棉花QTL定位原理、方法和研究进展

 棉花是我国的重要经济作物,其主要的农艺性状和经济性状如产量、纤维品质、抗病虫性等均为数量性状,从QTL（Quantitative trait locus）定位的原理、定位方法、定位群体的类型以及初步定位和精细定位的过程等方面综述了近年来棉花主要农艺性状、经济性状及抗病虫等方面的QTL定位研究进展,本综述有助于了解棉花QTL定位研究的进展,阐述了目前棉花QTL定位存在的问题,同时针对这些问题提出了解决方案,并对棉花QTL定位发展前景进行了探讨和展望。     

棉花纤维品质相关基因挖掘及功能基因研究进展

棉纤维是天然的,使用最为广泛的纤维材料。提高棉纤维品质成为当前棉花遗传育种的重要目标,对棉纤维发育相关基因的挖掘、定位、克隆与功能研究是实现这一目标的重要基础。本文阐述了基于QTL定位的陆地棉和海岛棉纤维优质基因挖掘、基于全基因组测序的棉纤维发育相关基因位点鉴定和分析、基于分子标记辅助育种技术的棉纤维品质改良以及棉花纤维发育相关功能基因验证等研究进展,以期为棉花纤维发育及品质改良研究提供有益借鉴和参考,并对今后棉花纤维相关研究和发展方向进行了展望。     

陆地棉自然群体纤维强度性状的全基因组关联分析

纤维强度是衡量棉花纤维品质的重要指标之一。了解棉纤维强度形成的遗传基础对棉花纤维品质的遗传改良具有重要的指导意义。本研究利用83份纤维强度差异显著的陆地棉材料，采用广义线性模型（General linear model, GLM），对5个环境的纤维强度及最佳线性无偏估计值（Best linear unbiased prediction，BLUP）进行全基因组关联分析（Genome-wide association study，GWAS）。结果表明，各环境纤维强度基本符合正态分布，且存在丰富的变异，变异系数为5.55%～8.44%，广义遗传力达到88.67%。GWAS共检测到19个稳定的显著关联SNP位点，分布在A01、A06、D05、D08、D10、D11和D13等7条染色体上，合并为9个数量性状位点（Quantitative trait locus， QTL）区间，其中4个QTL区间与前人定位的QTL区间重叠，其它5个QTL区间是本研究新发现的控制纤维强度性状的稳定位点。根据区间内基因的表达模式及功能注释，共筛选出4个可能与纤维强度相关的候选基因。本研究通过对棉花纤维强度进行全基因组关联分析，为棉花纤维品质性状的分子遗传改良奠定了基础。     

浅谈棉花分子育种研究进展

分子标记技术和QTL定位技术的迅速发展,使得以DNA多态性为基础的分子育种技术的研究不断深入,并在作物遗传育种中得到了一些成功运用,为解决有关复杂性状的选择问题带来了希望。本文综述了棉花分子标记、QTL定位原理和方法、关联分析、分子标记辅助选择等相关研究进展,以期为棉花分子育种、基因组选择研究奠定基础。     

棉花抗黄萎病分子标记研究进展

利用分子标记技术对棉花品种类群的划分与系谱分析基本一致。抗黄萎病分子标记技术研究在棉花抗病育种的标记辅助筛选中逐渐发挥作用,但还没有得到棉花抗黄萎病基因克隆。通过转几丁质酶基因、β-1,3葡聚糖酶基因以及转葡萄糖氧化酶基因等,得到了一些抗病品种。棉花分子辅助抗病育种成效较低的原因主要包括:黄萎病遗传规律的复杂性、标记和遗传图谱研究的滞后性、标记距离较远和QTL定位的不精确性以及基因上位性的存在和抗病QTL筛选与育种过程相分离等。应该利用不同的方法和手段加强棉花遗传和分子连锁图谱的构建,在棉花全基因组开展QTL定位,从而提高棉花抗病育种的目标性。     

大豆品质性状QTL定位的研究进展

大豆品质性状改良一直是大豆育种的重要目标之一.分子遗传学的发展和分子标记技术的逐步深入为大豆分子辅助选择育种提供了可能.该文综述了大豆QTL的定位方法、大豆品质QTL定位的研究现状和分子标记辅助选择概况.     

棉花重要性状分子标记的研究进展

重点综述了棉花研究中重要性状的分子标记位点及其在染色体或连锁群上的定位。包括产量性状、纤维品质性状、抗病性、胞质雄性不育系的恢复性、形态学性状及生理性状标记。最后分析了棉花分子标记中存在的问题,并对分子标记辅助育种应用前景进行了展望。     

“六五”至“十二五”期间我国棉花品种纤维品质评价分析

对"六五"至"十二五"期间国家棉花区域试验参试品种纤维品质进行了总结和分析,结果表明,我国棉花品种的综合纤维品质总体趋势是稳步改良,逐年提升。黄河流域棉区品种的纤维长度和断裂比强度呈优化发展趋势;长江流域棉区品种纤维长度、断裂比强度和纺纱均匀性指数呈优化发展趋势;西北内陆棉区品种纤维品质总体表现有上升趋势,但近5年来纤维品质表现略有下降趋势。     

水稻穗长研究进展

穗长是影响穗型的关键因子之一,与水稻的产量和品质密切相关,大量穗长性状相关的QTL及基因已被定位或克隆。本文主要概述水稻穗长及其影响因素,介绍穗长QTL定位及克隆,初步分析穗长调控的分子机理,为进一步解析穗长、穗型发育的分子调控网络以及促进水稻分子育种提供支持。     

油棕QTL定位的研究进展

QTL定位是以遗传连锁图谱为基础，利用分子标记与QTL之间的连锁关系来确定控制数量性状的基因在基因组中的位置。油棕的产量性状、品质性状和发育性状等重要的农艺性状都是数量性状，利用QTL定位是对数量性状进行分析的重要方法之一，它有利于加快油棕育种进程。综述油棕重要农艺性状的QTL定位研究进展，阐述存在的问题并对未来的研究方向提出建议。     

湖南棉花纤维品质的现状及改良措施

阐述了湖南棉花纤维品质现状 ,分析了限制湖南棉花纤维品质提高的原因 ,并根据长江中下游棉区定位为 5 0～ 60支纱产区的区划方针 ,提出了增强湖南棉花市场竞争力的几点建议。     

陆地棉品种间杂种纤维品质优势探讨

棉花杂种优势不仅能大幅度提高产量,也是改善纤维品质、增强抗逆性的重要途径。尤其近几年棉花杂种优势利用在我国棉花生产上发展迅速,获得越来越明显的经济和社会效益。随着纺织工业设备的更新,对原棉品质也有了更高的要求。面对我国加入ＷＴＯ的新形式,原棉质量的优劣将直接影响纺织产品在国际市场上的竞争能力,因此,努力提高棉花的纤维品质显得尤其重要,利用杂种优势无疑是改进纤维品质的有效途径。1998年进行了棉花纤维品质正反交杂种优势研究,旨在进一步了解纤维品质在杂种中的优势表现,为提高棉花的纤维品质提供理论依据。1　试验材料…     

利用SRAP和SSR标记构建红麻遗传连锁图谱

构建红麻遗传连锁图谱,为今后红麻重要农艺性状QTL定位、QTL图位克隆、优良基因筛选、分子标记辅助育种奠定良好的研究基础。对256对SRAP引物和64对棉花SSR引物进行了两次引物筛选,以泰红763×F71为作图群体亲本,150个F2代单株作为作图群体,构建红麻遗传连锁图谱。共筛选出条带清晰、多态性高的SRAP引物73对、SSR引物8对,构建的红麻遗传连锁图谱全长2155.43 c M,平均间距为16.09 c M,含有128个多态性标记,分布于18个连锁群。本研究初步证实了棉花SSR引物用于红麻是可行的,构建的红麻遗传连锁图谱密度较高,标记较为均匀,适合后续的QTL定位、QTL图位克隆等研究工作。     

QTL精细定位策略及水稻产量相关性状QTL分析

随着分子标记技术及水稻基因组学的发展,水稻产量相关性状QTL研究已进入QTL精细定位及克隆阶段。阐明控制复杂性状QTL的分子遗传基础,对于其在分子育种中的应用具有重要意义。本文针对目前构建QTL精细定位群体的主要策略及水稻产量相关性状QTL分析进展进行了综述。     

分子标记在花生遗传图谱及QTL定位中的研究进展

分子标记为花生遗传图谱构建及QTL定位的基础。本文介绍了分子标记的种类和特点,从遗传多样性分析、遗传图谱构建、基因定位等三方面综述了常用分子标记在花生遗传育种中的应用及研究进展,对分子标记技术在花生遗传图谱构建及QTL定位中的应用进行了探讨。     

大豆QTL定位的研究进展

QTL定位就是以分子标记技术为工具、以遗传连锁图谱为基础、利用分子标记与QTL之间的连锁关系确定控制数量性状的基因在基因组中的位置.本文综述了大豆农艺性状、生理性状、抗虫性状等的QTL定位及分子标记辅助育种的研究进展.     

对我国棉花纤维品质的探讨

简要阐述了纺织技术的革新对棉花纤维品质提出的挑战,分析了国内原棉品质存在的差距与问题,着重介绍了影响棉花纤维品质的因子,并提出了提高我国棉花市场竞争力的应对措施。     

四川棉花纤维品质改良现状及发展研究

以四川省棉花品种区域试验１９８５～１９９６年纤维检测资料为依据，分析了四川棉花纤维品质的现状及纤维品质改良的基础，浅析了四川棉花纤维品质改良进展缓慢的原因，提出了四川棉花纤维品质改良首先应强化对培育高纤维品质品种的激励机制，在品种审定中建立优质品种审定标准，其次应加强高纤维种质资源的遗传研究，创造丰富高纤维品质育种材料，利用现代高新生物技术和棉花杂种优势，改良棉花纤维品质，培育丰产优质棉花新品种。     

基于Web of Science的小麦QTL定位研究英文文献计量分析

为了解全球小麦QTL定位研究的现状,以Web of Science核心合集数据库为数据源,采用文献计量学方法分析2008-2017年小麦QTL定位研究论文的刊文数量走势,刊文数量前十的国家、机构、期刊,被引用频次前十的国家、期刊、个人,挖掘研究热点,查找国家间合作关系,分析主要作图群体、分子标记、统计模型和分析软件。结果表明,目前小麦QTL研究热点集中在逆境抗性和产量性状方面。在小麦QTL定位研究中,STS、SSCP、RFLP、SNP是近三年使用频率最高的几种分子标记类型;为提高研究准确性,遗传模型、分子标记和分析软件常被配套使用。近十年全球小麦QTL定位研究论文的刊发数量呈上升趋势,科研合作与交流密切的国家或研究单位发表论文的数量与质量一般较高,其中美国农业部农业研究局和中国农业科学院在刊文数量和被引用次数方面领先于其他机构。中国在小麦QTL定位研究领域刊文数量占据优势,但缺乏高质量、高影响力的权威性论文,与世界顶尖水平相比还存在较大差距。因此,我国在小麦QTL定位领域的研究需要进一步加大与其他国家的交流与合作,国内各学科之间也需要加强交叉与交流     

大豆脂肪酸组分相关QTL元分析

大豆油中脂肪酸的种类与含量是衡量其品质的主要指标.目前,对大豆脂肪酸组分相关的QTL研究较多,然而这些结果之间由于作图群体、分析方法以及环境条件的差异造成了QTL定位的区间过大或定位区间重叠等问题.通过搜集已报道的与大豆脂肪酸含量相关的83个QTL,提取相对有效且可靠的QTL标记信息,利用元分析软件BioMercator2.1将这些QTL映射到大豆公共遗传连锁图谱Soymap2上,构建了一张大豆脂肪酸组分相关QTL一致性图谱.并利用QTL的95%的置信区间来元分析推断"真实"QTL的位置.结果共得到定位在10个连锁群上的19个"真实"QTLs,他们主要分布在A1、B2、D1b、D2、E、G、L这7条连锁群上且成簇分布,明显缩短了其QTL的置信区间.研究结果为大豆脂肪酸组分相关的QTL的精细定位以及脂肪酸组分相关基因挖掘提供了有力的依据.