东北地区五个引进鸭品种的遗传多样性分析

通过线粒体D-loop区测序对东北地区的五个引进鸭品种（樱桃谷鸭、长岛鸭、北北京鸭、康贝尔鸭、白冠鸭）20个个体进行了遗传结构的分析,通过对mtDNA D-loop部分序列进行扩增,对PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了710bp的核苷酸序列。通过Mega软件对所得的序列进行比较,共检测出86个位点碱基存在变异,其中包括16个简约信息位点;利用Mega的“Pairwise distance”计算个体间的相对遗传距离。结果表明：其序列差异在0.000~0.082之间,得出20个个体有18种单倍型;并用构建了系统发育树。运用DNASP软件计算所得该群体核苷酸多样性（Pi）、单倍型多样度（Hd）和平均核苷酸差异数（K）分别为0.01911、0.9842和13.3588。研究结果表明：鸭种群线粒体D-loop区序列个体变异程度很小,但种群的遗传多样性水平很高,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析。     

东亚4个黑山羊群体mtDNA D-环遗传多样性及其起源

为了研究地方山羊品种的起源与分化，了解其遗传背景，为山羊资源的合理利用提供基础资料，利用PCR产物直接测序法对3个中国黑山羊群体和1个韩国黑山羊群体共39个个体的mtDNA D-环部分序列进行了测定和分析。测定的序列经排列比对后选取441bp分析，发现了55个多态位点，单一多态位点11个，简约信息位点44个，确定了29种单倍型，单倍型多样度为0.984。构建系统发育树将29种单倍型分成了明显的3个分支，角猾羊聚入A分支。同时利用群体间的单倍型的错配分布和遗传距离分析了各群体的亲缘关系。结果表明：4个黑山羊群体遗传多样性丰富，至少拥有3个不同的母系起源，角猾羊是家山羊的一个母系祖先。     

华中樱桃叶绿体InDel标记鉴定及应用

为筛选可用于华中樱桃遗传多样性分析和基因分型的叶绿体InDel标记,本研究以湖南省5个地理位置的华中樱桃群体为材料,鉴定了候选叶绿体非编码区序列中的InDel位点并应用于群体遗传多样性分析。结果表明,9个叶绿体非编码区片段中共有20个InDel位点,其中单碱基InDel位点9个,多碱基InDel位点11个,InDel出现频率约0.74%。非编码区trnR-UCU-atpA的InDel位点最多(5个),其次是trnHGUG-psbA (3个)和psbC-trnS-UGA (3个)。50个华中樱桃个体的核苷酸多态性(Pi)为0.001 51,可分为13个单倍型。群体ZF的核苷酸多样性最为丰富(Pi=0.001 58),其次是群体XP (Pi=0.001 40)、PJ (Pi=0.001 36)和LY (Pi=0.000 54)。从分布情况来看,单倍型H3为群体LY和PJ所共有,H5为群体ZF和XP共有,H6为群体PJ、XP和ZF共有,H8为群体PJ和XP共有;其他单倍型特异性地分布于各群体。系统进化分析结果显示,13个单倍型可分为两支：单倍型H5、H7和H11聚为一支,另外10个单倍型聚为...     

鸭亲本间遗传距离与杂交后代杂种优势关系的研究

运用随机扩增多态DNA方法,对樱桃谷鸭、麻鸭及其杂交一代和用F1作为母本再与父本番鸭属间杂交培育的三元杂交半番鸭(F2)基因组DNA进行了遗传分析。结果表明,RAPD可用于有效标记鸭品种之间遗传亲缘关系和杂种优势预测;在所使用的20种随机引物中,5个鸭种共产生760条带,其中多态性带568条,占总条带数的 74．7％,说明鸭群体具有较为丰富的遗传多样性;杂交一代多态性位点比例为67．9％,遗传相似度为0．822 7,三元杂交二代多态性位点比例为83．1％,遗传相似度为0．826 4。说明三元杂交子二代的杂种优势可以用杂种优势理论中的显形假说来解释。     

中国绵羊品种mtDNA遗传多态性与系统进化研究

摘要：本研究检测了中国8个地方绵羊品种和2个外来品种共计93只绵羊个体的mtDNA D-loop高变区,获得了63种单倍型,73个变异位点,其中单一多态位点30个,简约信息位点43个,除了缺失和插入位点外,还包括22处碱基转换和1个碱基颠换,转换和颠换之比为14.8;通过系统发育树分析,中国绵羊mtDNA D-loop单倍型序列聚类成A、B、C三大支系,表明了中国现代绵羊品种存在3个母系起源,且第三个起源地可能在中国。     

不同地区茶树品种PPO基因克隆及种群间遗传分化分析

茶树多酚氧化酶(PPO)作为一种儿茶酚酶,在茶叶加工过程中扮演了重要的角色,在任何一种茶叶品质形成过程中都起着至关重要的作用。不同的茶树品种在长期的演化过程中形成了丰富的单核苷酸多态性。本研究基于对不同地区的茶树品种的PPO基因进行克隆,研究其单核苷酸多态性及对不同茶树种群之间遗传分化进行分析。结果表明:83个品种之间共有197个SNP突变位点,其中137个为非同义突变,60个为同义突变,单核苷酸多态性指数pi为0.008 59,基因的单倍型数为69个,说明茶树多酚氧化酶有较高的遗传多样性。两个变量的简约信息位点120个,两个变量的非简约信息位点74个,三个变量的简约信息位点1个,三个变量的非简约信息位点2个。4个不同茶树种群间双向基因流均比较弱,Nm值在0.005~0.1,每一百世代迁出或迁入有效个数为0.5~10个。4个茶树不同地理种群间基因流受到比较严重的限制。     

基于线粒体控制区全序列的鄱阳湖水系鲢增殖放流群体与野生群体的遗传多样性分析

采用PCR和DNA测序技术研究鄱阳湖水系增殖放流群体与野生群体白鲢的遗传结构和群体遗传学特征,测定了瑞昌、赣江、增殖放流3个群体54尾鲢线粒体控制区全序列935bp,缺失或插入3个碱基,发现41个变异位点,均为简约信息位点,共检出24个单倍型。转换／颠换比为14.344。在邻接树上来自不同地点的鲢混杂分布于各分支,没有出现明显的谱系结构和地理聚群。AMOVA 分析表明变异主要来自种群内,种群间出现显著分化。FST=0.22388也表明遗传变异主要来自种群内。3个群体间的遗传距离为0.01035～0.01634,Fst值为0.08252～0.39171,表明3个群体间存在显著遗传分化。赣江、瑞昌和增殖放流群体的单倍型多样性分别为0.727、0.978、0.947,核苷酸多样性分别为0.00897、0.01135、0.00978,其中瑞昌群体的单倍型多样性与核苷酸多态性在3个群体中最丰富,其次是增殖放流群体,赣江群体单倍型多样性及核苷酸多样性最低,应加以保护。     

不同茶树品种PPO基因单核苷酸多态性分析

多酚氧化酶是茶叶加工过程中品质形成的关键酶类,在任何一种茶叶加工过程中都起着至关重要的作用。不同的品种在长期的演化过程中形成了丰富的多酚氧化酶单核苷酸多态性。本研究主要对著名红茶产区选育出的宜兴群体品种与引进的部分优良品种多酚氧化酶基因编码区进行传统克隆测序,研究其单核苷酸多态性,分析不同品种间的遗传距离远近,以及利用不同品种之间的独特SNP位点进行品种鉴别。结果表明:32个品种共发现了120个SNP位点,其中81个为非同义突变,39个同义突变,核苷酸多态性指数pi为0.011 06,基因的单倍型多样性(HD)为1.0,说明多酚氧化酶基因具有较高的遗传多样性。香山早与梅占的遗传距离最大,为0.02,这个两个品种亲缘关系最远,遗传距离最小的是鸿雁12号与白叶一号、湘波绿、玉兰、两两之间遗传距离均为0.001,横岩3号和乌牛早之间遗传距离也为0.001,亲缘关系最近。利用不同品种间的多酚氧化酶基因SNP位点,可以成功鉴别区分开32个品种,研究结果将在茶树遗传育种、利用遗传工程手段提高茶叶品质中具有重大意义。     

天山樱桃野生居群遗传多样性ISSR分析

利用ISSR标记技术对新疆天山樱桃的4个野生居群44份种质的遗传多样性进行分析。研究发现26条ISSR引物共检测到236个位点,其中多态性位点175个。Nei's基因多样度指数(H)和Shannon信息指数(I)分别为0.207 3和0.318 8,各居群间遗传分化系数(Gst)为0.228 2,基因流(Nm)为1.691 1,认为天山樱桃遗传分化水平较低,居群间基因交流频繁,遗传变异主要存在于居群内。基于遗传距离(GD)的聚类图可知,喀拉峻与大西沟居群遗传关系最近,与裕民县居群遗传距离(GD)较远,4个天山樱桃居群中大西沟居群遗传多样性最高,本研究可为天山樱桃种质资源的有效保护和利用提供理论依据。     

基于线粒体DNA控制区序列分析我国马鹿5个亚种的遗传分化

为了解马鹿种群遗传结构和分化水平,测定了马鹿5个亚种11个地理群共计146个体线粒体DNA控制区全序列。序列分析检测到167个变异位点,确定了54种单倍型;各个亚种呈现较高的单倍型多样性(h:0. 600～0. 959)及中等程度的核苷酸多样性(π:0. 006 3～0. 012 6)。中性检验仅发现甘肃马鹿显著性偏离中性突变,亚种间遗传分化指数FST 0. 5、基因流Nm0. 5,表明马鹿亚种间发生了显著的遗传分化,只存在少量基因交流。基于最大简约法和贝叶斯法构建的单倍型系统进化树和单倍型中介网络图显示塔里木马鹿有别于其他马鹿,它们分别来源于共同祖先的2个不同进化枝,阿尔泰马鹿、甘肃马鹿、阿拉善马鹿、天山马鹿又可细分为3个进化枝系,但它们是相互交叉聚类的。为我国马鹿的遗传资源保护和利用提供依据。     

基于mtDNA D-loop进行四种鲤科鱼类种间鉴定研究

为研究鲤科鱼类的遗传变异和种间鉴定,采用线粒体D环（mitochondrial DNA,mtDNAD-loop）作为分子标记,测定了四种常见鲤科鱼类（草鱼,Ctenopharyngodon idellus;鲢,Hypophthalmichthys molitri;鲤,Cyprinus carpio;鲫,Carassius cuvieri）mtDNAD-loop核苷酸序列。结果表明：四种鱼类mtDNAD-loop区碱基组成A＋T的平均含量（71.4%）明显高于G＋C（28.6%）。在108个个体中,共检测到132个多态位点（22个单一多态位点和110个简约信息位点）,由此界定了57个单倍型（H1-H57）。鲫的单倍型多样度（1.000±0.017）和核苷酸多样度（0.03593）最高,而草鱼最低（分别为0.499±0.071,0.00817）。四种鱼类可以通过53个特征性碱基严格区分。基于遗传变异分析表明：四种鱼类没有共享单倍型,种间特异性单倍类的特征性碱基可以作为种间鉴别的依据。通过mtDNA控制区的分子标记,可以为鱼类鉴定、种质资源保护及其产品的真伪鉴别提供依据。     

添加不同比例草粉的日粮对樱桃谷肉鸭屠宰性能的影响

摘 要：试验选择健康的樱桃谷商品雏鸭400只,以含不同比例龙须眼子菜的日粮饲养至42日龄。通过对以龙须眼子菜为优势种的布龙湖草粉的营养成分分析和肉鸭的饲养试验来研究该草粉在肉鸭屠宰性能方面的作用。试验结果表明：添加4%的草粉可以增加采食量,降低料肉比,虽然屠宰性能有所下降,但是能增加养殖效益,具有很好的推广和应用前景。     

海南普通野生稻（Oryza rufipogon Griff.）Adh2基因多态性分析

海南岛的4个保护区和2个非保护区内普通野生稻与2种栽培稻(Nipponbare, 9311)的Adh2基因序列在编码区共有单现突变 9个,信息位点4个,同义突变8个,替代突变5个。内含子内有单现突变21个,信息位点29个,插入/缺失位点161个。Adh2基因在整个区域的多态性(p_R, q_R)均为0.011,内含子区域的多态性明显高于编码区域。在编码区域,同义位点多态性明显高于替代位点。中性测试表明虽然Adh2各区域的净化选择在统计上不具有显著性,但编码区的净化选择作用明显大于内含子区域。聚类分析表明海南普通野生稻可以划分为2大类,其中一类(QH, LD)与中国大陆普通野生稻和栽培稻更接近,另一类(WC, WA, WN, DZ)则更接近东南亚普通野生稻。     

基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系

以狼尾草属(PennisetumRich.)的象草(P.purpureum)为外群体,依据rDNA-ITS序列探讨了甘蔗亚族(Saccharinae)内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1序列长度为200~208bp,变异位点91个,简约信息位点70个,GC含量为60.4%~69.1%;ITS2序列长度为215~220bp,变异位点93个,简约信息位点68个,GC含量为66.1%~73.4%;5.8sDNA序列长度为164bp,变异位点18个,简约信息位点9个,GC含量为54.1%~58.0%;根据变异位点,简约信息位点占总位点的比例可以看出,ITS序列比5.8sDNA序列变异程度高,其中ITS1序列又较ITS2序列变异丰富。属种间遗传距离表明芒属(Miscanthus)和荻属(Triarrhena)与甘蔗属(Saccharum)的亲缘关系最近,其次为蔗茅属(Erianthus)和河八王属(Narenga);而莠竹属(Microstegium)、大油芒属(Spodiopogon)、白茅属(Imperata)与甘蔗属亲缘关系较远。根据甘蔗近缘属种的NJ和MP系统发育关系,支持将斑茅(E.arundinaceus)归入蔗茅属,荻属归入芒属的观点;河八王属的河八王(N.porphyrocoma)与滇蔗茅(E.rockii)亲缘关系较近,而与同属的金猫尾(N.fallax)亲缘关系较远;蔗茅属和芒属属种系统进化关系较其他属种复杂;有4份材料被发现鉴定有误,不应用于后续研究。     

不同鸭品种在“稻鸭共作”系统中的行为学差异及对水稻产量的影响

为探究鸭在稻田间的运动规律,揭示不同鸭品种在田间的行为学差异以及对水稻产量的影响。本研究选取稻鸭共作试验田9块（766 m2/块）,按225只/hm2分别放入役用鸭（绿头野鸭♂?金定鸭♀）、金定鸭、白改鸭等3个鸭品种,通过视频监控系统,采用连续观察法记录鸭在每天的5:00—20:00时间段内在田间的游动、休息、采食等行为的发生时间和持续时间,连续观察5天。经观察发现,鸭田间活动高峰一般是在早上5:00—7:00,8:00—11:00以及15:00—18:00等时间段,役用鸭和金定鸭每天的活动时间分别为324.50 min(36.06%),315.75 min(35.08%),极显著高于白改鸭264.50 min (29.39%) (P＜0.01)。采用役用鸭、金定鸭、白改鸭进行稻鸭共作后,水稻产量分别比对照组提高了22.75%,20.14%和10.89%。水稻产量构成因素与鸭游动时间相关性分析发现,结实率、理论产量与游动时间呈极显著正相关(r=0.959,P＜0.01;r=0.858,P＜0.01),千粒重、实际产量与游动时间呈显著正相关(r=0.627,P＜0.05;r=0.767,P＜0.05)。研究结果表明：役用鸭对水稻的增产效果最好,且发现游动时间可作为影响稻鸭共作水稻产量的重要评价指标。该研究结果为稻鸭共作鸭品种的筛选以及稻鸭共作系统水稻产量的提升提供了重要的参考数据。     

Soil Moisture Conservation for Wheat Production in the Central Highlands of Jordan

A study was carried out at Mushaqqar Agricultural Experiment Station located in the Central Highlands of East Jordan. The objectives were to study and compare three crop rotations: Duck foot fallow–wheat; chemical fallow–wheat; and wheat–wheat, on soil moisture conservation and storage and on wheat yield.
Results indicated that, the storage efficiency for the duck foot fallow treatment was higher than that of chemical fallow (13.4 and 8.7% respectively). Also it was found that two duck foot or chemical fallow applications, for weed control, were needed before June.
Wheat yield was the highest after the duck foot fallow, followed by chemical fallow. Wheat yield had decreased from 3.34 Mg/ha to 1.08 Mg/ha, for continuous wheat.     

Molecular fingerprinting of hybrids and assessment of genetic purity of hybrid seeds in rice using microsatellite markers

Microsatellite markers were used for fingerprinting of hybrids, assessing variation within parental lines and testing the genetic purity of hybrid seed lot in rice. Ten sequence tagged microsatellite sites (STMS) markers were employed for fingerprinting 11 rice hybrids and their parental lines. Nine STMS markers were found polymorphic across the hybrids and produced unique fingerprint for the 11 hybrids. A set of four markers (RM 206, RM 216, RM 258 and RM 263) differentiated all the hybrids from each other, which can be used as referral markers for unambiguous identification and protection of these hybrids. Cluster analysis based on Jaccard's similarity coefficient using UPGMA grouped the hybrids into three clusters. Within the cluster all the hybrids shared a common cytoplasmic male sterile line as female parent. The genetic similarity between the hybrids ranged from 0.33 to 0.92 with an average similarity index of 0.63. The analysis of plant-to-plant variation within the parental lines of the hybrid Pusa RH 10, using informative markers indicated residual heterozygosity at two marker loci. This highlights the importance of STMS markers in maintaining the genetic purity of the parental lines. The unique value of the restorer gene linked marker for testing the genetic purity of hybrid seeds is demonstrated for the first time.     

栀子的psbA-trnH序列分析与鉴别

对栀子的psbA-trnH片段进行PCR扩展、测序,利用MEGA 6.0进行序列分析,计算样本的遗传距离(Pair-wisedistance法)和发育系统树(neighbor-joining法).结果表明,10种栀子属的psbA-trnH序列长度为250～297 bp,A+T平均含量74％,变异位点占24.76％;简约信息位点占6.43％.Pair-wise distance(PW)法计算遗传距离,平均遗传距离为0.058;邻接法(NJ)对栀子属种间的系统发育进行聚类分析,成功鉴别供试样本.psbA-trnH片段可作为栀子属物种分子鉴别的候选序列.