Association Analysis of MUC13 Gene Polymorphisms with Diarrhea in Huanjiang Miniature Pigs

The purpose of the study was to analyze the association between MUC13 gene polymorphisms and piglet diarrhea in Huanjiang miniature pigs.93 diarrhea piglets and 95 healthy controls were included in the study.The MUC13 gene polymorphisms were determined using high resolution melting (HRM),and the results of HRM were verified by direct sequencing.Mutations were compared between diarrhea piglets and healthy controls.SHEsis online platform was used to calculate the haplotypes.There were statistically significant association on G224A site showed significant difference between diarrhea piglets and healthy controls by allele frequencies (P < 0.05),and there were also statistically significant differences between the two groups by genotypes among GG,GA,GG+GA and AA (P < 0.05).But no statistically significant association was found between polymorphisms of A112G,T170C and G164C sites and piglet diarrhea risk (P > 0.05).However,haplotype Ⅹ (GTAC) in the distribution of diarrhea group was extremely significantly higher (P < 0.01).The present data revealed that MUC13 gene G224A site and the haplotypes Ⅹ (GTAC) were associated with reduce risk of piglet diarrhea.     

香猪NRAMP1基因多态性与仔猪腹泻的研究

天然抗性巨噬蛋白1(natural resistance associated macrophage protein 1,NRAMP1)基因是与人、鼠的一些病原微生物(如分支杆菌中的沙门氏伤寒菌等)的易感性和抗性有关的重要候选基因。本研究利用PCR-RFLP技术,分析了香猪的NRAMP1基因第6内含子的NdeⅠ酶切位点的多态性;观测记录哺乳仔猪的腹泻情况,结果发现,NRAMP1基因的第6内含子的NdeⅠ酶切位点在各品种猪表现出丰富的多态性,该酶切位点的基因频率和基因型频率在各猪种中分布趋于一致,香猪不同品系基因型与腹泻指数统计分析结果显示,Ⅰ系、Ⅱ系差异不显著,11世代显著高于10世代。     

猪SLA-DRA基因外显子2多态性及其与仔猪腹泻的关联分析

为探索SLA-DRA基因作为猪抗病育种分子标记的可能性,本研究采用PCR-SSCP和克隆测序方法对大白、长白和杜洛克共216头猪的SLA-DRA基因外显子2进行了多态性研究,分析了该基因与仔猪腹泻的关联性。结果,在SLA-DRA外显子2上检出了3个等位基因和6种基因型;6种基因型(AA、AB、BB、AC、BC和CC)在大白猪和长白猪中都存在,而在杜洛克猪中只检出4种基因型(AA、BB、AB和BC)。杜洛克猪与大白猪和长白猪间基因型分布均差异极显著(P<0.01);3个品种的基因型分布均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。最小二乘法分析表明,品种和性别对仔猪腹泻影响不显著(P>0.05),基因型与仔猪腹泻显著相关(P<0.05);AA和BB基因型个体腹泻评分的最小二乘均值均显著高于AC和CC基因型个体(P<0.05)。本研究表明,SLA-DRA基因不同基因型对仔猪腹泻有着重要的影响,可作为猪抗病育种应用中的一个潜在遗传标记。     

致仔猪腹泻产肠毒素大肠杆菌黏附素研究进展

黏附素(adhesion)是仔猪腹泻性大肠杆菌的一种毒力因子。大肠杆菌只有依靠黏附素黏附到小肠黏膜上皮细胞才能避免肠蠕动和肠液分泌对其的清除作用,并得以在肠内定居和繁殖,进而分泌肠毒素,导致腹泻。此文从黏附素主要类型、黏附素的表达条件、对肠黏膜黏附的特异性及其疫苗在仔猪腹泻防治中的应用等方面阐述了致仔猪腹泻的产肠毒素大肠杆菌最常见的几种黏附素的研究概况。     

香猪仔猪腹泻的诊断及药敏试验

为寻找香猪仔猪腹泻病原,对病原进行鉴定及药敏试验,现将结果报告如下:长白、两头乌仔猪腹泻经细菌学检查为埃希氏大肠杆菌引起,久仰香猪仔猪腹泻确定为仔猪副伤寒沙门氏杆菌引起.久仰香猪仔猪检出的细菌再用药敏试验来筛选病菌对药物的敏感性,其中氯霉素及氟哌酸最敏感,抑菌圈≥17 mm,庆大霉素处于中介,抑菌圈13～14 mm,氨苄青霉素最不敏感,抑菌圈≤12 mm.久仰香猪仔猪对致病性大肠杆菌侵袭不敏感.     

环江香猪断奶仔猪血液生理生化指标的测定

对环江香猪2月龄断奶仔猪60头(♂30头,♀30头)分别进行血液生理生化指标和血清钙、磷、钠、钾、氯的测定和分析。结果表明,母猪的红细胞总数、红细胞压积、嗜酸性白细胞、β-脂蛋白、尿素氮和碱性磷酸酶显著高于公猪(p<0.05),而淋巴细胞、血清总蛋白和胆碱脂酶显著低于公猪(p<0.05),其他血液生理生化指标和血清钙、磷、钠、钾、氯无明显性别差异(p>0.05)。     

剑白香猪脂联素基因遗传多态性分析

为了研究剑白香猪脂联素基因遗传多态性,研究采用PCR及测序技术对其进行检测.结果表明:在杂种猪中检测到2个变异位点,178位点和1165位点发生A/G碱基间的转换,在178位点观察到3种基因型即AA型、aa型、Aa型;在1165位点观察到dd型、DD型、Dd型.在剑白香猪每个位点上只观察到1种基因型,分别为AA型和dd...     

沃金黑牛GPR41基因多态性及其与不同阶段生长性状的相关性分析

[目的]研究旨在探讨GPR41基因多态性对沃金黑牛不同阶段生长性状的影响。[方法]试验共选取63头沃金黑牛(去势公牛)为研究对象,采用Sanger测序技术法检测单核苷酸多态性(SNP)位点,利用Haploview软件进行单倍型分析。利用“牛等家养动物群体遗传分析工具V1.0”评价沃金黑牛群体遗传结构,利用SPSS 19.0软件分析GPR41基因多态性与生长性状的相关性。[结果]结果发现,沃金黑牛GPR41基因外显子2存在2个突变位点,分别为S1:Chr18:46058902 bp处的G/T突变和S2:Chr18:46058908 bp处的C/T突变;S1、S2位点多态性与沃金黑牛不同生长阶段部分生长性状存在显著相关(P<0.05);2个SNPs位点共形成3种有效单倍型组合,单倍型组合H2H2(TT/CC)显著影响沃金黑牛体斜长与背膘厚。[结论]结果表明,GPR41基因SNP位点存在遗传多态性,可用于沃金黑牛(去势公牛)主要生长性状的基因标记参考、稳定与优化。     

贵州白香猪BF基因多态性研究

贵州白香猪为贵州特有的地方品种猪,本研究采用直接测序法对贵州白香猪BF基因外显子15、16、17的733bp进行多态性分析。结果显示,在第16外显子41bp处存在A→C的碱基突变,导致编码的氨基酸由谷氨酸（Glu）突变为天冬氨酸（Asp）。在贵州白香猪群体内检测到AA、AC和CC3种基因型,等位基因A和C频率分别为0.88和0.12。     

贵州白香猪apoA5基因多态性初步分析

贵州白香猪为贵州特有的地方品种,为了研究贵州白香猪apoA5基因多态性,试验采用直接测序法对贵州白香猪apoA5基因全序列2 473 bp进行单核苷酸多态性(SNPs)检测.结果表明:在apoA5基因的内含子2和外显子3中分别检测出1个、11个变异位点;有4个突变发生在氨基酸编码区内,其中3个突变为同义突变,而G1 1...     

杜洛克猪HLCS基因多态位点与生长发育性状的相关性分析

本研究旨在明确羧化全酶合成酶（holocarboxylase synthetase,HLCS）基因突变与杜洛克猪生长发育性状的相关性。利用Illumina SNP60芯片测序结果研究HLCS基因的突变位点,分析突变位点的多态性信息、突变位点与生长发育性状的关联性及突变位点的单倍型。结果显示,杜洛克猪HLCS基因具有4个SNPs位点：Ssc13：200455646 T>C、Ssc13：200458655 G>C、Ssc13：200504530 G>T、Ssc13：200551864 T>G,均符合Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）,呈现中度多态性。关联分析结果发现,Ssc13：200455646 T>C位点TT基因型100 kg背膘、剩余采食量均显著高于TC和CC基因型（P<0.05）;Ssc13：200458655 G>C位点GG基因型个体100 kg背膘、剩余采食量均显著高于CG和CC基因型（P<0.05）;Ssc13：200504530 G>T位点GT基因型平均日采食量、平均日增重均显著高于TT基因型（P<0.05）,GT基因型个体100 kg日龄显著小于TT基因型（P<0.05）;Ssc13：200551864 T>G位点TG基因型平均日采食量、平均日增重均显著高于GG基因型（P<0.05）,TG基因型个体100 kg日龄显著小于GG基因型（P<0.05）;其余性状各位点不同基因型间无显著差异（P>0.05）。Ssc13：200455646 T>C和Ssc13：200458655 G>C位点呈现高度连锁,Ssc13：200504530 G>T与Ssc13：200551864 T>G位点呈现高度连锁。结果表明,HLCS基因4个SNPs位点的多态性与杜洛克猪的剩余采食量、平均日采食量、平均日增重、100 kg日龄和100 kg背膘均具有显著相关性,可为猪的生长发育遗传改良奠定基础。     

Differential Expression Analysis of MUC4 and MUC13 Genes Between Resistant and Sensitive Weaned Meishan Piglets to ETEC F18

MUC4 and MUC13 genes as important candidate genes for enterotoxigenic Escherichia coil (ETEC) F4 resistance,may play an important role in the process of against ETEC F18 infection in weaned piglets. In this study,ETEC F18-resistant and -sensitive weaned Meishan piglets were used,and the expression levels of MUC4 and MUC13 genes in 11 tissues (heart,liver,spleen,lung,kidney,stomach,muscle,thymus,lymph nodes,duodenum and jejunum) were determined by quantitative Real-time PCR. The results showed that MUC4 and MUC13 genes were broadly expressed with different expression levels in all the 11 tissues. In the thymus and lymph tissues,the expression of MUC4 gene in resistant piglets was significantly higher than that in sensitive piglets (P<0.05);In the lung tissue,theMUC13 gene expression level in resistant individuals was significantly higher than that in sensitive individuals (P<0.05),and in the intestinal tissues of duodenum and jejunum, the expression level of MUC13 gene was relatively higher in resistant individuals. Thus we speculated that the high expression of MUC4 gene in immune tissues and MUC13 gene in intestinal tissues might improve the immune ability of piglets,protect and lubricate the intestinal tract, and resist ETEC F18 infection.     

早期断奶仔猪营养性腹泻的分析及防治

仔猪腹泻是一种严重制约养猪业发展的疾病,其发生由应激、环境、营养等多种因素造成。本文主要从营养方面阐述了早期断奶仔猪发生腹泻的原因,并综合近年研究资料,论述了各种营养因素对仔猪营养性腹泻的改善作用,为研究合理的断奶仔猪日粮提供理论依据。     

北京黑猪MYH3和MYH13基因多态性与肉质性状的关联分析

【目的】 试验旨在研究肌球蛋白重链3（myosin heavy chain 3,MYH3）和肌球蛋白重链13（myosin heavy chain 13,MYH13）基因遗传变异对猪肉质性状的影响。【方法】 利用北京黑猪背最长肌样本进行肉质性状（肌内脂肪（intramuscular fat,IMF）、水分、滴水损失、酸碱度（pH）、肉色L^*值、肉色a^*值和肉色b^*值）表型数据的测定。利用PCR和Sanger测序技术对MYH3和MYH13基因启动子区和CDS区进行基因分型。将性别、场、日龄作为协变量,采用协方差分析,确定与猪肉质性状相关的SNPs,利用实时荧光定量PCR检测基因表达水平。【结果】 试验共筛选到9个SNPs,其中MYH3基因CDS区有1个错义突变（c.5782 G>C）与IMF显著相关（P<0.05）,且MYH3基因表达水平与IMF呈正相关;MYH13基因CDS区有4个SNPs,其中2个（c.1923 G>A、c.1308 G>A）与肉色a^*值显著相关,1个（c.963 G>A）与滴水损失显著相关,1个（c.237 G>T）与肉色L^*值显著相关（P<0.05）;MYH13基因启动子区有4个SNPs,其中2个（rs699287502、rs318639161）与肉色L^*值显著相关,2个（rs321315318、rs330770991）与滴水损失显著相关（P<0.05）,且MYH13基因表达水平与滴水损失呈负相关。【结论】 MYH3基因有1个SNP与IMF显著相关,且其基因表达水平与IMF呈正相关。MYH13基因中存在3个SNPs与滴水损失显著相关,且该基因启动子区2个SNPs基因表达水平与滴水损失呈负相关;3个SNPs与肉色L^*值显著相关;2个SNPs与肉色a^*值显著相关。以上SNPs均可作为影响北京黑猪肉质性状的候选基因功能位点。     

猪EPHA1基因多态性及其与产仔数的关联性分析

研究利用PCR-SSCP技术对大白、长白和杜洛克猪EPHA1基因外显子多态性及其与产仔数的关系进行了研究。结果表明:在第15外显子上检测到一个发生G→C颠换的突变位点,形成3种基因型。对于大白猪,3~6胎的GG型个体的产活仔数(NBA)比CC型个体高出1.66头(P<0.05);在所有胎次中,GG型个体的总产仔数(TNB)比CC型个体高出0.2头(P<0.01)。对于长白猪,第2胎GG型个体的TNB和NBA分别比CC型个体高出1.41头(P<0.05)和1.46头(P<0.05);所有胎次中,GC型个体TNB比CC型个体高出0.67头(P<0.05)。对于杜洛克猪,3种基因型个体的TNB和NBA差异不显著(P>0.05)。对于试验大白猪群体而言,该多态位点GG基因型可作为TNB性状的标记基因型。     

大白猪PTGS2基因外显子2多态性及其与繁殖性状的关联分析

试验旨在研究前列腺素内过氧化物合酶2（prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2）基因的单核苷酸多态性,并将其与大白猪的繁殖性状进行关联分析,为猪分子遗传标记提供依据。以美系及法系纯种大白猪基因组DNA为模板,构建DNA混合池,通过克隆测序比对,检测猪PTGS2基因的遗传变异;采用PCR-RFLP技术对多态性位点进行基因分型,并与目标性状进行关联分析。结果显示,在猪PTGS2基因外显子2上存在1个g.86A>G碱基突变,并具有Msp Ⅰ酶切位点多态性,且在大白猪群体中检测到AA、AG和GG 3种基因型;哈迪-温伯格平衡检验结果显示,在法系大白猪群体中,PTGS2基因g.86A>G多态性分布达到遗传平衡状态（P>0.05）。关联分析结果表明,在美系大白猪群体中,AA基因型初产母猪弱仔数显著少于AG基因型（P<0.05）,AA基因型经产母猪初生窝重显著高于AG基因型（P<0.05）;在法系大白猪群体中,GG基因型个体总产仔数、健仔数和初生窝重均高于AA和AG基因型,但未达到显著水平（P>0.05）。PTGS2基因外显子2 g.86A>G多态性位点显著影响初生窝重和弱仔数,可作为猪分子标记辅助选择育种的潜在位点。     

ITGB5和MUC13基因在产肠毒素大肠杆菌抗性和易感大白仔猪间的差异表达分析

为分析仔猪腹泻抗性候选基因在大白仔猪抗性和易感个体间的差异表达情况及组织表达特异性,实验利用荧光定量PCR技术检测整合素β5(ITGB5)基因和黏蛋白13(MUC13)基因在仔猪小肠、脾脏、肺脏、胸腺、肝脏和淋巴6种组织中的表达水平以及在产肠毒素大肠杆菌(ETEC F4)抗性和易感仔猪个体间的差异表达情况。结果表明:大白仔猪ITGB5基因在6种组织中均有一定的表达,在抗性个体小肠组织中的表达量低于易感个体(P>0.05);MUC13基因在小肠中高度表达,在其他组织中表达量较低,且抗性个体的表达量显著高于易感个体(P<0.05)。由此可知,小肠组织中ITGB5基因的低表达和MUC13基因的高表达可能有助于降低致病性大肠杆菌黏附到小肠上皮细胞上,进而实现对致病性大肠杆菌的抗性。ITGB5基因和MUC13基因可能与仔猪腹泻抗性存在密切关系,都可以作为抗性候选基因用于标记辅助选择,应用于抗腹泻仔猪的选育。