鱼类CC趋化因子基因及其系统进化分析

CC趋化因子（CC Chemokine）是一类能够促进动物体内炎症部位的各种白细胞的补充、激活和黏附的趋化性细胞因子家族，是鱼类天然免疫系统的重要组成部分。趋化因子也是当今国际鱼类分子免疫学研究的热点之一。本研究通过比较基因组学和生物信息学的方法，分析了虹鳟（Oncorhynchus mykiss）、牙鲆（Paralichthys olivaceus）和斑点叉尾鮰（Ictalurus punctatus）等重要经济鱼类的CC趋化因子基因结构特点和功能，并采用Clustal X的NJ法对所有新的CC趋化因子和先前发表的鱼类趋化因子与其他动物的CC趋化因子进行系统进化分析，建立了3个独特的包含非鱼类OC趋化因子的直向进化同源组。第1个直向进化同源组建立于人的CCL27和CCL28，有丽鱼科（Cichlidae）Melanochromis auratus和Pamlabidochromis chilotes的SCYA101、SCYA101a、大西洋鲑（Salmo salar）的CB510320、斑马鱼（Danio rerio）的B1839410、虹鳟的CK11、斑点叉尾鮰的BM027974和BM029630；第2个直向进化同源组是以人类C／2L20建立的，包括虹鳟的CK8a、CK8b、斑点叉尾鮰的SCYA112和鸡（Callusgallus）从K84434，其中鸡的序列与人的CCL20最相近（与其他鱼类CC趋化因子相比）；第3个直向进化同源组是以鸡的XP-424980和蓝鮰（Ictalurus furcatus）的SCYA109建立的。所有其他鱼类CC趋化因子都没有归类到非鱼类CC趋化因子的同源组中。为了进一步分析鱼类CC趋化因子和哺乳类CC趋化因子间的关系，采用Clustal W的非自举检验（Bootstrapping）启发式搜索（heuristic search）比对法对这些OC趋化因子进行归类分析，结果得到7个潜在的直向进化同源组，包括含有4个鱼类OC趋化因子的CCL20直向进化同源组、5个鱼类CC趋化因子的CCL24直向进化同源组、8个鱼类CC趋化因子的CCL22直向进化同源组、4个鱼类CC趋化因子的CCL17直向进化同源组、15个鱼类CC趋化因子的CCL25直向进化同源组，7个鱼类CC趋化因子的CCL27／CCL28和17个鱼类CC趋化因子的CCL19／CCL21直向进化同源组。趋化因子的研究将有助于更好地了解鱼类抗病性与天然免疫性的关系。     

鱼类趋化因子家族的研究进展

趋化因子(chemokines)是一类分子量仅 8~10 kD 的小分子细胞因子,由巨噬细胞、成纤维细胞、T 细胞和 B 细胞等表达分泌。按生理功能的差异可将趋化因子分为组成型和诱导型,前者通常参与淋巴细胞的迁移、定位以及免疫监视, 而后者仅在感染或炎性刺激时分泌并诱导白细胞迁移至炎症部位。根据氨基酸序列中前两个半胱氨酸(Cys)的排列方式, 可以将趋化因子分为 4 类: CXC 亚族、CC 亚族、C 亚族和 CX3C 亚族。鱼类至今尚未发现有关 CX3C 亚族趋化因子的研究报道, 但拥有一类特有的 CX 亚族。除了基本的募集和激活白细胞功能外, 鱼类趋化因子在免疫应答、应激反应、胚胎发育及血管生成等方面也发挥着重要作用。本文从鱼类趋化因子及其受体的分类、鉴定、结构、表达以及功能等方面进行了综述。     

鱼类免疫学：先天免疫

现代免疫学已成为生物和医学科学中的一门极其活跃的学科。七十年代掀起了“免疫热”。1974年[美]D.P.Anderson 著《鱼类免疫学》一书出版。书中提及“1971年出版了第一本俄文鱼类免疫学书,作者是 Lukyanenko☆,该书内容涉及全面论述鱼类免疫学所必要的各方面论题,也包括论述了像溶菌酶(Lysozyme)这类过去被忽视的论题。……该书全是俄国的研究工作,引用了任何西方图书馆几乎无法找到的大量俄国参考资料,西方文献即使有也极少。该书已由 Robert Kaba-     

鱼类MHC及其基因研究进展

MHC广泛存在于脊椎动物中,在鱼类中由于其高度的多态性,使其在遗传进化、免疫相关、抗病育种等方面倍受关注.本文综述了国内外关于鱼类MHC基因的遗传结构、功能特性及系统学方面的研究进展,并展望了将此类基因应用于遗传育种中的前景,以及制约研究所存在的问题.     

鱼类嗅觉受体基因研究进展

嗅觉是鱼类感知外界环境的重要器官,参与觅食、定位、避敌以及生殖洄游等行为。嗅觉功能基于嗅觉信号通路并由嗅觉受体蛋白识别外界环境中的气味分子而实现。嗅觉受体基因编码G蛋白偶联受体蛋白,在脊椎动物中已发现的嗅觉受体基因有5个家族,即主嗅觉受体基因(MOR)、犁鼻器Ⅰ型受体基因(V1R/ORA)、犁鼻器Ⅱ型受体基因(V2R/OlfC)、痕量胺相关受体基因(TAAR)和甲酰基肽受体基因(FPR)。鱼类占脊椎动物所有种类的50%以上,近年有关鱼类嗅觉受体基因的研究越来越多,新的发现不断涌现,但目前国内的相关文献甚少。本文总结了鱼类嗅觉受体基因家族的研究进展,整理了研究中遇到的有关问题和相应对策,并对研究前景作了展望,旨在为国内鱼类嗅觉受体基因的研究提供参考资料。     

荧光原位杂交技术在鱼类基因定位研究中的应用

荧光原位杂交fluorescence in situ hybridization,FISH）技术是一种简单而有效的染色体上物理定位DNA序列的技术。本文介绍了荧光原位杂交技术的基本原理以及实验流程,综述了近年来FISH技术在鱼类基因定位方面的应用,如来源于细菌人工染色体（bacterial artificial chromosome,BAC）文库的单拷贝基因的定位、核糖体基因和组蛋白基因等中度重复序列的定位、着丝粒特异序列和性别特异序列等高度重复序列的定位以及其他重复序列的定位等,用于研究特定基因定位、性染色体鉴定及种间杂交等遗传学问题,并展望了此技术在定位鱼类经济性状相关标记或基因、性别相关标记或基因及种特异染色体标记中的应用前景。     

试论深入开展鱼类基因定位研究的新构思↑（*）

本文根据国内外鱼类基因定住研究的现状，特别是本室近年来在该研完领域的新进展，提出了深入开展鱼类基因定位研究的新方案。其中包括：(1)迅速构建多种鱼类二价体高分辩G带模式图，(2)构建以序列标志微卫星位点为基础的鱼类二价体基本框架图；(3)深入开展基目比较定位研究；(     

鱼类免疫应答机制研究进展

鱼类免疫应答可以分为固有免疫和适应性免疫,但固有免疫发挥主要作用。固有免疫对病原体的识别是通过模式识别受体PRR与病原相关分子模式PAMP的相互结合实现,这与哺乳类相似。但为适应水生生活,鱼类固有免疫对PAMP的识别范围更广,免疫应答的启动条件更低。固有免疫的效应细胞主要是单核/巨噬细胞、嗜中性粒细胞、自然杀伤细胞等,具有吞噬和杀伤功能,还可分泌多种免疫相关的细胞因子,介导发生炎症反应。适应性免疫中,T淋巴细胞通过抗原提呈细胞分解吸收抗原,由主要组织相容性复合物(MHC)类分子递送到细胞表面才能识别。B淋巴细胞分泌产生以免疫球蛋白Ig M为主的抗体分子,而发挥抗体中和作用及免疫调理作用的Ig G在鱼类中比较少见,说明鱼类抗体的免疫功能还处于较低水平。本文综述了近二十年内鱼类免疫应答机制的相关研究进展,为进一步了解鱼类免疫应答机制提供参考。     

低鱼粉饲料中添加低分子水解鱼蛋白对凡纳滨对虾非特异性免疫力和抗氧化能力的影响

以鱼粉水平为30%的饲料为高鱼粉饲料对照组,以豆粕替代高鱼粉饲料中50%鱼粉形成低鱼粉基础饲料,低鱼粉基础饲料添加0、0.5%、1.0%、1.5%和2.0%低分子水解鱼蛋白,配制 6种实验饲料,对初始体重为(0.44±0.02) g的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)幼虾进行48 d的养殖实验。实验结束后采集样品,测定肝胰腺酸性磷酸酶(ACP)、碱性磷酸酶(AKP)、总超氧化物歧化酶(T-SOD)活力和丙二醛(MDA)含量,并分析肠道先天免疫缺陷基因(IMD)、对虾素3a分子(Penaiedin 3a)、溶菌酶(LZM)和Crustin相关免疫基因的表达量,以探讨低分子水解鱼蛋白对凡纳滨对虾非特异性免疫力和抗氧化能力的影响。结果显示,在低鱼粉饲料中添加适宜水平的低分子水解鱼蛋白能够显著提高对虾肝胰腺T-SOD、AKP和ACP的活力,降低MDA的含量;且1.5%低分子水解鱼蛋白能增加IMD、Penaiedin 3a、LZM和Crustin基因表达量。综上,凡纳滨对虾非特异免疫力和抗氧化能力的降低可能是影响植物蛋白源替代鱼粉的关键原因之一,而在饲料中补充1.0%–1.5%的低分子水解鱼蛋白可有效提高凡纳滨对虾抗病相关基因的表达量,增强其非特异免疫力和抗氧化能力。     

加工鱼产品种类的电泳鉴定

介绍了几种鱼的白肌在乳酸脱氢酶和蛋白电泳表型上种的特异特征。链,镛,草,青,尼罗罗非鱼白肌乳酸脱氢酶的谱带数不同,活性强度亦不同;蛋白质电泳图谱的迁移率也有差异。这类特征可为加工产品的种类鉴定提供可靠判据。鱼类电泳鉴定技术的标准化及其应用将为规范鱼品加工业,检验鱼产品提供理想的检测手段。     

鱼油的提取与精制技术探讨

利用水产加工下脚料提取鱼油并进行精制.探讨了湿法工艺提取鱼油和精炼的工艺,比较了不同脱酸工艺对产品质量的影响,介绍了白土脱色和活性碳脱色工艺条件,并对冬化和脱臭工艺进行了研究.     

我国鱼病生态防治研究情况简述

本文从水产养殖结构调整、鱼类种质改良、养殖水平控制和病原生物量控制四个概述了我国鱼病生态防治研究的状况。     

广东星湖鱼类区系及其特点

为了给星湖国家城市湿地公园科学管理提供依据,2006～2008年对星湖鱼类区系现状进行了系统调查。在星湖5个湖区共设15个监测点,进行了12次调查。结果表明,有鱼类45种,隶属于8目、21科、37属;其中,鲤形目2科、8亚科、18属、19种,占星湖鱼种类的42%;其次是鲈形目7科、7属、11种,占星湖鱼类种数的24%;土著鱼类32种,占星湖鱼类种数的71%;外来物种13种,占星湖鱼类种数的29%。星湖鱼类可分3种生态类型,即洄游型鱼类3种、半洄游型13种、定居性型29种;地理区划为3个区系复合体,即热带平原鱼类区系复合体、中国江河平原鱼类区系复合体、古代第3世纪鱼类区系复合体。星湖鱼类种群变化受制于人类的各项活动,主要经济鱼类为人工放养的奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼、鳙、鲢;其中奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼经过近10年自然繁殖,已发展为绝对优势种。     

基于电子鼻技术的鱼露与鱼酿酱油的品质分析

通过电子鼻获取鱼露、鱼酿酱油和生抽的气味信息,进行主成分分析(PCA)、线性判别分析(LDA)和负荷加载分析(Loadings),并结合氨基酸态氮、盐分、全氮和游离氨基酸含量,对比分析3种调味品的品质。结果显示,3种调味品中游离氨基酸种类丰富,鱼露中苏氨酸、甘氨酸、丙氨酸、甲硫氨酸、赖氨酸的含量明显高于鱼酿酱油和生抽;生抽和鱼酿酱油中鲜味氨基酸的含量明显高于鱼露,但生抽中必需氨基酸的含量远低于鱼酿酱油和鱼露;3种调味品挥发性成分复杂,电子鼻10个金属传感器能很好地区分3种调味品的挥发性气味,W5S、W1S、W2S号传感器比其他7个传感器有更高的响应值,其中W2S号传感器的响应值变化最显著。这说明电子鼻能较好地区分鱼露、鱼酿酱油和生抽,虽然3种调味品中第1、2主成分相同,但醇类、氮氧化合物类物质对第1、2主成分的贡献率不同。     

捕捞诱导鱼类生物学特征进化研究进展

随着捕捞强度加大,渔业生物为了应对捕捞压力、维持种族繁衍,逐渐产生适应性进化,这一过程称为捕捞诱导进化(Fishing-induced evolution,FIE),通常表现为渔业生物个体变小、性成熟提前,个体对捕捞的敏感性增强,进一步导致渔业种群结构简单、生态系统稳定性下降和渔业经济效益降低。认知捕捞诱导的渔业生物适应性进化,掌握捕捞对渔业种群的作用机制,有利于制定科学合理的渔业资源养护与管理策略。虽然FIE方面已进行了大量研究,但FIE在生理、生态及基因层面上对渔业生物的具体影响过程尚未明确,尤其是在气候变化、多物种相互作用等的动态环境中,FIE的作用方式更为复杂。作者综述了鱼类FIE的主要研究方法,总结了捕捞对大个体的选择性在鱼类生长、性成熟和行为方面的影响,并分析了这种影响对渔业种群恢复与管理产生的效应,以及今后需要解决的关键科学问题,旨在为FIE的进一步深入研究和渔业资源的科学管理提供帮助。     

怒江傈僳族自治州的鱼类资源调查

为了保护怒江州的鱼类资源,按照《内陆水域渔业资源调查手册》要求,于2006年1月至2007年底开展怒江州鱼类资源调查。调查范围涉及全州29个乡（镇）中的28个,覆盖了怒江州的内怒江、澜沧江、伊洛瓦底江3大水系的干流和主要支流。云南省怒江傈僳族自治州现有鱼类72种;其中,土著鱼类58种,隶属5目、8科、32属;分析了鱼类组成区系和分布特点,并提出了保护鱼类资源的初步建议。