用MTDFREML方法估计优质细毛羊主要经济性状的遗传参数

遗传参数估计是家畜育种工作的一项基本任务，因为育种方案的制定必须以准确、可靠的遗传参数估计为前提条件。国内外的大量研究证明，REML（restricted maximum likelihood）法是目前动物育种中遗传参数估计比较理想的方法。由于REML方法计算比较复杂，Graser在1987年提出了REML的非求导（derivative-free）算法，其基本思想是根据观察值向量线性函数K’Y的似然函数，用非求导方法使自变量在参数空间内变化取值而得到似然函数的极值，从而估计方差组分。这一相对简单的算法使得REML方法在动物育种中得以广泛应用。     

方差组分的最大似然估计

一、引言方差组分估计又称方差分量分析,它大大开阔了方差分析的应用领域.尤其在动植物遗传育种的研究中很有用处,在家畜育种中,多数情况下的遗传参数可以用遗传方差和遗传协方差表示.目前方差组分估计已广泛应用于动物育种的以下几个方面1.构造选择指数.2.混合模型最佳线性无偏估计(Blμp法).     

估计猪早期生长性状和繁殖性状的动物模型比较

分析了三种模型对出生重，21、60、90日龄重，总产仔数，以及出生窝重性状遗传参数估计中的加性遗传效应、母体效应、窝效应和残差效应的方差组分、遗传力及其变化趋势。结果表明，出生重、21日龄重和60日龄重采用包含加性遗传效应、母体效应、窝效应和残差效应的模型进行估计比较适宜。90日龄重、总产仔、产活仔和出生窝重性状采用包含加性遗传效应、母体效应和残差效应的模型进行估计效果较好。     

基于多性状动物模型估计大白猪、长白猪生长性状的遗传参数

<正>猪生长性状和繁殖性状是重要的经济性状,测定并评估这些性状的遗传参数,对制定选种的方法、设计选择指数、预测选种进展和提高选种效果,都有一定的现实意义。根据统计学的基本原理,种猪育种中遗传参数的估计,实际上就是计算数学模型中各影响因子的方差组分,进而利用方差组分估计遗传力、重复力、遗传相关等遗传参数。只有得到了准确的遗传参数,才能估计出准确的育种值,从而实现准确的遗     

杜洛克公猪背膘厚度、日增重、日采食量和饲料效率相关性状的遗传参数估计

对384头扬翔华系杜洛克公猪生长育肥阶段背膘厚度(BF)、日增重(ADG)、日采食量(ADFI)、饲料转化率(FCR)和剩余采食量(RFI)5个性状用DMU程序进行遗传参数估计探究杜洛克公猪的遗传参数。结果表明, ADFI和RFI的遗传方差占表型方差的比例分别为87.73%和84.91%;BF和ADG的遗传方差占表型方差的比例分别是58.77%和58.91%;RFI与BF、ADG的表型相关系数均为零,而遗传相关系数分别为-0.22和0.15;RFI与ADFI的表型、遗传相关系数分别为0.98和0.99,RFI与FCR的表型、遗传相关系数分别为0.44和0.81。多性状模型与单性状模型的估计遗传力基本趋于一致,ADG和FCR遗传力分别是0.27和0.19,属于低遗传力性状;而BF、ADFI和RFI的估计遗传力在0.31～0.46范围,属于中等遗传力性状。     

中国西门塔尔牛肉用群体重要经济性状遗传参数估计

本研究旨在对出生于2008-2013年的中国西门塔尔牛肉用群体的重要经济性状进行遗传参数和方差组分估计,该群体大小为2 939头。采用非求导约束最大似然法估计遗传力、遗传相关和方差组分。结果显示,初生重、断奶重、出栏重、胴体重、屠宰率和净肉率的遗传力估计值分别为0.48、0.44、0.43、0.38、0.31、0.39。其中,初生重和断奶重的遗传相关估计结果为0.57,出栏重和胴体重的遗传相关为0.94,屠宰率和净肉率的遗传相关为0.89。该群体的生长和屠宰相关性状均属于中高遗传力性状,且性状之间具有较高的遗传相关。本研究对中国西门塔尔牛肉用群体重要经济性状的遗传参数做了系统评估分析,为将来制定育种方案和遗传评估奠定基础。     

长白、大白猪窝性状遗传参数估计

本研究旨在估计北京、天津地区长白猪、大白猪窝性状的遗传参数，为该群体进一步制定合理的育种计划和方案提供依据。收集种猪场2016—2021年3 906头长白母猪的11 583窝数据和22 070头大白母猪的62 210窝数据，利用R v4.2.2软件对影响窝性状的固定效应进行显著性检验，运用DMU 6.0软件对长白猪、大白猪的总产仔数（Total Number Born,TNB）、产活仔数（Number Born Alive,NBA）、初生窝重（Litter Birth Weight,LBW）、平均个体初生重（AverageBirth Weight,ABW）、仔猪均匀度（PigletUniformity,PU）进行遗传参数估计，采用单性状重复力模型估计各性状的方差组分，采用双性状动物模型估计性状之间的遗传相关，并分析分娩胎次对各性状的影响。结果显示：分娩场次、年份、胎次对窝性状影响显著（P<0.001），长白猪的TNB、NBA、LBW、ABW、PU遗传力分别为0.095±0.015、0.090±0.014、0.106±0.017、0.192±0.021、0.023±0.014，大白...     

利用Bayesian-MCMC方法进行畜禽远交群多家系离散性状QTL连锁检测

利用Bayesian—MCMC方法对不同家系结构的畜禽远交群体的二级离散性状进行QTL连锁检测，在分析中，基于IBD方差组分的随机模型的定位策略，同时利用MCMC的3种不同抽样技术（Gibbs抽样、Metropolis抽样和Reversible jump MCMC抽样）产生相应QTL参数的后验样本，在此基础上进行目标参数的Bayesian统计推断。结果表明：Bayesian—MCMC方法能够对QTL数目进行准确估计，并且在不同家系结构下得到较为理想的参数估计结果。     

大白猪、长白猪繁殖性状的遗传参数估计

<正>养猪生产中,随着胴体瘦肉率逐渐达到最佳水平,母猪繁殖性能的改良对追求利益最大化更加重要。而准确的估计繁殖性状遗传参数,对估计育种值、预测遗传进展及优化育种方案是必不可少的~([1])。本文根据全国生猪遗传改良计划遗传评估的方法,对天津市某两家国家核心育种场主要品种大白猪、长白猪的繁殖性状总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生窝重(LBW)的遗传参数进行估计,包括各性状的方差组分、遗传力和遗传相关的分析。目的是奠定目     

数量性状方差组分的估计方法(续)

四、方差组分的其它估计方法除了极大似然法外,还有许多方法,如MIVQUE、MINQUE以及Henderson法等。下面我们将作一简单介绍。 (一)MINQUE法根据Henderson的算法,MINQUE估计方差组分的公式为: