采用动物模型BLUP法对不同模型进行筛选

运用动物模型BLUP法时敖汉细毛羊的早期性状和产毛性状进行分析得出:模型(1)适合估计周岁重、断乳毛长度和断乳毛细度;模型(4)适合估计初生重和断乳重;模型(5)适合估计产毛量、体重和毛长度;模型(7)适合估计毛细度、毛弯曲分、毛密度分和毛油汗分.     

鲁西斗鸡体尺、体重及屠宰性状间的典型性相关分析

对鲁西斗鸡的体尺、体重和屠宰3组14个性状进行测定,并对这些变量进行了典型性相关分析。结果表明,体尺指标(胸深、胸宽、胫长、体斜长、龙骨长)间的相关系数为0.682~0.767;体重性状(初生重、180日龄重、日增重)间的相关系数为0.306~0.935,屠宰性能(胴体重、屠宰率、半净膛重、半净膛率、全净膛重,全净膛率)各项指标间高度相关,相关系数为0.945~0.986。体重性状和体尺性状间、体重性状与屠宰性状间及体尺性状与屠宰性状间的第一个典型相关系数差异极显著,其典型相关系数分别为0.705、0.560和0.878,贡献率分别为0.979、0.984和0.820。     

应用MTDFREML法对科尔沁细毛羊主要经济性状的遗传力估计

为了研究科尔沁细毛羊群体遗传趋势,试验采用最大似然法(MTDFREML法)和半同胞相关法分析了科尔沁细毛羊主要数量性状的方差组分及遗传力。结果表明:科尔沁细毛羊毛长度的变异系数最大为20.43%,其次为断奶毛长度、断奶重、初生重,分别为17.41%、16.14%、14.06%。属于高等遗传力(h2≥0.5)的性状有断奶毛长度、2周岁毛细度、2周岁毛长度,h2分别为0.51,0.52,0.50;属于低等遗传力(h20.2)的性状有6周岁体重,h2为0.13;其余的性状均属于中等遗传力(0.2≤h20.5)。     

“鹊山鸡”体尺、屠宰性能、肉品质测定及相关分析

为揭示"鹊山鸡"体尺和屠宰性状的性别差异情况及体尺与屠宰指标间的相关性,试验对30只300日龄公母"鹊山鸡"的体尺和屠宰性状进行测定和分析。结果:平均活重(0.96±0.2)kg、屠体重(0.86±0.18)kg、半净膛重(0.75±0.18)kg、全净膛重(0.75±0.18)kg、胸肌重(0.11±0.03)kg、腿肌重(0.13±0.04)kg,屠宰率(89.34±2.81)%、半净膛率(76.94±3.66)%,"鹊山鸡"体尺和屠宰性状均呈性别显著、极显著差异(P0.05;P0.01),"鹊山鸡"各体尺性状、多数屠宰性状及多数体尺与屠宰性状间均呈正相关关系,肉质指标系水力与肉色部分指标间达到了显著或极显著水平(P0.05;P0.01)。     

草原红牛胰岛素样生长因子结合蛋白6基因外显子2的遗传多态性及遗传效应分析

本试验旨在研究草原红牛不同基因型与屠宰肉用性状的关联性。选用草原红牛作为试验群体,采用PCR-SSCP方法检测胰岛素样生长因子结合蛋白6(insulin-like growth factors binding proteins 6,IGFBP6)基因外显子2的多态性,采用最小二乘法拟合线性模型将突变位点的不同基因型与牛屠宰肉用性状进行关联分析。结果表明,在IGFBP6基因外显子2上发现1个多态性位点A180G,具有3种基因型:AA、AB和BB。SPSS 13.0统计分析结果表明,IGFBP6基因外显子2 AB和BB基因型净肉重极显著高于AA基因型(P<0.01);眼肌面积和骨重显著高于AA基因型(P<0.05),而在宰前活重、胴体重、肾脂重和肋脂重方面3种基因型个体之间差异不显著(P>0.05)。结果显示,IGFBP6基因的多态性与屠宰肉用性状具有一定的关联性,可为今后草原红牛的育种保种工作提供理论依据,并对草原红牛肉用性状的改善提供参考。     

约束选择的研究概况及约束选择指数

一、约束选择的研究概况在动植物育种中,经常会遇到多个性状的问题。对于多个性状的选择,基于经济的考虑,Hazel(1943)提出了综合选择指数法。由于多个性状间普遍存在的相关性,一个性状的改良会使其它性状发生程度不同、方向不同的改变。综合指数法只是把握了多个性状经济复合值的变化,而没有考虑到一些特殊性状的具体情况。例如(Foulley,1976:Anderson,1977),用综合选择指数法选择青年公牛时,若考虑初生重和断奶     

中国西门塔尔牛GH基因SNPs与经济性状的关联分析

本试验采用PCR-RFLP和DNA测序等技术检测牛生长激素基因P3位点(growth hormone,GH-P3)在中国西门塔尔牛群体中的多态性,并利用最小二乘法拟合线性模型对该位点与牛经济性状进行关联分析。结果表明,BB基因型个体胴体重和净肉重极显著高于AA和AB基因型个体(P<0.01),屠宰率和净肉率显著高于AA和AB基因型(P<0.05),AA基因型背膘厚极显著低于AB、BB基因型(P<0.01)。本研究结果显示,GH-P3位点对中国西门塔尔牛个体胴体重、屠宰率、净肉重、净肉率及背膘厚等经济性状有显著或极显著的影响,为中国西门塔尔牛重要经济性状的分子标记辅助选择(MAS)及品系培育提供理论依据。     

牛CTSB基因第6内含子SNP与经济性状的关联分析

以174头西门塔尔牛和鲁西黄牛的杂交后代作为试验动物,利用PCR-RFLP方法对组织蛋白酶B基因(cathepsin B,CTSB)内含子6进行多态性检测,并应用SAS软件采用最小二乘法拟合线性模型,对不同基因型与牛部分经济性状进行关联分析。结果表明,CTSB基因内含子6的T5357C位点与大理石纹和活重2个经济性状显著相关,其中AA型大理石纹评分显著地高于BB型(P<0.05),BB型活重显著高于AA型(P<0.05)。上述结果为T5357C作为肉牛部分经济性状的分子标记提供了一定的理论依据。     

鲁西斗鸡体尺、体重及屠宰性状的回归分析

用SAS软件COKR过程对鲁西斗鸡体尺、体重及屠宰性状进行相关分析,并以鲁西斗鸡胸宽(x1)和初生重(x2)为自变量,180日龄重(y1)、日增重(y2)、胴体重(y3)、屠宰率(y4)、全净膛重(y5)、全净膛率(y6)为依变量。采用KEG过程的回归分析方法,构建了估测鲁西斗鸡屠宰性状的回归方程,结果表明:胸宽可以作为选择屠宰性状的间接指标。本研究结果对于鲁西斗鸡的选育具有参考意义。     

AA肉鸡屠宰性状与肌肉品质的相关性分析

为了进行AA肉鸡屠宰性状和肌肉品质的相关性分析,笔者选择200只1日龄健康AA肉鸡(公母各半),常规饲养;42日龄时随机抽取20只(公母各半),测定屠宰性状中的活重(x1)、屠宰重(x2)、半净膛重(x3)、全净膛重(x4)、胸肌重(x5)、腿肌重(x6)、腹脂重(x7),肌肉品质中的肌肉(胸肌、腿肌)色度(红度、黄度、亮度)(x8~x10)、嫩度(x11)、失水率(x12),进行2组性状间的相关分析。结果表明,在21个屠宰性状相关系数中,有6个达到极显著水平(P0.01);在6个肌肉品质相关系数中,有1个达到显著水平(P0.05);屠宰性状与肌肉品质2组性状间的35个相关系数,达到显著水平(P0.05)的9个相关系数均为负值;其余均不显著(P0.05)。说明屠宰性状与肌肉品质有一定的负相关性。     

GH和GHR基因多态性与滩羊生长性状的关联分析

为了解滩羊生长发育的遗传机制,寻找与生长性状相关的分子标记,试验采用PCR-RFLP方法检测宁夏滩羊GH和GHR基因的多态性,分析了多态位点不同基因型及合并基因型与滩羊生长性状的关联性。结果表明:GH基因第2内含子和GHR基因第4外显子分别经PvuⅡ和HpaⅡ酶切各产生BB(0.375 0)、AB(0.625 0)和DD(0.825 0)、CD(0.175 0)2种基因型;GH基因PvuⅡ位点的不同基因型个体初生重和6月龄体重差异显著(P0.05),与断奶重差异极显著(P0.01),AB为优势基因型;GHR基因HpaⅡ位点的CD基因型初生重和6月龄体重显著高于DD基因型(P0.05),而这两种基因型与断奶重差异不显著。对这两个SNPs位点进行基因互作分析发现双杂合基因型个体各生长性状均显著高于其他基因型组合(P0.05),并且多标记位点的组合效应高于单标记位点。说明ABCD是影响滩羊生长性状的最佳基因型组合,可作为滩羊生长性状的遗传标记。     

湘村黑猪繁殖性能的遗传效应分析

依据调查记录的育种数据资料,运用多性状非求导约束最大似然法(multiple traits derivative free restricted maximum likelihood,MTDFREML)数学模型,对湘村黑猪繁殖性状进行了遗传参数估计。结果表明,窝总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生窝重(LW)和21日龄窝重(LW21)的遗传力分别是0.18、0.15、0.07、0.09。母体效应率、窝效应率的变化范围分别是0.07~0.11、0.14~0.33;性状间遗传相关、永久环境相关、残差相关、表型相关范围分别为0.40~0.91、0.68~0.97、0.33~0.62、0.31~0.87。     

福建白兔体尺性状与屠宰性状的典型相关分析

研究福建白兔体尺性状与屠宰性状的相关关系,可为福建白兔的选育提供参考依据。对76只福建白兔(90日龄,公母各半)4个体尺性状(体长、胸围、耳长、耳宽)和5个屠宰性状(宰前活重、半净膛重、全净膛重、半净膛率、全净膛率)进行简单相关和典型相关分析。结果表明,福建白兔90日龄体尺性状和屠宰性状在性别之间的差异均不显著(P0.05),而体尺性状与屠宰性状呈不同程度的表型相关,其中以全净膛重与半净膛率相关性最高,简单相关系数0.986,半净膛率与全净膛率相关性次之,简单相关系数0.947,体尺性状与屠宰性状间的第1和第2典型相关系数分别为0.756和0.488,分别达差异极显著(P0.01)和差异显著(P0.05)水平,其所解释的相关信息占2组性状间总相关信息的62.30%。说明体尺性状与屠宰性状之间存在相关性,体尺性状与屠宰性状间的相关性主要是由耳长、胸围与宰前活重、全净膛重的相关性引起的,故可以通过对福建白兔耳长和胸围的选择实现对屠宰性状的间接选择。     

封闭群五指山小型猪主要繁殖性状的多重回归与通径分析

试验选取45头普通级封闭群五指山小型猪初产母猪,测定总产仔数(X1)、初生活仔数(X2)、初生窝重(X3)、初生个体重(X4)、21 d活仔数(X5)、21 d窝重(X6)、21 d个体重(X7)、断奶活仔数(X8)、断奶个体重(X9)和断奶窝重(Y)等10个繁殖性状表型值,并对各繁殖性状表型值进行相关、回归及通径分析,以揭示母猪繁殖性状间的真实关系。结果显示,封闭群五指山小型猪的绝大多数繁殖性状的表型值间存在显著正相关,有3对性状间存在较弱负相关。通过多重回归分析建立的估计断奶窝重的多元回归方程为:Y=－4.98690－2.61933X5+1.13628X6－7.55296X7+3.33048X8+6.74545X9,并且形成了三因素水平的性状间因果关系层次。通径分析剖析了相关性状间的直接效应和间接效应,显示X5~X9对断奶窝重有显著性直接影响,表明母猪的泌乳力和营养水平对其繁殖性能有显著影响,先天性繁殖性状对繁殖性能影响较小。     

大白猪胎盘效率遗传规律的初步研究

本文分析了 77头纯种大白母猪的 469头初生仔猪的胎盘效率、胎盘面积、胎盘长度、胎盘重及初生重等性状资料 ,估计了各性状间的简单相关系数 ,应用非求导约束最大似然法 (MTDFREML)估计大白猪胎盘效率、胎盘面积、胎盘长度、胎盘重及初生重的遗传力 ,估计结果分别为0 46 ,0 2 5 ,0 1 1 ,0 1 4和 0 2 9     

林甸鸡蛋品质性状的遗传参数估计

为提高林甸鸡蛋品质性状的选育效果,实验选择300日龄林甸鸡,基于动物模型利用REML方法对蛋重(EW)、蛋黄重(YW)、蛋黄比例(AY)、蛋壳重(ESW)、蛋壳强度(ESS)、蛋壳厚度(EST)、蛋白高度(AH)、哈氏单位(HU)、纵径(ELL)、横径(ESL)和蛋形指数(ESI)等11个主要性状进行遗传参数估计。结果表明:除ESS性状的遗传力较低外(h~2=0.15),其余蛋品质性状都属于中等或高等遗传力性状;EW与描述鸡蛋内部特征的YW、AH,以及描述鸡蛋外部特征的ESW、ELL、ESL等性状存在显著的正遗传相关(P9.1E-4),且遗传相关较高;ESW、ESS和EST 3个性状间呈显著正遗传相关。     

蕨麻小型猪繁殖性能测定和分析

对蕨麻小型猪母猪的主要繁殖性状进行统计分析,筛选影响繁殖性能的性状,以指导实验动物选育工作。依据相关国家标准和操作技术规范测定普通级蕨麻小型猪种猪繁殖性状,主要有总产仔数(X1)、产活仔数(X2)、初生头重(X3)、初生窝重(X4)、断奶头数(X5)、断奶头重(X6)和断奶窝重(Y)等7个繁殖性状,并与产地数据进行对比,通过SAS8.01软件进行相关与通径分析。结果发现,蕨麻小型猪在广东地区的繁殖性能较原产地放牧型蕨麻小型猪显著提高。在所分析的7个性状中,X4-X6与断奶窝重直接相关,所建立的多元回归方程为:Y=-10.373 5+0.616 2X4+4.397 7X5+1.864 6X6(R2=0.988 1)。蕨麻小型猪经过系统的实验动物化选育后,繁殖性能获得了明显提高,部分性状尚存在较大变异,提示仍需进一步选育纯化。     

荻和南荻杂交种F1群体主要农艺性状的杂种优势、遗传及相关性分析

利用主要农艺性状上具有显著差异的荻和南荻为亲本,杂交得到种间杂交种F₁群体(232个单株)为试验材料,对荻和南荻杂交种茎节数、叶片长、叶宽、主茎长、花茎长、花序长、株高、基部茎径、平均单分蘖干重、最大分蘖干重、分蘖数和单株重等12个主要农艺性状的杂种优势进行了度量,采用主基因+多基因混合遗传模型对F₁杂交群体的12个主要农艺性状进行遗传和相关性分析。结果表明,在F₁分离群体中12个主要农艺性状呈连续的、单峰、偏态分布,说明这些性状为多基因控制的数量性状。除基部茎径外的其他11个农艺性状都有较大的中亲优势,其中单株重、平均单分蘖干重、花序长、主茎长、株高、最大分蘖干重具有显著的超高亲优势,说明杂种优势可以作为荻和南荻育种的主要方法。混合遗传分析表明,花茎长、最大茎重能检测到1对主基因,叶片宽、主茎长、株高、分蘖数、单茎均重、单株重能检测到2对主基因的存在,主基因遗传率大小顺序为叶片宽(87.76%)>单株重(81.48%)>单茎均重(65.12%)>分蘖数(59.20%)>主茎长(49.87%)>株高(48.01%)>花茎长(47.75%)>分蘖最大茎重(37.19%)。产量相关性状中的单株重、单茎均重和分蘖数具有较高的主基因遗传率,适合于早期世代选择。这12个农艺性状间存在一定的相关性,多数性状间的相关性为极显著的正相关,其中单株重与分蘖数、单茎均重、主茎长和株高的相关系数最大,在育种实践中可以利用相关性状进行间接选择。     

比较机器学习等算法对肉鸡产蛋性状育种值估计的准确性

我国白羽肉鸡育种中,通过遗传途径提高产蛋数和控制合适的蛋重是培育优良品系的一个重要方面。为探索适合我国白羽肉鸡育种中的基因组选择模型,本研究以2 474只白羽肉鸡品系的产蛋性状为研究对象,主要分析了机器学习算法KAML、BLUP(包括：PBLUP、GBLUP、SSGBLUP)和Bayes(包括：Bayes A、Bayes B和Bayes Cπ)方法对产蛋数和蛋重性状的预测准确性,准确性以5倍交叉验证进行评估。利用系谱以及基因组信息估计了产蛋数和蛋重性状的遗传力和遗传相关。结果表明,产蛋数性状遗传力为0.061~0.16,属于低遗传力性状;蛋重遗传力为0.28~0.39,属于中等遗传力性状;产蛋数与蛋重是中等遗传负相关(-0.518~-0.184),不同阶段产蛋数之间是强的遗传正相关(0.736~0.998)。不同模型预测43周产蛋数和52周蛋重的育种值估计准确性结果表明,KAML方法对两者的预测准确性分别为0.115和0.266,与GBLUP方法(准确性分别为0.118和0.283)和SSGBLUP方法(准确性分别为0.136和0.259)的准确性差异显著,同时显著低于Bayes方法(准确性分别为0.230~0.239、0.336~0.340)的预测准确性, PBLUP方法预测准确性最低(准确性分别为0.095和0.246)。因此,在白羽肉鸡产蛋数和蛋重性状中应用Bayes方法将获得最高的育种值估计准确性。     

利用GWAS研究母猪繁殖性状的进展

母猪繁殖性状一直是猪的重要性状之一,母猪繁殖性能的高低关乎着养猪场的规模和养猪业的发展。目前利用GWAS(全基因组关联分析)发现影响母猪产仔数、初生重、断奶重和乳头数等繁殖性状的SNP(单核苷酸多态性)位点,进而发现关联的基因已经成为研究热点之一,并且利用GWAS研究母猪的繁殖性状取得了一定的进展。因此,文章主要对利用GWAS研究母猪繁殖性状的进展进行概述。