中国水产科学研究院牵头完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制

由中国水产科学研究院首席科学家孙效文研究员牵头,中国水产科学研究院联合黑龙江水产研究所、中科院基因组研究所、哈佛大学、奥本大学等单位组建的国际合作研究团队,完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,成为国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果以Article形式于2014年9月21日在国际生物学权威期刊《自然-遗传学》(Nature Genetics)杂志在线发表(DOI 10.1038/ng.3098)。     

朱鹮全基因组序列图谱绘制完成

4月15日,西安交通大学和华大基因在西安交通大学科学馆召开新闻发布会,宣布朱鹮全基因组序列图谱绘制完成。这是继家鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,世界上完成的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱,其对于挽救和保护朱鹮和注释生命现象具有重要科学价值和战略意义。     

科技动态

<正>我国科学家完成大黄鱼全基因组测序日前,由浙江海洋学院领衔,与上海交通大学、复旦大学等机构联合破译了大黄鱼全基因组测序,构建了大黄鱼基因组图谱,并成功解析其先天免疫系统基因组特征。该研究成果发表在《Nature Communications》杂志上。据介绍,大黄鱼全基因组测序是我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,标志着我国大黄鱼研究进入组学时代。大黄鱼免疫基因信息的充分解     

鲤鱼白细胞介素10基因组DNA克隆及序列分析

为获得鲤鱼白细胞介素10(interleukin 10,IL-10)全长基因组序列,本研究利用鲤鱼IL-10全长cDNA序列(GenBank登录号:JX524550),通过在两端非编码区设计引物,以提取的鲤鱼脾脏基因组为模板,使用PCR方法成功获得鲤鱼IL-10全长基因组序列。鲤鱼IL-10基因组全长2176 bp,GenBank登录号为JX524551。将所获得的序列与其他物种IL-10基因组序列相比,结果发现都含有5个外显子,4个内含子,外显子在进化上相对保守,剪切位点都符合"gt......ag"规则;序列包含540 bp的开放阅读框,编码179个氨基酸,有2段典型的IL-10氨基酸信号基序。     

中国科学家完成世界首个鲤鱼基因组图谱绘制

<正>中国水产科学研究院黑龙江水产研究所8日对外发布,由该院孙效文研究员领衔的国际合作研究团队,完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制,并揭示其独特的全基因组复制事件,这是国际上首个完成全面解析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究成果近日发表于《自然-遗传》(Nature Genetics)杂志。鲤鱼是全球分布和养殖范围最广泛的经济鱼类之一,是中国具有代表性的淡水养殖鱼类,是最有条件利用基因组资源进行品种改良的水产养殖物种。鲤鱼基因组由100条染色体组成,是迄今完成全基因     

浙东白鹅全基因组序列图谱绘制完成

近日,浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所、华大基因研究院联合召开新闻发布会宣布,以浙东白鹅进行的首个鹅全基因组序列图谱已经绘制完成。这是我国独立研究完成的全世界首个鹅全基因组序列图谱。鹅全基因组序列图谱绘制由浙江省农业科学院、象山县浙东白鹅研究所和华大基因研究院共同主持完成,基因组大小约为1.2Gb     

我国家蚕基因组的最新研究——对家蚕基因组精细图和40个蚕类基因组遗传变异图的解读

2008年12月,西南大学家蚕基因组研究团队宣布了世界上第1张家蚕基因组精细图谱的诞生。家蚕基因组精细图和2003年发布的家蚕基因组框架图相比,具有基因覆盖度高、基因组组装更加完整、基因鉴定更加准确等特点。2009年,该研究团队在家蚕基因组精细图的基础上,选取具有代表性的29个家蚕突变品系和11个不同地理来源的中国野桑蚕品系进行了全基因组重测序与序列比较分析,共获得了29个家蚕突变品系和11个中国野桑蚕地理品系的全基因组序列,绘制完成了世界上第1张基因组水平上的蚕类单碱基遗传变异图谱,同时还发现了驯化对家蚕生物学性状影响的基因组印记,从全基因组水平上揭示了家蚕的起源进化。2009年8月,《Science》杂志发表了西南大学的研究论文"40个蚕类基因组的重测序揭示了家蚕的驯化事件及驯化相关基因",标志着家蚕基因组计划进入一个新的历史阶段。     

牛基因组研究进展

本文分牛基因组遗传图谱、物理图谱、全基因组序列图与转录组研究四个部分介绍了牛基因组学研究进展.最新的牛遗传连锁图谱由4 585个标记组成,平均图距精确到1.2 cM,是研究牛数量性状位点、定位克隆生产性状相关基因进行分子辅助育种的蓝图.基于限制性酶切指纹图与末端测序技术对294 651个BAC克隆分析拼接成的物理图谱,覆盖约15.8倍基因组,为牛全基因组测序和组装提供了框架.融合了全基因组鸟枪法和逐步克隆法绘制的牛基因组草图,包含了26 052 388个可用测序读长,覆盖约7.0倍基因组,拼接成2.87 Gb的基因组序列.牛各个组织器官的cDNA文库构建和EST测序以及基因芯片方面的基因转录和表达的研究,将阐释更多的泌乳、繁殖、产肉和疾病抵御力等重要性状相关功能基因,从而将更多的基因应用到牛的分子辅助育种上.     

科学家绘出鸡的基因组序列草图和遗传差异图

由多国科学家组成的两个小组3月1日宣布绘出鸡的基因组序列草图和遗传差异图谱,这两项成果在禽流感防治、培育优质鸡种、改善食品安全和增进人类健康等领域都将有应用价值。其中鸡遗传差异图谱的绘制工作由中国科学院北京基因组研究所负责。美国国家人类基因组研究所在一份新闻公告中说,在该所资助下,美国华盛顿大学威尔逊博士领导的一个小组经过一年工作,已首次成功测绘并组装出鸡的基因组序列草图并已存入公共数据库。这也是迄今完成的首张禽鸟类物种的基因组序列草图。科学家们选择了家鸡的远祖——红原鸡为测绘对象,绘出的草图中约包含1…     

科学家绘出鸡基因组序列草图和遗传差异图

由多国科学家组成的两个小组近日宣布绘出鸡的基因组序列草图和遗传差异图谱 ,这两项成果在禽流感防治、改善家禽和人类健康等领域都将有应用价值。其中鸡遗传差异图谱的绘制工作由中国科学院北京基因组研究所负责。美国国家人类基因组研究所资助的美国华盛顿大学威尔逊博士领导的一个小组经过一年的工作 ,已首次成功测绘并组装出鸡的基因组序列草图。这也是迄今完成的首张禽鸟类物种的基因组序列草图。科学家们选择了家鸡的远祖———红原鸡为测绘对象 ,绘出的草图中约包含 10亿个碱基对。科学家们已将鸡基因组序列草图数据存入公共数据库 …     

基因芯片技术在畜牧业中的应用

DNA芯片（DNA chip）技术是20世纪90年代中期以来影响最为深远的重大科技进展之一,是近年来生命科学与微电子学等学科相互交叉的一门高新技术.该技术通过设计不同的探针阵列,使用特定的分析方法可以具有多种不同的应用价值,如基因表达图谱测定、基因突变检测、基因多态性分析、基因组文库作图及杂交测序等,为＂后基因组计划＂时期基因功能的研究及现代医学发展提供了强有力的工具,将在新基因的发现、基因诊断、药物筛选、给药个性化方面取得重大突破.     

用改进的酚-氯仿法提取鱼类基因组DNA效果的分析

提取鱼类基因组DNA的研究报道并不多见,效果也各有差异。本文以泰山螭霖鱼、东平湖鲤鱼、东平湖鲫鱼为材料,采用改进的酚-氯仿法提取基因组DNA,并进行了紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳、微卫星PCR扩增等方法的鉴定。结果表明,本方法提取的基因组DNA浓度在0.9μg/μL~3.25μg/μL之间,A260/A280比值在1.79~1.87之间,电泳条带整齐明亮,适合微卫星PCR扩增,且整个操作过程使用试剂较少,简单易行。     

高密度SNP芯片及其对肉牛育种影响的研究进展

近年来先进的测序和基因分型技术促进了肉牛育种方法的革新。从过去低通量、耗时的限制性片段多态标记(RFLP)到如今高通量、高密度的单核苷酸多态性(SNP)标记,基因检测效率大幅提高。随着肉牛基因组序列图谱及SNP图谱的完成,基于高密度SNP标记的牛全基因组选择成了牛育种的新热点。作者立足高密度SNP芯片对肉牛育种的影响,综述高密度SNP芯片及和下一代测定技术及肉牛全基因组选择的研究进展,阐明高密度SNP芯片对多品种全基因组选择的模型的建立及准确的预测基因组育种值极其重要。     

AnnualReviewofEntomology：家蚕基因组序列解析推动了家蚕的前沿研究

自从2003年家蚕全基因组框架图测序计划完成以来，基于基因组序列的家蚕比较基因组学与功能基因组学研究得到了极大的推动。近10年来，中国西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室领衔先后完成了家蚕全基因组精细图、全基因组遗传变异图及转录组图谱构建，并重点开展了家蚕丝蛋白合成及免疫抗性等性状形成的分子基础解析；中国科学院上海植物生理生态研究所及华南师范大学长期致力于家蚕变态发育的分子调节机制研究。     

我国科学家成功破译飞蝗基因组图谱

正1月16日记者从中科院获悉,由该院动物研究所康乐院士领衔,深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究,成功破译了飞蝗的全基因组序列图谱,这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息,科学家们还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。飞蝗是世界性的重要农业害虫,在过去近百     

“千人基因组计划”发布高精度遗传变异图谱

由中、美、英等国共同发起的大型国际合作项目"千人基因组计划"的最新研究成果10月31日在《自然》杂志上在线发表。该协作组公布了高分辨率的人类基因组遗传变异整合图谱,将为基因组学在人类疾病与健康领域中的应用,以及个体化医疗时代的到来奠定坚实基础。"千人基因组计划"2008年年初由中国华大基因、英国桑格研究所及美国国立人类基因组研究所等机构共同发起,最终将对2500个体的基因组进行测序,绘制最详尽的人类基因多态性图谱,寻找基因与人类     

用改进的酚-氯仿法提取鱼类基因组DNA效果的分析

提取鱼类基因组DNA的研究报道并不多见,效果也各有差异。本文以泰山螭霖鱼、东平湖鲤鱼、东平湖鲫鱼为材料,采用改进的酚-氯仿法提取基因组DNA,并进行了紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳、微卫星PCR扩增等方法的鉴定。结果表明,本方法提取的基因组DNA浓度在0．9μg／μL～3．25μg／μL之间,A260／A280比值在1．79～1．87之间,电泳条带整齐明亮,适合微卫星PCR扩增,且整个操作过程使用试剂较少,简单易行。     

家蚕基因组计划序曲

<正>1995年,向仲怀院士与中国科技大学李振刚教授共同提出中国家蚕基因组计划设想。实验室随即启动家蚕近等位基因系构建和基因组测序品种"大造"等的近交系培育。1998年,本实验室参与"国际蚕分子育种计划",开始了家蚕分子连锁图谱研究。2000年10月,中国蚕学会学术年会在西安召开,理事长向仲怀院士作"基因组生物学的发展与家蚕基因组计划"的报告。     

跨世纪研究项目——动物基因组计划

跨世纪研究项目──动物基因组计划张守印（解放军农牧大学图书馆，长春１３００６２）动物基因组计划就是建立一个包含各种动物全部基因的基因图谱，其核心是对各个基因的定位。这种图谱包括基因的名称、基因在染色体上的位置及与相邻基因的距离、基因的核苷酸序列和功能...     

犬基因组研究概况

美国科学家在2005年12月8日出版的《自然》杂志上公布了一头1岁拳师犬的完全基因组图谱,该图谱将有助于理解一些特定基因的演化,并将促进对人类和犬类共患疾病的研究。这次由政府资助、美国国家人类基因组研究所领导的“犬基因组计划”是于2003年6月正式启动的。研究小组用了一