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藏猪SLA-DRB基因第2外显子PCR-RFLP多态性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
采用限制性内切酶RsaⅠ对藏猪SLA-DRB基因外显子2进行多态性分析。结果表明:藏猪SLA-DRB基因外显子2在RsaⅠ-RFLP位点上存在7种基因型,以杂合子BC型居多,基因型频率为0.4419,为优势基因型。χ2适合性检验结果表明,藏猪SLA-DRB基因外显子2 的RsaⅠ酶切位点的χ2值为10.14,高于显著水平(P<0.05),说明藏猪SLA-DRB基因在RsaⅠ酶切位点上没有达到Hardy-Weinberg平衡状态。 相似文献
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藏猪生长激素基因核苷酸多态性分析 总被引:8,自引:0,他引:8
本文应用PC R方法,体外扩增了藏猪5个个体的生长激素(GH)基因64~2022位之间1959 bp的片段(包含完整的5个外显子和4个内含子),并进行了序列测定。结合网上下载的猪GH基因同源区段序列进行比较分析,结果表明:藏猪GH基因有较丰富的核苷酸多态性;检出的24个核苷酸突变位点中有6个发生在外显子区,外显子2内有4个突变位点,导致2个氨基酸变异,外显子3和外显子4内各有一个突变位点,特别是外显子4内这个突变位点引起了1个氨基酸变异;单核苷酸转换(21个位点)大于颠换(5个位点)。 相似文献
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藏猪雌激素受体(ESR)基因PvuⅡ多态性分析 总被引:3,自引:0,他引:3
藏猪是世界上分布在海拔最高地区的放牧型猪种,能适应高原的恶劣气候和低劣饲料环境,具有体型小、鬃毛发达、体质结实紧凑、皮薄、肌纤维细、肌间脂肪含量高、肉质好等特点。据《四川家畜家禽品种志》记载,在放牧条件下藏猪的繁殖性能较低,初产母猪产仔数平均 ( 4. 5±0. 1 )头,第 2胎平均(5. 4±0. 2)头, 3胎以上平均(5. 6±0. 2)头。但据作者在四川省稻城县走访调查结果表明,藏猪繁殖性能不亚于四川其他猪品种,经产母猪平均窝产仔数也能达 10头以上。现对藏猪雌激素受体基因进行PvuⅡ酶切多态性分析,旨在从分子水平上研究藏猪繁殖性… 相似文献
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鸭生长激素(GH)基因编码区及调控区多态性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
根据鸭生长激素基因编码区及调控区的序列设计8对引物,利用PCR-SSCP方法对北京鸭、西湖野鸭、樱桃谷鸭、金定鸭、山麻鸭、荆江鸭、绍兴鸭、缙云麻鸭等8个鸭种进行单核苷酸多态性分析。结果共发现3个突变位点,分别为230处(C→G)、244处(C→A)和3 701处(C→T)。前两处突变位于5′调控区,3 701处突变位于编码区第4外显子,但该编码区的突变是沉默突变,3′调控区表现了高度的保守性。统计结果发现:⑴在5′调控区基因座上,金定鸭的等位基因B频率显著高于其他品种;⑵在外显子4基因座上,基因型频率的分布与品种有关,且肉用型鸭的CC基因型频率显著高于蛋用型。可以推测,本研究所检测到的基因座可能与生产性能相关。 相似文献
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成都麻羊和波尔山羊生长激素基因HaeⅢ多态性的比较研究 总被引:4,自引:0,他引:4
利用PCR-RFLP技术检测了成都麻羊和波尔山羊生长激素(Growth Hormone,GH)基因的HaeⅢ酶切多态性。结果表明:成都麻羊和波尔山羊2个山羊群体中均存在GH基因HBeⅢ酶切位点的多态性,且均有A、B两个等位基因。成都麻羊群体等位基因A和B的基因频率分别为0.6216和0.3784;波尔山羊群体中等位基因A和B的基因频率分别为0.5345和0.4655。GH基因HaeⅢ酶切住点的基因型分布在两个山羊群体中均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡定理(P〈0.01)。但两个群体间不存在显著差异(P〉0.05)。 相似文献
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金华猪生长激素基因多态性分析及生长曲线比较 总被引:1,自引:0,他引:1
采用PCR-RFLP法测定了金华猪生长激素基因Apa -Ⅰ及Msp Ⅰ酶切多态性.并分析了各基因型与生长速度的相关性,进而对金华猪的生长曲线进行了拟合.结果表明,金华猪生长激素基因经Apa Ⅰ酶切后未出现多态,经Msp Ⅰ酶切后出现了AB(274、238、137 bp)和BB(238、137 bp)2种基因型,且不同基因型间的个体初生体质量、1月龄体质量、2月龄体质量、3月龄体质量、5月龄体质量、6月龄体质量及0~6月龄间平均日增体质量的差异不显著(P>0.05),而BB基因型4月龄体质量差异高于AB基因型(P<0.05).生长曲线拟合结果表明,Bertalanffy模型效果最佳.AB与BB基因型2种生长曲线进行比较,显示出BB基因型具有早期生长速度较快、生长拐点早、拐点体质量小的特点. 相似文献
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生长激素基因多态性与猪部分生产性能的关系 总被引:1,自引:0,他引:1
采用PCR-RFLP对南昌白猪(117头)和大约克夏猪(361头)的GH1基因的-119bp~+486bp进行了扩增,并用HhaⅠ酶切,产生4个等位基因:C1(605bp)、C2(498bp+107bp)、C3(449bp+156bp)和C4(449bp+107bp+49bp)。分析了不同基因型对平均初生重、2月龄体重、6月龄体重、料重比、校正背膘厚、平均背膘厚和瘦肉率等生产性能的影响。结果表明,在南昌白猪中,C2C2基因型猪的2月龄体重比C1C1基因型猪的大,差异显著(P<0.05)。在大约克夏猪中,C3C3基因型猪的初生重最小,与C2C4基因型猪的相比,差异极显著(P<0.01);C2C4基因型猪的6月龄体重最大,与C2C3和C3C3基因型猪的相比,差异显著(P<0.05)。 相似文献
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马鹿生长激素(GH)基因生物信息学预测及分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为研究马鹿生长激素(GH)基因的结构和功能,从GenBank中下载马鹿、梅花鹿、鼷鹿、牛、山羊、绵羊、猪、人、黑猩猩、挪威大鼠、小家鼠、北极狐、狗、鸡和斑马鱼的GH基因完整编码区(CDS)及氨基酸序列,利用DNAStar 7.0、BioEdit 7.0生物软件与相关在线工具对马鹿GH基因核苷酸序列的基本信息及其编码蛋白的理化特性和结构特征进行了生物信息学预测及分析,对马鹿与其他14个物种GH基因的CDS序列及其编码氨基酸序列进行相似性分析,并基于氨基酸序列构建了15个物种的系统进化树。结果表明:马鹿GH基因DNA序列长度为2 100 bp,包括完整的5个外显子和4个内含子,部分5′UTR和3′UTR,CDS全长654 bp,编码217个氨基酸;其编码的蛋白是一种分子质量为24.588 4 ku,等电点为7.62的疏水性稳定碱性蛋白;存在2个强跨膜区、8个广泛磷酸化位点,二级结构元件以α-螺旋和无规则卷曲为主;该蛋白位于细胞外,含有1个信号肽,属一种分泌型蛋白;马鹿与梅花鹿、牛、绵羊、山羊和鼷鹿等动物的GH基因氨基酸序列相似性较高,亲缘关系最近。该研究结果可为马鹿GH基因的进一步分析提供详细的生物学基础信息。 相似文献
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GH基因在5个藏猪群体中的遗传多态性分析 总被引:5,自引:0,他引:5
采用PCR-RFLP技术,扩增了5个不同地理类群藏猪群体(工布江达藏猪、米林藏猪、理塘藏猪、迪庆藏猪、合作藏猪)生长激素基因(GH基因)-119bp-+486bp之间的区域,分别用内切酶ApaI及Hin6I检测其多态性。结果表明:(1)从ApaI酶切产生的多态型来看,除理塘藏猪之外,A等位基因在其它4个藏猪群体中频率高于B等位基因;(2)从Hin6I酶切产生的多态型来看,在5个藏猪群体中C4频率较高、C1频率极低,而C3除在工布江达藏猪之外的其它猪种中的频率也很低,其基因型主要表现为C4C4、C2C4、C2C2;(3)利用Hin6I对扩增出的GH基因片段进行酶切电泳,在工布江达、迪庆、合作藏猪中发现一种特异酶切带型,初步判定GH基因在这些个体中可能为多拷贝基因。 相似文献
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LXRα和LXRβ基因是猪肌肉发育和脂肪沉积的重要候选基因。本研究利用PCR-RFLP技术测定了112头藏猪的LXRα-BslI和LXRβ-AciI多态性。结果显示,藏猪群体中LXRα-BslI有CC、CG和GG3种基因型,基因型频率分别为0.4286、0.4643和0.1071;LXRβ-AciI有TT、TC和CC3种基因型,基因型频率分别为0.1964、0.5179和0.2857;与瘦肉型猪基因型分布差别较大。推测可能与藏猪肌肉和脂肪发育遗传特点有关。 相似文献
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本文在对猪品种生长激素基因多态性进行研究的同时,借助于PCR和测序技术,对11个猪品种的生长激素基因全序列多态性进行检测,43个SNPS和1个位于内含子3的7bp缺少片段被检测出,结果表明,猪品种之间的某种遗传分化在某种程度上不仅仅与地理的分布有关,同时和其基因的交流也有着直接性的关系。 相似文献
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