辣椒基因组SSR引物的开发及品种纯度分子鉴定

辣椒是世界上重要的蔬菜作物之一,基因组简单重复序列(simple sequence repeats,简称SSR)标记的开发对于辣椒分子育种和杂交种子纯度检测具有重要意义。为了检测辣椒品种绿陇3号杂交种子的纯度,基于辣椒全基因组序列开发了75对SSR标记。结果表明,只有SSR标记p50对父母本的扩增结果表现为带型清晰、共显性,且具有高多态性,可进一步用于杂交种的纯度检测。为了确保标记p50的准确性和可靠性,对其PCR产物进行了进一步测序。测序结果表明,在父母本中分别扩增出了251、293 bp的序列。用标记p50对绿陇3号辣椒进行纯度检测,结果显示,种子纯度为100%,鉴定结果与田间纯度一致。新SSR分子标记的开发,为辣椒杂交种子纯度的鉴定提供了参考,也为辣椒种质资源遗传多样性分析及分子育种研究奠定了基础。     

茄子SSR多态性标记筛选及杂交种纯度鉴定

[目的]建立一套快速、准确、高效的茄子杂交种纯度鉴定方法,为其制种过程中除伪存真及大面积推广应用提供技术支持.[方法]挑选已公布的48对SSR引物对2个茄子杂交种15-16和1-7的亲本进行多态性标记筛选,选取有效引物对茄子杂交种进行纯度鉴定,并结合田间植株纯度鉴定,验证SSR分子标记纯度鉴定的有效性.[结果]在48对SSR引物中,有12对引物在杂交种15-16亲本材料中存在多态性,其多态性引物带型呈互补带型的有8对(SM14、SM15、SM17、SM20、SM29、SM30、SM34和SM45);有5对引物在杂交种1-7亲本材料中存在多态性,其多态性引物带型呈互补带型的有4对(SM15、SM20、SM24和SM29).分别选取2对呈互补带型的SSR引物进行杂交种纯度鉴定,结果显示杂交种15-16和1-7的纯度分别为99%和100%,与田间种植鉴定结果一致.[结论]采用SSR分子标记检测茄子杂交种纯度具有准确、高效的特点,可为茄子杂交制种过程中真假杂种鉴定提供技术支持.     

基于SSR标记的“一管两步”法检测两系杂交稻种子纯度

利用SSR分子标记技术,对两系杂交稻盐两优888的双亲及F1之间的多态性进行引物筛选及纯度检测技术体系优化研究.结果表明,在已筛选的48对引物中有2对引物(RM208和RM225)表现出稳定的共显性,即杂交种呈现父母本互补的带型,采用“一管两步”简易法提取的DNA完全满足引物RM208纯度检测需要.利用RM208对4个盐两优888样品进行纯度鉴定,SSR标记结果和田间鉴定结果差异不显著,说明筛选的SSR分子标记能够快速、准确地鉴定盐两优888杂交种纯度.     

杂交稻种子纯度的SSR分子检测及应用研究

利用SSR标记构建了15份恢复系和11份不育系共26份籼型杂交水稻亲本的DNA指纹图谱,筛选出了冈优725和Ⅱ优838两个杂交种亲本的共显性SSR标记。同时对四川省6家种子企业生产的两个杂交水稻品种冈优725、Ⅱ优838及其亲本进行田间和SSR标记纯度鉴定。结果表明两种鉴定方法无显著差异,均可应用于种子纯度检测,但分子标记纯度检测的结果更准确、可靠。不同来源的种子纯度存在显著差异,6家种子企业提供的亲本及杂交种的纯度普遍较低,多数未达国家标准。     

甘蓝一代杂种纯度SSR鉴定与田间鉴定的一致性研究

【目的】分析甘蓝杂交种纯度的SSR分子标记鉴定结果与田间形态学鉴定结果的一致性,寻找一种快速、准确鉴定甘蓝杂交种纯度的方法。【方法】选用SSR分子标记,筛选杂交种具有父母本互补带型的引物,用其鉴定“秦甘50”杂交种的纯度,并与田间常规鉴定结果的一致性进行比较。【结果】300对SSR分子标记引物中,有1对引物SQ1019对“秦甘50”杂交种表现为父母本互补带型;利用引物SQ1019标记鉴定“秦甘50”大田杂交种的纯度为96.3%;“秦甘50”大田杂交种经田间鉴定纯度为96.0%,2种鉴定结果的一致性高达99.7%。【结论】SQ1019是SSR分子标记“秦甘50”杂交种的特异引物,SSR分子标记是一种快速、准确鉴定“秦甘50”杂交种纯度的方法,其结果与田间常规鉴定结果相一致。     

利用SSR标记对甘蓝型黄籽油菜贵油519杂种纯度鉴定

在用SSR(简单重复系列)标记构建了53份甘蓝型黄籽油菜种质资源的DNA指纹图谱的基础上,筛选出一个对黄籽油菜杂种贵油519及亲本具有共显性的SSR引物Ra2A05b,鉴定大田生产F1杂种群体的纯度,并对比田间调查的鉴定结果表明,SSR标记鉴定可以识别更多的非杂交种单株,如因微粉导致的自交、花粉污染、机械混杂等带来的非杂交种单株。就SSR标记鉴定杂交种纯度鉴定的可行性和优点进行了讨论。     

SSR标记技术鉴定‘新食葵7号’品种纯度的研究

以‘新食葵7号’及其双亲的DNA为模板,对100对SSR引物进行筛选,以期为生产应用提供准确、便捷的杂交种种子纯度鉴定方法。SSR多态引物标记521在‘新食葵7号’母本产生特异条带大小为482bp,父本为447bp;标记563在母本上特异条带大小为352bp,父本为384bp,分子鉴定的纯度和田间鉴定纯度基本一致,通过SSR引物筛选,得到可以区分父本、母本和杂交种的标记引物521和563,这2个引物标记可有效鉴定‘新食葵7号’杂交种种子的纯度。     

豫玉22玉米杂交种子纯度的SSR和SNP分子比较鉴定

为研究豫玉22玉米杂交种子的SSR和SNP两种分子标记纯度鉴定方法,为快速有效鉴定玉米种子纯度提供依据。采用SSR荧光标记法和SNP分子标记的KASP技术对豫玉22玉米杂交种子进行基因组DNA提取、引物筛选、基因型分析、纯度鉴定。豫玉22的SSR特异性引物为umc2007y4和bnlg161k8,纯度鉴定结果为97.92%。SNP特异性引物MaSNP64和MaSNP245纯度鉴定结果是98.44%。SSR和SNP分子标记鉴定豫玉22玉米杂交种子纯度的最佳方法,为拓展玉米杂交种纯度鉴定方法具有指导意义。     

SSR标记技术鉴定新食葵6号品种纯度的研究

[目的]通过利用SSR分子标记技术测定向日葵种子纯度,以期为生产加工应用提供准确、便捷的杂交种种子纯度鉴定方法提供依据.[方法]该研究以新食葵6号及其双亲的DNA为模板,通过DNA提取、PCR扩增反应和 制作电泳的步骤,进行了约100对SSR物分子标记的筛选.[结果]SSR多态引物标记532在新食葵6号母本分别产生特异条带大小为496bp,父本特异标记条带大小为451 bp;引物标记574在母本上特异条带大小为364 bp,父本上的特异标记条带大小为384 bp,同时室内分子鉴定的纯度和田间鉴定纯度基本一致;通过SSR分子标记方法可出可得到区分父本、母本和杂交种的引物标记532和574,这2个引物标记可有效用于鉴定上述新食葵6号杂交种种子的纯度,辨别种子的真伪.[结论]该方法具有简单,快速、准确、重演性高的优点,目前该方法已成为向日葵品种鉴定的主要方法.     

利用SSR分子标记技术鉴定和分析茄子杂种F_1的纯度

【目的】分析、鉴定茄子杂种F1纯度,为提高茄子杂交育种效率提供参考依据。【方法】在育苗期,采用SSR分子标记技术对栽培茄×栽培茄正、反杂交种和野生茄×栽培茄杂交种进行纯度鉴定及亲缘关系分析。【结果】从124对SSR引物中筛选出15对在亲本间存在差异、扩增稳定、条带清晰的引物;从210株杂种F1单株中共鉴定出208株真杂种,杂种纯度为99.0%,鉴定结果与田间性状调查结果一致;栽培茄×栽培茄正、反交组合的F1与亲本的亲缘关系均较近,遗传关系差别微小;野生茄×栽培茄组合的F1与父本的亲缘关系均较远,且表现出偏母本遗传。【结论】SSR分子标记技术能快速、准确鉴定茄子杂交后代的纯度,可作为分子标记辅助育种手段用于指导选择符合茄子育种目标的优良杂交品种选育。     

SSR分子标记鉴定栽培茄与野生茄杂种F_1研究

SSR分子标记技术对鉴定作物杂种真实性及茄子种间杂交研究具有重要意义。文章以16份茄子杂交材料及其亲本为试验材料,参考茄子基因组,以SSR分子标记技术为鉴定手段,鉴别茄子杂交材料真伪。结果发现2对SSR引物(emg01J09和emh21J12)可用于试验材料杂交种真实性检测,与田间鉴定结果一致。研究表明,SSR分子标记可应用于栽培茄与野生茄杂种鉴定,可及时排除假杂种,减少后期试验工作量,准确验证杂交结果。该技术对杂种后续研究及茄子品种改良具有应用价值。     

SSR标记鉴定玉米品种真实性及纯度的研究

[目的]探讨杂交玉米及其亲本种子真实性和纯度的分子检测判读标准。[方法]以16个玉米杂交种及其双亲和202个骨干自交系为引物筛选材料,分别构建3个杂交种和3个自交系人工群体的验证试验材料,用CTAB法提取幼苗叶片DNA,选137对SSR引物进行SSR扩增及产物检测,用于玉米品种的真实性鉴定和纯度检测,并与同批移栽至大田的种植鉴定结果相比较。[结果]从137对SSR引物中筛选出了多态性信息含量（PIC值）高、扩增条带清晰和重复性好的20对一级和20对二级核心引物,用一级核心引物对杂交种人工群体进行真实性鉴定,根据一级核心引物的扩增结果,从中选取3对（phi080、umc1196、umc2084）表现较好的引物用于杂交种人工群体的纯度检测。ssR分子检测结果与田间种植鉴定结果具有高度一致性。[结论]利用SSR标记技术鉴定玉米品种真实性和纯度的方法是可行的。     

甘蓝型油菜中油杂8号种子纯度的SSR鉴定

细胞质雄性不育三系杂交种的纯度鉴定是油菜种子生产中重要的一环。选用173对SSR引物在中油杂8号的亲本间扩增,从中筛选到6对扩增效果好、条带清晰且差异片断在亲本间能够重复出现的引物,其中P051、P078和P203三对SSR引物在杂种F1中同时表现出父母本的特征条带。用这3对引物对32份中油杂8号的DNA进行鉴定,发现P078和P203的鉴定结果完全相同,因此采用其中的P078引物对经过田间种植鉴定的中油杂8号样品进行了鉴定。结果表明,SSR鉴定的结果与田间种植鉴定的结果非常接近,说明采用P078或P203都可以对中油杂8号进行快速准确的鉴定。     

五个鲜食玉米新品种的DNA指纹图谱研究与应用

利用SSR标记技术,对5个鲜食玉米新品种及其亲本的DNA指纹图谱进行了研究。从88对SSR引物中,筛选出37对在鲜食玉米中表现多态性丰富、带型清晰明显且稳定的引物,分析了鲜食玉米自交系的遗传多样性,建立了各品种的特征DNA指纹图谱及数字指纹,可以有效用于种子质量检测。     

应用SSR标记技术进行引物筛选及玉米杂交种纯度的鉴定

利用SSR标记技术分别筛选出玉米杂交种强盛16、强盛9、强盛62、强盛11的特异引物,建立了4个品种的种子纯度鉴定试剂盒。试验表明,应用此试剂盒可快速、有效地鉴定4个杂交种的种子纯度。     

应用SSR技术进行白菜品种纯度鉴定的研究

以5个白菜杂交种和8个亲本为试验材料,利用白菜单粒干种子DNA快速提取方法,筛选出能够区分5个杂交种与双亲,并具有互补带型的SSR引物,建立适于SSR分子标记检测白菜种子品种纯度的反应体系。试验结果证明这套检测技术体系可用于白菜杂交种品种纯度室内快速鉴定,从而为SSR分子标记技术在白菜种子纯度鉴定中的应用和推广打下了坚实的基础。     

应用盐溶蛋白电泳和SSR分子标记鉴定玉米种子纯度的研究

[目的]建立一种快速、准确、经济的品种鉴定方法,为品种纯度鉴定和新品种保护提供依据。[方法]利用盐溶蛋白PAGE法与SSR分子标记对玉米杂交种先玉335和泽玉11的指纹图谱进行分析。[结果]应用盐溶蛋白PAGE法,可以很好地鉴定玉米种子纯度,可用于大批量检测;选用的10对SSR引物,其中3个多态性好的SSR引物能区分所有材料。[结论]盐溶蛋白PAGE法具有简单、快速、准确、稳定和低成本的特点。在该法为主批量检测种子的基础上,对难以鉴定的品种可采用SSR分子标记法作为辅助手段进行鉴定。     

"夏光"、"早夏16"甘蓝杂交种DNA指纹图谱的构建

用SDS法提取甘蓝(Brassica oleraceavar.capitata)杂交种“夏光”、“早夏16”及其各自亲本的基因组DNA,通过SSR、RAPD两种分子标记方法构建其DNA指纹图谱用于纯度鉴定。利用30对甘蓝SSR引物和50个适用于甘蓝的RAPD引物,以各杂交种及其亲本的基因组DNA为模板组合进行筛选,结果显示:多数SSR引物对两组合扩增带型一致,未能建立SSR指纹图谱;通过RAPD标记方法筛选出能鉴定两杂交种纯度的引物分别为S15、S42、S147和S42、S78、S88,其中引物S42对两组合均能扩增出特异的RAPD指纹图谱,并将RAPD指纹图谱转变为相应的数字指纹。