梨AFLP标记遗传图谱构建及果实相关性状的QTL定位

以‘八月红’ב砀山酥梨’的97株F1群体为试材,利用AFLP技术构建梨（2n=34）的分子遗传连锁图谱,共获得17个连锁群,包含209个标记位点,覆盖基因组1506.3cM,平均图距为7.21cM;用区间作图法进行梨果实可溶性固形物、单果质量、果实纵径、果实横径和纵横径比等5个性状的QTL定位,其中在LG1连锁群上定...     

黄瓜分子遗传图谱的构建

 利用黄瓜( Cucumis sativus L. ) 欧洲温室生态型栽培种高代自交系‘欧洲八号’和华北露地生态型品种‘秋棚’杂交获得的140 份重组自交系, 采用AFLP、SSR、RAPD 分子标记进行遗传分析, 构建了包含9 个连锁组群, 由234 个标记组成的连锁图谱, 其中包括141 个AFLP 标记、4个SSR 标记和89个RAPD 标记, 覆盖基因组727.5 cM , 平均图距3.1 cM。     

RAPD和SRAP分子标记在金针菇菌种鉴定中的应用

试验从分子生物学和形态学角度,利用SRAP和RAPD分子标记技术对7个金针菇菌株进行遗传多样性分析。SRAP共扩增出469条DNA条带。大部分条带分子量在200～3000bp,多态性条带为377条,占总条带数的80．4％,每对引物平均获得41．9条多态性条带。RAPD扩增出476个条带。其中多态性条带为274条,占总条带数的57．6％,每个引物平均获得343条多态性条带。结果证明,RAPD与SRAP分子标记技术在试验中分别在以相似系数0．91和0．72为阈值时,7个供试菌株的分组大致是相同的。金913和金19同源性最大,在2种分子标记技术中相似系数分别达到了0．9903和0．8966,表明金913和金19可能是同物异名,而金405与其他菌株的亲缘关系最远,其远缘优势应在杂交育种中引起重视。     

利用中国香瓜与哈密瓜的F2 群体构建SRAP连锁遗传图谱

 以中国甜瓜地方品种自交系4G21 (香瓜) 和3A832 (哈密瓜) 杂交产生的114个F2单株为材料, 利用29对SRAP引物构建甜瓜分子遗传图谱, 共产生187个多态性位点, 其中152个位点组成12个连锁群, 该图谱覆盖基因组长度2 077.1 cM, 平均图距13.67 cM。每个连锁群的标记数6～32个, 平均图距9.72～19.19 cM, 连锁群长度85.3～469.1 cM。     

RAPD和SRAP分子标记在绣球菌菌种鉴定中的应用

采用RAPD、SRAP两种标记方法分别对6个绣球菌（Sparassis crispa）菌株进行亲缘关系分析,结果分析表明2种方法结果一致,平均每条引物组合产生的条带数分别为20.5和24.5,多态性条带的比例分别为91.4%和78.8%。结果显示,6个菌株间均有遗传上的差异,菌株4号、5号同源性最大,相似系数分别达到了0.981和0.875,说明菌株4号、5号可能是同物异名。     

利用AFLP和RAPD标记构建桃的遗传连锁图谱

为了给进一步研究桃的遗传标记的定位打下基础,以毛桃北京2—7[Prunus persica(L．)Batsch．Beijing2-7]、山桃白花山碧桃[Prunus davidiana(Carr．)Franch．Baihuashanbitao]以及2者的F1代为试材,用RAPD、AFLP标记构建了北京2—7和白花山碧桃的遗传连锁图,分别覆盖221．7 cM(7个连锁群)、1238．8 cM(12个连锁群)。其中北京2—7的连锁图包含19个标记,标记间平均距离为11．7 cM;白花山碧桃的连锁图包含103个标记,标记间平均距离为12．0 cM。     

荔枝AFLP分析体系的建立

以39份荔枝种质资源为试材,建立起荔枝AFLP分析体系。对AFLP分析过程中的影响因子(酶切与连接、预扩增、标记)进行了研究。双酶切必须完全彻底。选出适于荔枝AFLP分析的引物组合3对,分别为EcoRIAAC+MseICTG,EcoRIAGC+MseICAT,EcoRIACC+MseICAT。应用其中2对引物(EcoRIAAC+MseICTG,EcoRIACC+MseICAT),共在106个位点扩增出条带,多态性带92个(86.7%)。对荔枝AFLP分析的影响因子进行了分析。     

利用多种分子标记构建龙眼高密度分子遗传图谱

 以龙眼特优质品种‘凤梨朵’为母本, 大果型主栽品种‘大乌圆’为父本, 杂交创建了‘凤梨朵’ ב大乌圆’F₁群体。从该杂种群体中随机选用94个单株作为作图群体, 连同两个亲本品种, 进行了RAPD、ISSR、SRAP和AFLP分子标记分析, 并运用JoinMap3.0进行连锁分析, 分别构建了‘凤梨朵’和‘大乌圆’的分子遗传图谱, 其中, ‘凤梨朵’的遗传图谱为21个连锁群, 包含183个标记位点,覆盖总图距965.1 cM, 位点间平均遗传距离为5.84 cM; ‘大乌圆’的遗传图谱为22个连锁群, 包含251个标记位点, 覆盖总图距1 064.8 cM, 位点间平均遗传距离为4.65 cM。这是龙眼上首次报道的高密度分子遗传图谱, 为后续的基因定位及辅助选择奠定了良好的基础。     

荔枝品种亲缘关系的AFLP分析

 应用AFLP技术，对39个荔枝品种进行了遗传多样性分析及分类研究。筛选出适于荔枝AFLP分析的最佳引物组合3对，分别为EcoRI AAC+MseI CTG，EcoPd AGC+MseI CAT，EcoRI ACC+Msel CAT。在分子水平上，荔枝品种的遗传多样性并非形态学性状所体现的那样丰富。AFLP分析将39个荔枝品种分成了6组，与传统的以果皮龟裂片隆起类型为分类标准的分类没有一致性。初步建立起荔枝主要栽培品种的分子标记标准图谱。应用AFLP技术对来自两个不同地方的两个荔枝品种(桂味、妃子笑)进行了鉴别。     

梨果皮色泽变异品种（系）的AFLP与SRAP标记鉴定

为揭示梨果皮色泽变异品种（系）与原始品种的遗传差异,利用AFLP和SRAP标记对3组果皮色泽的变异品种（系）进行了鉴别。54对AFLP引物共检测1 089个位点,其中多态性条带数为688,多态性比率为63.2%;20对SRAP引物可检测210个位点,其中多态性条带为76条,多态性比率为36.2%。分析结果表明,7对AF...     

基于SRAP 分子标记的安祖花遗传连锁图谱的构建

 以安祖花（Anthurium andraeanum）抗逆性较强的品种‘Pink Champion’为母本,主栽品种‘Dakota’为父本,杂交得到F₁代,从该杂种F₁代中随机选出94个单株为作图群体,利用SRAP分子标记技术并运用JoinMap4.0^®软件的CP作图模型构建了遗传连锁图谱。该图谱覆盖基因组长1 689.5 cM,共254个标记,定位于19个连锁群上,标记间平均距离为6.65 cM。各连锁群长度在7.6 ~ 187.2 cM范围内,每个连锁群包含3 ~ 43个标记。     

利用重组自交系群体构建番茄AFLP 遗传连锁图谱

 以普通栽培番茄（Solanum lycopersicum）99165-30为母本,野生多毛番茄（Solanum habrochaites）LA1777为父本进行杂交,通过单粒传得到了含有80个F_5︰6家系的重组自交系分离群体,利用荧光AFLP分子标记技术构建番茄分子遗传连锁图谱。AFLP标记采用MseⅠ和EcoRⅠ两种内切酶及荧光标记（IRD-700或IRD-800）的E + 3和非荧光标记的M + 3引物组合进行选择性扩增,扩增结果经95 ℃预变性后在6%变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳2.5 h,运用LICOR 公司的NEN Global Edition IR² DNA Analyzer（Model 5200 LI-COR Biosciences,Lincoln,NE）荧光扫描检测DNA多态性。对RILs群体中产生分离的274个AFLP标记运用JoinMap 3.0软件分析,得到一张番茄分子遗传连锁图谱,图谱总长度为662 cM,共包括18个主要连锁群,125个多态性分子标记。每条连锁群上的标记数在3 ~ 22个之间,连锁群的长度在14.0 ~ 58.0 cM的范围内,平均图距在 2.27 ~ 13.3 cM。总平均距离5.3 cM,本研究中构建的番茄永久遗传图谱,为番茄分子辅助育种及重要农艺性状的定位奠定了基础。     

利用SSR标记技术构建黄瓜遗传连锁图谱

利用抗黄瓜花叶病毒病(CMV)的黄瓜材料F-3和感CMV的黄瓜材料HZL04-1为亲本,构建包含190个F2后代的遗传作图群体。结果表明:采用SSR、EST-SSR和SCAR 3种分子标记技术对该群体进行遗传连锁分析,获得1个包含170个SSR标记,6个EST-SSR标记,3个SCAR标记的黄瓜遗传连锁图谱,该图谱涉及7个连锁群,总长度为862.886 cM,平均图距为4.79 cM。该图谱的构建为黄瓜抗CMV的QTL定位奠定了基础,并确定了连锁群与染色体之间的对应关系。     

二倍体马铃薯分子连锁图谱的构建

利用二倍体马铃薯亲本08675-21与09901-01及其125份杂交一代无性系进行AFLP分析, 按亲本来源构建与24条染色体对应的AFLP分子连锁图谱, 母本图谱含有75个标记, 覆盖基因组全长512cM, 平均图距为6.83 cM; 父本图谱含有95个标记, 覆盖基因组全长578 cM, 平均图距为6.08 cM。     

大白菜永久高密度分子遗传图谱的构建

 以大白菜高抗TuMV白心株系91-112和高感TuMV桔红心株系T12-19为亲本建立的小孢子培养DH系作为图谱构建群体, 构建了包含10 个连锁群、406 个标记位点的分子连锁图谱, 图谱总长度826.3 cM, 标记间的平均图距为2.0 cM, 连锁群数目和染色体数相等。每个连锁群上的标记数在7～111个之间, 连锁群的长度在26.4～156.1 cM的范围内, 平均图距在1.0～3.8 cM之间。该连锁图谱包括246个AFLP标记、135个RAPD标记、11个SSR标记和12个同工酶标记、1个SCAR标记和1个形态标记。     

茄子RAPD分子标记图谱的构建

与其它蔬菜作物相比,茄子(Solanum melongena)的分子图谱构建研究相对滞后。本研究利用RAPD技术初步构建了茄子的RAPD标记连锁图。茄子材料为两个纯合的自交系E-31和E-32,杂交F1自交后获得的119株F2代群体。使用了660条随机引物进行筛选,能够扩出带的引物共有442条。选其中能够扩出差异明显且稳定谱带的引物72条,用于图谱构建。扩增出的带大小在300~3000bp之间,每条引物扩出带5~8条。用这些引物在F2代分离群体中进行扩增,共得到多态性的带101条。进而在119株F2代分离群体中对这些多态性位点进行连锁分析,用JoinMap3·0构建连锁群,77…     

RAPD标记构建芥蓝×甘蓝分子标记连锁图

 以芥蓝C_100-12×甘蓝秋_50-Y7为杂交组合, 构建了F₂ 作图群体, 利用300 个随机引物对两亲本进行了RAPD 检测, 共筛选到150 个RAPD 引物在亲本间表现多态, 多态引物的比率为58. 3 %。共分析了52个引物产生的96 个多态性RAPD 标记在该群体中的遗传。96 个RAPD 标记中有94 个在F2 群体中的分离比符合3∶1 , 说明该群体适合于QTL 分析, 共发现两对共分离的RAPD 标记。利用该作图群体构建了甘蓝的基本遗传图谱。该图谱由9 个主要的连锁图构成, 覆盖基因总长度约为555. 7 cM。