十八个麝香百合基因型遗传差异性的RAPD分析

对18个麝香百合基因型的遗传差异性进行了RAPD分析,筛选具有优良性状的新品种,并尝试使用RAPD标记技术的DNA指纹图谱作为DUS测试的分子生物学依据.结果表明:14条引物共扩增出142条带,其中多态性条带106条,多态百分比为74.65%,总体多态百分比不是很高,说明各基因型之间遗传差异较小.对RAPD扩增结果进行聚类分析,这18个基因型可以分成4类.一些引物扩增的结果显示,部分基因型具有特异性条带,说明RAPD技术在DUS测试中可以从分子生物学性状来鉴定新品种的特异性.     

30份莲种质资源的RAPD遗传多样性分析

采用RAPD分子标记技术对30份莲(Nelumbo nueifera Gaertn.)种质资源的遗传多样性进行鉴定.筛选出14对有效引物进行PCR扩增,共产生2 146条带,其中有1 516条为多态性条带,各对引物的平均多态性条带为108.29条,扩增条带的多态率达70.64％.对所得到的30份莲种质资源的RAPD图谱...     

中国部分兰花品种RAPD分析

用随机引物扩增多态DNA（RAPD）分析技术，对中国兰花迸行品种鉴定和分类研究。使用10种20个碱基的引物，对19个中国兰花品种的基因组DNA进行扩增，其产生83条扩增带，其中80条大多态性带。每个兰花品种都有其特有的扩增带可与其它品种区别开来。这种特异的条带可作为一个品种的分子标记应用于品种鉴定和分类RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果基本相符。各个种内的不同品种问亲缘关系接近，而不同种间差异较丸RAPD技术为中国兰花品种的鉴定和分类提供了新的途径     

‘黄金冠’桃及其品系亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD技术对黄桃新品种‘黄金冠’及其它6个品系的亲缘关系进行了研究。从80个随机引物中筛选出15个重复性好、条带清晰的多态性引物对桃品系进行了RAPD扩增,共扩增出84条谱带,其中38条表现多态性,多态性比率为45.2%。利用NTSYS软件和UPG-MA聚类法对扩增结果进行了品种间相似系数的计算及聚类分析。结果表明:相似系数为0.78~0.86,黄桃19和其它桃品系亲缘关系最远,‘黄金冠’和锦黄2号的亲缘关系最近。     

香石竹品种的RAPD 标记

 用随机扩增多态DNA (RAPD) 技术, 选用4 个随机引物, 对87 个大花型香石竹品种总DNA进行随机扩增。4 个引物均得到了稳定的RAPD 图谱。扩增出的片段分子量在500～4300 bp 之间, 每个随机引物扩增出的条带数在8～12 条之间, 共扩增出2113 个条带, 平均每个引物扩增的DNA 条带数为915 条。根据DNA 谱带计算品种间遗传距离, 对87 个品种进行了聚类分析, 分为10 个组群, 组群间差异较大, 组群内差异较小。     

不同产地人参种质资源RAPD和SSR分析

以15个产地人参种质资源为试材,采用RAPD和SSR分子标记技术对其遗传多样性进行分析。结果表明:2种分子标记均能揭示不同地区人参种质间的遗传多样性。共筛选出11条RAPD随机引物,平均每条引物可扩增出3~17条DNA片段,共扩增出104条清晰条带,多态性条带100条,多态性百分率为96.15%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.505 3~0.989 5,平均值为0.760 4。筛选出5对SSR引物,平均每对引物可扩增出1~8条DNA片段,共扩增出38条清晰条带,多态性条带35条,多态性百分率为92.11%,揭示供试材料间遗传相似系数(GS)为0.400 0~0.960 0,平均值为0.742 1。RAPD和SSR标记的聚类分析在分类上稍有差异,但总体趋势一致,RAPD、SSR及RAPD+SSR均将样品聚为三大类,均能揭示它们之间的亲缘关系,为人参种质资源的收集与利用奠定了基础。     

豆瓣菜种质资源遗传多样性的RAPD和ISSR分析

以8个豆瓣菜的品种为试材，用筛选出的79个RAPD引物和34个ISSR引物对这8个品种的基因组DNA进行扩增，分别扩增出361条和179条谱带，每个引物扩增出的带在3～10条之间，平均每个引物扩增出约5条带。根据所得的条带进行聚类分析，两种标记产生的聚类图存在一些差异，但它们都可以较好地将8个品种按亲缘关系的远近划分为3个不同的类群。Mantel测试得出相关系数r=0．58155，表明RAPD和ISSR两种分子标记技术的相关度很低。     

河南17 个桂花品种的RAPD 分析

 采用改良CTAB 法提取河南17 个桂花品种的基因组DNA , 利用RAPD 技术对其进行鉴定和分类研究。从100 个10 bp 的随机引物种筛选出15 个扩增效果较好的引物进行扩增, 共产生121 条带, 其中87 条为多态性带。根据扩增结果进行聚类分析, 得出反映各品种间亲缘关系的树状图。各个品种群内的不同品种间的亲缘关系接近, 而不同品种群间亲缘关系较远。RAPD 对基因组的分析结果与传统分类学的结果基本相符。     

长白山地区野生软枣猕猴桃遗传多样性研究

利用RAPD分子标记技术对长白山地区24个野生软枣猕猴桃种质资源进行检测,应用NTSYSpc 2.10e软件对遗传一致性和遗传距离进行分析。以期解析长白山地区野生软枣猕猴桃种质资源的遗传多样性、亲缘关系。结果表明:用24个扩增效果良好的引物进行RAPD扩增反应后,共扩增出187条带,其中多态性条带为181条,占96.8%,平均每个引物产生7.54个多态性条带。24个野生软枣猕猴桃种质资源之间遗传距离为0.02~0.58,并具有同一地理区域聚类趋势,且不同地理区域间存在较高的遗传多样性。     

东北地区香茶菜属植物遗传多样性的RAPD分析

以东北地区不同产地的24份蓝萼香茶菜和尾叶香茶菜样品为试材,采用RAPD分子标记技术对其进行遗传多样性分析.结果表明:从60条随机引物中筛选出5条引物用于2种香茶菜的扩增,2种香茶菜共扩增得到63条清晰条带,其中55条为多态性条带,多态性比率为87.30％.系统聚类分析结果表明,2种香茶菜亲缘关系明显,遗传多样性较丰富,且种间大于种内.因此,RAPD分子标记技术可以作为研究香茶菜属植物遗传多样性的有效标记方法.     

24个大果沙棘品种的RAPD分析

为了解沙棘种质资源的遗传多样性和品种间的亲缘关系,以24个大果沙棘品种为材料,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法进行沙棘的遗传多样性分析。从120个随机引物中筛选出多态性丰富的18个引物用于扩增反应,在24个大果沙棘品种中检测到171个RAPD位点,其中多态性DNA带112条,多态位点百分比为65.5%,表明大果沙棘品种具有丰富的遗传多样性;在RAPD分析的基础上,对大果沙棘品种进行了聚类分析,结果表明,以相似系数0.58处作为分界,可将供试的24份大果沙棘种质分为4类。     

Genetic relatedness (diversity) and cultivar identification by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers in teasle gourd (Momordica dioica Roxb.)

Genetic relationship and variation of 29 accessions of teasle gourd (Momordica dioica Roxb.) and 1 accession of Momordica cochinchinensis Spreng. (wild relatives of teasle gourd) were examined by RAPD analysis using 44 dodecamer oligonucleotide primers. A total of 496 fragments were produced by 44 primers of which 95% bands were polymorphic. Using presence or absence of specific RAPD markers or combination of primers, 23 out of 30 accessions were identified. The genetic relatedness or genetic distance based on Nei and Li's genetic similarity varied from 0.86 to 0.65 with an average of 0.74 among 29 M. dioica accessions (when M. cochinchinensis excluded). In the phenetic dendrogram developed from cluster analysis using UPGMA method, M. cochinchinensis was out grouped as single accession, while others showing relatively weak grouping formed four groups. Clustering pattern did not demonstrate any relationship between geographical origin and genetic diversity. A DNA extraction method has been standardized. This is the first report of using RAPD techniques in teasle gourd. It was concluded that RAPD analysis is a useful tool for genotypic identification and estimation of genetic similarity in teasle gourd.     

茄子耐盐种质亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD标记对14份耐盐茄子种质资源进行遗传多样性分析。结果表明：从100个引物中筛选出10个多态性较好的引物,共扩增出102条带,多态性条带所占的比例为77.45%。聚类分析结果显示：14份耐盐茄子材料的遗传相似系数在0.316～0.975之间|在遗传相似系数0.47处可将14份耐盐茄子材料分为3大类,大部分种质资源（85.71%）都聚在第3类（栽培种）,表明收集到的茄子耐盐种质亲缘关系较近。     

海南部分荔枝种质的RAPD分析

 采用10个10碱基的随机引物，通过RAPD分析的方法，在分子水平上对海南30份荔枝种质进行鉴定、分类和亲缘关系分析。结果表明，大多数种质相似系数在55% ～80%之间，说明他们之间的亲缘关系较近；在相似系数为0.61的水平上，30份海南荔枝种质被分为4组，与以龟裂片特征为主要分类依据的形态分类有一定的相关性，但是RAPD分类比形态分类的分类范围更细。因此，传统形态分类不能完全反映出品种间的亲缘关系，有待结合RAPD分析方法进一步完善。     

15个樱桃品种的RAPD分析

利用RAPD技术,用104条随机引物对甜樱桃的14个品种和中国樱桃的1个品种进行遗传多样性分析,其中有14条引物的多态性较好。用任意一条能出现扩增带的引物,能明显区分开中国樱桃和甜樱桃,RAPD标记能够准确地进行种间的区分;而用一个引物或两个引物的组合只能鉴定出甜樱桃的一个品种。聚类结果显示,中国樱桃和甜樱桃的遗传距离最远;黄色果肉的养老和其他红色果肉的品种遗传距离较远。RAPD分析基本能够反映甜樱桃品种间的遗传多样性,但效果不理想,鉴定品种较为困难。     

北京地区杏鲍菇菌株遗传多样性的RAPD分析

对北京地区24个杏鲍菇栽培品种的遗传多样性进行RAPD分析,选取了40条RAPD随机引物对供试的24个杏鲍菇菌株的基因纽DNA进行PCR扩增,最终成功筛选出9条RAPD引物,共扩增出142条稳定、清晰的DNA条带;聚类分析结果表明,在相似系数为0．850的水平时,可将24个供试菌株分为5大类;主坐标分析结果与聚类分析基本一致;RAPD分子标记技术成功的表明了北京地区杏鲍菇菌株的遗传多样性,为杏鲍菇的遗传育种研究奠定基础。     

DNA fingerprinting and genetic diversity analysis of late-bolting radish cultivars with RAPD,ISSR and SRAP markers

Three molecular marker systems, RAPD (random amplified polymorphic DNA), ISSR (inter-simple sequence repeat) and SRAP (sequence-related amplified polymorphism), were employed for identification and genetic diversity analysis of 35 elite late-bolting radish cultivars. Detected by 35 RAPD primers, 22 ISSR primers and 17 SRAP primer combinations, the proportions of polymorphic bands were 85.44%, 85.2% and 85.41%, respectively, and the mean genetic similarity coefficients between pairs of genotypes were 0.781, 0.787 and 0.764, respectively. Each of the three molecular marker systems can identify all the cultivars. Five sets of three-RAPD primers, 3 sets of three-ISSR primers and 16 sets of three-SRAP primer combinations were able to distinguish all the cultivars. A linear relationship was observed between Resolving power (Rp) of a primer and its ability to distinguish genotypes. The 35 cultivars were clustered into three major groups based on the RAPD, ISSR and marker combination data with UPGMA, which are in high accordance with their own origins and main characteristics. The results demonstrated that these three marker systems could be useful for identification and genetic diversity analysis of radish cultivars.     

彩色猕猴桃与美味猕猴桃的遗传差异分析

彩色猕猴桃(Actinidia deliciosa var．coloris)为美味猕猴桃(A．deliciosa var．deliciosa)的红心变种,数量稀少,十分珍贵,是中国特有的种质资源,具有重要的育种价值。采用RAPD技术研究彩色猕猴桃红美,TJ-DD—19,TJ- DD-54,TJ—DD-75和Ckou—DD-18的遗传多样性,以及它们与3个有代表性美味猕猴桃品种川猕1号,秦美和海沃德的遗传差异性。从120个引物中筛选出扩增效果较好的18个引物,共扩增出242条带,其中多态性带206条,占85．1％。各引物扩增的条带数在5～18条不等,平均每个引物扩增出的带数为13．4条。结果表明,彩色猕猴桃和美味猕猴桃具有复杂的遗传关系,它们除了变种间具有较大的遗传差异外,变种内也存在一定的遗传差异。同时,采用UPGMA法聚类的结果与传统的形态分类存在一定的差异,但部分反映了猕猴桃的地理分布。