SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨 Ⅵ.不同引物判定同一样品植株纯度的准确性

将同一样品在室内用不同引物对各植株进行检测,并与田间检测结果比对,发现不同方法对杂株的判别能力不同,并分析了导致同一植株出现不同判定结果的原因,为降低分子检测和田间鉴定结果之间的误差提出了相应技术对策。     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅳ.不同品种同一引物检测试验

根据引物筛选结果,选出9个均可用SSR引物RM17检测纯度的两系杂交稻品种,通过室内鉴定判断品种间的分子学差异.同时通过田间正季鉴定判断品种间的植物学特征差异,探讨SSR引物的分辨力和可靠性.结果表明,当遗传背景较近的品种相互混杂时,用单对引物不能有效区分.     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅰ.亲本和杂交种分别筛选引物的适用性

分别采用亲本和杂交种为材料,从44对引物中筛选出适合于鉴定两系杂交水稻品种两优17、苯两优639、天两优616的引物.结果表明,对同一品种用两种方法筛选出的SSR引物相同.在没有亲本的情况下,仅用杂交种筛选得到的引物可用于室内纯度鉴定.     

SSR鉴定水稻两系杂交种纯度的运用与探讨Ⅱ.不同苗龄取样方法对室内纯度结果的影响

以水稻(Oryza sativa L.)两优17为试验材料进行标准发芽后,对幼苗进行大苗、小苗分类,并利用SSR引物分别对其进行室内纯度鉴定.鉴定结果表明,苗的大小对鉴定结果的影响较大,小苗与大苗的纯度相差2.8个百分点,超出了允许的误差范围.与大田相比,大苗的纯度更接近于田间秧苗纯度.在田间小苗往往不能成苗,不影响大田纯度,故小苗是造成室内与大田纯度鉴定结果产生差异的重要原因之一.     

山西省主推玉米杂交种纯度鉴定SSR核心引物的筛选

选用10对SSR核心引物对18份山西省玉米杂交种进行DNA指纹分析,并综合考虑多态性和杂合率,认为umc1590和umc1196这2对引物可鉴定17个品种纯度,phi402893,phi102228,phi233376,p-phi072,umc1066和phi022也可作为纯度鉴定的引物。建议采用umc1590,phi402893,phi233376,phi022这4对引物对18个杂交种纯度进行检测。     

SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度

采用SSR分子标记技术鉴定两系杂交水稻"荃两优2118"的种子纯度。从48对SSR引物中筛选到2组引物(RM7120、RM8277)。随机选取"荃两优2118"种子6组,每组样品随机取192棵种子苗种进行纯度检测,结果显示同一样品SSR标记与田间鉴定结果接近,最大、最小差异分别为2.05%和0.23%。因此,SSR标记技术适用于"荃两优2118"的种子纯度鉴定。     

辣椒杂交种纯度鉴定的SSR核心引物筛选（英文）

[目的]该研究旨在筛选一套适于辣椒杂交种纯度鉴定的核心SSR引物。[方法]利用17对SSR引物对100份已知辣椒杂交种进行DNA指纹分析。[结果]根据多态性和杂合率两个指标,确定Hpms1-214、Es395和Hpms1-5为辣椒杂交种纯度鉴定的首选核心引物。利用这3个引物进行筛选,97个品种(占97%)能够找到具有杂合带型的鉴定引物,确定5个引物Es330、Es363、Epms923、Es120和Es64为辣椒杂交种纯度鉴定的备选核心引物。筛选出14个品种的特异性引物,可进一步筛选每个辣椒杂交种的双亲互补型引物。[结论]该研究为构建辣椒杂交种纯度鉴定标准DNA指纹图谱奠定基础。     

应用SSR标记技术进行引物筛选及玉米杂交种纯度的鉴定

利用SSR标记技术分别筛选出玉米杂交种强盛16、强盛9、强盛62、强盛11的特异引物,建立了4个品种的种子纯度鉴定试剂盒。试验表明,应用此试剂盒可快速、有效地鉴定4个杂交种的种子纯度。     

利用SSR标记鉴定两系杂交稻“广两优7203”的种子纯度

利用SSR分子标记技术对两系杂交稻"广两优7203"及其父母本的多态性引物进行了筛选,对种子纯度进行了鉴定。结果表明:在24对SSR引物中有1对引物(RM224)在广两优7203及其双亲之间表现为稳定的共显性且能将杂交种及其亲本完全区分开。利用筛选的引物RM224对广两优7203的种子进行纯度鉴定,鉴定结果与田间鉴定结果基本一致。     

利用SSR标记鉴定两系杂交稻“广两优7203”的种子纯度

利用SSR分子标记技术对两系杂交稻"广两优7203"及其父母本的多态性引物进行了筛选,对种子纯度进行了鉴定。结果表明:在24对SSR引物中有1对引物(RM224)在广两优7203及其双亲之间表现为稳定的共显性且能将杂交种及其亲本完全区分开。利用筛选的引物RM224对广两优7203的种子进行纯度鉴定,鉴定结果与田间鉴定结果基本一致。     

不同引物鉴定同一杂交水稻种子样品纯度结果的差异及其原因分析（英文）

在对冈优158、Ⅱ优808、五优308及天丰优316的杂交种子样品进行室内纯度鉴定时,发现不同SSR引物鉴定的纯度结果存在明显差异。为了探讨其原因,将这4个组合的种子样品在海南进行田间种植鉴定,并按单株进行了分子与田间表型的对比分析。结果表明,冈优158、Ⅱ优808、五优308和天丰优316分别用引物RM208、RM264、RM242和RM164鉴定种子纯度时,只能鉴定出不育系(母本)杂株,室内分子鉴定纯度的结果均高于相应的田间纯度鉴定结果 ;而引物RM341、RM297、RM21和RM110不仅能鉴定出不育系(母本)杂株,还能鉴定出串粉株,室内分子鉴定纯度与田间鉴定纯度相当。因此,室内纯度鉴定时应采用多对引物进行检测,以增加识别串粉株的几率。     

两系杂交水稻纯度检测方法探讨

[目的]探索两系杂交水稻种子纯度的最佳检测方法。[方法]以丰两优香一号、丰两优四号和丰两优一号两系杂交水稻种子为材料,分别采用酯酶同工酶法和SSR分子法检测其纯度,并对2种方法的检测结果进行比较。[结果]同工酶测纯结果与SSR测纯结果的相关性较显著（r=0.964）,但同工酶测纯结果总体低于SSR测纯结果;了解种子的大致纯度时可采用同工酶方法测纯,精确掌握种子纯度时可采用SSR分子方法测纯。[结论]SSR测纯结果更接近种子的真实纯度。     

两系杂交稻持续高纯高产制种技术探讨

目前两系杂交稻制种过程中,制种母本受到低于23.5℃(育性转换临界温度)的低温影响,即会出现不育特性向可育方向波动,给两系制种持续高纯度、高产量生产造成极大威胁。使用化学杀雄方法,对两系母本的育性波动进行挽救性处理,可确保制种生产实现"双高"。在不育性能尚未有效把握以前,化学杀雄方法是抵御制种风险唯一可选的可靠做法。     

小麦抗蚜品种的遗传多样性SSR标记分析

分析小麦抗蚜品种(系)的遗传多样性,为进一步培育和推广抗蚜品种提供依据。在田间对956份小麦品种(系)损失率鉴定结果的基础上,取47份年度间鉴定抗性结果较为一致的材料,按损失率大小,由小到大排列起来,利用筛选的18对多态性SSR标记检测了参试材料的遗传多态性。结果表明,18对SSR标记在47份不同抗性品种中检测到99个等位基因,能够将所有品种区分开来,每对引物可以检测到1~10个等位基因,平均为5.21个。47个小麦品种间的相对遗传距离在0.33~0.94之间,平均为0.65。高抗品种间相对遗传距离平均为0.59(0.39~0.77);中抗品种间的相对遗传距离平均为0.62(0.39~0.83);感虫品种间的相对遗传距离平均为0.62(0.37~0.83);高感品种间的相对遗传距离平均为0.64(0.37~0.84)。SSR标记聚类分析在相对遗传距离为0.67处将供试材料分为7大类群。选育和推广抗虫品种时尽可能选择聚类图中亲缘关系较远的材料。抗虫品种‘临远95-5322’单独聚为一类,同其余品种具有较远的亲缘关系,可作为新的抗源用于抗虫育种。     

美国大灵芝（Ganoderma oregonense）转录组SSR位点的生物信息学分析

为了解美国大灵芝（Ganoderma oregonense）转录组中的简单重复序列（simple sequence repeat,SSR）位点信息,并为开发灵芝分子标记辅助育种技术奠定基础,将高通量转录组测序获得的美国大灵芝转录组数据通过Trinity软件拼接组装,再利用MISA软件分析其SSR位点信息。随后采用Primer 3根据SSR位点设计特异性鉴别引物,并以灵芝DNA为模板,对其有效性进行验证。共获得65 064条单基因簇（unigene）,在其中2 981条unigene中检测到3 380个符合软件参数的SSR位点,发生频率为5.19%,平均分布距离为12.60 kb。美国大灵芝转录组SSR位点总长度为52 168 bp,平均长度为15 bp。单核苷酸、三核苷酸是美国大灵芝转录组SSR的主要重复类型,分别占总SSR的35.33%和38.67%。SSR基元重复次数范围为5~73次,其中5次重复的发生次数最高。SSR重复基元共有98个类型,其中C/G是最常见的重复基元,比例为17.72%,其次是A/T,比例为17.60%。针对3 380个SSR位点设计出2 324对SSR引物,随机选择15对引物对3种灵芝栽培品种进行PCR扩增,10对引物可稳定扩增出条带,其中8对在3个灵芝栽培品种中表现出多态性。说明美国大灵芝转录组SSR位点多态性丰富,对灵芝的功能基因挖掘、分子标记辅助育种开发以及遗传多样性分析等具有重要意义。     

玉米杂交种子纯度的SSR检测与田间鉴定的比较研究

为发展分子标记技术在玉米杂交种子纯度鉴定上的应用,文章对吉林省2005年玉米省级区试的30个品种进行了SSR分子标记的纯度分析,筛选出11时多态性好的引物,并与田间纯度鉴定结果进行了比较.通过相关分析和差异显著性分析表明:SSR鉴定的(平均)纯度与田间纯度鉴定结果较为一致,相关系数达到0.798,而且两者无显著差异,因此,SSR分子标记可以用于玉米田间纯度的鉴定;引物umc1069和引物umc2373所标记的结果能较好的代表田间纯度鉴定的结果.     

利用SSR标记鉴定棉花杂交种兴杂2号纯度的研究

杂交棉在制种过程中往往因母本去雄不彻底或漏去雄形成自交铃而导致制种纯度不高,寻找快速准确的纯度检测方法是杂交棉种子生产和经营急需解决的问题。试验以棉花杂交种兴杂2号及其亲本为材料,选用77对异源四倍体棉花SSR引物,采用SSR分子标记技术筛选出双亲间的多态性产物,并对兴杂2号种子的纯度进行了检测。结果表明,CP55、CP128、CP483、CP478等4对引物在兴杂2号双亲间扩增出多态性产物,可以准确地鉴别出兴杂2号及其亲本间的差异,为棉花杂交种兴杂2号的纯度鉴定提供了一个准确、稳定、快捷、实用的检测方法。     

小麦抗蚜品种的遗传多样性SSR标记分析

分析小麦抗蚜品种（系）的遗传多样性,为进一步培育和推广抗蚜品种提供依据。在田间对956份小麦品种(系)损失率鉴定结果的基础上,取47份年度间鉴定抗性结果较为一致的材料,按损失率大小,由小到大排列起来,利用筛选的18对多态性SSR标记检测了参试材料的遗传多态性。结果表明,18对SSR标记在47份不同抗性品种中检测到99个等位基因,能够将所有品种区分开来,每对引物可以检测到1~10个等位基因,平均为5.21个。47个小麦品种间的相对遗传距离在0.33~0.94之间,平均为0.65。高抗品种间相对遗传距离平均为0.59（0.39~0.77）;中抗品种间的相对遗传距离平均为0.62（0.39~0.83）;感虫品种间的相对遗传距离平均为0.62（0.37~0.83）;高感品种间的相对遗传距离平均为0.64（0.37~0.84）。SSR标记聚类分析在相对遗传距离为0.67处将供试材料分为7大类群。选育和推广抗虫品种时尽可能选择聚类图中亲缘关系较远的材料。抗虫品种‘临远95-5322’单独聚为一类,同其余品种具有较远的亲缘关系,可作为新的抗源用于抗虫育种。