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《中国农业科技导报》2012,(4):153
植物小分子RNA整合分析软件psRobo开发完成植物小分子RNA,主要包括microRNA和小干扰RNA,在基因的转录和转录后调控过程中具有重要作用。第二代测序技术的广泛应用极大地推动了小分子RNA的相关研究,对不同组织和材料中的小分子RNA进行深度测序已成为研究的常 相似文献
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【目的】分析寄生疫霉菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,为探明microRNA对应靶标基因的调控网络及其可能的病理学和生物学功能奠定基础。【方法】以寄生疫霉菌(Phytophthora parasitica)和模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,鉴定在病菌侵染胁迫下拟南芥表达的microRNA,构建其靶标调控网络,并进行Gene Ontology和蛋白质结构域富集分析。【结果】在寄生疫霉菌侵染拟南芥的Solexa测序文库中鉴定39条拟南芥microRNA,筛选出了5个转录因子相关的调控网络;Gene Ontology富集结果表明,在生物学过程中,转录调控相关的基因显著富集;蛋白质结构域富集结果表明,靶基因中转录因子显著富集。【结论】拟南芥响应寄生疫霉菌microRNA靶标基因的功能主要集中在转录因子的调控功能上。 相似文献
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植物盐胁迫抗性的分子机制研究进展 总被引:7,自引:0,他引:7
土壤盐渍化是目前影响农作物产量和质量的主要环境因子之一。植物对盐胁迫的适应非常复杂,提高作物的耐盐性仍然面临着极大的挑战。本文对SOS信号(salt overly sensitive)转导途径、microRNA和转录因子在盐胁迫中的调控作用进行了综述,旨在为后期抗盐性研究与耐盐育种提供基础支持。 相似文献
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植物miRNA是广泛分布于植物基因组的长度在22个核苷酸左右的内源性非编码调控RNA,是真核生物基因表达的一类负调控因子,主要通过指导靶基因的切割或降低靶基因的翻译从转录后水平上抑制植物基因表达,在控制植物的发育、开花时序、新陈代谢、应激反应等方面起着重要的作用.已知植物miRNA在转录后水平上抑制基因表达,主要是通过导致mRNA的裂解,对抑制目标转录物的翻译起作用.综述了植物miRNA形成、作用机理、功能和研究方法等方面的研究进展. 相似文献
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猪背最长肌与腰大肌microRNA表达谱分析 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】为研究microRNA在猪肌肉生长发育中的作用。【方法】采用Illumina高通量测序技术对猪背最长肌和腰大肌的microRNA转录组进行测定,并鉴定差异表达的microRNA。【结果】在猪背最长肌和腰大肌文库中分别产生了15.22M和17.52M的序列;两个文库共检测到的695个microRNA,其中有363个共表达、193个差异极显著(P<0.01)。【结论】说明microRNA在不同骨骼肌类型中存在差异表达。 相似文献
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MYC转录因子属于植物bHLH类转录因子家族,为该家族中研究较多的转录因子.综述了不同植物分离克隆的MYC转录因子的结构与特性,分析了其在植物的生长发育、抗逆反应、次生代谢产物合成、激素信号途径中起着重要的作用,为MYC转录因子在不同植物基因工程和代谢工程中改造应用,提高非生物胁迫耐受性以及药用活性成分的产量等研究提供参考. 相似文献
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干旱是常见且反复出现的气候特征,严重影响农作物生产.microRNAs(miRNAs)是一类长度为18~24 nt的小分子非编码RNA,转录后的miRNAs可调节基因表达,参与植物生长发育过程.从miRNAs 的发现、合成及作用机制,干旱胁迫响应miRNAs 的种类及其靶基因、miRNAs介导干旱胁迫的响应机制等方面进... 相似文献
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Jingyi WANG Juhua LIU Caihong JIA Hongxia MIAO Jianbin ZHANG Zhuo WANG Biyu XU Zhiqiang JIN 《农业科学与工程前沿(英文版)》2016,3(4):335
Cold stress is an environmental factor affecting plant development and production. Recently, microRNAs (miRNAs) have been found to be involved in several plant processes such as growth regulation and stress responses. Although miRNAs and their targets have been identified in several banana species, their participation during cold accumulation in banana remains unknown. In this study, two small RNA libraries were generated from micropropagated plantlets of Musa balbisiana grown at normal and low temperature (5°C). A total of 69 known miRNAs and 32 putative novel miRNAs were detected in the libraries by Solexa sequencing. Sixty-four cold-inducible miRNAs were identified through differentially expressed miRNAs analysis. Among 43 miRNAs belonging to 26 conserved miRNA families with altered expression, 18 were upregulated and 25 downregulated under cold stress. Of 21 putative novel miRNAs with altered expression, four were downregulated and 17 upregulated. Furthermore, eight miRNAs were validated by stem-loop qRT-PCR and their dynamic differential expression was analyzed. In addition, 393 target genes of 58 identified cold-responsive miRNAs were predicted and categorized by function. These results provide important information for further characterization and functional analysis of cold-responsive miRNAs in banana. 相似文献
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microRNAs(miRNAs)是约21nt的非编码RNA,主要在转录后水平调节基因的活性。miRNAs通过与靶基因的互补位点结合从而降解靶基因mRNA或抑制其翻译。miRNAs 参与调控植物生长发育的多个方面,包括生长、开花、代谢、激素应答、生物与非生物胁迫。综述了miRNAs在植物花发育中的研究进展,以期为更好地了解miRNA在此过程中的作用机制,并应用于改良植物的农艺性状及培育优良品种奠定基础。 相似文献
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MicroRNA是一类广泛存在于动植物中长约21 nt的非编码小分子RNA,主要通过内切核苷酸或者翻译抑制调节基因转录后表达。植物MicroRNA在植物的生长发育、开花时序、新陈代谢及环境胁迫等方面起重要作用。简述了植物MicroRNA的生物发生、作用机制及调控功能,并在此基础上综述了高通量测序技术在植物MicroRNA研究中的最新应用进展。 相似文献
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利用土钻法对不同封育年限下石灰岩山地植被细根生物量进行对比研究。结果表明院封育5 年林分细根
生物量为6.6287 t/hm2,封育10 年林分细根生物量为2.3063 t/hm2,封育20 年林分细根生物量为3.1316 t/hm2,封育
30 年林分细根生物量为2.8316 t/hm2;不同封育年限下细根生物量均随着土层深度的增加而降低,0~10 cm 土层的细
根生物量明显高于其他两个土层;不同封育年限细根生物量年动态变化均呈现双峰型。 相似文献