利用RAPD标记鉴定豌豆栽培品种(P.sativum)和野生种(P.fulvum)

随机扩增多聚链ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是基于聚合酶反应链（ＰＣＲ）的扩增反应。笔者应用ＲＡＰＤ技术区别Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ和Ｐ．ｆｕｌ－ｖｕｍ１２个品（种）系,并估测这些品（种）系之间的遗传多样性,用１２个１０－ｍｅｒ核苷酸引物扩增出１６８条染色带。估测遗传类型中遗传相似性是基于扩增产品中成对方法比较,遗传树的构建是利用无重量成组方法的平均数（ＵＰＭＧＡ）进行的。７个Ｐ．ｓａｔｉｖｕｍ栽培品种和５个Ｐ．ｆｕｌｖｕｍ材料群集为截然不同的两大组。ＲＡＰＤ的应用将为育种提供豌豆种间遗传关系资料。ＲＡＰＤ－ＰＣＲ鉴定出的物种特殊的强染色体带可以发展为稳定的物种特殊标记用于基因渗入研究。     

中国3大主产棉区棉花品种遗传多样性的RAPD及其与农艺性状关系的研究

 选择我国３大主产棉区不同年代有代表性的３０个陆地棉棉花品种，利用ＲＡＰＤ标记进行棉花品种之间分子标记遗传差异的研究。利用 Ｊａｃｃａｒｄ遗传相似系数计算了 ３０个品种的ＲＡＰＤ数据的遗传距离矩阵，按ＵＰＧ－ＭＡ方法进行聚类，发现３０个棉花品种之间的遗传距离在０．０５～１．５８之间。聚类分析表明，３０个棉花品种可分为３组，品种间的遗传关系与品种自身的系谱有关，大多数品种的遗传基础比较狭窄。同时，１９９９年的田间试验调查了３０个品种的１５个农艺性状。并对农艺性状数据和ＲＡＰＤ数据形成的树状图进行了初步比较，二者的相关系数为０．７６，达显著水平，并且二者获得的聚类结果是相似的，这一研究的遗传距离和遗传相似系数为育种者进行亲本选择和品种遗传变异评价提供了理论依据。     

引物及RAPD标记数对芥菜变种聚类分析的影响

利用ＲＡＰＤ标记对１６个芥菜变种的遗传关系进行研究,并在ＵＰＧＡ聚类分析的基础上建立了亲缘关系系统树图和利用不同的引物数和不同的ＲＡＰＤ标记数对芥菜进行聚类分析。结果表明,聚类结果基本一致。即都可将１６个芥菜变种划分为３组：Ｃ组只有茎瘤芥１个变种,Ａ组和Ｂ组的变种数则略有差异。说明少至２种引物的扩增产物（２７个ＲＡＰＤ标记）也能基本反映１６个芥菜变种间的遗传关系。但随着引物数和ＲＡＰＤ标记数的减少,１６个芥菜变种间的平均遗传距离递减,即从１９种引物、２４０个ＲＡＰＤ标记的７．３４减少到２种引物、２７个ＲＡＰＤ标记的２．３４。而遗传距离的变小,使划分芥菜变种的亲缘关系更加困难。因此,在利用ＲＡＰＤ技术研究芥菜变种间的遗传关系时,有必要保证一定数量的引物和ＲＡＰＤ标记。     

四川主栽小麦品种RAPD标记遗传差异研究

采用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ） 标记,对四川近５０ 年来年推广面积６－６７ 万ｈｍ２（１００万亩）以上的４０ 个小麦主栽品种遗传差异进行了初步探讨。结果表明,５５ 个随机引物中,有３２个引物（ 占５８－２％ ） 扩增产物具有多态性。３２ 个引物共扩增出１８５ 条带,其中９３ 条带（ 占５０％ ）具有多态性,每个引物可扩增出１ ～１１ 条多态性带,平均２－９ 条。４０ 个品种ＲＡＰＤ 标记遗传距离（ＧＤ） 变异为０－０１９ ～０－４７５ ,平均ＧＤ 值为０－２２１。聚类分析表明,在ＧＤ 值０－２３ 水平上,４０ 个品种可聚为５ 类。一些随机引物对有些品种能进行特异性扩增。引物ＯＰＮ１４ 对小麦１ＢＳ 扩增能产生特异性ＤＮＡ 片段,能完全鉴定出４０ 个供试品种中的９ 个１ＢＬ／１ＲＳ小麦－ 黑麦易位系品种。据此认为,ＲＡＰＤ标记可以作为小麦品种鉴定的指纹图谱。     

RAPD技术在烤烟品种资源鉴定及纯度分析中的应用

以３１外优良烤烟品种为材料,从干叶中提取ＤＮＡ,进行ＲＡＰＤ扩增,探索利用ＲＡＰＤ标记鉴定烤烟品种和纯度分析的可能性,结果表明,烤烟品种间有明显差异,利用多个引物可将３１个材料完全分析。     

浙江地方猪种遗传多样性研究

采用蛋白电泳和线粒体 ＤＮＡ ＲＦＬＰ分析方法，研究了浙江七个地方品种猪及浙江野猪的遗传多样性状况⒚从分析的３０ 个遗传座位、９９ 个地方品种个体中发现 ＭＤＨ，ＰＥＰＢ，６ＰＧＤ，ＡＫ，ＡＤＡ，ＰＨＩ六个座位具有多态性，其中ＡＫ，ＭＤＨ 多态座位在家猪中为首次发现⒚多态座位百分比和平均杂合度分别为Ｐ＝ ０２００， Ｈ＝ ００４３⒚用ＵＰＧＭＡ 法对由基因频率所计算的标准遗传距离进行聚类分析，结果显示：浙江地方猪种的亲缘关系很近⒚在ｍ ｔＤＮＡ ＲＦＬＰ水平，２５ 种限制性内切酶在２７ 个地方品种个体及３ 个野猪个体中共检出３０ 种限制性态型，可归结成三种单倍型⒚各单倍型间平均遗传距离（Ｐ）为０００５，群体平均多态度（π）为００００ ８，处于遗传多样性贫乏范围⒚另外对金华Ⅲ系猪的研究表明金华Ⅲ系猪可能有两个母系起源⒚浙江省地方猪种遗传多样性贫乏，可能是由于起源于一个共同的野猪亚种祖先     

利用RAPD标记水稻亲本遗传差异及其在杂种优势中的利用

以１７个杂交水稻亲本、３个新株型株系和２４个光壳稻、爪哇稻品种为ＤＮＡ样品来源,通过随机引物ＰＣＲ扩增基因组ＤＮＡ的多态性,探索ＲＡＰＤ标记水稻亲本遗传差异在杂交稻育种中利用的可能性。研究结果表明,２２个１２碱基随机引物共扩增产物９８个,其中１７个引物可产生多态性产物,所扩增产物的４７．９％ 至少在两个基因型间存在差异。每个ＰＣＲ扩增产物分别以１和０记录存在与否。由ＲＡＰＤ数据计算的Ｎｅｉ＇ｓ遗传距离创建聚类树状图。聚类分析结果表明,籼稻和粳稻容易被分开,普通粳稻又容易与光壳稻、爪哇稻分开,但光壳稻和爪哇稻混合聚在一起。根据聚类图发现普通粳稻亚群内杂种优势较弱,亚群间即生态群间的杂种优势较强,群间即籼、粳亚种间杂种优势更强。利用光壳稻、爪哇稻选育不同生态群方向的恢复系和不育系,已配组育成超强优势的杂交稻组合。     

棉药黄萎病菌致病类型及其分子指纹分析

对２０个大丽轮枝菌菌株的致病性进行了测定和ＲＡＰＤ指纹扩增,完成了供试菌株致病类群与其ＲＡＰＤ指纹组间的相关性分析。结果表明,根据２０个菌株对５个棉花品种的抗感反应及其平均病情指数分为４种不同的致病类群;用１０个随机引物对２０个菌株进行ＲＡＰＤ－ＰＣＲ扩增,产生９２条ＤＮＡ带（其中５１条为多态带）;用计算机进行聚类分析,２０个供试菌株聚类为９个ＲＡＰＤ指纹组。相关性分析表明,致病类群与ＲＡＰＤ指纹     

RAPD鉴定棉花抗（耐）黄萎病品种（系）的遗传变异研究

利用ＲＡＰＤ分子标记技术,结合已知系谱信息,对国内外不同来源的２５个抗（感）黄萎病的棉化品种（系）进行特征及特性分析。从被测试的４０个引物中选取对２５个棉花品种（系）Ｄ 增表现多态性的２６个随机引物,构建２５个棉花品种（系）ＤＮＡ指纹图谱,并进一步分析了遗传多样性。结果表明：供试的２５个棉花品种（系）可划分为４个类群,这与其系谱来源基本吻合。第Ｉ类为国外引入的抗黄萎病品种,第Ⅱ类为陕种“太仓１２１     

福建稻瘟菌群体遗传多样性RAPD分析

以ＯＰＧ、ＯＰＨ、ＯＰＫ等３个系列６０个引物对福建稻瘟菌进行了ＤＮＡ随机扩增多态性（ＲＡＰＤ）分析,６０个引物中有２１１个扩增出多态性条带,表明福建省曙菌群体有丰富的ＲＡＰＤ多态性,可为该菌的遗传分析提供大量的遗传标记,对ＲＡＰＤ条带多样性分析发现龙岩江山病圃稻瘟菌群体遗传多样性较简单,有明显优势种群可能影响其抗瘟评定的代表性较说明多点进行品种抗性理必要的。     

基于SSR小豆新品种(系)DNA指纹图谱构建及亲缘分类初探

为寻求鉴定小豆品种基因型的新途径,对不同地区来源的37个新品种(系)和12个品种资源进行了SSR分析。利用7对SSR引物扩增出的22个多态位点,对供试品种(系)进行了区分,初步构建出供试品种(系)DNA指纹图谱。聚类分析表明,当截值取0.37时,49个小豆材料可划分为7个类群。37个育成品种(系)全部聚在同一类群内,遗传差异相对较小;在育成品种类群内,可划分为8个具有不同特征的亚类群,聚类结果与品种(系)的系谱来源相吻合。地方品种资源内的遗传多样性较高,与育成品种间遗传距离较远。     

不同基因型小麦及其近缘属黑麦的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)对来自我国不同生态区的21个普通小麦(Triticum aestirum L)品种以及3个小麦近缘属栽培黑麦(Secale cereale)品种的遗传差异进行分析.结果表明,黑麦与普通小麦间的分子标记多态性(66.20%)明显高于普通小麦之间的多态性标记(43.90%).冬春性不同的普通小麦品种间的多态性存在着较大的差异,冬性小麦品种间多态性(40.30%)明显高于春性小麦品种间RAPD多态性(14.66%).黑麦与普通小麦间的平均遗传距离(0.5086)是普通小麦品种间平均遗传距离(0.1378)的4倍.聚类分析表明,利用RAPD标记可以将黑麦和普通小麦以及冬春性普通小麦明显划分开来;来自同一选育单位或同一生态区的小麦品种大多都聚在一起.一些引物能对有些品种进行特异性扩增.因此,利用RAPD标记可以进行小麦品种指纹分析,确定基因型之间遗传差异,进一步划分小麦杂种优势群.     

石榴品种资源的RAPD亲缘关系分析

以36份石榴品种(类型)为研究对象,用RAPD技术对其亲缘关系进行分析。从128个随机引物中筛选出12个重复性好、条带清晰的多态性引物,并用这些引物对36份材料进行RAPD扩增,共扩增出111条谱带,平均每个引物9.25条。12个引物扩增出不同的多态性条带,多态性程度达到72.07%。用Statistic分析软件计算出的遗传距离在0.027~0.441之间,并对36份材料进行了UPGA法聚类,RAPD结果的亲缘关系树状图显示,36个品种或类型基因背景较复杂,说明了我国的石榴栽培品种有丰富的种质资源。     

Analysis of Genetic Diversity Among Sweetpotato Landraces in China

Genetic diversity of 48 sweetpotato landraces randomly sampled from Anhui,Fujian, Henan and Guangdong provinces in China was analyzed using RAPD, ISSR and AFLP markers. Thirty RAPD primers, 14 ISSR primers and 9 AFLP primer pairs generated 227, 249 and 260 polymorphic bands, respectively. AFLP markers were better than RAPD and ISSR markers in terms of the number of polymorphic bands detected and the experimental stability. These three molecular markers revealed the similar results that Chinese landraces exhibited a high level of genetic diversity, and the genetic variation of Guangdong landraces was significantly higher than those of the landraces from the other three regions. These results supported the hypothesis that China was a secondary center of sweetpotato diversity. The present results also supported the view that sweetpotato was first introduced to Guangdong and from there spread to other regions of China. The dendrogram based on the combined RAPD, ISSR and AFLP dataset could separate the 48 landraces into two groups: One mainly including 8 landraces from Guangdong and the other consisting of the remaining landraces from Guangdong and landraces from the other three regions. Thus, the utilization of Guangdong landraces should be specially considered in sweetpotato breeding.     

中国甘薯地方品种的遗传多样性分析

 用RAPD、ISSR及AFLP分子标记，对来自中国安徽、福建、河南和广东4省的48个甘薯地方品种进行遗传多样性分析。用30个RAPD引物、14个ISSR引物和9对AFLP引物分别扩增出227条、249条和260条多态性带。从多态性带的数量和实验稳定性看，AFLP标记优于RAPD和ISSR标记。3种分子标记得出的结果，均揭示中国甘薯地方品种的遗传变异十分丰富，支持中国是甘薯的次生多样性中心的观点。品种遗传变异的地区间差异比较表明，广东地区的地方品种遗传变异高于其余3省，并且达极显著差异水平，从分子水平揭示广东应是中国甘薯的最早引入地，并向周边省及内陆地区扩散。研究发现，由3种标记产生的聚类图存在一些差异，但将3种标记产生的多态性带结合产生的聚类图可以很好地揭示48个地方品种的亲缘关系，所有品种聚为两大类，一类以8个广东地方品种为主，另一类由剩余的8个广东地方品种和其余3省的32个地方品种组成。因此，在进行甘薯育种时应重点考虑广东地方品种的利用。     

安徽省辣椒疫霉菌株遗传多样性的RAPD分析

通过利用RAPD(Random Amplified Polymorphic DNAs)随机引物中筛选到的可扩增出清晰条带、主带明显、稳定的10条引物,对来自安徽合肥、淮南、和县、潜山、岳西、江苏南京和四川邛崃等县市的发病辣椒上分离鉴定获得23个辣椒疫霉菌(Phytophthora capsici)进行全基因组DNA RAPD标记遗传多样性分析。选用引物共标出DNA指纹图带113条,其中多态性条带96条,多态性检测率为84.96%,表明辣椒疫霉菌具有较丰富的遗传多样性。根据引物扩增的DNA指纹图谱,运用UPGMA法分析,以遗传相似系数0.7为阈值,供试菌株被划分为3个遗传聚类组,除部分相同地理来源的菌株被划分为同一组外,其他不同菌株间的遗传相似性与地理来源无直接相关性。     

新疆小麦地方品种遗传多样性的SSR分析

为了评价新疆小麦地方品种的遗传多样性,利用42对SSR引物对75份新疆小麦地方品种进行遗传多样性分析。结果表明：在75份地方品种中42个SSR位点共检测到317个等位变异,等位变异变化范围为2~15个,平均7.55个;多态性信息指数(PIC值)变化范围为0.169~0.905,平均0.696。基因组的平均等位变异是D＞B＞A,遗传多样性指数为B＞D＞A。聚类分析表明75份供试新疆小麦材料可划分为3大类8亚类,聚类结果与材料的生态型密切相关,冬小麦地方品种和春小麦地方品种分别归属不同的类或亚类,春小麦地方品种的遗传多样性高于冬小麦地方品种,同时也反映了一定的地域特性。总之,新疆小麦地方品种具有丰富的遗传多样性,可用以拓宽育成品种的遗传基础。     

Genetic Diversity of Chinese and Swedish Rapeseed (Brassica napus L. ) Analyzed by Inter-Simple Sequence Repeats (ISSRs)

We have compared genetic diversity of 24 Chinese weak-winter, Swedish winter and spring B.napus accessions by inter-simple sequence repeats (ISSRs). By cluster analysis (UPGMA) based on 125 polymorphism bands amplified with 20 primers, the 24 accessions were divided into three groups. Six Swedish winter lines and eight Chinese weak-winter lines were in the group Ⅰ and the group Ⅱ were two Chinese weakwinter lines Xiangyou15 and Bao81. The third group contained eight Swedish spring lines. Principal co-ordinates analysis (PCO) showed similar groupings to cluster analysis. Results from cluster analysis and PCO analysis showed very clearly that Chinese weak-winter, Swedish spring and winter accessions were distinguished from each other and Chinese weak-winter accessions in this study were genetically closer to Swedish winter accessions than to Swedish spring accessions. The Chinese weak-winter accessions had larger diversity than Swedish spring or winter accessions did. This study indicated that ISSR is a suitable and effective tool to evaluate genetic diversity among rapeseed germplasm.     

新疆早熟陆地棉SSR标记遗传多样性分析及指纹图谱构建

采用SSR分子标记对41份北疆地区早熟陆地棉品种进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。最终100对引物筛选出8对多态性较好引物,共检测50条带,其中多态性33条,多态性比率66%,每对引物平均扩增到6.25条条带。多态信息含量(PIC)为0.568 0~0.784 6,平均值为0.646 2。聚类分析表明,供试材料在遗传距离为0.42时可划分为3类,第3大类又可以划分为2大亚类,多数品种属于第3大类。利用其中7个特异性标记引物获得的数据构建供试材料的分子指纹图谱。新陆早系列在选育过程中亲本的来源较为广泛,遗传背景较复杂,获得的SSR分子指纹图谱能够用于新疆早熟陆地棉品种及相关材料的鉴定。     

芥菜遗传多样性的RAPD分析

随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）是一种新的分子标记技术,利用ＲＡＰＤ标记对芥菜（Ｂｒａｓｓｉｃａ ｊｕｎｃｅａ Ｃｏｓｓａ）１６个变种的遗传多样性进行了分析,从６０个１０ｂｐ随机引５物中筛选出２７个有效的,这２７个有效引物共扩增出３３６条ＤＮＡ带,其中２７５条为多态性带,占总数的８１．８５％,平均每个引物扩增出的ＤＮＡ带数为１２．４４,不同引物扩增出各自不同的ＤＮＡ指纹图谱,大部分图谱均有特征或特