不同品种猪α1-岩藻糖转移酶基因遗传变异初析

本实验采用PCR RFLP方法对 5个瘦肉型猪种杜洛克、长白猪、大白猪、汉普夏猪和皮特兰猪共计 2 5 0头猪的α1 岩藻糖转移酶基因 (FUT1)进行多态性分析。结果表明 :本研究中的 5个猪种在该FUT1基因座位存在多态性 ,均分布着三种基因型 (AA ,AG和GG) ,抗性基因型AA分布频率为 0 .0 2 8,易感基因型AG与GG分布频率分别为0 .2 4 4和 0 .72 8。卡方检验结果表明 ,长白猪与大白猪基因型频率差异极显著 (P <0 .0 1) ,与皮特兰猪之间差异显著(P <0 .0 5 ) ,其它猪种之间差异均不显著。     

塔里木马鹿血液蛋白多态性的研究

本研究采用垂直聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,分析了 3 3头塔里木马鹿的血清白蛋白 (Alb) ,后白蛋白 (Po) ,转铁蛋白 (Tf) ,后转铁蛋白 (Ptf) ,血清蛋白酶抑制物 1 (Pi Ⅰ) ,血清蛋白酶抑制物 2 (Pi Ⅱ) ,后白蛋白 1 (Po Ⅰ) ,后白蛋白 2 (Po Ⅱ)共 8个蛋白座位的基因型频率、基因频率和群体遗传变异指标。结果表明 ,Po Ⅱ和Alb座位呈单态 ,其余各蛋白座位均呈多态。在多态座位中Pi Ⅱ和Po Ⅰ各有 3种基因型 ,分别受两个等位基因所控制。Ptf有 6种基因型 ,受3个复等位基因控制。Po有 4种基因型 ,Tf和Pi Ⅰ各有 3种基因型。群体遗传变异指标 (杂合度 )计算结果表明 ,Ptf,Tf和Po的杂合度较高 ,分别为 0 .6 3 0 5 ,0 .6 1 2 9和 0 .5 94 6 ,有效基因数也较多 ,分别为 2 .70 6 1 ,2 .5 83 6和 2 .4 6 6 6。     

东北马鹿血清三种蛋白(酶)多态性的研究

采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,分析了57头东北马鹿的红细胞碳酸酐酶(CA)、血清后转铁蛋白(Ptf)、血清转铁蛋白(Tf)3个蛋白座位的基因型频率、基因频率和群体遗传变异指标。结果表明:所检测马鹿(大兴安岭)平均杂合度为0.3345,在各血液蛋白位点中,CA的变异程度最大,杂合度顺序为CA>Ptf>Tf各位点有效等位基因数的大小顺序和杂合度大小顺序一致。     

泰和乌骨鸡部分血液蛋白质座位多态性研究

采用不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定了泰和乌骨鸡的6个血液蛋白质(酶)座位。结果表明运铁蛋白(Tf)、碱性磷酸酶(Akp1)、前白蛋白(Pa)、淀粉酶(Amy1)、后运铁蛋白(Ptf)和酯酶(Es1)6个蛋白座位表现多态性,照像记录了典型的蛋白质电泳区带,并计算了各座位的基因型频率和基因频率。其平均杂合度为0.404。分析表明,泰和乌骨鸡遗传多样性程度相对较高,遗传选择潜力大,可为我国地方鸡种的保护、开发、利用提供良好的素材。     

新疆天山马鹿血液蛋白多态的研究

采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,分析了40头新疆天山马鹿的血清白蛋白(Alb),前白蛋白(Pro),转铁蛋白(Tf),前转铁蛋白(Prt),血红蛋白(Hb)5个蛋白座位的基因型频率、基因频率和群体遗传变异指标,以便为天山马鹿选种选配繁育工作提供理论依据。结果表明,Alb座位呈单态为AA型,其余各蛋白座位均呈多态。Pro有1种基因型AB,受A、B 2个等位基因控制;Hb有2种基因型AB、BB,受A、B 2个等位基因所控制;Prt有5种基因型AA、AB、BB、AC、BC,受A、B、C 3个等位基因控制;Tf有4种基因型AB、BB、AC、BC,受A、B、C 3个等位基因控制。群体遗传变异分析结果表明,Prt、Tf、Alb、Pro、Hb的杂合度分别为0.667,0.610,0,0.513,0.431。基因多态信息含量分别为0.575,0.528,0,0.375,0.332。平均杂合度为0.4442,平均多态信息含量为0.362,表明天山马鹿的遗传多样性丰富,具有较大的遗传潜力。     

猪微卫星座位杂合度与肌肉肌苷酸含量的关系

英系大白猪和梅山猪产生的139头F2代个体用作试验猪。分析猪1、2和6号染色体的24个微卫星座位与肌肉肌苷酸的关系,发现5个座位与肌苷酸含量显著关联(P<0 05)。它们分别是1号染色体的Sw2185、2号染色体的Sw2516、S0170、Sw1883和Sw2192。6号染色体9个微卫星座位均没有显著的相关(P>0 05)。这提示2号染色体的一些基因或QTL对肌苷酸含量有较大的遗传作用。分别以24个座位分类、以5个显著关联座位分类和以19个中性座位分类来研究基因杂合度与肌苷酸含量的关系,结果均表明随着基因杂合度增加,肌苷酸含量呈下降趋势。其中前两者分析结果大体一致。基因杂合度在0 5～0 8范围内,每增加0 05则肌苷酸含量下降幅度大约是群体肌苷酸均值的1 2%～7 5%。提示显著关联座位在肌苷酸的杂种优势中可能具有重要的遗传效应。同时,在应用微卫星标记估计基因杂合度与肌苷酸含量的关系时,尽可能选用显著关联座位,可以作到多快好省。     

甘肃滩羊血液蛋白多态性及标记性状的应用研究

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,测定分析了甘肃皋兰、景泰及靖远 3个滩羊种群Hb、Tf、Es、Amy、Alb、EP - 1、EP - 2 7个蛋白座位的多态性。除了Amy、Alb、EP - 1、EP - 2四个座位呈现单态外 ,其余 3个蛋白座位都表现出丰富的多态性。Hb、Tf、Es在 3个滩羊地方种群中表现出地区分布和选育不同程度的差异性。Hb和Es基因座各具有 3种基因型 ,受两个等位基因控制 ,其中HbB 基因在 3个群体中均占优势。Es-基因在皋兰和景泰群体中占优势 ,Es+ 在靖远群体中占优势 ;Tf基因座有 2 1种基因型 ,受 8个复等位基因控制 ,其中TfB、TfC 基因和TfBC、TfCC基因型在 3个群体中均占优势。甘肃滩羊 3个地方种群的Nei氏预期平均基因杂合度 (H)都很低 ,其值分别为 0 .2 0 37、0 .2 0 2 1和 0 .2 2 5 4 ;滩羊群体间的平均基因多样度 (Dst)和基因分化系数 (Gst)的值分别为 0 .0 0 19和 0 .0 0 90。结合羔羊肥育试验筛选出HbAA、Es+ + 两个高产基因型 ,作为滩羊肉用选育方向的标记辅助选择 ,并建立了与部分生产性能相关的多元回归线性数学模型     

不同品种猪SLA-DQA、FUT1和MUC4基因遗传变异初析

为了解析地方猪种淮南猪抗逆性强的分子机制,试验采用PCR-RFLP方法对4个猪种(淮南猪、杜洛克猪、大白猪和长白猪共计395头)的猪耳组织白细胞抗原(SLA)-DQA基因、α-1岩藻糖转移酶基因1(FUT1基因)和4型黏蛋白(MUC4)基因进行多态性分析。结果表明:4个猪种在SLA-DQA基因座位存在多态性,AA型在4个猪种中基因型频率最高,淮南猪为中等多态,其他3个猪种为低度多态,淮南猪与长白猪、大白猪品种间基因型分布差异极显著(P0.01),淮南猪与杜洛克猪品种间基因型分布差异不显著(P0.05);FUT1基因座位也存在多态性,GG基因型在4个猪种中基因型频率最高,淮南猪、大白猪和杜洛克猪都是中等多态,长白猪是低度多态,淮南猪与长白猪品种间基因型分布差异极显著(P0.01),淮南猪与大白猪、杜洛克猪品种间基因型分布差异不显著(P0.05);MUC4基因座位同样也存在多态性,AA基因型在淮南猪、长白猪和大白猪中基因型频率最高,AG基因型在杜洛克猪中基因型频率最高,淮南猪和杜洛克猪都是中等多态,大白猪是低度多态,淮南猪与长白猪、杜洛克猪品种间基因型分布差异极显著(P0.01),淮南猪与大白猪品种间基因型分布差异显著(P0.05)。说明淮南猪在这3个基因上都有着较高的遗传多样性,更适合用于抗病育种研究的实践中。     

塞北兔群体遗传变异的微卫星标记

检测了125只塞北兔在6个微卫星座位的基因型,分析了等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量等参数值,并对塞北兔在6个微卫星座位Hardy-Weinberg平衡检验。结果显示:塞北兔在6个微卫星座位共检测到的等位基因30个,每个基因座位为4~6个,等位基因大小在129~244bp之间,塞北兔除了在SOL03基因座位呈中度多态性变异以外,在SOL33、SOL44、7L1B10、L7C11和SAT12等5个微卫星座位呈高度多态性变异;除了在基因座位SOL33和SAT12以外,塞北兔在其他4个基因座位SOL03、SOL44、7L1B10、L7C11均处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

兰州大尾羊血液蛋白(酶)多态性的研究

以126只兰州大尾羊为实验对象,采用不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)对血清酯酶(Es)、淀粉酶(Amy)、乳酸脱氢酶(LDH)、血红蛋白(Hb)、白蛋白(Alb)、后白蛋白(Po)和转铁蛋白(Tf)等7个蛋白位点进行了多态性检测和遗传多态性分析。结果表明,在所检测的7个蛋白位点中,Es、Hb、Po和Tf等4个蛋白位点表现多态性,而Alb、Amy和LDH等3种蛋白(酶)未检测到多态性。其中,Es基因座上共检测到3种基因型,即Es++、Es+-、Es--;Po基因座上表现出2种基因型,即AA、AB;Tf蛋白位点上表现出5种基因型,分别为AC、BB、CC、BC、CD;Hb蛋白位点上表现出3种基因型,分别是AA、AB、BB。群体遗传分析表明,Es、Hb、Po、Tf的杂合度分别为0.4987、0.4574、0.3346、0.5547。Es、Hb、Po、Tf蛋白位点有效等位基因数分别为1.9948、1.8430、1.5029、2.2457。卡方检验表明,在Es、Po、Tf、Hb多态性位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。兰州大尾羊种内平均有效等位基因数、平均杂合度、平均多态信息含量分别为1.8966、0.4614、0.3802。平均杂合度和有效等位基因数呈明显下降趋势。     

6个猪种胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因座位遗传多态性检测

本文采用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ分析方法对我国地方猪种民猪、香猪、桃源猪、内江猪、姜曲海猪以及用作对照的国外猪种杜洛克猪的ＩＧＦ－１基因座位进行研究。结果发现：ＩＧＦ－１基因ＰＣＲ扩增片段存在２个限制性内切酶ＨｈａＩ酶切位点,其中１个酶切位点产生遗传多态。此片段上共产生２个等位基因。在ＩＧＦ－１基因位点上,香猪除与桃源猪基因频率差异不显著之外,与其它猪种之间基因频率差异极显著（Ｐ＜０．０１）,而其它各猪种之间差异均不显著     

江西地方猪种血液蛋白及酶的多态性研究

采用聚丙烯酰胺凝胶和淀粉凝胶电泳方法测定了１４个江西地方猪种的血清转铁蛋白（Ｔｆ）、前白蛋白（Ｐａ）、后白蛋白（Ｐｏ）、淀粉酶（Ａｍ）、血液结合素（Ｈｐｘ）和铜蓝蛋白（Ｃｐ）的多态性，统计和计算了基因频率、标准遗传距离，并进行了聚类分析。结果表明，江西地方猪种在Ｔｆ、Ｐａ、Ｐｏ、Ａｍ、Ｈｐｘ位点存在高度的多态性，各品种间的标准遗传距离从０．００５５～０．２２５１不等，显示江西地方猪种存在明显的遗传多样性。     

五指山猪小群体遗传学检测

本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测,用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,统计了群体平均基因纯合率、等位基因数,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)。统计结果:全群平均基因纯合率为66.5%;平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0.807、0.338、0.835;每个位点平均等位基因数为11.92,此结果说明该群体虽然近交程度较高,但仍具有丰富的遗传多样性,遗传变异较大。     

湖南地方猪种群亲缘关系的生化遗传学研究

采用改进的淀粉凝胶电泳测定了湖南地方猪11个种群的T_f 、Pa、Hpx、Po、Cp、Am多态性,统计和计算了基因频率,标准遗传距离及其位点内取样方差,作了聚类分析。揭示了湖南地方猪种6个血清蛋白质位点的遗传规律;将湖南地方猪11个种群分为3类。分析了湖南地方猪与江西、东亚地方猪和美国猪种的遗传关系。     

10个云南地方猪种微卫星遗传多样性分析

为阐明保山猪、迪庆藏猪、高贡黎山猪、丽江猪、明光小耳猪、滇南小耳猪、撒坝猪、大河猪、昭通猪、大河乌猪10个云南省优良地方猪种的群体遗传多样性和遗传结构,本试验参考ArkDB数据库中家猪14条染色体上的15对微卫星引物,对549个云南地方猪个体的耳组织样品进行了检测分析,计算各微卫星座位等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon's信息指数（I）、表观杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、F-统计量（Fis、Fit、Fst）、基因流（Nm）、群体遗传距离等相关参数及多态信息含量（PIC）,采用NTsys 2.10软件构建聚类树,并采用STRUCTRUE 2.3.3软件评估群体遗传结构。结果显示：15个微卫星座位共检测到293个等位基因,各座位等位基因数在5~38个之间,平均等位基因数为19个,平均有效等位基因数8.3682个;10个云南地方猪群体的Shannon多样性、表观杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别在1.4374~2.0317、0.6389~0.7756、0.7021~0.8281和0.6647~0.7993之间。各座位单个群体内近交系数（Fis）、总群体近交系数（Fit）、群体间遗传分化系数（Fst）的变化范围分别为-0.0678~0.4594、0.0618~0.5567和0.0713~0.1801;群体间Fst平均值为0.1101,处于中度遗传分化状态,有11.01%的遗传变异来自于群体间,大部分遗传变异来自于群体内;每个座位基因流程度较高,变化范围在1.6392~3.2551之间,平均值为2.0214。基于Nei氏遗传距离构建UPGMA系统发生树显示,高黎贡山猪与迪庆藏猪聚为一支,并与丽江猪、保山猪和明光小耳猪聚为一大支,其结果得到了STRUCTURE分析的验证。综上所述,10个云南地方猪种遗传多样性丰富,群体内有近交现象,群体间处于中度遗传分化,存在着一定的基因交流。     

东佛里生羊MSTN基因多态性及其与生长性状的关联分析

试验旨在研究肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因多态性及其对东佛里生羊生长性状的影响。从324只东佛里生羊全血中提取DNA,对MSTN基因外显子序列和非翻译区(untranslated region,UTR)序列进行PCR扩增,采用一代测序技术鉴定单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,分析不同位点的遗传多态性,并将不同基因型与东佛里生羊的生长性状进行关联分析。结果显示,在东佛里生羊MSTN基因外显子中未检测到突变;在3'-UTR区的272 bp处存在G→A单碱基突变,该位点只检测到AG和AA基因型,且AA基因型频率高于AG基因型;在5'-UTR区的176 bp处存在C→A突变,该位点只检测到CC和AC基因型,且CC基因型频率高于AC基因型。遗传多样性参数分析结果表明,东佛里生羊群体MSTN基因3'-UTR-272和5'-UTR-176位点的纯合度分别为0.827和0.887,杂合度分别为0.173和0.113,2个位点的多态性均较低(PIC<0.25),其群体基因型分布均符合哈代-温伯格平衡(P>0.05)。关联分析发现,3'-UTR-272位点AG基因型体斜长显著高于AA基因型(P<0.05),5'-UTR-176位点CC基因型胸围显著高于AC基因型(P<0.05),其余指标均无显著差异(P>0.05)。综上,东佛里生羊MSTN基因3'-UTR和5'-UTR突变位点可作为其目标性状选育的分子标记。     

BMPR-IB、BMP15、ESR、GDF9与ADAMTS1基因多态性与杜泊羊繁殖性状的关联性分析

为揭示绵羊繁殖力的影响机制,利用分子标记辅助选择来快速提高绵羊的繁殖性能,本实验采用直接测序法对杜泊羊与湖羊群体5个基因中的突变位点进行了比较分析。结合测序后序列通过DNAStar软件预测蛋白质二级结构;统计基因型频率、基因频率、纯合度、杂合度和多态信息含量并将基因多态性与产羔数进行关联分析。结果表明:杜泊羊ESR2基因中的RS428438934位点处发生T→C突变,导致氨基酸发生了改变,CC与CT、TT与CT基因型之间产羔数差异显著;RS418841713在杜泊羊与湖羊中都具有多态性,处于不平衡状态;RS398521635、RS402413016、G7、G8、RS417060437、RS604746425在杜泊羊与湖羊中均只有1种基因型,无突变类型,处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

青海本地黄牛乳蛋白的多态性

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳法对 84头青海本地黄牛的 4种乳蛋白多态性进行了研究。结果发现 :( 1 )α -乳白蛋白、β-乳球蛋白、αs1-酪蛋白和 β-酪蛋白等 4种乳蛋白都存在多态性 ;( 2 ) 4种乳蛋白的平均基因杂合度为 0 .2 0 0 8;平均基因均质度指数为 0 .62 82 ,平均有效等位基因数为 1 .2 869;( 3 )在青海本地黄牛中发现一个新等位基因αs1-CNE     

利用微卫星标记分析乌骨大骨鸡的遗传多样性

利用微卫星标记分析了乌骨大骨鸡的遗传多样性和遗传结构,筛选了鸡基因组7条染色体上的7个微卫星标记位点,随机选取24羽乌骨大骨鸡个体,进行多态性检测,共检测到23个等位基因,每个座位等位基因数目从2个到5个不等,平均等位基因数为3.3个。该群体平均多态信息含量和平均杂合度分别为0.660 3和0.717 6。结果表明乌骨大骨鸡属多态性较丰富的群体。     

摩拉水牛二酰甘油酰基转移酶2基因的多态性检测

本研究旨在检测水牛二酰甘油酰基转移酶2（diacylglycerolacylt-ransferase,DGAT2）基因的单核苷酸多态性（SNP）,探究摩拉水牛多态性位点的群体遗传特征。以广西水牛研究所的57头摩拉水牛为材料,PCR扩增DGAT2基因的部分序列（外显子2及内含子2、3）,通过常规测序法检测其SNP,并运用遗传多样性分析软件（POPGENE）和SPSS软件对群体的多态性位点进行基因频率、基因型频率、多态信息含量（PIC）、有效等位基因数（Ne）及遗传杂合度（He）的检测。结果表明,在摩拉水牛DGAT2基因外显子2和内含子2、3上共发现了9个SNPs位点（IVS2.54 G > A、IVS2.158 A > G、EVS2.191 A > G、EVS2.228 A > G、IVS3.311 C > T、IVS3.444 A > G、IVS3.451 A > C、IVS3.466 C > T、IVS3.521 C > T）,其中EVS2.191 A > G位点的突变导致氨基酸由异亮氨酸突变为缬氨酸,突变位点间存在一定程度的连锁遗传但接近连锁平衡状态。从基因频率上看,IVS2.158 A > G、EVS2.191 A > G、IVS3.311 C > T、IVS3.451 A > C、IVS3.466 C > T和IVS3.521 C > T 6个SNPs位点的两个等位基因频率有较大差异,提示等位基因频率较大的基因个体可能更适合生存。9个SNPs位点在摩拉水牛品种上多处于高度多态,杂合度在0.1744~0.4975之间,说明摩拉水牛群体中DGAT2基因遗传多态性丰富,具有较大的育种价值和性状改良潜力。