7种食源性致病菌GeXP多重PCR检测方法的建立及其应用

本研究旨在建立一种能够同时鉴别包括大肠杆菌O157：H7、沙门菌、空肠弯曲菌、单核细胞增生李斯特菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌和金黄色葡萄球菌7种常见食源性致病菌的GeXP多重PCR检测方法。根据这些致病菌在GenBank上公布的保守基因序列,设计合成了7对特异性GeXP引物。用单一或混合细菌样品的DNA模板优化反应条件,设置对照组,构建重组质粒,随机组合不同浓度的样品,验证所建立的GeXP方法的特异性、敏感性和准确性。最后用该方法检测120份临床样品,进一步验证所建立的GeXP检测方法的准确性和可靠性。结果显示,单一或混合模板的GeXP检测均能特异性出现相应清晰峰值,可在10³拷贝·μL^-1水平上同时特异地检测出7种细菌病原体,不同浓度模板混合时,本试验所建立的方法依然可检测出对应病原体。检测120份临床样品,GeXP多重PCR阳性率为2.50%（3/120）~15.83%（19/120）,普通PCR阳性率为2.50%（3/120）~15.00%（18/120）,GeXP多重PCR多检出8份阳性,表明GeXP方法更为敏感与准确。本研究建立的同时鉴别7种食源性致病菌的GeXP多重PCR检测方法,具有高通量、特异性强和敏感性高的特点,为食源性常见致病菌感染或混合感染提供了快速分子诊断方法。     

7种猪场常见高致死病原GeXP检测方法的建立

本研究旨在建立能同时检测猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、伪狂犬病病毒(PRV)、猪细小病毒(PPV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、坏死梭杆菌(Fn)和副猪嗜血杆菌(Hps)7种猪场常见高致死性流行病原的多重PCR检测方法。利用7种病原体的保守序列设计7对特异性引物,同时合成了Cy-5标记的通用引物。将通用引物分别连接到特异性引物的5′端形成7对特异性嵌合引物。优化反应条件,分别使用7组嵌合引物和通用引物混合,扩增7种病原的混合cDNA/DNA,验证其单重PCR的特异性。利用GeXP多重基因表达遗传分析系统,混合7种嵌合引物和通用引物,扩增单一病原的cDNA/DNA,验证其多重PCR特异性;将其他常见猪病病原的基因组作为干扰的阳性标本,利用7对混合嵌合引物和通用引物进行多重PCR分析,扩增加入了阳性标本的混合模板,验证其多重PCR的抗干扰能力。利用重组质粒和体外转录的RNA进行梯度稀释,确定GeXP多重检测体系的灵敏度。结果表明,7种不同引物分别进行GeXP单重及多重检测,均能检测出特异性目的片段的信号,无明显的干扰片段信号出现;GeXP多重检测抗干扰试验结果显示,在混入3种干扰病原模板后,依然可同时特异性检测出7种病原;GeXP多重检测灵敏度分析显示,在10~3拷贝/μL浓度条件下能检测到7种不同基因的特异性结果。本研究建立的同时检测7种猪场常见高致死性流行病原的GeXP检测方法具有高通量、高特异性和高灵敏度的特点,为快速诊断猪流行性疾病的交叉感染和混合感染提供了新型的检测方法。     

二温式多重PCR同时检测鸡的6种呼吸道病病原方法的建立

设计了6对分别针对鸡传染性支气管炎病毒（IBV），禽流感病毒（AVI）、鸡毒素霉形体（MG）、鸡传染性喉气管炎病毒（ILTV）、新城疫病毒（NDV）和滑液霉形体（MS）的特异性引物，根据反转录滞酶链反应（RT－PCR）和多重PCR原则，优化建立了一次PCR反应同时检测6种禽呼吸道病原的二温式多重PCR。该方法可同时扩增出6条区段大小与设计相符符的特异性片段，即IBV 1720bp,AIV 1050bp,ILTV647bp,NDV310bp,MS207bp，对人工感染鸡临床样品检测结果证明，该方法可用于临床诊断。     

羊痘病毒多重PCR检测方法的建立

根据羊痘病毒（CaPV）末端反向重复序列中的一段序列和P32基因序列,设计合成了2对引物,通过确定最佳的PCR反应条件,建立了检测羊痘病毒核酸的多重PCR方法。结果显示,用这2对引物均能扩增出羊痘病毒相应的特异性片段,而用此PCR方法检测口蹄疫病毒和羊口疮病毒,结果均为阴性。与中和试验比较,建立的PCR方法具有更好的敏感性。表明,该PCR方法可对组织病料中的CaPV进行快速检测。     

牛源肉孢子虫多重PCR检测方法的建立

为了准确快速鉴别检测牛源肉孢子虫的种类,本研究根据毛样肉孢子虫、黑氏肉孢子虫、人肉孢子虫、枯氏肉孢子虫和罗氏肉孢子虫5种牛源肉孢子虫的18SrRNA或COX1基因序列设计多重PCR引物,优化并建立了能够同时检测这5种牛源肉孢子虫的多重PCR方法.结果显示,多重PCR对毛样肉孢子虫、黑氏肉孢子虫、人肉孢子虫、枯氏肉孢子虫...     

奶牛乳腺炎5种病原菌多重PCR快速检测方法的建立与评价

为建立一种能同时快速检测多种奶牛乳腺炎致病菌的多重PCR检测方法,本研究以化脓隐秘杆菌ISR基因、无乳链球菌cfb基因、大肠杆菌phoA基因、副乳房链球菌23SrRNA基因和金黄色葡萄球菌nuc基因为靶基因,设计并合成了 5对特异性引物,通过方阵法对多重PCR反应体系及反应条件优化,建立了一种能快速检测5种病原菌的多重...     

猪重要病毒性病原多重PCR检测方法建立及应用

本试验针对当前对养猪业危害严重的猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、伪狂犬病病毒(PRV)和猪细小病毒(PPV),分别建立了检测CSFV和PRRSV的双重RT-PCR方法和检测PCV2、PRV及PPV的多重PCR方法。所建立的方法对CSFV、PRRSV、PCV2、PRV和PPV核酸的检出量分别为7.5 pg/μL、14.2 pg/μL、6.9 pg/μL、9.2 pg/μL和8.6 pg/μL。应用建立的方法分别对陕西省的陕南、陕北、关中等地区部分猪场采集的118份血清进行病毒检测。5种病毒的检出率分别是,CSFV为4.23%(5/118),PRRSV为22.01%(26/118),PCV2为15.25%(18/118),PRV为22.88%(27/118),从血清样品中未检测到PPV。本研究建立的检测RNA病毒双重RT-PCR和DNA病毒的多重PCR方法,为猪主要病毒其快速检测提供了可选择方法。     

鸡胚致死孤儿病毒荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用

目的:建立鸡胚致死孤儿病毒CELO的荧光定量PCR检测方法,实现该病毒在鸡胚及禽源性生物制品中的快速检测.方法根据CELO L5纤突1序列设计引物和探针,建立荧光定量PCR检测方法,并对其线性、特异性、精密性、灵敏度进行考察.运用建立的方法对40份SPF鸡胚尿囊液和16株流感疫苗主种子批毒种进行CELO检测.结果:建立的荧光定量PCR其最佳线性范围为1x109~1x104拷贝/μl,R2值达0.99以上,特异性良好,与其他种属的腺病毒及流感病毒间均无交叉反应,灵敏度为102拷贝/μl;荧光定量PCR方法检测40份SPF鸡胚尿囊液和16株流感毒种结果为阴性.结论:本研究所建立的鸡胚致死孤儿病毒荧光定量PCR检测方法,特异性好,敏感性高,为鸡胚及禽源性生物制品中的快速检测提供了技术支撑.     

Contracaecum rudolphii姊妹种特异 PCR鉴定方法的建立

参考已测得的C．rudolphii姊妹种（C．rudolphii A和C．rudolphii B）及C．septentrionale的核糖体DNA（rDNA）内转录间隔1、2（ITS-1及ITS-2）核苷酸序列，设计、合成了针对C．rudolphii A、C．rudolphii B及C．septentrionale的特异性引物HFA（F）、HFA（R）、HFB（F）、HFS（F），通过PCR条件优化和扩增后，它们均能特异地扩增出目的DNA片段，分别是323、321、108bp，而其它对照样品均未扩增出特异性片段，敏感性试验可检测到最低浓度分别为1．6、21．8、0．27ng／μL。从而初步建立了鉴定C．rudolphii姊妹种的特异PCR方法。该方法特异性强、敏感度较高、重复性好，不仅可用于C．rudolphii姊妹种的分类鉴定，也可用于它们所导致的寄生虫病的诊断和流行病学调查。     

奶牛乳房炎3种主要病原多重PCR检测方法的建立

根据GenBank收录的序列,针对金黄色葡萄球菌、无乳链球菌在16S rRNA与23S rRNA之间的序列设计2对引物,扩增的片段长度分别为420 bp和270 bp;酵母样真菌参照念珠菌和隐球菌的18S rRNA发表的序列设计引物,扩增的片段长度为730 bp左右。建立了用于检测奶牛乳房炎的多重PCR检测方法,并对PCR扩增的特异性和敏感性进行了优化。运用建立的多重PCR方法对从无锡市采集的34份样品进行病原菌检测,结果表明,本试验建立的多重PCR检测方法具有高效、快速和灵敏的特点,为进一步防控乳房炎奠定了基础。     

六师地区规模化猪场7种主要猪病的病原学检测结果分析

为了解兵团六师地区规模化猪场疾病的发生情况,2021年笔者采用荧光RT-PCR和荧光PCR法对六师范围内的25家规模化猪场采集的1478份全血、扁桃体、鼻拭子、肛拭子、病死猪组织(心、肝、脾、肺、肾、淋巴)等样品进行了7种主要疾病的病原检测,包括:猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、支原体(MYCO)...     

2010年上半年11省市规模猪场疫病监测与剖析

为了解近期发病猪场几种病毒性疫病的流行状况,采用RT-PCR和PCR方法,对2010年1月至6月期间,来自11省(市) 50个猪场共147份病料进行猪瘟病毒（CSFV）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）、高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒（HP-PRRSV）、伪狂犬病毒（PRV）和猪圆环病毒2型（PCV2）检测,并采用ELISA方法对其中26个猪场458份血清样品进行伪狂犬gE野毒抗体检测。结果表明,PCV2阳性率最高,为75.3%（70/93）;PRRSV阳性率次之,为57.4%（78/136）,HP-PRRSV阳性率为43.5%（54/124）;CSFV和PRV的阳性率分别为37.7%（52/138）和21.0%（21/100）;伪狂犬gE野毒抗体阳性率为16.4%（75/458）。同时检出2种及2种以上病毒的样品占46.9%（69/147）,其中以HP-PRRSV+PCV2、CSFV+PCV2及CSFV+HP-PRRSV+PCV2三种形式最为常见。PRRSV（50.0%）是猪场繁殖障碍性疾病中的最常见病原;CSFV（56.0%）和PCV2（48.0%）是断奶前后仔猪腹泻的常见病原;HP-PRRSV（53.5%）、CSFV（50.7%）和PCV2（48.0%）是保育猪发生高热症的常见病原。该检测结果为猪场疫病的诊断与防控提供了参考。     

猪群中7种高发传染病多重PCR诊断方法的建立

[目的]建立猪瘟、蓝耳病(又称猪繁殖与呼吸综合征)、圆环病毒2型感染、猪链球菌病、副猪嗜血杆菌病、猪多杀性巴氏杆菌感染和猪支原体感染7种猪病的多重PCR诊断方法.[方法]根据GenBank发表的核苷酸序列设计了分别针对猪瘟、蓝耳病、圆环病毒2型感染、猪链球菌病、副猪嗜血杆菌病、猪多杀性巴氏杆菌感染和猪支原体感染的2套多重PCR特异性引物,优化多重PCR反应条件后进行敏感性与特异性评价.[结果]建立的2套多重PCR诊断方法对其他常见猪病痛原的基因组无特异性扩增,检测病原基因组最低浓度可达到pg级.[结论]该研究建立的2套多重PCR诊断方法可以用于猪群中上述7种猪病痛原的单一感染或混合感染的鉴别诊断.     

福氏志贺菌2型多重PCR检测方法的建立

为构建一种快速、高效、特异性强的检测与鉴定福氏志贺菌的多重PCR方法,本试验以不同血清型志贺菌中的特有基因ipaH、gtrⅡ、gtrⅩ和R002为扩增目标来设计相对应的引物,在同一PCR体系中对福氏志贺菌进行检测。通过一系列探索及对反应条件的优化调整,最终建立了可在多种细菌中快速检测出福氏志贺菌2型（2a和2b）的方法。结果表明,应用多重PCR可快速、高效、准确的对福氏志贺菌进行验证和鉴别,对于预防实验室菌种污染和志贺氏菌病的临床诊断与治疗有着重要意义。     

2011年新疆部分猪场主要疫病调查及免疫抗体评估

对本实验室2011年受理检测的92个规模化和散养猪场猪瘟、口蹄疫等血清学监测和流行病学调查信息分析,结果表明,猪瘟平均免疫抗体合格率为76.86%,口蹄疫免疫抗体合格率为60.82%,猪伪狂犬病免疫抗体合格率为51.75%,猪繁殖与呼吸综合征免疫抗体合格率为55.52%。结合临床诊断及实验室检测,部分猪场存在胸膜肺炎放线杆菌、猪圆环病毒、链球菌、副猪嗜血杆菌等感染,胸膜肺炎放线杆菌抗体阳性率为48.10%,猪圆环病毒抗体阳性率为53.21%,链球菌抗体阳性率为48.89%,副猪嗜血杆菌抗体阳性率为25.58%。     

畜禽源3种革兰氏阴性杆菌多重PCR检测方法的建立与应用

为建立一种可准确、快速鉴定畜禽临床病例中3种常见革兰氏阴性杆菌的多重PCR检测方法,本试验针对大肠埃希菌23S rRNA基因、巴氏杆菌KMT基因和沙门氏菌invA基因分别设计合成了1对特异性引物,构建可同时快速鉴别大肠埃希菌、巴氏杆菌和沙门氏菌的多重PCR反应体系,并进行反应条件优化及方法性能评估。结果显示,所建立的方法最佳引物浓度分别为1.0、1.5和1.0 μmol/L,最佳退火温度为56 ℃。性能评价结果显示,所建立的多重PCR检测方法具有较好的特异性和敏感性,其中对沙门氏菌检测敏感性最高,为1.44 pg/μL。对70株革兰氏阴性临床分离细菌进行检测,结果表明,所建立的多重PCR检测方法能实现3种临床分离细菌的快速准确鉴定。本方法的建立为相关临床病例快速诊断及流行病学调查提供了有效的技术支持。     

Establishment and Application of Multiplex PCR Detection Method for Three Main Gram-negative Bacilli from Livestock and Poultry

To establish a rapid and accurate multiplex PCR method for the clinical detection of three main Gram-negative bacilli from livestock and poultry in Guizhou province,three pairs of specific primers were designed and synthetized according to 23S rRNA gene of Escherichia coli(E.coli),KMT gene of Pasteurella and invA gene of Salmonella.In this study,A mutiplex PCR reaction system was established for detecting the three pathogens at the same time,and the reaction system was optimized and it's performance was evaluated.The results showed that the best concentration of primers was 1.0,1.5and 1.0 μmol/L,respectively,and the best annealing temperature was 56 ℃.The results of performance evaluation showed that the method had good specificity and sensitivity,the sensitivity of Salmonella could reach to 1.44 pg/μL,was the highest.70 Gram-negative clinical isolated strains were detected by the multiplex PCR and it was proofed that the method could identify the three pathogens rapidly and accurately,and it could provide effective technical for the rapid clinical diagnosis and epidemiological survey.     

转基因牛多重PCR检测方法的建立

为建立一种快速检测转基因牛的多重PCR方法,针对牛线粒体16 S rRNA基因(BOS mtD-NA16 S rRNA,BOS)、转基因动物常用标记基因新霉素磷酸转移酶基因(NPT Ⅱ)、人乳铁蛋白编码基因(human laetoferrin gene,hLF)、人-α-乳清蛋白编码基因(human α-lactalb...     

MEV、ADV和CAV三种病毒多重PCR检测方法的建立

建立一种同时检测貂肠炎病毒(MEV)、貂阿留申病毒(ADV)和犬腺病毒(CAV)的多重PCR诊断方法.引用已有的CAV引物,并根据GenBank发表的MEV、ADV序列保守区域设计特异性引物进行PCR扩增,可同时得到扩增长度为795(MEV)、451(ADV)、1 019 bp(CAV)3奈特异性片段,对猪细小病毒(PPV),犬瘟热病毒(CDV)进行PCR检测结果为阴性.各种模板、引物之间相互不构成干扰.敏感性试验证明,可以检测到模板中MEV 101.5 TCID50和CAV 100.5 TCID50的病毒含量,对ADV检测的敏感性更高.     

猪流行性腹泻病毒抗体ELISA检测方法的建立

为检测猪血清中猪流行性腹泻病毒(PEDV)抗体水平,以纯化的PEDV作为包被抗原,优化ELISA反应条件,建立了检测PEDV血清IgG抗体的诊断方法:当血清OD_(450nm)值0.31时,判定阳性;当OD_(450nm)值小于0.26时,判定阴性;当OD_(450nm)值介于两者之间判定可疑。结果表明,试验建立的ELISA抗体检测方法可用于检测猪血清中猪流行腹泻病毒抗体、监测猪流行腹泻病的流行情况和评价相关疫苗的免疫效果。