杨树PIF基因家族成员表达模式研究

[目的]为探究光敏色素相互作用因子(PIF)基因在杨树生长发育中的功能。[方法]利用生物信息学方法预测了杨树基因组中的PIF基因家族成员并对各成员的基因结构、保守基序进行了系统分析;在此基础上,采用实时荧光定量PCR技术检测了PIF成员在不同组织及低温、干旱和Na Cl胁迫下的表达模式。[结果]表明:杨树基因组中至少含有10个Pt PIF成员,这些成员在进化上相对保守,均具有典型的b HLH结构域。基因表达分析显示:Pt PIF基因在杨树不同组织及不同非生物胁迫条件下存在明显的表达差异。[结论]杨树Pt PIF基因家族包含10个成员参与不同的生物学过程,研究结果将为深入解析杨树Pt PIF基因的功能奠定了基础。     

杨树基因工程研究的现状及展望

杨树是重要的栽培树种,具有广泛的用途,同时也是最早开展基因工程研究的树种。迄今为止,杨树基因工程取得了许多重要进展,有近二十个杨属种或杂种获得了转基因植株,一些重要的基因如抗虫基因、抗病基因、降低木质素基因、抗除草剂基因、不育基因等被转入杨树细胞基因组中。通过基因工程育种,有可能获得用常规育种方法很难或需要很长时间才能选育出的具有重要经济价值的杨树新品种。随着杨树基因工程的进一步发展,不仅在理论上推动林木基因工程的研究,也必将为林业生产的可持续发展发挥重要作用。     

基因组水平上杨树NAC基因家族的初步分析

利用其他物种的NAC蛋白,构建NAC结构域的位置特异得分矩阵(PSSM).用PSSM搜索整个杨树Populus L.基因组,获得编码杨树NAC结构域的DNA片段在基因组上的位置信息.然后运用Perl脚本语言从基因组相应位置提取包含基因全长的序列,推测NAC基因的全长、氨基酸序列及其结构特征,并对得到的杨树NAC基因家族进行了系谱发生分析.结果表明:杨树中至少存在132个非冗余的NAC基因,系谱分析表明这些NAC基因归属于14个亚家族,同一亚家族内各基因编码NAC结构域的外显子数量和结合位置的分布具有一定的相似性.     

抗虫转基因杨树的培育及其抗虫性初步研究

以杨树优良新品种欧美杨107(Populus×euramericanacl."74/76")为试材,通过根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)介导法,将Bt毒蛋白基因导入107杨的叶片及茎段外植体,经潮霉素抗性筛选,获得了转基因再生植株。提取转基因植株的总DNA,经PCR扩增,部分植株呈阳性反应,证明目的基因已经整合到杨树基因组中。以转基因杨树叶片饲喂天幕毛虫幼虫的杀虫试验结果表明,转基因杨树表现出一定的杀虫活性。     

转多基因杨树中抗生素标记基因N PT II表达量分析研究

对转基因库安托杨及银腺杂种杨(含1～5个外源基因)中选择标记基因新霉素磷酸转移酶基因(NPTⅡ)进行PCR扩增,证实该基因稳定存在于转基因杨树的基因组中.应用酶联免疫吸附测定法(ELISA)对2种转基因杨树中NPTⅡ蛋白的表达量进行定量检测,结果显示:NPTⅡ蛋白的表达量并没有随着目的基因数量的增加而升高,说明与转单个基因杨树相比,转多个基因杨树可能由标记基因引起的生物安全问题并不会加剧.     

辽宁省杨树栽培区划及适生品种

为了满足辽宁省的杨树栽培需求,在分析辽宁省的自然条件、杨树的生物学和生态学特性基础上,采用田间调查和模糊聚类分析等相结合的方法,将辽宁省划分为4个杨树栽培区、3个杨树组,即慢生杨树组、中生杨树组、速生杨树组;列出4个栽培区适合栽植的杨树品种(无性系)。讨论了山地和盐碱地栽植杨树以及气候变暖对速生杨树栽培的影响等问题。该文为以后辽宁省各地区如何选择杨树品种造林提供了技术支撑,具有较大的实际应用价值。     

杨树基因组SSR标记在康定柳中的通用性分析

SSR分子标记因具有共显性遗传、高度多态性、重复性和稳定性好、易于实现自动化等优点,在遗传育种等方面有着广泛的应用前景。本研究在杨树基因组中随机选取622对SSR引物对来自5个不同群体的康定柳雌雄各20个个体,共计200个进行了通用性分析。结果表明：杨树基因组SSR标记在康定柳中的通用性达到7.88%。     

关于杨树的特性及造林技术的探讨

杨树作为一种常见树种,其生长快、用途广,具有经济价值、社会价值和环保价值等,目前在我国很多地区都有大量栽植。在认识杨树特性的基础上,深入探讨杨树造林技术,期望有利于提升各地区的杨树栽植水平,促进我国林业事业的可持续发展。     

派间杂种110杨再生系统的建立

杨树(Populus spp.)是我国北方地区重要的造林绿化树种之一,因其速生丰产、防风固沙能力强、无性繁殖容易,且基因组较少,而成为林木遗传改良的理想模式植物[1].随着分子生物学的发展和杨树组织培养技术的日趋成熟,人们纷纷把目光转向基因工程,希望在短期内达到改良杨树品种的目的[2].     

杨树钙依赖蛋白激酶基因家族生物信息学分析

为给进一步分离和克隆植物中的CDPK基因奠定基础,以已经鉴定的拟南芥的CDPK(Calcium-dependent protein kinases)基因编码的结构域为检索序列,在基因组水平上对杨树的CDPK基因家族的成员进行分析,结果共找到36个杨树CDPK基因。同时利用这些基因编码的蛋白质序列与拟南芥中的CDPK基因构建了系统进化树,并对这些蛋白序列的保守序列进行了分析。结果表明,杨树CDPK基因内含子的插入位置相对比较保守。与拟南芥相比,杨树CDPK基因家族成员含有更多的基因对。通过对拟南芥、杨树CDPK家族之间进化关系和内含子分布比较发现,一些CDPK家族成员在拟南芥和杨树未分离之前就已经形成。     

工能基因组学:T-DNA介导的基因诱捕和植物基因鉴定(英文)

拟南芥菜、水稻、蕃茄、土豆、玉米、小麦和大豆的全基因组测序为植物细胞和发育生 物学研究提供了许多有用的信息。基因组学的中心任务是利用这些信息去探索蛋白质的功能 和鉴定与发育有关的重要基因。尽管依赖于毁坏基因和产生可识别的突变表型的经典遗传学 方法仍然是极为成功的基因鉴定方法，借助于报告基因结构，随机插入植物基因组的T-DNA 介导的基因诱捕正发展成为植物细胞和发育生物学研究的极强有力的技术。本文描述了基因 诱捕、启动子诱捕和增强子诱捕在植物生物学中的应用，并且希望这些基因鉴定方法有助于 植物分子生物学家和生物技术工作者的研究。     

杨树CDPK基因家族的表达分析及功能预测

为探究CDPK基因在木材形成过程中的作用,本研究在基因组水平上对杨树CDPKs基因家族的成员进行分析,找到32个CDPKs及10个CRKs成员。对CDPK基因家族成员在杨树中表达特性进行了分析,发现其家族成员在不同组织、不同发育阶段以及毛白杨次生维管发育不同时期的表达特性不同。分析杨树CDPK基因家族中3个基因Pt CPK1、Pt CPK6、Pt CPK15,其蛋白质一级结构均存在1个跨膜区,其蛋白定位在细胞膜上。     

A MADS-box gene of Populus deltoides expressed during flower development and in vegetative organs

A MADS-box gene (PdPI) was isolated from a cDNA library constructed from male flower buds of Populus deltoides Bartr. ex Marsh. According to an analysis of genomic DNA structure and putative protein structure, and a phylogenetic study, PdPI is an ortholog of the Arabidopsis PI gene. Relative-quantitative real-time polymerase chain reaction analysis showed that PdPI has a broader expression pattern than PI in Arabidopsis. PdPI was strongly expressed in floral buds and roots and weakly expressed in immature xylem, leaves and apical buds of the male P. deltoides tree. In male inflorescences, PdPI expression was abundant in the perianth and anther, and weak in the peduncle and mature pollen. The large differences in PdPI expression at various phases of male floral bud development were closely related to the development of flower organs (perianth and stamen) and pollen. PdPI was also expressed in female inflorescences. Our results suggest that PdPI has multiple functions in the development of P. deltoides.     

毛白杨PtCDD基因5'片段的原核表达及功能分析

根据GenBank中毛白杨钙离子依赖型脱氧核糖核酸酶(PtCDD)基因序列,以毛白杨形成层区域的cDNA为模板,经PCR扩增出该基因上游637 bp的cDNA片段.将该片段与PET-30b( )载体连接,构建杨树PtCDD基因片段原核表达载体并进行表达研究,获得大量的PtCDD-(HIS)6 融合蛋白.并进一步对该蛋白进行纯化和功能检测.结果表明:PtCDD基因片段能够在大肠杆菌体内表达出具有DNase功能的蛋白,克服了因表达全酶可能强烈降解DNA所带来的不能最终获得表达产物的问题,为今后PtCDD蛋白的抗体制备以及进一步研究奠定了基础.     

The complete chloroplast genomic landscape and phylogenetic analyses of Populus alba L.

Populus alba is a foundation species in evolutionary and ecological studies in the northern hemisphere.In this study, the chloroplast genome and gene map of P.alba were constructed. The P. alba chloroplast genome is156,505 bp in length comprising a large single-copy region, two inverted repeat regions and a small single-copy region. The genome contains 131 genes, including 86 protein-coding genes(77 PCG species), eight ribosomal RNA genes(four r RNA species) and 37 transfer RNA genes(30 t RNA species). Phylogenetic analysis indicates that all Populus chloroplast genome sequences are clustered together and divided into three large branches.Among reported Populus chloroplast genomes, the leuce section formed monophyletic, indicating that all Populus spp. have a common maternal ancestor. P. rotundifolia and P. tremula are closely related and are sisters to P.davidiana. P. alba is closely related to P. adenopoda.Population genetic research in ecology and evolution may be easily developed through chloroplast genomes as they are conserved. This research will benefit future studies related to Populus, one of the world's most ecologically and economically important genera.     

Construction of cDNA Library from Populus euphratica

1 Introduction Populus euphratica is a salt tolerant tree species, which is mainly distributed in the desert regions in northwest China (Wei 1993). Moreover, it is the only large tree species, which can survive and develop into forest in these arid and saline-alkali areas. P. euphratica forest plays a very important role in restraining the expansion of desert, maintaining ecological environment in west China, protecting the biological diversity and raising the local people抯 living standard…     

Construction and Characterization of cDNA Library from Water-Stressed Plantlets Regenerated in vitro of Populus hopeiensis

In order to isolate and clone water-stress-responsive genes, total RNA was extracted from water-stressed plantlets regenerated in vitro of Populus hopeiensis using a QIAGEN RNeasy Plant Mini Kit. CDNA, synthesized by LD-PCR with the SMART cDNA Library Construction Kit, was n vitro packaged into a phage λTriplEx2 vector. The resulting primary library and amplified library have a titer of 1.68×10i6 and 1.69×109 pfu·mL–1 respectively. The combination ratio reached 98.8% and the average size of inserts was about 800 bp. In addition, the percentage of inserted fragments (> 400 bp) was approximately 90%. The results indicate that a cDNA library has been successfully constructed.