SSR分子标记在玉米种子纯度鉴定中的应用

SSR是建立在PCR技术上的一种广泛应用的分子标记,具有含量丰富、多态性高、共显性等优点。本文简要介绍了SSR分子标记技术的原理和特点,重点介绍了SSR分子标记技术在玉米种子纯度鉴定上的研究进展,并就其在玉米种子纯度方面的应用潜力进行了探讨。     

SSR标记在茄子杂交种纯度检验中的应用

鉴定和分析茄子杂交种F1纯度,为提高茄子杂交育种效率和鉴别真假杂交种提供参考依据.利用分子生物学手段SSR标记技术对茄子双亲及杂交一代'福茄8号'研究其特异性位点的扩增,进行亲缘关系及纯度鉴定分析.从100对引物筛选出5对引物在茄子父母本和F1杂交一代之间产生差异性位点.引物ESSR97扩增F1杂交一代的位点是父母本双...     

应用ISSR分子标记分析裸大麦的遗传多样性

为研究裸大麦的遗传多样性,利用筛选得到的16条ISSR引物对收集的国内外102份裸大麦材料和1份皮大麦材料进行了遗传多样性分析,并分析了裸大麦地理分布与遗传多样性的关系。结果表明,16条ISSR引物共扩增出133条条带,大小在100~2000bp。不同引物扩增的条带数在3?15条,平均每条引物扩增出8.31条,多态性条带为113条,多态性的平均百分率为85.1%,103份材料的遗传相似系数(GS)在0.2817~6,提示裸大麦的遗传多样性较高。利用NTsys 2.1软件进行聚类分析,103份材料分为四大类,第一大类只分布在中国青海,第二大类分布在亚洲、欧洲、北美洲和非洲,第三大类分布在亚洲、北美洲和南美洲,第四大类仅分布在亚洲和北美洲,表明亚洲,尤其中国地区具有较高的遗传多样性。裸大麦的遗传多样性与其地理来源的相关性,为进一步研究裸大麦尤其是青稞起源提供了参考。     

棉花常规种种子纯度的SSR分子标记鉴定

棉花是新疆重要的经济作物,寻找一种有效的棉花品种(系)纯度检测方法是解决目前市场上棉花品种多、乱、杂问题的有效途径.本研究选取新疆棉花品种(系)中的41个常规种为试验材料,利用简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)分子标记技术筛选出15对条带清晰、多态性高的核心引物,对41份试验材料进行...     

杂交水稻品和真实性和纯度的SSR分子标记鉴定

本研究以459份杂交水稻为研究材料,分别用SSR分子标记、田间小区品种纯度正季鉴定法鉴定杂交水稻品种真实性和纯度,以田间小区品种纯度鉴定结果为对照,比较SSR分子标记鉴定方法的准确度.研究结果表明,SSR标记法与田间正季鉴定结果基本一致,两种鉴定方法的真实性鉴定结果完全一致,两种鉴定方法的纯度值最大相差8.8％,平均差距为0.7％.实验结果表明SSR分子标记法能准确、快速地鉴定杂交水稻品种真实性和纯度.     

白菜类蔬菜种子纯度SSR分子标记鉴定

种子纯度是种子质量的核心指标,是保障优良品种增产的关键因素。为了鉴定白菜种子纯度,本研究利用72对SSR分子标记检测种子纯度并结合田间植株形态观察,鉴定了5个白菜类优势品种的种子纯度,分别是‘珍绿6号’‘、津夏3号’‘、津研快绿1号’‘、速俊228’‘、速俊316’。结果表明,从72对SSR引物中筛选出5对具有多态性的引物,能够将父母本与杂交种区分开。试验中SSR分子鉴定结果虽略低于田间形态学鉴定结果,但利用统计学进行显著性分析,发现两者间无显著性差异。说明SSR分子标记可以用于白菜种子纯度的鉴定并通过本研究建立了一套准确、有效的品种纯度鉴定体系。     

应用SSR和ISSR标记分析栽培香稻品种的遗传多样性

本研究利用24对SSR引物和36个ISSR引物,分析33份来源于亚洲10个国家的香稻品种的遗传多样性。分别获得93条和181条多态性片段,每个SSR座位可检测3～8个等位基因,平均为4．23个;每个ISSR引物可检测3～8个多态性位点,平均为5．03个。根据SSR和ISSR标记计算的品种间遗传相似系数分别在0．294～0．884之间和0．595～0．867之间。聚类分析表明,利用两种标记所得的聚类结果基本上一致,与品种所处的3种气候类型变化基本相符。进一步证实SSR和ISSR标记是研究水稻种质资源分类有效的工具。     

陆地棉耐盐性状与SSR分子标记的关联分析

本研究以134份陆地棉栽培种为试验材料,测定其在0.3%盐浓度(质量分数)下的出苗率,并使用74对SSR引物对这些材料进行基因组变异扫描。利用Structure2.3.4软件分析该自然群体的遗传结构,在此基础上采用Tassel2.1软件对耐盐性状与SSR分子标记进行关联分析,寻找与棉花耐盐性状相关的分子标记。研究结果表明:(1)134份陆地棉栽培种的出苗率呈极显著差异,并筛选出27个盐敏感材料和10个耐盐材料。(2)74个SSR分子标记共检测出148个多态性位点,涉及246个等位变异,变异范围为2~7,平均每个标记3.32个;基因多样性指数变异范围为0.0295~0.4959,平均值为0.2897;SSR分子标记多态性信息含量(PIC)变幅为0.0290~0.3729,平均值为0.2381。(3)通过群体结构分析,将该自然群体划分2个亚群体,分别包含89份和45份材料。(4)关联分析共发现8个与棉花耐盐性状相关的SSR分子标记位点,表型变异解释率变幅为2.91%~7.82%,平均值为4.32%。此研究结果可以为棉花耐盐性状分子标记辅助选择育种提供参考。     

SSR分子标记检测杂交稻种纯度的技术改良

通过改进DNA提取方法,利用多层点样的电泳技术和样本量确定等方面,探讨SSR分子标记检测杂交稻种纯度技术的改良,以期能提高室内纯度检测的可靠性及效率。结果表明:利用TPS法提取糙米DNA和3层点样的电泳技术是可行的;192~288的样本量较适合室内种子纯度检测。     

基于ISSR及SSR标记的苜蓿遗传多样性分析

探究苜蓿种质资源亲缘关系,为苜蓿品种鉴定和新品种选育提供理论依据。采用ISSR和SSR分子标记方法对30份苜蓿材料进行遗传多样性分析。12条ISSR标记引物共扩增出125条带,多态性条带117条,多态性条带比率(PPB)为93.01%。有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)和香农多样性指数(I)均值分别为1.465 9,0.281 3,0.431 4;12条SSR标记引物共扩增出152条带,多态性条带144条,多态性条带比率(PPB)为94.05%。有效等位基因数(Ne)、Nei′s基因多样性指数(H)和香农多样性指数(I)均值分别为1.542 7,0.313 9,0.470 1。2种标记遗传相似系数及聚类分析表明,材料Zxy2010p-7900、Zxy2010p-7740可单独分为一类,与其他材料亲缘关系较远;清水紫花苜蓿、陇东紫花苜蓿、甘农4号杂花苜蓿可分为一类,其品种间遗传相似系数较大,亲缘关系较近。2种标记方法客观真实地检测出供试苜蓿种质的亲缘关系。     

辽东地区胡桃楸天然林ISSR分子标记体系的建立和优化

为建立胡桃楸天然林ISSR-PCR反应体系,本实验从DNA的提取到扩增进行了研究.通过对比CTAB和试剂盒两种方法,发现胡桃楸最佳DNA提取方法为试剂盒法.利用正交试验设计法确定了胡桃楸ISSR-PCR反应最佳体系,并对影响胡桃楸PCR反应的Taq酶浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度等因素进行了优化.最终获得胡桃揪ISS...     

向日葵SSR分子标记中DNA不同提取方法的研究

在向日葵SSB分子标记中,为了探寻一种快速有效的DNA提取方法,本研究比较了七种不同的向日葵DNA提取方法,结果表明:CTAB改进法是一种简便快速的DNA提取方法,省时,省力,节约成本,降低对操作人员的危害,改善了DNA的提取方法.     

ISSR分子标记及其在植物研究中的应用

ISSR(inter simple sequence repeat)分子标记是一种以微卫星序列为引物,进行多位点PCR扩增的技术.ISSR技术简易、快捷,同时兼备AFLP(扩增酶切片段多态性)、SSR(简单序列重复)和RAPD(DNA随机扩增多态性)等分子标记方法的优点.引物设计无需预知基因组序列,只要是目标区域的长度在可扩增范围内,就能扩增出微卫星重复序列间的DNA片段.ISSR标记以其高多态性,已被广泛应用于种质收集、品种鉴定、遗传多样性、系截系、遗传作图、基因定位、标记辅助选择、预测基因组SSR基序的丰度以及SSR引物开发等研究.本文对ISSR技术及其在植物研究中的应用进行全面的概述.     

茄子SSR标记在番茄上的通用性分析

微卫星标记(SSR)是分子育种中常用的遗传标记之一,但目前报道的番茄SSR标记并不能满足番茄分子育种的需要,有必要发展出更多的SSR标记,近缘物种转移法是一种发展SSR标记简便快速的方法。本研究分析了茄子SSR标记在番茄上的通用性情况,结果表明:300对茄子SSR引物中有111对能在番茄基因组DNA上扩增出产物,97对引物扩增出的带型在茄子、番茄间相似程度高,标记通用率为32.3%;EST-SSR比基因组SSR的通用性更好,前者通用率为36.6%,后者为30.0%。将这些标记转移到番茄上,能节省开发番茄SSR标记的成本。     

应用SSR分子标记方法检测玉米种子真实性的几点思考

SSR分子标记方法已经越来越多地应用到玉米种子真实性检测试验中。针对在实际应用过程中遇到的样品纯度、检测引物、PCR产物检测方法及试验结果的数据对接等问题进行了分析和探讨,为进一步完善SSR分子标记方法检测玉米种子真实性提供参考。     

用SSR标记提高水稻分子连锁图谱密度

本课题组利用圭630／台湾粳的DH群体，建立了一个水稻RFLP连锁图。该图谱含175个标记，总长1224．6cM，相邻标记间平均距离为7．0cM。但该图标记分布不够均匀，存在较多空白区，且在第4和第8染色体上分别存在一个断点。本研究试图在原有RFLP图谱的基础上，添加一些SSR标记，以使该图谱标记更加密集和均匀，并消除两个断点。共筛选了361对RM引物，获得了183对多态标记，在12条染色体上共整合了57个RM标记，染色体连锁图总长度为1811．2cM，比原图谱增长了47．9％，相邻标记间平均距离为7．8cM，与原图谱相近。不过，两条染色体上的两个断点仍无法消除，暗示这两个断点区域多态性较低或重组率较高。     

花生ISSR分子标记技术初步研究

以花生为研究对象,初步建立起花生的ISSR分子标记技术体系,包括DNA提取、DNA模板浓度、引物浓度、退火温度、循环次数和引物筛选等.结果表明:从48条引物中选择4个条带清晰的引物对7个品种进行扩增,共检测出15条带,其中多态性带为12条,多态性比例为80％,能把7个花生品种区分开采.本试验为花生品种鉴定和新品种选育提供理论依据.     

茄子作物中微卫星的鉴定和描述

分子标记被认为是作物育种、基因型鉴定和研究基因组机体构成和演变的有用方法；基因组制图是应用分子标记最重要的一种。DNA基础标记的问世在近10年间显著地简化了几种作物基因组的制图。分子标记和控制有价值农艺性状的基因间的连锁可以     

IRAP分子标记在茄子种质资源亲缘关系分析中的应用

参考马铃薯和烟草的反转录转座子LTRs保守区域设计引物,对34份茄子材料进行PCR扩增,得到了多态性丰富的指纹图谱。聚类分析将34份茄子材料分为三大类群,表明IRAP分子标记适合于茄子种质资源的亲缘关系分析。     

用ISSR分子标记鉴定亚洲百合杂种F1代

百合杂交育种工作中,只有确定杂种的真实性,才能确定杂交工作是否成功。利用ISSR-PCR分子标记方法对5个亚洲百合系内杂种进行鉴定,建立了百合ISSR最佳扩增反应体系,从15个ISSR引物中筛选出了2个多态性引物,共扩增得到29条DNA条带,其中多态性条带24条,占总条带数的82.76%。结果表明,5个杂种多数条带和亲本共有,出现双亲相加性带型,或双亲各自特有条带,部分杂种出现双亲均没有的条带从这些特异的带型,我们可初步鉴定杂种的真实性。实践证明,ISSR分子标记,是百合杂交育种中杂种检测的快速简便手段。