勒虫总感染率为35.23%（99/281）。不同采样点羊吕氏泰勒虫感染率差异极显著（P<0.01）,其中河南省羊吕氏泰勒虫感染率最高（98%,49/50）,新疆最低（0）。绵羊和山羊吕氏泰勒虫感染率分别为51.67%（31/60）和30.77%（68/221）,差异极显著（P<0.01）;放牧羊吕氏泰勒虫感染率（41.55%,86/207）极显著高于舍饲羊（17.57%,13/74）（P<0.01）;羊吕氏泰勒虫感染率在春、夏、秋及冬四季分别为56.00%（28/50）、42.75%（59/138）、9.43%（5/53）和17.50%（7/40）,差异极显著（P<0.01）;≥ 12月龄和<12月龄羊吕氏泰勒虫感染率分别为33.50%（67/200）和39.51%（32/81）,差异不显著（P>0.05）。此外,遗传进化分析表明,本研究获得的羊吕氏泰勒虫分离株与中国流行的吕氏泰勒虫分离株同源性高达99.60%以上,且位于同一分支上。本研究为进一步了解中国不同地区羊吕氏泰勒虫的流行现状及分布提供了重要参考依据。     

多浆旱生植物霸王18SrRNA基因的克隆及序列分析

为探讨多浆旱生植物霸王(Zygophyllum xanthoxylum)的生物进化历程及与其他植物的亲缘关系,本研究以霸王叶基因组DNA为模板,使用通用引物扩增其18S rRNA 基因片段,并克隆到pGEM T载体,阳性克隆经鉴定后进行测序。核苷酸序列分析结果表明,该片段长1 808 bp,所得序列与GenBank中注册的18S rRNA基因序列的同源性均在96%以上。可见,高等植物18S rRNA 的基因非常保守。同源性分析与Blast比较结果表明,霸王与小盘木(Galearia filiformis)、驱虫苋(Cnidoscolus aconitifolius)及橡胶树(Hevea brasiliensis)同源性最高。系统进化树分析表明,霸王与三七(Panax notoginseng)的亲缘关系最近。     

山羊催乳素受体基因部分片段的克隆与序列分析

采用PCR技术扩增出济宁青山羊催乳素受体基因长892 bp的片段，该片段含有97 bp的部分外显子8序列（外显子8全长为100 bp）、683 bp的内含子8、70 bp的外显子9及42 bp的部分内含子9。将该片段克隆到pGEM-T Easy质粒中，重组质粒用PCR进行阳性克隆鉴定，然后测定核苷酸序列，并推导其氨基酸序列。该序列与绵羊、母牛、人、大鼠、小鼠的催乳素受体基因mRNA的对应序列的核苷酸同源性分别为99.4 %、97.01%、89.22%、89.22%、88.02%，氨基酸同源性分别为100%、94.55%、81.88%、81.82%、83.64%。     

Morphological and Molecular Biology Identification of Ornithodoros lahorensis

This study was to establish a method for the identification of Ornithodoros lahorensis with molecular biology. The samples of Ornithodoros lahorensis were collected from sheep in Xinjiang region and the morphological characters were screened by stereo microscopy and electronic microscopy. Then the 16S rDNA,18S rDNA and cytochrome oxidase Ⅰ(COⅠ) of samples were amplified by PCR and subsequently sequenced. Then the analysis of genetic divergences and Neighbor-Joining (NJ) phylogenetic tree were carried out based on the sequences acquired from Ornithodoros lahorensis,combined with the reference sequences of GenBank database. In this study,the comprehensive and clear micromorphological traits of ovoid scutum,round fovea of Ornithodoros lahorensis were provided. Besides,the DNA sequences of Ornithodoros lahorensis were assembled together with sequences of Argasidae and form monophyletic clades in the 16S rDNA and COⅠ based Neighbor-Joining trees. According to the intraspecific K2P genetic distances of Ornithodoros lahorensis (0~0.3%),we determined that the molecular biology method based on 16S rDNA and COⅠ could rapidly and accurately identify the species of Ornithodoros lahorensis.     

山羊Ets-1基因cDNA的克隆与序列分析

根据GenBank已收录的牛(Bos taurus)、人(Homo sapiens)和小鼠(Mus musculus)等物种Ets-1基因序列的同源保守区域,设计特异性引物,采用RT-PCR和RACE技术,分离并克隆了西农萨能奶山羊(Capra hircus)Ets-1基因的cDNA序列。该序列全长2 263 bp(GenBank登录号HQ589338),包括5’UTR 331 bp,CDS 1 326bp和3’UTR 606 bp,编码441个氨基酸组成的蛋白质。核苷酸序列分析发现,山羊编码序列与牛、猪、人、小鼠等的相应序列同源性分别为98%、94%、92%和90%,3’UTR相应序列为96%、83%、81%和77%,5’UTR相应序列为98%、85%、82%和71%。氨基酸序列分析发现,山羊与牛、猪、人和小鼠的Ets-1的相似性较高,均在95%以上。蛋白质结构分析发现,其蛋白质分子量为50 340.8 D,等电点为5.08,具有典型的螺旋-转角-螺旋结构域,不存在跨膜结构,并且整个序列不含信号肽。     

山羊MyoG基因启动子区序列分析与结构预测

为探明山羊MyoG基因的启动子序列与结构及转录调控机制,本研究设计了1对引物,采用PCR扩增、测序以及序列比对分析,从波尔山羊基因组中扩增出一段长度为969bp的山羊MyoG基因的5′侧翼序列,其GC含量为50.6%。经过生物信息学分析,确定了其转录起始位点及活性区域;发现在转录起始位点上游-24bp处存在1个TATA-box,另外还发现了1个GC-box、2个CAAT-box、2个E-box和1个富含A-T碱基的模体结构;该序列还包含HSF、ADR1和cap等转录因子结合位点。通过比对分析,所得山羊MyoG基因5′侧翼序列与牛、马鹿、人、小鼠和鸡同源序列的相似性在37.22%～96.85%之间,说明不同物种间该序列具有一定的保守性。本研究为进一步探讨山羊MyoG基因的表达和调控机制奠定了理论基础。     

山羊流产衣原体ompA和CPAF基因的序列分析及原核表达

为了解山羊流产衣原体陕西分离株ompA和CPAF基因的遗传变异情况及制备检测抗原,根据GenBank收录的ompA和CPAF基因序列设计合成特异性引物,分别进行ompA基因和CPAF基因的基因克隆、序列分析及原核表达.结果表明,成功克隆出大小为1 053 bp的ompA基因和大小为1 056 bp的CPAF基因;核酸序...     

Molecular detection of Hepatozoon canis in dogs and ticks in Shaanxi province,China

Hepatozoon canis, transmitted by Rhipicephalus sanguineus, is a tick-borne pathogen and causes canine hepatozoonosis. Until now, only limited previous studies were conducted on the molecular detection and characterization of Hepatozoon sp. in dogs in China. Blood samples were collected from 93 sick dogs that were clinically diagnosed as babesiosis but tested negative for Babesia, and 103 apparently healthy dogs, as well as their infesting ticks in Xi’an and Hanzhong cities, Shaanxi province of China. PCR amplifying partial 18S rRNA gene was used to detect the DNA of Hepatozoon sp. Genetic and phylogenetic analysis were performed to determine the Hepatozoon species. Our results demonstrated that H. canis was identified from the sick dogs and the infested ticks in Hanzhong, with no significant differences of prevalence between both genders and ages. No positive blood or tick samples were found in Xi’an. Moreover, all the 18S rRNA gene sequences recovered from both dogs and the infested ticks showed a high genetic similarity with each other, and also presented a close relationship with other known sequences in and outside China. In conclusion, H. canis was identified in babesiosis-suspected dogs and ticks infesting them in Shaanxi, China, although the association between clinical signs and H. canis need further study.