烟草分子遗传连锁图谱构建

DNA分子标记已广泛应用于植物遗传连锁图谱构建,烟草分子标记遗传连锁图谱的构建始于2001年,已经构建了4张SSR分子标记遗传连锁图。较高密度的分子图谱能有效地应用于烟草不同栽培类型若干数量性状的基因定位、基因图位克隆、比较基因组学和分子标记辅助育种等研究。因此,进一步构建烟草不同栽培类型高密度的遗传连锁图具有重要意义。     

SRAP标记在植物性状标记和遗传图谱构建中的应用研究进展

由于SRAP标记简便、快速、不需预知物种的序列信息,近年来已广泛应用于植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因连锁标记、基因定位、比较基因组学研究及杂种优势预测等研究。基于此,综述了SRAP分子标记在植物性状标记和遗传连锁图谱构建方面的应用进展,以便为今后的研究提供相应的理论依据。     

绵羊遗传连锁图的研究现状

随着DNA分子标记不断增加和各国对畜禽基因组计划的逐步开展，一些重要的畜禽(如牛、猪、绵羊、鸡等)的遗传连锁图谱的研究工作取得了巨大的成就。本文对绵羊的主要参考家系、构建遗传连锁图的分子标记的选择、绵羊的遗传连锁图的研究现状以及展望进行综述。     

DNA分子标记在落叶果树上的应用

综述了分子标记在落叶果树品种鉴定、遗传多样性、分子标记连锁图谱的构建及基因定位与标记方面的研究，分子标记在果树上的应用仍较落后，离实际应用尚有距离应同常规技术研究应用相结合，加快分子标记在果树上的应用进程。     

橡胶树SSR-SRAP-AFLP标记遗传图谱构建

利用橡胶树GT1与IAN873杂交组合183株实生苗的F1代群体作为构图群体,利用SSR、SRAP、AFLP等3种分子标记对该群体进行遗传连锁分析,构建1张包括18个连锁群、372个标记位点的橡胶树分子遗传连锁图(LOD≥3),其中包括19个SSR标记、73个SRAP标记、280个AFLP标记,连锁图谱的总图距覆盖1 735.9 c M,所有标记间的平均图距为5.22 c M。在此连锁图谱上的标记区间为[8,46],所有连锁群长度区间为[55.3 c M,134.7 c M]。LG9连锁群包含标记最少为8个;LG1连锁群包含标记最多为46个;LG1的平均图距最小为2.80 c M;LG17的平均图距最大为7.92 c M。总图谱中存在图距大于20 c M的空隙为5个。     

利用AFLP标记构建家蚕分子连锁图谱

 ＡＦＬＰ技术构建了家蚕分子标记连锁图谱,在扩增中使用了１８组双引物及两个单引物在家蚕品系７８２和ｏｄ １００的回交子代中得到了１１７７个扩增位点,有３５９个非分离位点,８１８个分离位点。分离位点中有２９２个位点符合孟德尔１：１分离比例。用ＭＡＰＭＡＫＥＲ软件将２９２个标记位点及形态标记基因ｏｄ分成２６个连锁群,１９个二联体及８１个未进入连锁关系的标记。每个连锁群包含３～１４个标记。平均为 ６．５个标记。该连锁图总图距为 ３２８５．５ｃＭ。标记间平均距离为 ２０．０ｃＭ。形态标记ｏｄ被定位于该图谱中 ３号连锁群上,而ｏｄ基因位于家蚕Ｚ染色体上,故可确定该分子标记连锁群对应于传统的家蚕形态标记图谱中的Ｚ染色体。     

芜菁花青素合成途径已克隆基因In Silico定位

以构建的芜菁SSR分子标记遗传连锁图谱与“津田”芜菁基因组重测序数据为基础,将本实验室已克隆的30个芜菁花青素合成相关结构基因与调节基因,通过序列比对的方法分别定位到10条连锁群的不同分子标记区间,并对这些花青素生物合成途径相关基因的结构与分布进行精确分析,为芜菁花青素合成候选基因关联分析、图位克隆和深入研究花青素合成基因上游调控元件提供基础.     

棉铃虫对转Bt棉抗性遗传的AFLP连锁图谱分析

利用AFLP分子标记方法,对抗Bt棉棉铃虫（Helicoverpa armigera）抗性品系和敏感品系回交BC1代（F1（YCR♀×YCS♂）♀×YCR♂）群体进行连锁图谱的构建。经23组AFLP引物的选择性扩增,共得到406个多态位点,√检验后有217个为有效位点。利用Mapmaker／Exp（Version3．0b）软件进行连锁分析,其中126个标记分属35个连锁群,连锁群标记数变化范围为2～11个,平均每个连锁群标记数为3．6个,该图覆盖的基因组长度为1138．4cM（图距单位）,连锁群长度变化范围为4．0～166．1cM,连锁群的平均长度为32．53cM。连锁图谱的构建为棉铃虫对抗Bt棉抗性基因的定位奠定了基础。     

植物非整倍体及其在遗传研究上的应用

植物单体、三体、缺失体等非整倍体是遗传研究和染色体工程育种的重要基础材料,在基因及分子标记的物理定位、确定连锁群与染色体的对应关系上具有不可替代的作用.随着分子标记技术的不断进步,创建和研究新的系列非整倍体工具材料对促进基因及分子标记的染色体定位,进而实现目标基因的克隆和应用具有重要意义.     

与EST-SSR连锁的抗性候选基因潜在功能分析

利用课题组已开发的80个具有良好多态性的EST-SSR标记对已构建的遗传连锁图进行加密.结果表明,共有16个EST-SSR标记在父母本间具有良好的多态性,多态性标记频率为20%；后代群体基因型数据经x2测验符合1:1分离比例；经连锁分析,16个差异EST-SSR标记被整合到已构建的具有19个连锁群的分子遗传连锁图谱中,...     

高丹草AFLP分子遗传连锁图谱的构建

【目的】对高丹草低氢氰酸含量及产量等重要性状进行QTL定位,构建其AFLP分子遗传连锁图谱,为分子标记辅助育种等研究奠定基础。【方法】以散穗高粱×红壳苏丹草杂种F2代305个分离单株为作图群体,利用AFLP分子标记技术先从供试AFLP引物中筛选适宜引物对,再用这些引物对对其供测群体进行PCR扩增;根据扩增原始数据,利用Join Map 3.0作图软件进行高丹草分子遗传连锁图谱构建。【结果】从113对AFLP引物组合中筛选出了25对多态性丰富、重复性好、条带清晰的适宜引物,对高丹草F2分离群体305个单株的基因组DNA扩增,得到444个AFLP分子标记位点,据此构建的高丹草遗传图谱包含10个连锁群,覆盖的基因组总长度为1 468.12cM,各连锁群的长度变幅为114.24~189.34cM,标记间平均图距为3.38cM。【结论】成功构建了一张密度较高的高丹草分子遗传连锁图谱。     

利用AFLP构建大白菜高密度遗传连锁图谱

以大白菜根肿病抗性材料CR Shinki DH系和感病性材料大白菜自交系94 SK杂交F2的138个单株作为构建遗传图谱的群体。利用AFLP技术通过45对引物筛选共获得835个AFLP标记,应用其中608个AFLP标记和6个与抗根肿病基因CRb紧密连锁的AFLP标记转化成的SCAR标记构建了一张包含556个标记位点、10个连锁群、覆盖基因组长度为795 cM的连锁图谱。该图谱中每个连锁群上的标记数在10~83个之间,平均图距在0.86~4.34 cM之间,连锁群长度在43.4~120.9 cM之间。CRb基因定位于第3连锁群9 cM的范围内。     

鲤遗传连锁图谱的构建

利用JoinMap 4.0软件包,以德国镜鲤选育系为祖父母所培育的自交F2群体的68个个体为作图群体,首次以新型分子标记单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)为主要作图标记,以微卫星(Simple Sequence Repeats,SSR)和表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)为辅助标记,采用CP(CrossPollinators)模型构建鲤的遗传连锁图谱。构建的遗传连锁图谱含有560个标记(174个SSR标记、41个EST-SSR标记和345个SNP标记),分布在50个连锁群上,最大连锁群由60个标记组成,最小连锁群仅含2个标记,平均每个连锁群有11.2个标记。最大连锁群的图距为198.1厘摩(centimorgan,cM),最小的连锁群图距为1.5 cM,图谱总图距为3 295.92 cM,标记间平均间距为7.21 cM,图谱覆盖率为76.26%。构建的图谱为中等密度的遗传连锁图谱可为进一步的鲤相关经济性状的QTL定位研究和分子标记辅助选择育种(MAS)打下基础。研究亮点:首次以新型分子标记SNP为主要作图标记并以SSR标记为...     

花生分子标记的研究进展

介绍了应用于花生的主要分子标记类型及其种质资源的遗传多样性、指纹图谱、抗性基因的标记和遗传连锁图构建等,并综述了SSR引物的数量。     

鲤遗传连锁图谱的构建

利用JoinMap 4.0软件包,以德国镜鲤选育系为祖父母所培育的自交F2群体的68个个体为作图群体,首次以新型分子标记单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）为主要作图标记,以微卫星（Simple Sequence Repeats ,SSR）和表达序列标签（Expressed Sequence Tag,EST）为辅助标记,采用CP（Cross Pollinators）模型构建鲤的遗传连锁图谱。构建的遗传连锁图谱含有560个标记（174个SSR标记、41个ESTSSR标记和345个SNP标记）,分布在50个连锁群上,最大连锁群由60个标记组成,最小连锁群仅含2个标记,平均每个连锁群有11.2个标记。最大连锁群的图距为198.1厘摩（centimorgan,cM）,最小的连锁群图距为1.5 cM,图谱总图距为3 295.92 cM,标记间平均间距为7.21 cM,图谱覆盖率为76.26%。构建的图谱为中等密度的遗传连锁图谱可为进一步的鲤相关经济性状的QTL定位研究和分子标记辅助选择育种（MAS）打下基础。     

长果种黄麻SRAP标记遗传连锁图谱的构建 及3个质量性状基因定位

 【目的】构建黄麻遗传连锁图谱,定位质量性状基因,为今后有关黄麻基因组结构、重要农艺性状QTL定位、分子标记辅助育种和基因克隆等研究工作奠定基础。【方法】以甜麻（黄麻野生种）和宽叶长果（黄麻栽培品种）为杂交亲本,构建了187个F2单株作为作图群体,利用513对SRAP引物进行遗传图谱构建,并对3个质量性状基因（托叶色、叶柄色、叶缘色）进行了定位。【结果】122个SRAP多态性标记位点和这3个形态学标记被定位在该图谱上,初步构建的长果种黄麻遗传连锁图谱全长2 231.9 cM,包含10个连锁群,每个连锁群有2—38个标记位点,2个标记间平均间距为17.86 cM。【结论】该图谱上的标记位点均匀分布在10个连锁群上,没有出现标记位点聚集的现象,表明SRAP标记十分适合黄麻遗传图谱的构建。     

SSR标记在苹果种质资源及遗传育种研究中的应用

SSR标记作为一种有效的分子标记手段,被广泛地应用于苹果种质资源和遗传育种研究中。对其在苹果种质资源保存、品种鉴定、遗传多样性、遗传连锁图谱构建、基因标记及定位等方面的应用做了简要概述。     

小豆SSR分子标记遗传连锁图谱构建

【目的】以小豆SSR为锚定标记,将公开发表的豇豆SSR、普通菜豆SSR和EST-SSR标记定位整合到小豆遗传连锁群中,构建中国小豆遗传图谱,为小豆基因定位、图位克隆和分子标记辅助选择育种提供更多可用的分子标记。【方法】用1 473对SSR和EST-SSR引物进行PCR扩增,包括906对豇豆SSR、123对普通菜豆和196对小豆SSR引物及248对普通菜豆EST-SSR引物,筛选亲本间多态性标记,验证栽培小豆HB801×AG109及GM892×AG110的F2分离群体。【结果】整合和构建了含有145个SSR和EST-SSR标记小豆遗传连锁图谱,包括59个小豆SSR标记,新增63个豇豆SSR、9个普通菜豆SSR、14个普通菜豆EST-SSR标记和1个茎色标记。紫茎色性状被定位在第9连锁群,离CEDG022和cbess058标记的遗传距离分别为0.9 cM和0.1 cM。图谱全长823 cM,覆盖11个连锁群,每个标记间平均距离为5.64 cM。每个连锁群长度为49.1—125.6 cM,平均长度74.82 cM;每条染色体上的标记数7—26个,平均13.27个。【结论】率先把小豆近缘物种分子标记引入小豆,加密了小豆SSR分子标记遗传连锁图谱。     

番茄分子连锁图谱的发展和分子标记辅助育种

鉴于植物中第一张RFLP标记图谱和高密度分子标记图谱都是在番茄上首先完成的,就番茄分子连锁图谱的发展过程和取得的最新进展以及分子标记辅助育种的前景进行了综述和讨论。     

云南省在烟草育种技术研究方面取得新突破

第2届云南烟草科学技术大会召开,云南在烟草育种技术研究方面取得新突破。2011~2012年,云南省烟草农业科学研究院牵头承担了烟草基因组计划项目＂烟草分子遗传图谱构建和重要突变基因定位克隆＂＂烟草遗传图谱构建和重要抗病基因精细定位＂。通过研究,成功构建了世界上第1张烤烟简单序列重复（SSR）标记遗传连锁图,这是目前密度最高的野生烟草遗传连锁图,为突破育种理论和技术瓶颈奠定了基础。